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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000238_pilon:179294..184058+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042362 ID=XLOC_042362|Name=XLOC_042362|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4765bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000238_pilon:179294..184058+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGATATGATGGGAATCAATTTGACGCAGCAAAATTTgctcatttt
tggactttgtttgTCTTGTTTGGTTGCGCCCTTGTCTGCGGTAAGATTCT
TGCAAAAGATTATTTGGGTTATCAATCATTTTCCTGGGATCGCTCTTGTC
GCTTATTGTACACGTTTGTCGGTTTAAATTTGAATGGTCGGTTATCGCTT
AAGGCTTAACTTAAGATGATTTTTACAAAGAACAACCCCTGTCCATCGGA
GTAGAGACTTTCCGCTATGTTTTCCCGCTTCGATTACACATAGAGACGCC
TCGGTTGGGCGATACGTGCGTTTTTCATTTGGAGATGGAAggctgttgtt
gtttttgtttttgatttgacttGGAGGCGATTAGTGCGGGATAATGAGAT
GACTTAATCGGATTAAGAAGACGCTAATAACTTTCCAATGGCTTGTTTTG
GTGCACTCTCTACCTTCCTTCTTTTTGATTATGTTTTATTATGTTTTCTT
TAGAAGAGTCTCTTGTTGTTGAATTTTGAGCTTGTTTCTTCTGCCTTCGT
GACGACTTCAGCCCTCACGGCCGTTCGTGATTTCATTAGTTAACATCTTT
CTTCCGCCCTTTAACATGACACTCCTTTGATATTGCTTACCTATTCTCTG
AAACCTCAAAAGTATAGGAGCCGGTGTTCATTTGTTTGATGTCCGGGAAT
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GTGTACTTTTAATAGATCgtcttaatgaccaattagtggTCACGTAATTC
GCATGATTTATGGAAAAAGTTAAACCTCTTTTCAAGTGTTGTTACCTATT
TTTAAAGTTGTTTGTTTGGCTGGCCTAATAAGATGTTCGTTATAAGAAAA
CGATTAATATTGATTATAAAGAAATGTGTTTTCGCTTTCGATTTGTAACA
GGGTTAAGatacttttgatattttttcgtgCTTTATACAATCTGTTGATT
GGAGGTAGATTAGTAAGACTTTTTCATGTCGCTCTTTGATAATCGGTGAA
ACTTATTTATCGAGTTTTATTTCGTGCTCTTCTTATAAAATCCAAATCGT
TTTGACAAATTGTTCGAAAATTAAATCTTGTCATGTTTTCGTTGCATTCT
TGCTTCTgctgatgtaaacaaaccaaatcaaatattTCGGCCTAATCACT
CACTTCCGCTTTTCCgacaaaatgaacaaaatagCTAACCTCTCCATCCC
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TTTTTAGAAATGGTGAGTTTTTGTTAACATTCTTAGTGATTTAgcactga
agattgccatcctggatggcatgaaactttgagtacgaaattaacttaaa
ttgttttctttctgaAACTAGTGATTTGGTAATCTTAGAAAACTATTCGG
GcaaaaccctttttttaaataattcaaGATAGTTTTTCTCTGGAATGGTG
TGGGGACACAACTCAATTACTGATTTTCGTCACTaataaatattctttca
aacAGAGAGACAATATCATAGAGGAATCAATTTGAATTACGTCAAACTCG
CCCACTCTTTTCGTTTCCACGTTTTTAAGCAGTAAAAGTTCATCGATATA
GATACCACTTGTACAAGAACTCCACCTCTCAAGAACTTAAGTGGGGCGCA
AACCGGCCAACATGTTGGCCGAAATGTTGGTCGAAAATGTTGGCCGGTTT
GCGCCCCACTTTAACCTGGCAGCCTCTTTAATTAAACGTGAGATTTTGCA
CGAACTTACTGAAAAGCTTGAAAGCATAAAAATCGACCAAACAGTGACAA
ATCAAAGGTTTCTTTGGATAAATAAAACCGATCACAGAACATGgacattt
aacattttttgatgGTCAAAGGTCACAGTTTTGAATGTTTCTTTTCTGTC
AATCAAACTTAATTCTTTGGCGTTGGATTTCGTTGATGAAATCAATTGGT
CgtggtggtgacgtcatcactgAGTTCTTGTGTGTTCTTATTGGTTGATT
TCCTACTAAACCTTTGAAGTGCTAAGGATAGTGCTGGAAACGAACGAACC
CATGCATAATCCCACACATAATTTTTGGGTATTACATAGGGtataaaaat
tttgtgattgaCTTATTCTTATTGAAGTCTAATTagataaatttcatttt
gatcagCCAAATTTTTAAAGTGTTCAATTTAAATCTATCGAACTCAGCAT
ATTGATTCTGTTTTAAATTAGGATAgattttccactggaaaaatagttTC
TATTTATGAAAAGGTAGCACTCCTTGATCAACAGGCTCCAATGGCATCTT
TTCATTGTTTGGGTTTGTTTATTTTAAGTCGGTTGTACATAGACGCGTGG
TGCATGTAGCGTGCTGTTTAAGCTGACAGCTTACGTGATGCCGATGATAA
AAAAGCTCATGTAAACATCCCTTTATGGAAAGTTCGTGTAAACAAGAACC
CCACCTCTCGCTTgaatatatattattttcattccGAGTTAGTCCAAAAG
TAGGGAGATGCTAAGAAGCTGTTGAGGATCCAAATGTTATAGATGTCCTC
CCCATTGATGAGTTATGAAGTATTTGCGCTACTACGAACttcttttgttc
tgtttttCTGTTGAACCTAATACCTGACATACCATACATTCATGGAGAAA
TTCTTTGCCAGATGGtttttttGGCAAAGAGTTGTGGTCGTGGATTTTTA
TGATGGTCTGAATGAATGAggctgtttgtttgtttgtgtcTGTCAAATTA
ATGGaaggaaaattgaaattccTTGTTTGAAGAAATGAGATTAAGGATAA
TCGGCCCTTGATCGTTTCTCGGTTGCTATGGTTACAAGACGATGCAGAGC
AGGCTGTCATAGGTttaagaaaaatgagaaaactttCCTAACGATCATTC
CCTTTCATTTGCAGTTAAATAcccccccccTCACTCCACATACTCgttca
aatataaaacaaaattcTCACATGAGATTTCTTGAATAATTTCTAAAACA
TTATTATTCTCTCAATTTTAGACGTTCGAAGCGTGTCGAAGGAATTCACA
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tggaattttttcctatcttATATGGTCAGTGTTGTTTGAATCTCATCATA
GAGACGTCGAACTATGGTCCCggtaaaatttataatttcaaatttctccA
GTGTATTTTGAAACAGATGTTTttacttgtttttctttaatttgagaTTT
CACATTGGGTGATAAATGGCGCTTCTCATAACATTTTGATTCGAACATTC
TTGAAAGTAGCGGATTTCTTTGACAGATTTACTTCCTGCTTTTAAAGTAC
CCAGAATCTTTTACTTGCTGTGAATGACACCACAACCTAATAAAGGGATG
AATTTTATCAATTGGATTTAATATGACTAATTCGTTACAAATCTTTTCAC
GTTTTGCTCAAAAGAGAAGAAGCTTCTTTTCCTGTTATTCTATTTTTGTT
ACTTGTGGCATTCTATCCGTGTTATTGATGCGccgaatcaataaaaagaa
tCCTGAGGTCACCATTTTGAGATAAGGATGAAAATTGTCTCAAAAATTTG
TTTACGGCAAAGATGAGaagtcaaaatatttcaagtattaaaaaattgct
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CCCCCTGGACAGATTCAAAAGATCTACAGTATCACAGTTAGAATTCACTT
CAAACCGGGGGTCATTTAGTGAACTATATCCGACCAACTTGAGGTTTTAG
GCGACACTCCTTGATCtgtgagaaatttcaaaaatgacaaaaacaagtCA
GTTGTTTACGCTGAGCAGTTATTTTGAAcgcttttcataaaaaaatcagt
tATTGTCAACCCTCAGAATGCGAGATAAGAAAAATGCCTGAGGCTTTATG
TTTTATAATGTCAAAACATGTCAAAACAAAGAGATAAAAGTCTGGACTTG
GATATTTAGATACAATCAGATTGTAATAACATTCGCGTTATGTTCCTTTA
AAACCTTTTTAACCTTTTCACTCAACGGAATATTCACCGCTTTACTGACT
TGACCTTTTCGCCCGACGGGATATCCGGCCGCTACTCATATGGCCAAATT
AACAAATTCTTTCTGTCAAAAATAGCGCCCATGGTCCATTAATATAATTT
CGTAttaatttgaacaaattaaTTTGTTTGAGAATATCTGAAATATTTTC
ATGGCAACCCGGACATAAATCAACCTTTGATTTTAAATGAAGATGTTTTT
CCACGCTGTCAGAATAACCGGAATCACGAAGgttaaaatacaaacaaaat
taaTTGGTCATGTTTATTGAAGAACAGAAATTATAAcatttctgtttaca
ttttcagttatcaaagaCGTTTGGTTGCGGGTGTGAAGAGGGCTTAACGT
GTGCCATCGTTTCACGTAAGGGTCCATACACACGACTACGTTGCGTTGAA
ATTCCTGCGACGGTCAAAGTGAAGATCGACGACAAACAAAAGAATTCAAC
GGACACTATCACCAAATTATTGACAGCTTACGAGCTGAGACATTTATTAG
AAGTGATTAAAGAACGACCTGTCATCAAAACTCCAGTCAGTAGTGACACC
CCTGATGAAACATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000238_pilon:179294..184058+ >XLOC_042362 ID=XLOC_042362|Name=XLOC_042362|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=942bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000238_pilon:179294..184058+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGATATGATGGGAATCAATTTGACGCAGCAAAATTTgctcatttt
tggactttgtttgTCTTGTTTGGTTGCGCCCTTGTCTGCGATGAGAGATA
TGATGGGAATCAATTTGACGCAGCAAAATTTgctcatttttggactttgt
ttgTCTTGTTTGGTTGCGCCCTTGTCTGCGACGTTCGAAGCGTGTCGAAG
GAATTCACAATGCAAGAAGGGATTTTGTTGTGCGGGACCCCCGTCTTTTG
GTTTTTGTATGCGAAACAAGAAGCTTGGTGAATTATGCAGTGCGTCACAT
TTGACGTTCGAAGCGTGTCGAAGGAATTCACAATGCAAGAAGGGATTTTG
TTGTGCGGGACCCCCGTCTTTTGGTTTTTGTATGCGAAACAAGAAGCTTG
GTGAATTATGCAGTGCGTCACATTTGttatcaaagaCGTTTGGTTGCGGG
TGTGAAGAGGGCTTAACGTGTGCCATCGTTTCACGTAAGGGTCCATACAC
ACGACTACGTTGCGTTGAAATTCCTGCGACGGTCAAAGTGAAGATCGACG
ACAAACAAAAGAATTCAACGGACACTATCACCAAATTATTGACAGCTTAC
GAGCTGAGACATTTATTAGAAGTGATTAAAGAACGACCTGTCATCAAAAC
TCCAGTCAGTAGTGACACCCCTGATGAAACATGAttatcaaagaCGTTTG
GTTGCGGGTGTGAAGAGGGCTTAACGTGTGCCATCGTTTCACGTAAGGGT
CCATACACACGACTACGTTGCGTTGAAATTCCTGCGACGGTCAAAGTGAA
GATCGACGACAAACAAAAGAATTCAACGGACACTATCACCAAATTATTGA
CAGCTTACGAGCTGAGACATTTATTAGAAGTGATTAAAGAACGACCTGTC
ATCAAAACTCCAGTCAGTAGTGACACCCCTGATGAAACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000238_pilon | genome | sc0000238_pilon:179294..184058 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 214-471:4508 |
| Aaloc | 91-213:3072 |
| Aaloc | 1-90:1 |
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