XLOC_042455 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042455
Unique NameXLOC_042455
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000289_pilon:351476..368450-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042455 ID=XLOC_042455|Name=XLOC_042455|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16975bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:351476..368450- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAAGTTTTGATTAAAAAAACAATCAAGCGATATGTTTCGGTGTTTTCACC ATCTTCAAGCTTATAAAAATACAAGGTCTGAACAATCTTAAATTTTCGGA AACAAACAGGAGGTTTGAGCTTTGAGGGGTCCTGCAGCGCCATTTGACAT TTATGTTATTTATATTTGATTTTGTGCATTTTTCTGCGACGGAGGCAGTA AGGTTCTAACTTGACTACATCCTGGCTAACTGAGGATGACGGTAAATTAG CGCTTTTACCTGCTTTTACCGTCCTTGATTTTGCGAGTCGGAACTGCGGG TTATTCCAAATTGATTCAGTCACTCCGCCGTCCTCAAAAGTGCAAATACA TAAACTCGCTAATGTTTAAAGATAAGGAGGATTAATATGATTCGGATGCA TTCAAAGCCATCTTCCTCCATGCTGCTCAAAAAAAAGGTTATCCGGCTAA ACACACCCCCTTTTCATACTTTCTTTCATTGCATTGATCATTTGCACACA TTTGTGACAGTGTGCCTTGAAGCAAAACAATGTACCATCTAAGACATGTT TTTTACTGTAAACAACTGCTCTAGCTCGTATTTTGTTCATACTAGTAACA TTGTGAATAACTTAATCTAAAGGTGTTTTGTAAAAGATTTGCCTCGTTAA GGAAAAAATAGATCTATCCATCATATCCACATTTGTGACTTTTTCTTTTT GTTTACAGGGTACGGGCGGCGCGGACGCTGAAATACAACGTATCAAAGAA TCGATGAAAGAAGAAGTTAAGAAATTTGAAGTCACGGAAAACTCACACGT TCCAGAGTATTATAACATGCATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000289_pilon:351476..368450-

>XLOC_042455 ID=XLOC_042455|Name=XLOC_042455|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2460bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:351476..368450- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCGGGTGTCAGAAAACAAAACCGTTCGAAAGAGCGCAAGATGATAAGAGG
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AATAGCTCTACAACCTCCACACCTCAGACACCAGAAGCAATTGCTAAGGA
GAACCGGGTGTCAGAAAACAAAACCGTTCGAAAGAGCGCAAGATGATAAG
AGGACAAGAGGTGTCAGATACAAACGACAACAAATCTGCAAGTGCAATGT
TCCAAAATAATAAGGCAAATAATGATCGTAATACTAAAGCAAGTACTAGT
AGTAATAGCTCTACAACCTCCACACCTCAGACACCAGAAGCAATTGCTAA
GGAGAAGTTAGCAATCTATGTTTATGAATATCTTCAGCATCAAGGGGCAA
CGCGAGCTGCACAAACATTTTTGAGTGAGGTTAGCAATCTATGTTTATGA
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TCCATGATTTGCGTCTTCTGGGACTTATATTCAGCAGCACCAGAGCGACA
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AATAACATGACAGGGATGCCAGGTTACTATGCAAATTCTGGTACCCTCCC
ATCTCCAAACTATATTCCGCAACCCCCTGGTGATATGAATAACATGACAG
GGATGCCAGGTTACTATGCACGACCACCAATGGGTGGTAACAACATGAAT
ATGCTTGGAGCTCGACCACCAATGGGTGGTAACAACATGAATATGCTTGG
AGCTTTTATGGGAGGTAATCGATATAATGCAGGCAGAACACCAAATATTA
GGATACCTAACCAGTTTATGGGAGGTAATCGATATAATGCAGGCAGAACA
CCAAATATTAGGATACCTAACCAGATGGGAATGGGGGGTCAATTACCTTT
TTCAAATATGGATCCTTCAAGGCAGCAACAAGTAGCAGGGGGAAACTATC
AAAATATGCAAGATGGGAATGGGGGGTCAATTACCTTTTTCAAATATGGA
TCCTTCAAGGCAGCAACAAGTAGCAGGGGGAAACTATCAAAATATGCAAG
CAAACTCAATGACATCTGGGATGCGACCTTTCAATAACGGAATGGGACCA
GTTCCACCACAAACTCAATGACATCTGGGATGCGACCTTTCAATAACGGA
ATGGGACCAGTTCCACCAAACTACAATCGACTTCCATCGATGTCTAACGG
CAGCATGATGGGTGGTAATCCAATGGGAGGCCCATCAATGCAAATAACTA
CAATCGACTTCCATCGATGTCTAACGGCAGCATGATGGGTGGTAATCCAA
TGGGAGGCCCATCAATGCAAATGGCACCACGTGGACCTTGGAATAATCCG
CCTCCTCCTGGCACCACGTGGACCTTGGAATAATCCGCCTCCTCCTAGCC
CACTAACACCTGGACCAACTCGAACACCAATACTATCGAGCCCTCAAGGC
GACCCAACGACTAACATCAATAACAACTCGGCAACACCCGTCAGCATGTC
ACCGGTTAGCTTAGACATGCAAAATAGCCCACTAACACCTGGACCAACTC
GAACACCAATACTATCGAGCCCTCAAGGCGACCCAACGACTAACATCAAT
AACAACTCGGCAACACCCGTCAGCATGTCACCGGTTAGCTTAGACATGCA
AAATTTTGGTATGAAACCACCAGATCAAAATCCACAAATGAACATATCAG
GGACGCCAGGAGGTATTATAAAGACAGTTTGGTATGAAACCACCAGATCA
AAATCCACAAATGAACATATCAGGGACGCCAGGAGGTATTATAAAGACAG
AAACAAACGAAACACTCGAAGACTTACCGACCAGCGTTAAACAAACGAAA
CACTCGAAGACTTACCGACCAGCGTTGGTACGGGCGGCGCGGACGCTGAA
ATACAACGTATCAAAGAATCGATGAAAGAAGAAGTTAAGAAATTTGAAGT
CACGGAAAACTCACACGTTCCAGAGTATTATAACATGCATTGAGGTACGG
GCGGCGCGGACGCTGAAATACAACGTATCAAAGAATCGATGAAAGAAGAA
GTTAAGAAATTTGAAGTCACGGAAAACTCACACGTTCCAGAGTATTATAA
CATGCATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042455XLOC_042455-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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