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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000094_pilon:1101999..1109906+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042389 ID=XLOC_042389|Name=XLOC_042389|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:1101999..1109906+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttcattaCAGGGGAAGTTCATTCACCTTCAGGATCATCAGGCTATGGAAC
AACAGGAGATGAAGGTTCGTaaaacgtccaaataacgtccATTAGATGTC
CATAAACTGTGGTtgagacggcccacttttcgccttGCCTATTCTGACTG
TGAATTAAGATGGGTAAAAATTTCGGCTGCCTAAAGTCAATGCTTTGCCC
TCTTTTGacatcaatgcaatgacttctttcaatctttttcgaGCAAAGAT
TTTGATTGTCCACTTTTTGCTCACTCTAATAACTAGACGAAAAGGCATGG
CAGAAATtcgaccgtctaaactagaggtAACAGCTGTAAAACGCtacata
aacgttgaaacagTCTTTGCCGCCGCGGAAAGTTATTTCATAAGCAGCAC
ATAGAccatacaaaaaaaattaatttcttcagGGAGTTTTCCTCACTTTC
TGATTGATGACCAACAATTGTCAGTTCGATGAGTTGGGGGTGATAATAAA
GGGTCCCCTATATACCCCTAGACTGGTAGAGAATAAGCTGAAGGTAGATA
ATGTGTATGAATGTATGAGCGATGGCCGGATGGTCTGAGACGTTGTCACC
ACAAACCAGGGGTTCCCGGCTGGAATCCCCATCCCTTACATTGTTCCACC
CAGTCCGTTGTCAGCCAGACAGGCTGCCCGGAGAATAACTTTAATAACCA
AAATAACTGTATTTACCTTAAACAATCCAAAAGctcccttaacaatcaaa
agcgcCAAAATTCGGATATTGCTGCGGTATAGCCATTCTTTTGCGGTATT
TTGcgattttagtgtttttgattgttaagggagCGATTGGATTGTTAAGG
GTAAGTGCGGTACTTCCTttaccctttccggacgcacgaGGAATGGGGTA
GCCCATGCCGGTTTATCTTTAGAGCCTTCCCAAGAACTCCTTCAGCTACC
GTTTGAAAGAGTAGAACTTGTTGAGTAAGATAGGTCAATTCGAGGCGTCG
TACCAACTATAACGATCGTCTCGACACATGcgaaatattttgcttttttt
ttcaaaaaaggcaatTCTCTCGTCCGGAAAGGGTTGAAATTATTTGGATC
ATCTTTAGATAAGACCTATCAACCTATAGTATCGATTTTAATGAAttcct
ttaaaggttttatttttatataagtgttcccgttttatatcagacacata
tttcatatcaggatagtgtctgcctattgttatattatgctgacaaaagc
aaaaaaacttttttcttttcttctttctgaccaatcttgctccacatcca
tgtcaatctATTGTCAATCTTTAAATCTCTTTTACTACTAGATGTCATCC
ACGCGAGTACCATTGTTGCTAATCACATCAAAACGAAGAGTTTGGAGGTT
GGTAACATCGTGATCGGTAACACTATACAAACACACCAGGGAGACATCGC
GTACCATTTCCCGATTCAAGATTGCGATGAATTCTTTAAAGAAGGTATAT
ATACACaatagacattttcataaattacatgaCAAACAACACTTTCCTCG
TTTTCGATATATTGCTATGGcaattgattcccagaggagtcCATAAGAAG
TCTATTGATAAAAGTAATACTTGAAGTCTCGAGGGatataatcaccttgg
taatggtttcaaaacgaggcagtcgttgcactcaaaataattcatgaaaa
ggcctattcatgatattcattcTGTAATATTTTCTACGGGAACATCCCGA
TTTTTCGCCAGTAGTGGaagattttaaacaattttttttcatagcgtaaa
ttttttaaatttgccactgctGGTAAGAAATAGAGCGtttctgtagaaaa
cattacgtcatgaacaatATGAAATCACTTTTCTAAAGATTAATTTGGAG
GctcgttttcaaaattgtctTTCCATTGATATCAATGTGCATGAGTGTTT
TAGTTTTGGTGTGCAAGAAAATTTGCTCTAAACTGTACTCTTAATTTTTT
GCCAGGCGAAGTTATTGGTTTATTCCATTGTacgaaagaaaacaaaatga
tGATCAAGAAACTGACTGCAGCCACCGCTCCCAGTGCTTCTCTTAAAGGT
GTCATTACACGGTCACAATATCTGGAAGCCATGAAACCTAAAGACCCCAA
TGGTAAGTCTTTGTGGGGACGCCTGCTCTAAAACCCTTAAAGATCGGGCC
AATCTCCCATCCGGAAGAATGATGATAGTCGGGTTCAAGTACCCTTGTAT
GTAAGCCTAATGCCTCTCCCCTTAATTTTTGACTGATCTTATCCCAAGAA
ACTGTTTTGTTGGGATTTTGATGGGACGCTTTCCCTTTCGTGACTTTTCT
TTCATATGTATACTATGTTTTCTGAAGCATAGACCATTTGTTTTTGATTG
GTCTAAATCACGACTGATTGTagactagactagagtctacttctggctga
actttgctttctaataattttttatgagtccagtgaagtagactaggagc
atttgacgaggttaccattttgaaaagaattttaaatcaaaataacaaaa
cagCTACTTGAAGTtgaccatatactaccgggtcacataatcgcgccatc
cagtctataaaaaatgttttaagtgGACCCTGGGCTAGACTGATTGAGGA
CAGCATAATtgcttttaccgtcctcgaatGTGCGGATCAAAACTGATCAG
TCGCtctgccgtcctcaaaagtgtagATAGAATAAACTCTTTTATATATT
CTAGTGATGACAGAGACAATCTGTATGCTTGGTATAGTTCCTGTCAAAGT
TCTTGGGAAAGTGAACGCCAATGATCCGCTCTACGCATCCAAAAGTGAAC
CTGGAGTCGCAGTTTCAGGTAAAGAGTCCACACTCTTTAAAAATATCTAG
TTACGCTATATTCttgatatttatgacgtcatcttttatacggaaaaaCC
CGAAGAACACCCGGTGTTTGCCACCAGTCTTAGATTCAAACAATGGAACG
GGTGGCAAACGCCCAGTATTTTTCTGGTGTTTCTGTATAAAAGATTGTGT
CTCATGAATACCAAGAGTAATAAATTAACAATTTGAATGATGAATCAGAC
CAATaaaaaaaTGACCGAGTATCTCAGTCGgaagagcattcgccttacaa
ttcaagggttgtgggttcaatccctggTCACTGTCATCTCAACGAATGAG
TAGCTTCGATTGGGTTTAATGTAGGGGGTAGGTTAATGGGGGCTAAGAGG
AGATGTGGTGCTCCATCTCACTATTCGACCTCCCAGGCCTAGctcaaata
gaaaaggggatagttTCCCTTACTCCCGGCTACGTCCACAGCCATCAGAT
AAATAAACCAACTAACTTAAAAGGAACTTGAATTTATTGAAAGTTTAATG
CAGCCTCGCTTGAAAATCGAAATCTTGGAAACTAGATCTAACAAATATAA
TCTCATTTTGTAGGCTATCACTCACAGACGCACGATATCAGTGATGATTC
GTTAATCGGATACGCCTTTGAAGATCATGATGCCGCCCATCAACACCAGG
TACCAAACGCCCCTGTTTTACTACCTCTCCCTCGTCGCCGCCTAACTCTC
ACCTTTTTCGGTTTGTTTGAATAAAGTAATAAATACCAGTATAGATATAA
AATCTTTTGCTTTCAGATTCCAAAGGTCAGTTTCATGGCTCGGTGGGCAA
TATATCCGATTTCGTCTCCAATAAGCGTACCCCGAGTGGAGCACTTTAGC
ACATTGCTTAAAATATAATTAGGAATATTCTGGAGCAACAAACACCCTGA
GAAAAGCTAACTAATATATTTGATATTATTAGAACTGCTTTTCTGCAGGC
GACCGGATAGTGCAAGGGTAGAGTAGCCggctacggtgcacaaggttgtG
TGTTCTATCCCACGCCGGGTCATATTTCATACAAAGATATGCTTtatctc
tgcttgatgctcagcataAGTGGACCAATCCAGAGTGAAGTAATGGCGCC
TTCGGGTGGGtagctattgaaagaggagccttcgggtccaCTCCGACTAC
CGTTGCAGACTTACTTAGTTTTAAGcaaacaaatttcaatttcaattcag
aTTGGTTTCGTGAACGCTGGTGTTTCAGTGTTAAACACAGCAAGTCATAT
TCTTCTGAACAAACGAATCAAGAAGCTTGAAAATCATTGGGATAGACGAA
TCAGGGAGCTGACAAGAGCAAATACCAATTTCAAACGATGTAAGTTTCAT
GTAACAGTGCGATCGCTCGTAGCCGCGCGGCCTCTTTTGTCTGCAAACCG
TCTGCAAGTAAAAATTGAGAGTTTATGTATCAGTTTTTCTGCGACGGTGA
CGATTAGCTTCTAACTGACTGACTAACTGACTTTTTTACCGTCcttgata
ttttttttgggTCAAAACTGTTGGCTATTCCAAATTGCTTCAGTCACTCC
ACTCTGCCTTCTTAAAAAGTGCTTGCTAATGTTTCGTTTATAAGAGATTT
TTCGTCACCTTTTCCCGACTTGTTTTCTTTTCAGGTAAGCTTTGTTTGCT
ATGATATAGAGTACGAAGCTTGGGCTCATTGGGGAAGTAAACTTTCAAAT
ACCTTATTGGTAATAATAACGACGACAATAATTCGTCGGTAAAAATTTAC
GTCACCAAGGGGATTTTTTCTTCACTATTGCGAACGATCCTTTAAACCGA
TAATGTACTTAAAATAGTGTGTCGGTTCGTCAGTGCATCGTCTATTTTAA
CGATCTaggattgtcaataaaagtgaacCTTAAGGCAATACTTCCAATGG
CATCTTGTCTTGTCGGTTTAAATTGACATCGGCACGGAAGTGGCCGAAAT
ATAAGGGGTTAGACAGGTTATTAGGCAATAGATGTTATTCTGATGTCTTA
TCATAAACTTTTAAAAGGGTTTTCCCCTTAAGTTCGATAAGTGGGGAGAG
TACTTTCGggtcttgtttttgttttcaaaagcttcaaaaaattgcaatgt
tgtcatctaaatttttttgatgacttttctTAGAATTCAGTTTATGCAAT
ACATATAACTTATTATGTTTTTTAATCTTTCTTGACATTCGTAAGAGTTT
ATCCAAATAAATGTCAGACACTGACATCATCATCTTTGCCAATTTTACTG
GGAATTTTGATGTTATATAATATGCGAGTGAAAAGTGGGTCAtattcacg
tttttttataagaatgttgtaTTCCCATTTCATTAtggatatttttaata
tttttataaaaatcatccTCAAGCTAAAATATTTGTCCCAATATTCCTAG
GTCCAAACCTAACCTAAACTTAATTGCTTTGTGCGTAAGAAAATAGTAGG
AGTTCTGTTAAACGATGTCCTTTAAACTTTTCTAACAGTTACAGATTTCA
AAATCAGAccgtttgttatattttaggcCAAAGTATATATCTTTTTATGG
CTCTGCTTgaaattgtccaaattttttgacAGCTGGAGCGTTTTTTAACT
CTTAAAGATCACTATTAAGTGTGCGTTGGCCGGGTTTACAGTATCATATT
TCTGTAGGGTATTTACAATATTTTGTTTCTCGGAAGATTGACTGACTAAC
ACACTGTATGTTGAcactaatctttttttttggtgtCTTATTCCTTTCAG
TCTTTTATGATAATTCAAAACCTAATCATTTACATCTTATCGAATGACAA
CCATAGTCAAACTCCCACTCAGATAATAAATATTGATAAAACATGAGTCT
CGAgaggtttcaaatttttcagccCGCGATATTTGCATTGACAAAATCGT
CAGAATTTGATTATGAAACTATACATCTCAGCGCTTCCTTTGCCCAACGC
CACTCCTCATTTGAAAGCTAATAATATTTTAATGCCCGTCAAAAAATCCC
GCAACCGACCGAGAATCTTatttttgttggcaaaaatGTTGTCAACAAGC
GACTTTTTTATCGTCATGTTTTGCCGACATTATAAGAAAATAACacaata
acaaaaaatttcttgtcTTTTTCTACAGGTTTCGTGACGTCTGGATTAAC
CTTCTTCTTCTTATCACTTTTGACGGGATTCTTCTTGTGGCAACTACTGA
CACCCGGAACAGCATACCGATACTGGAAATGCCGGGATGGTTCTATACCG
GATCATCAAGCAACATTTAAATATAATCCTGACAGATTCTCCTTTTCGGT
ATGTGTGAGTGAAAAAAGTCTCATGATATGCGAGATTAGATTACATAGAT
TTTGTAATGAACACAGATGCTATGGAAAACCAAAGAGAAGTGTTGTTGTT
GTAATTATTCGAGTAAGAGAAACGAAATACTCTCATAAAAACTTTCTAAC
GGGGAAAACTAAGTACTAAGGAAATGTTATAAAAGGGAATTGTCCACATA
CCTTAGATAATCCATTCGAGACATTAGTGGAACGGATTAGCACATTTTAG
CATAACGATACTTCAAATTAGAGTTCTGTAAATTTGCACAGGCACTCTTC
ATGGATTGTGCTTTTGTATGAAAGCTAAACCCGCGGGAAGCTTATTAGCG
CTTACTTAcgcgttttcttcattttaagaTTCTCGTAGCGACCATAGTGC
AGTGGTACAGCATCAAGCTACGGTACGCAAGGCCGTGGCTTCAATCCCAG
GCCGGGTCATACATACAGTTTCGTATTTAGTATAGAAATGGTATTAGATG
CCTCTCAGCTTGATGCTttgcaattaagagaaggatcaagggcaAATGTG
CCAATCCAGGGAGATTTACCTTCGGGTTgatagctattgaaagaggaCCC
TTCGGGTCGCCTCAGACTACGATTCGTAGACTTACTTATTTACTTACTCG
GATGTGCTGTCCttttttttCTAGCTTGAAGATGTGAATGGGATCGAATT
TGATTTCAAGAAGCTGATGAAGAAGACAGAACATTCGCAATACCCAATGA
TGGATTCTAAAGGTTTGTTTACATGTCAGTTTAAATGACACTTTTCAACC
TGAAAGAAAGATCTAAAAGGGTCTAACAAATTGTTATTTTACatggatac
acgcttttttgtataagaatggtgtaagtccatttcattatggatatttt
caactttttttgggaaaatcatcctaaaatatgcttacagcattcttagg
ttaggatcctagtTCAgattagatttaacatttactACATACATCTCatg
cataaaatggcatttttgtgaaaggatgCCTTACTTgagggtaattggca
atttataattgaaaatactctaaaaatggcattcttagcatgagtagcca
aattccatgatggtgatatctttaacattattcttaatttttttggccat
tttcatcatgtacATTcttaaagtgtattcttataaaaaaaagcgtgtaa
cctgttaatctaggacttttagacagttttTTCTATCGGCCGGCTATCTC
GGTTATCTATGAACTGATACATATAGCCCGCTAGCACGCTACCCCTTTTT
CTTTTCGTCGGCGCCGAAAGGCTAAAAAAGTCCTACACTTACATCGGCGA
AAGTTTTAGTTTAGACCCCTTTTTTGGCAACTAAAATTTCTTTAGTTATA
TTTCAATGTCATCAAACATCCATAATTTCCtgattcatttttcattctcc
TACTGTGTAGCATACCCTGGCGTTCGTTATTACCTGAATGTAGACGTTTG
TGCGTACGGCGGGACGCGTTCGACACAAGATATAACAACAGGTCAGAAAG
TGGTATATGGCCCTGATGTATTCGCAGTTGACAAAGATTgcaaaaaagct
ttttattttGTCGAGTGGGAATTCAAATGGCGACAAATTTATTCGTCCAG
ATTTGTCAATTTCACGCATACCATTCACAACCCGTTGAATTTGACGTGTG
TTTCTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000094_pilon:1101999..1109906+ >XLOC_042389 ID=XLOC_042389|Name=XLOC_042389|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2418bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:1101999..1109906+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttcattaCAGGGGAAGTTCATTCACCTTCAGGATCATCAGGCTATGGAAC
AACAGGAGATGAAGttcattaCAGGGGAAGTTCATTCACCTTCAGGATCA
TCAGGCTATGGAACAACAGGAGATGAAGATGTCATCCACGCGAGTACCAT
TGTTGCTAATCACATCAAAACGAAGAGTTTGGAGGTTGGTAACATCGTGA
TCGGTAACACTATACAAACACACCAGGGAGACATCGCGTACCATTTCCCG
ATTCAAGATTGCGATGAATTCTTTAAAGAAGATGTCATCCACGCGAGTAC
CATTGTTGCTAATCACATCAAAACGAAGAGTTTGGAGGTTGGTAACATCG
TGATCGGTAACACTATACAAACACACCAGGGAGACATCGCGTACCATTTC
CCGATTCAAGATTGCGATGAATTCTTTAAAGAAGGCGAAGTTATTGGTTT
ATTCCATTGTacgaaagaaaacaaaatgatGATCAAGAAACTGACTGCAG
CCACCGCTCCCAGTGCTTCTCTTAAAGGTGTCATTACACGGTCACAATAT
CTGGAAGCCATGAAACCTAAAGACCCCAATGGCGAAGTTATTGGTTTATT
CCATTGTacgaaagaaaacaaaatgatGATCAAGAAACTGACTGCAGCCA
CCGCTCCCAGTGCTTCTCTTAAAGGTGTCATTACACGGTCACAATATCTG
GAAGCCATGAAACCTAAAGACCCCAATGTGATGACAGAGACAATCTGTAT
GCTTGGTATAGTTCCTGTCAAAGTTCTTGGGAAAGTGAACGCCAATGATC
CGCTCTACGCATCCAAAAGTGAACCTGGAGTCGCAGTTTCAGTGATGACA
GAGACAATCTGTATGCTTGGTATAGTTCCTGTCAAAGTTCTTGGGAAAGT
GAACGCCAATGATCCGCTCTACGCATCCAAAAGTGAACCTGGAGTCGCAG
TTTCAGGCTATCACTCACAGACGCACGATATCAGTGATGATTCGTTAATC
GGATACGCCTTTGAAGATCATGATGCCGCCCATCAACACCAGGCTATCAC
TCACAGACGCACGATATCAGTGATGATTCGTTAATCGGATACGCCTTTGA
AGATCATGATGCCGCCCATCAACACCAGaTTGGTTTCGTGAACGCTGGTG
TTTCAGTGTTAAACACAGCAAGTCATATTCTTCTGAACAAACGAATCAAG
AAGCTTGAAAATCATTGGGATAGACGAATCAGGGAGCTGACAAGAGCAAA
TACCAATTTCAAACGATaTTGGTTTCGTGAACGCTGGTGTTTCAGTGTTA
AACACAGCAAGTCATATTCTTCTGAACAAACGAATCAAGAAGCTTGAAAA
TCATTGGGATAGACGAATCAGGGAGCTGACAAGAGCAAATACCAATTTCA
AACGATGTTTCGTGACGTCTGGATTAACCTTCTTCTTCTTATCACTTTTG
ACGGGATTCTTCTTGTGGCAACTACTGACACCCGGAACAGCATACCGATA
CTGGAAATGCCGGGATGGTTCTATACCGGATCATCAAGCAACATTTAAAT
ATAATCCTGACAGATTCTCCTTTTCGGTTTCGTGACGTCTGGATTAACCT
TCTTCTTCTTATCACTTTTGACGGGATTCTTCTTGTGGCAACTACTGACA
CCCGGAACAGCATACCGATACTGGAAATGCCGGGATGGTTCTATACCGGA
TCATCAAGCAACATTTAAATATAATCCTGACAGATTCTCCTTTTCGCTTG
AAGATGTGAATGGGATCGAATTTGATTTCAAGAAGCTGATGAAGAAGACA
GAACATTCGCAATACCCAATGATGGATTCTAAAGCTTGAAGATGTGAATG
GGATCGAATTTGATTTCAAGAAGCTGATGAAGAAGACAGAACATTCGCAA
TACCCAATGATGGATTCTAAAGCATACCCTGGCGTTCGTTATTACCTGAA
TGTAGACGTTTGTGCGTACGGCGGGACGCGTTCGACACAAGATATAACAA
CAGGTCAGAAAGTGGTATATGGCCCTGATGTATTCGCAGTTGACAAAGAT
TgcaaaaaagctttttattttGTCGAGTGGGAATTCAAATGGCGACAAAT
TTATTCGTCCAGATTTGTCAATTTCACGCATACCATTCACAACCCGTTGA
ATTTGACGTGTGTTTCTTAGCATACCCTGGCGTTCGTTATTACCTGAATG
TAGACGTTTGTGCGTACGGCGGGACGCGTTCGACACAAGATATAACAACA
GGTCAGAAAGTGGTATATGGCCCTGATGTATTCGCAGTTGACAAAGATTg
caaaaaagctttttattttGTCGAGTGGGAATTCAAATGGCGACAAATTT
ATTCGTCCAGATTTGTCAATTTCACGCATACCATTCACAACCCGTTGAAT
TTGACGTGTGTTTCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000094_pilon | genome | sc0000094_pilon:1101999..1109906 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 964-1209:7663 |
| Aaloc | 874-960:6875 |
| Aaloc | 706-873:6031 |
| Aaloc | 565-702:4101 |
| Aaloc | 481-564:3466 |
| Aaloc | 367-477:2757 |
| Aaloc | 220-363:2008 |
| Aaloc | 67-216:1344 |
| Aaloc | 1-63:1 |
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