XLOC_042419 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042419
Unique NameXLOC_042419
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:786320..799585+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042419 ID=XLOC_042419|Name=XLOC_042419|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13266bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:786320..799585+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:786320..799585+

>XLOC_042419 ID=XLOC_042419|Name=XLOC_042419|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2076bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:786320..799585+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCAACTCAGAAGATCATCCACATTTGAGACTCAACTTGTTGACCAA
TGAGTGGGTCATTGTTTCACCTCATCGTATGAAAAGACCATGGGCTGGAC
AAATCGAAGCTACAGAAggagaaaatatttcaagacaTGATTTGAAGAAT
CCTTTGTGTCCAGGAGCTACCAGGTCCTCAGGAAAGATGTTCAACTCAGA
AGATCATCCACATTTGAGACTCAACTTGTTGACCAATGAGTGGGTCATTG
TTTCACCTCATCGTATGAAAAGACCATGGGCTGGACAAATCGAAGCTACA
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AGCTACCAGGTCCTCAGGAAAGATGAACGATGATTATAAAAGCACTTTCG
TGTTCGAAAATGATTTTCCTGCATTGCTAAAAGAAACACCAGATGAACGA
TGATTATAAAAGCACTTTCGTGTTCGAAAATGATTTTCCTGCATTGCTAA
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AGCTGTCATTACCGAGTGGATTAACCAGTATACTGAACTCTCCAAGACAT
ACCAATGGGTACAAcCGAGTGATGTGCTTTCATCCATATTCAGATTTATC
CTTACCATTGATGAGCACAGTTGAGATACAAGCTGTCATTACCGAGTGGA
TTAACCAGTATACTGAACTCTCCAAGACATACCAATGGGTACAAattttt
gaaaacaaaggaaaaatgatgGGCTGCTCTAATCCACATCCTCATTGTCA
GatttttgaaaacaaaggaaaaatgatgGGCTGCTCTAATCCACATCCTC
ATTGTCAGATCTGGGGATGCAATTTTCTACCTAATGAAGCAATAAAGCAG
ATCTGGGGATGCAATTTTCTACCTAATGAAGCAATAAAGCAGCAAGAAAA
CCAGTTGAAGTATTACAACGAAAAGCAATCATCCTTACTGCTTGACTACA
TTAAACTTGAACAACAGAAAAAGCAAGAAAACCAGTTGAAGTATTACAAC
GAAAAGCAATCATCCTTACTGCTTGACTACATTAAACTTGAACAACAGAA
AAAGGAACGAATTGTGGTAGAAAATGATGATTGGATTGTCGTTATACCTT
ACTGGAACGAATTGTGGTAGAAAATGATGATTGGATTGTCGTTATACCTT
ACTGGGCGATGTGGCCTTTTGAAATACTGGTGATGCCAAAGAAAGCAACA
CAGAGAATTAACGATTTATCAACATCTCAACAACAGTGGCGATGTGGCCT
TTTGAAATACTGGTGATGCCAAAGAAAGCAACACAGAGAATTAACGATTT
ATCAACATCTCAACAACAGTCACTGTCTACAATTATGAAGAGCTACCTGA
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CACACACTGTCTACAATTATGAAGAGCTACCTGACGAAATATGATAATTT
ATTCAAAACGTCATTTCCTTATTCAATGGGCTGGCACAGCGCACCTGGTC
TCGAAGATAGTCCACATTGGCAGCTGCATGCTCACTATTACCCTCCTCTT
CTAAGATCGGCTACTGCGCACCTGGTCTCGAAGATAGTCCACATTGGCAG
CTGCATGCTCACTATTACCCTCCTCTTCTAAGATCGGCTACTGTCAAAAA
GCACATGGTTGGTTTTGAAATGCTGTCAGGTGCTATGCGAGATATAACAC
CTGAAAAGGTCAAAAAGCACATGGTTGGTTTTGAAATGCTGTCAGGTGCT
ATGCGAGATATAACACCTGAAAAGGCAGCCACAACTTTAAGAGACTTATC
AGATATCCACTATAAAACTACATGAGCAGCCACAACTTTAAGAGACTTAT
CAGATATCCACTATAAAACTACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042419XLOC_042419-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:786320..799585 +
Properties
Property NameValue
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Aaloc1-186:1