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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000001_pilon:869968..873645+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042416 ID=XLOC_042416|Name=XLOC_042416|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3678bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:869968..873645+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTGTGGAAAAACGTTTGGTTCTTTTTCTAATCCAATTTAACTATTT
GGTTTTGAGAGGTAAGAAAATTTACTTTCAATACTTTATTCAGCTTTTTT
ATACCATAACTTTCAGGTggcaaataaacggggggagatATCGTACATAC
TTGTTCTCCAGTCGGTAGAGATGGACCACGGCCACTTTGACTGCCTGAAA
ACGCCGTGCGGCCCGGCAATTGTCTgggggggACAATTAGACAATAAGTC
AATAACCGGGAGGATAAAAATTGTACCTTATAGACTAAAACTTGGCTATT
TAGAGAGTGATAGAGGACTCTTGTTTTGACAgctgaaatttccaaaaatt
aataaaagggGGGTGGTCTTAATGGACAAAAAATCGGCAAATCAACAAGC
AAGGGTCGTTCATTAGGCACCTAGAAGTAACAATCGGTAAGGTTTTAAAG
GACCAGTTTATCATATATTATCCATACAGTTCAGCAttatatacagggtg
tcccgaaaaacgTGTCAGTGTCAGAAAGTGTCAGACCACTTttataagta
gaaaaaaaattgtttgtgtatcacaaaattttaaatctttaattatTCGA
TTTAAGACGATCTTTAAAGAAATGTTATCGGGTTATTCTCATGTTGCATT
AATAATGTGATAAGTTGATTACTTAAAGCTTTTTTGCTTTTGTATTATCG
TGATTTGTGAAATGATCAAGTTCTAATTACTGTTGAattaaaaagagaca
aaattttTTCGGGACACTTTATGTACAAATTCCAGCATCAATTTTTAAGG
ACATTACGTTGAACCTTCAAGCAATTATGAAAGTCGGCAAAAACTAGTGA
CAACATCACCAACCAATGATTTGACCACCTTCCACCAAGTGACAACAAAA
CATTCAACAGCACCTTCGGTAACATACCATTCAACACCAATCATAACATC
ACAAACTAGCCTGCCATCTTCGTCGACTGATTTGATCTATACGGAATCGA
GCTTTCAATCCTCGTTGTTGTCTTCAATACAACAAACTTCTATAATCTTA
GATTCACTTCAGTCAAGCCAAACATCAACATCTCCGACAACAAGTCAACC
ATTAATATCTCCGACAACAAGCCAACCGTCAGTATCTGAAACATCAAGTC
AGACGTCGATATTTTCAACTTCAACATCTCTGAGATCAATATCTTTAACA
TCAAGTCAGGCGTCGATAACTTCAACATCAAATCAAACGTCGATATCTGC
AATATCAAGCCAGACGTCAATATCTCCGCCAGCATTATCTCCGGCAATAA
GTCAGACATCAATATCTTCAACATCAGGTCAAACATCGATATCTCCGACT
TCAAGTCAGACGTCGATATTTCCAACATCAGGTCAAACATTGACATCTTT
AACATCAAGTCAGACGTCGATGACTTCAACATCAAGTCAAATGTCGATAT
CTTCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTTTAACATCAAGTCGAAAATTC
ACATATCCGACATCATTATCTCTGTTATCAAGTCAGACATCAATATCTTC
GACGTTGAGTCAGATGTCAATATTTCCGACATCAAGTCAAACATCAACAT
CTCCGACATCAAGTCAGATGTCGATATCACAGATATCAAGTCAGACATCA
ATATCTCCGACATCAAGTCAGATATCAATATCTCCGACATCAAATCAAAC
ATCGATATCTGCGACGTCAAGTCAGACGTCAATATCTCCACCAGCATTAT
CTCCGGCAACAAGTCAGACATCAATATCTCCGACATCAAGTCAGAAACTC
ACATATCCAACATCATTATCTCTGTTATCAAGTCAGACATCAATATCTTC
GACGTTGAGTCAGATGTCAATATTTCCGACATCAAGTCAAACATCAACAT
CTCCGACATCAAGTCAGAAACTCACATATCCAACATCATTATCTCTGTTA
TCAAGTCAGACATCAATATCTTCAACATCAGGTCAAACGTCTATATCTCC
GATGTCAAGTCAGACGTCGATATTCCCAACATCAGGTCAAACATTGACAT
CTTTAACATCAAGTCAGACGTCGATAACTACAACATCAAGTCAAATGTCG
ATATCTTCGACATCAAGTCATACATCAATATCTTTAACATCAAGTCGAAC
GTCGATATCTCCAACATCAAGTCAGACATCAACATCTTCGACATCAAGTC
ATATGTCGATATCTCCGACATCAAGTCACACATCAATATCTTCGACATCA
AGTCATATGTCGATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGAC
ATCAAGTCAGACGTCGATATCTCCAACATCAAGTCAGACATCAATATCTT
CGACATCAAGGCAGACATCAACATCTTCGACATCAAGCCAGGCGTCAATA
TCTCCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGGC
GATATCACAGGTATCAAGTCAGACATCAATATCTCCGACATCAAGTCAGA
CGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGT
CAGATGTCAATATCTCCAACTTCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATC
AAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAA
CATCAAGTCATACATCAATATCTTCGACATCATCAAGTCAGACATCAAGT
CAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTCCGAAATC
AATTCAGGCATCAATATTTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATTCAGGCTT
CAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTACAACATCAAGTCAG
ACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAACATCTTCGACATCAAG
CCAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACAT
CAAGTCAGATGTCGATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAATATCTCCG
ACATCAAGTCAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACATCAATATC
TTCGACATCAAGTCAGATGTCGATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAA
TATCTCCGACATCAAGTCAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACA
TCAAATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCCTCACATCAAGTCAGACATCAA
TATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAACATCAAGTCAGACA
TCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACGTCAATATTTCCGACATCAAGTCA
GACATCAATATCTCCGACATCAAATCAGATGTCAATATCTCCAACTTCAA
GTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAACA
TCAAGTCATACATCAATATCTTCGACATCATCAAGTCAGACATCAATTCA
GGCATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCGAGATCAA
GTCAGTTATCAATATCTTCGACATCAGGTCAGACATCAATTCAGGCATCA
ATATCTTCGACATCAAGTCTGATGTCAATATCTCTGACATCAATTCAAGC
ATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTCCGACACCAAGTC
AGACATTGACATCTTTAACGTCAAATCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:869968..873645+ >XLOC_042416 ID=XLOC_042416|Name=XLOC_042416|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:869968..873645+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTGTGGAAAAACGTTTGGTTCTTTTTCTAATCCAATTTAACTATTT
GGTTTTGAGAGATGATTGTGGAAAAACGTTTGGTTCTTTTTCTAATCCAA
TTTAACTATTTGGTTTTGAGAGGACATTACGTTGAACCTTCAAGCAATTA
TGAAAGTCGGCAAAAACTAGTGACAACATCACCAACCAATGATTTGACCA
CCTTCCACCAAGTGACAACAAAACATTCAACAGCACCTTCGGTAACATAC
CATTCAACACCAATCATAACATCACAAACTAGCCTGCCATCTTCGTCGAC
TGATTTGATCTATACGGAATCGAGCTTTCAATCCTCGTTGTTGTCTTCAA
TACAACAAACTTCTATAATCTTAGATTCACTTCAGTCAAGCCAAACATCA
ACATCTCCGACAACAAGTCAACCATTAATATCTCCGACAACAAGCCAACC
GTCAGTATCTGAAACATCAAGTCAGACGTCGATATTTTCAACTTCAACAT
CTCTGAGATCAATATCTTTAACATCAAGTCAGGCGTCGATAACTTCAACA
TCAAATCAAACGTCGATATCTGCAATATCAAGCCAGACGTCAATATCTCC
GCCAGCATTATCTCCGGCAATAAGACATTACGTTGAACCTTCAAGCAATT
ATGAAAGTCGGCAAAAACTAGTGACAACATCACCAACCAATGATTTGACC
ACCTTCCACCAAGTGACAACAAAACATTCAACAGCACCTTCGGTAACATA
CCATTCAACACCAATCATAACATCACAAACTAGCCTGCCATCTTCGTCGA
CTGATTTGATCTATACGGAATCGAGCTTTCAATCCTCGTTGTTGTCTTCA
ATACAACAAACTTCTATAATCTTAGATTCACTTCAGTCAAGCCAAACATC
AACATCTCCGACAACAAGTCAACCATTAATATCTCCGACAACAAGCCAAC
CGTCAGTATCTGAAACATCAAGTCAGACGTCGATATTTTCAACTTCAACA
TCTCTGAGATCAATATCTTTAACATCAAGTCAGGCGTCGATAACTTCAAC
ATCAAATCAAACGTCGATATCTGCAATATCAAGCCAGACGTCAATATCTC
CGCCAGCATTATCTCCGGCAATAAGTCAGACGTCGATATTTCCAACATCA
GGTCAAACATTGACATCTTTAACATCAAGTCAGACGTCGATGACTTCAAC
ATCAAGTCAAATGTCGATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTT
TAACATCAAGTCGAAAATTCACATATCCGACATCATTATCTCTGTTATCA
AGTCAGACATCAATATCTTCGACGTTGAGTCAGATGTCAATATTTCCGAC
ATCAAGTCAAACATCAACATCTCCGACATCAAGTCAGATGTCGATATCAC
AGATATCAAGTCAGACATCAATATCTCCGACATCAAGTCAGATATCAATA
TCTCCGACATCAAATCAAACATCGATATCTGCGACGTCAAGTCAGACGTC
AATATCTCCACCAGCATTATCTCCGGCAACAAGTCAGACATCAATATCTC
CGACATCAAGTCAGAAACTCACATATCCAACATCATTATCTCTGTTATCA
AGTCAGACATCAATATCTTCGACGTTGAGTCAGATGTCAATATTTCCGAC
ATCAAGTCAAACATCAACATCTCCGACATCAAGTCAGACGTCGATATTTC
CAACATCAGGTCAAACATTGACATCTTTAACATCAAGTCAGACGTCGATG
ACTTCAACATCAAGTCAAATGTCGATATCTTCGACATCAAGTCAGACATC
AATATCTTTAACATCAAGTCGAAAATTCACATATCCGACATCATTATCTC
TGTTATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACGTTGAGTCAGATGTCAATA
TTTCCGACATCAAGTCAAACATCAACATCTCCGACATCAAGTCAGATGTC
GATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAATATCTCCGACATCAAGTCAGA
TATCAATATCTCCGACATCAAATCAAACATCGATATCTGCGACGTCAAGT
CAGACGTCAATATCTCCACCAGCATTATCTCCGGCAACAAGTCAGACATC
AATATCTCCGACATCAAGTCAGAAACTCACATATCCAACATCATTATCTC
TGTTATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACGTTGAGTCAGATGTCAATA
TTTCCGACATCAAGTCAAACATCAACATCTCCGACATCAAGTCATATGTC
GATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGA
CGTCGATATCTCCAACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGG
CAGACATCAACATCTTCGACATCAAGCCAGGCGTCAATATCTCCGACATC
AAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGGCGATATCACAGG
TCATATGTCGATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACAT
CAAGTCAGACGTCGATATCTCCAACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCG
ACATCAAGGCAGACATCAACATCTTCGACATCAAGCCAGGCGTCAATATC
TCCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGGCGA
TATCACAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCG
ACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAACTTCAAGTCAGACATCAATATC
TTCGACATCAAACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACATCAATATCT
TCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAACTTCAAGTCAGACATCAAT
ATCTTCGACATCAATCAATTCAGGCATCAATATTTTCGACATCAAGTCAG
ATGTCAATTCAGGCTTCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATC
TACAACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAA
CATCTTCGACATCAAGCCAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACA
TCAATATCTTCGACATCAATCAATTCAGGCATCAATATTTTCGACATCAA
GTCAGATGTCAATTCAGGCTTCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCA
ATATCTACAACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGAC
ATCAACATCTTCGACATCAAGCCAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTC
AGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCA
AGTCAGATGTCGATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAATATCTCCGAC
ATCAAGTCAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTT
CGACATCAAGTCAGATGTCGATATCACAGATATCAAGTCAGACATCAATA
TCTCCGACATCAAGTCAGACGTCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACATC
AATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAACATCAAGTCAGA
CATCAATATCTCCGACATCAAGTCAGACGTCAATATTTCCGACATCAAGT
CAGACATCAATATCTCCGACATCAAATCAGATGTCAATATCTCCAACTTC
AAGTCAGACATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAA
CATCAAGTCATACATCAATATCTTCGACATCATCAAGTCAGACATCAATT
CAGGCATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCGAGATC
AAGTCAGTTATCAATATCTTCGACATCAGGTCAGACATCAATATCTTCGA
CATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAACATCAAGTCAGACATCAATATCT
CCGACATCAAGTCAGACGTCAATATTTCCGACATCAAGTCAGACATCAAT
ATCTCCGACATCAAATCAGATGTCAATATCTCCAACTTCAAGTCAGACAT
CAATATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCAACATCAAGTCAT
ACATCAATATCTTCGACATCATCAAGTCAGACATCAATTCAGGCATCAAT
ATCTTCGACATCAAGTCAGATGTCAATATCTCCGAGATCAAGTCAGTTAT
CAATATCTTCGACATCAGGTCTGATGTCAATATCTCTGACATCAATTCAA
GCATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAATATCTCCGACACCAAG
TCAGACATTGACATCTTTAACGTCAAATCAGTCTGATGTCAATATCTCTG
ACATCAATTCAAGCATCAATATCTTCGACATCAAGTCAGACATCAATATC
TCCGACACCAAGTCAGACATTGACATCTTTAACGTCAAATCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000001_pilon | genome | sc0000001_pilon:869968..873645 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 2071-2181:3568 |
| Aaloc | 1972-2067:3430 |
| Aaloc | 1735-1971:3190 |
| Aaloc | 1627-1731:3036 |
| Aaloc | 1423-1623:2751 |
| Aaloc | 1318-1419:2500 |
| Aaloc | 1243-1317:2386 |
| Aaloc | 1123-1242:2254 |
| Aaloc | 565-1119:1357 |
| Aaloc | 64-561:802 |
| Aaloc | 1-60:1 |
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