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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000044_pilon:1229386..1230939+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042282 ID=XLOC_042282|Name=XLOC_042282|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1554bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1229386..1230939+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTTGGCTTTATTGAATGGTTGCTAATCTGTTTACCGCTGGCATTTCA
TTCTTTCACCCTTCATCATCTTACCTTACTCACAACCTCTTTTATTTTAA
CACTATTTGGACGAAGTCAATCAAACTTAAGATGGAACTACCAATCGAAG
ATGGAATTATTGTTTCGTTGTTTCAGCGATGATGGTTTTGTCTACCCTAT
TGTTGTCTTCCCAACATTTTTCTGCATCAAAGATTCTTTGCAAAATCTGC
AAGGAGACTCCAATGGTTACTTTTACGCTGTCATGACATCAACATTATTT
GCAGTATTTGGtttttttGTTTGCTTTGGACCTTTGATGACTATATTATT
ATTTGCTACTGTGTTCATTATTATATCCCCAACAATAACAACTGGATGGT
TCATTGTCATTTTAGCAACGATTGCagtctattttgccttatttttcaCC
ATTGTGAGACATTCGCCAAACAGTTTCACTTTTGGAGAAGCTGGTTTAAT
AACTCAAGTTATTGGTTATGTTTTGATGAAATTCACAAAGAATATATTAT
ATACCCTTCAAAACAGTATTGCAATTTCGAATGACAATATACATCTACAG
TTTATATTTGTACTCTTTGGGTCAACCTGTTTAACAATAATCATTCTATC
ACCTATTTTGTATTGCAAAAGATACTGGTGTCCTCAATATATTGATCAAG
TTGTGGCTTCTATTTCCTTTTACATCGGATTGGTTTTGAACCTTATTTTC
GTTTTTGTTCCAGCTTTTATTTACCTTATGAATGAGGCAAATATTTTAAC
GTGGCTGTTACAAGAAATTACAAAAACTCAATTTCGTCTTGCACTGATGG
TATACTGGCTGATTCTAACCATTTCATCCTTTGCTGTAACTTGTTGGTTT
TTATCTGGAGAGAAACACATAGAAAAGACTGTTatacgaaaaatatttca
tggAATAGCGTTTTTGATCTTTTTACCCGCCTACAAAGATGTTGAATTTG
TTGCTCTTGTGACTGCACTTGTTTTTGTTGCTTTCATTTTCATCGAATTG
GTCAGAGTGAATAATATTGAACCAATTGCAAGAATATTGACACAATATTT
GGAACCATTCAGAGAACAACAGGACAGTGGTCCATTGATTTTGACGCATA
TTTATTTGTTATCTGGTTTATCTTTTCCATTTTGGTATGCTTTATCCGAG
GAGAATCTAAACAATCCGACAAACCTTACTTTATTCCAATTTTTGACAAT
CAACGCTGGGGTTGTTTCCTTATGTGTTGGTGATACGTTTGCATCTATTA
CTGGTAAACTCTTTGGAACTCAGACATGGCCAAACCGAAGTAAAACCTAT
AAAGGAACATTGGGTTGTTTCCTTTCAATGTTGATATTTAGTTTGATTTC
TATATtctattttcaatttcatgtaGATTTATACCAAATAATTTTATTAG
TAtttttttGCGTTTGTGTCAGTTTATTGGAGAGTATTTCAAACCAgatt
gataattttttgttacCGATTTATGCCCTATTATTGTGTAAAATGTTTCA
ATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:1229386..1230939+ >XLOC_042282 ID=XLOC_042282|Name=XLOC_042282|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3108bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1229386..1230939+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTTGGCTTTATTGAATGGTTGCTAATCTGTTTACCGCTGGCATTTCA
TTCTTTCACCCTTCATCATCTTACCTTACTCACAACCTCTTTTATTTTAA
CACTATTTGGACGAAGTCAATCAAACTTAAGATGGAACTACCAATCGAAG
ATGGAATTATTGTTTCGTTGTTTCAGCGATGATGGTTTTGTCTACCCTAT
TGTTGTCTTCCCAACATTTTTCTGCATCAAAGATTCTTTGCAAAATCTGC
AAGGAGACTCCAATGGTTACTTTTACGCTGTCATGACATCAACATTATTT
GCAGTATTTGGtttttttGTTTGCTTTGGACCTTTGATGACTATATTATT
ATTTGCTACTGTGTTCATTATTATATCCCCAACAATAACAACTGGATGGT
TCATTGTCATTTTAGCAACGATTGCagtctattttgccttatttttcaCC
ATTGTGAGACATTCGCCAAACAGTTTCACTTTTGGAGAAGCTGGTTTAAT
AACTCAAGTTATTGGTTATGTTTTGATGAAATTCACAAAGAATATATTAT
ATACCCTTCAAAACAGTATTGCAATTTCGAATGACAATATACATCTACAG
TTTATATTTGTACTCTTTGGGTCAACCTGTTTAACAATAATCATTCTATC
ACCTATTTTGTATTGCAAAAGATACTGGTGTCCTCAATATATTGATCAAG
TTGTGGCTTCTATTTCCTTTTACATCGGATTGGTTTTGAACCTTATTTTC
GTTTTTGTTCCAGCTTTTATTTACCTTATGAATGAGGCAAATATTTTAAC
GTGGCTGTTACAAGAAATTACAAAAACTCAATTTCGTCTTGCACTGATGG
TATACTGGCTGATTCTAACCATTTCATCCTTTGCTGTAACTTGTTGGTTT
TTATCTGGAGAGAAACACATAGAAAAGACTGTTatacgaaaaatatttca
tggAATAGCGTTTTTGATCTTTTTACCCGCCTACAAAGATGTTGAATTTG
TTGCTCTTGTGACTGCACTTGTTTTTGTTGCTTTCATTTTCATCGAATTG
GTCAGAGTGAATAATATTGAACCAATTGCAAGAATATTGACACAATATTT
GGAACCATTCAGAGAACAACAGGACAGTGGTCCATTGATTTTGACGCATA
TTTATTTGTTATCTGGTTTATCTTTTCCATTTTGGTATGCTTTATCCGAG
GAGAATCTAAACAATCCGACAAACCTTACTTTATTCCAATTTTTGACAAT
CAACGCTGGGGTTGTTTCCTTATGTGTTGGTGATACGTTTGCATCTATTA
CTGGTAAACTCTTTGGAACTCAGACATGGCCAAACCGAAGTAAAACCTAT
AAAGGAACATTGGGTTGTTTCCTTTCAATGTTGATATTTAGTTTGATTTC
TATATtctattttcaatttcatgtaGATTTATACCAAATAATTTTATTAG
TAtttttttGCGTTTGTGTCAGTTTATTGGAGAGTATTTCAAACCAgatt
gataattttttgttacCGATTTATGCCCTATTATTGTGTAAAATGTTTCA
ATGAATGCTTGGCTTTATTGAATGGTTGCTAATCTGTTTACCGCTGGCAT
TTCATTCTTTCACCCTTCATCATCTTACCTTACTCACAACCTCTTTTATT
TTAACACTATTTGGACGAAGTCAATCAAACTTAAGATGGAACTACCAATC
GAAGATGGAATTATTGTTTCGTTGTTTCAGCGATGATGGTTTTGTCTACC
CTATTGTTGTCTTCCCAACATTTTTCTGCATCAAAGATTCTTTGCAAAAT
CTGCAAGGAGACTCCAATGGTTACTTTTACGCTGTCATGACATCAACATT
ATTTGCAGTATTTGGtttttttGTTTGCTTTGGACCTTTGATGACTATAT
TATTATTTGCTACTGTGTTCATTATTATATCCCCAACAATAACAACTGGA
TGGTTCATTGTCATTTTAGCAACGATTGCagtctattttgccttattttt
caCCATTGTGAGACATTCGCCAAACAGTTTCACTTTTGGAGAAGCTGGTT
TAATAACTCAAGTTATTGGTTATGTTTTGATGAAATTCACAAAGAATATA
TTATATACCCTTCAAAACAGTATTGCAATTTCGAATGACAATATACATCT
ACAGTTTATATTTGTACTCTTTGGGTCAACCTGTTTAACAATAATCATTC
TATCACCTATTTTGTATTGCAAAAGATACTGGTGTCCTCAATATATTGAT
CAAGTTGTGGCTTCTATTTCCTTTTACATCGGATTGGTTTTGAACCTTAT
TTTCGTTTTTGTTCCAGCTTTTATTTACCTTATGAATGAGGCAAATATTT
TAACGTGGCTGTTACAAGAAATTACAAAAACTCAATTTCGTCTTGCACTG
ATGGTATACTGGCTGATTCTAACCATTTCATCCTTTGCTGTAACTTGTTG
GTTTTTATCTGGAGAGAAACACATAGAAAAGACTGTTatacgaaaaatat
ttcatggAATAGCGTTTTTGATCTTTTTACCCGCCTACAAAGATGTTGAA
TTTGTTGCTCTTGTGACTGCACTTGTTTTTGTTGCTTTCATTTTCATCGA
ATTGGTCAGAGTGAATAATATTGAACCAATTGCAAGAATATTGACACAAT
ATTTGGAACCATTCAGAGAACAACAGGACAGTGGTCCATTGATTTTGACG
CATATTTATTTGTTATCTGGTTTATCTTTTCCATTTTGGTATGCTTTATC
CGAGGAGAATCTAAACAATCCGACAAACCTTACTTTATTCCAATTTTTGA
CAATCAACGCTGGGGTTGTTTCCTTATGTGTTGGTGATACGTTTGCATCT
ATTACTGGTAAACTCTTTGGAACTCAGACATGGCCAAACCGAAGTAAAAC
CTATAAAGGAACATTGGGTTGTTTCCTTTCAATGTTGATATTTAGTTTGA
TTTCTATATtctattttcaatttcatgtaGATTTATACCAAATAATTTTA
TTAGTAtttttttGCGTTTGTGTCAGTTTATTGGAGAGTATTTCAAACCA
gattgataattttttgttacCGATTTATGCCCTATTATTGTGTAAAATGT
TTCAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000044_pilon | genome | sc0000044_pilon:1229386..1230939 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1554:1 |
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