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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000044_pilon:1289967..1295905+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042262 ID=XLOC_042262|Name=XLOC_042262|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5939bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1289967..1295905+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgatacTGAGGTCTGTCATTTTGTTGGTTGCTTTTTGCTCATTGGCGAA
TCAAGGTTAGTGTATAAAAATACAGTTGAATGCTGCTTGAAGTTTGAGCT
GTTTGAAAAAGGCTCGGCTCGGGTTAGAGTCTACTCCTGAGGACCTAAAT
AagtgctaattaatttttgaaaatggggaCTAATATGTTTCTCAGCAAGC
GAGTGCATGTTCTGAGTTCTCAAGTTTTAAGAAGAAATGTCATATAAAGT
ATTATTAAAGTCTACTGTATTTCTTCTTTCAGCTAATGGATCACCGGCCA
CGAATACCAACAAACAACTAGTTGTGTACTGGGGACAAGATTCAGCTGGT
TCACTTCGACTCACTCTTGAGAAAGGATTAGATTATTATTGCAAGAACTA
TGATTATGATATCATCCCAGTAGCTTTCCTCAACGTCTTCTTCGACACTG
CTAATAAAGGTATATGTCCTGTTTTTGTCTCTcattaaaatagaatttct
tCAGGGGGTATTTAGGCAAGACAGGTGACAGATACGTGAGAGCCATAAGG
GCACCCTTTTTCATTCCgcaaaagtccctcaaaggggtacaaattcatag
attagtctctcaaagggtcccaaaatcactaagattgaaaatttccctgt
caaagggagaaaaatttgaccaagttttggaaaaaaccgcccaaaattct
gacaaaaatctctcaaagagtctcaaaaatgtcaaaatcttttaaacttt
caaagggtcgattttttatttttggctctgcgtcacctcgcaaacctatt
ACCCCCGGGAGGTTTTGTTCAAATAATATGTAAAAACATGTTATTGATGT
GAGTTGCACGTTCGATTTTGCCAAAAAGTGTTTGCAAATTATTGCATATG
ACGATAACATGCCTTTACACAGTTGAACAAATCTGATACATACATATTTC
GAAACAAACAAATGCGTTGGTTTGTGTTTGTACCTTATGATGTGGTTGTT
GATAAATAAATACTTGATGTGAACGTAATGTATGTGTGATTTGTCTAACA
CGCTATGAAAGTGATAGTCAGAACTTGTTATAGCATGTCTTTTCGGATaa
aaaaaaCCAGAACTTCAATTTGCATTGAAGTGTAACTAGTGTAACTACCA
GAGAAACTAATCATAATGCTCAAGTCAAatctctttctaattcgaatacc
cctcagctggaaagtcaTATGAAATACTCTCTGAAATTGGAATCTCTCTC
TaacttgaagaaaattcttgatcCTTTGAAGAAGAAGGctcttctttcga
tagctatctacccgaaggtaggggagggcgccagaCTTTCTCCTTGattt
gctccacttaccctttatCCTTCTCTTAATCTTAAGAAGATGGAAAAAGA
GAGTGAGTCAACTGTATTGctaaagaaagttttaagtgatATCGATCAAG
TTCGAATTTAAAACCCGGATTCTAGAGTGGCGTGAACCATGAAATTCATG
AAATTGTGGAGGGATGATCTCACCAGCTTTTGCCTGTAAAGGAAAGATTA
GGCCGTATCTTGAAGGTAGAGTATCCAGTGCGCAAGGTTATGGATTTGAT
CCTTGGCCGGATCGTACCAAAAACTTCttacaaaatggtacttgatgctt
ctCTGCTTGGTGCTcaacaattaagagaaggatcaagggtaagtggagct
aCTCAGGGAGAAAGtctggcgccctcccctaccttcgagtagatagctat
cgaagaggagccttcgggtcgcctccgactgcgtcGCAAACTTCTTACTA
CTTACTTAAAAGATTAGGACCTATTGAATAATAGTTCTTTACGAACACCT
GATGCCAAGAGAGAGGATGGTCATGTGACAGAACCACCTGCTTATGTTCT
TCCGCTTTTGCATTATCATTGAAGCAAAAGTttactttaagggaagaaac
ttttgcgaaaagaaactttcgcgaattcaaaagaattttaaacGGTTGAT
ATTTTAACTCAACTCAACAAAACTCATTCAGGATCCACATATACTCCGGA
CCTGAATATGCTTATAAAGTATGTAATGTGTTAATTAACCGTTTTGTTCT
CGTTATAAATCAATTATCTTATCGTATTACCTCAAAATGTCTATGTTTTA
GTTCAGCAGACCAGCAgagtagaaaaaaagaaaagctttTGAGTCTCGCA
TAGATGAGGTAGACAGATTTTTAGAGCGattccaattttcgggtcaggac
tgaagttgcttagcattctagctcattttctggaAAATTGGCTTTGACCA
CCCTTGATATTTTACCATATTAatgcttacacgtttttttatcgaatttt
ttagttttaagcctaaaaatgttcttaacatgttcttacttttgtcattt
ttgagtatttttgtctatctTCTTTTGAAATCGGTgctttagagtccgca
aagccttaaaatgtttttaacttgttctagcattttggccatcgaagcct
tatgttcttatatagtttgttcttataaaaaacgtgtattgggtcaaggg
ctatcgttttCCATGCttaaattatctaaaaagcttttactttacgagtt
TAATTGATTCGAGGACTACAGCCTTAGCGACCGATGATGTGTAAATGCTT
ATATTAAGCGGTAGATTTTTGACATGATAAAGGGGTAGtgtatttatttc
attttgctATGCTAATCATATATCTTTTCGAAAATGTCTGTATCTATCAA
TCATTATGTGTAAGATCAAAATACTTTCTACTCATTACATGTTTTAGTTT
CAAAAAAGATCCGTTTCGTGAAAATATATTCATGGTTTCTCCTTGGTTGA
TTTGAGATTTAGGAAaggctttttgagttttttttgtgATTGTTGTATCG
CGTTTACttatctttctttttcagtaattttaaaGAGTTATATTTGTAAA
ATGACAATATGAGAGCCACAACCATTTACAGTCTTTGTTTATTTATGTCA
TTTGCTGGATATTGGAAATTTGTGGTCACGGAAGAATCCTTTTCGATGAT
CTGTCCACAAAGAAGAAATATCACCATCATCCCATACTCTATTTTTAATG
ATTATAATGAGGATAAGCAAGAATTTCCCAGTCAGTATTACATGACGTAT
GGATTGCAACTGAGCTACTTAGTAAaagttttgcataaattatctTGTTC
TCAAATTTGGGTTTATTCGCCAATTCGAAACCTTTGCATTCGTTTGACTA
ATGAAAATtatatgcagttctttgaaagtGATTGGATGGCCATGACATGG
ACAGATGATAATGACATTTTGAATCTCTTGGCTAAAATTCCTCACAGTAA
TGACCATTATGAACAAACTCTACTCTTTGCAACGTACGAAGCACCTTTAA
TTTATCTTAAAAGCAATTCttcaattatttcaaaaacattgCAAGATATG
AGAACCAAAGTCAATATCATATTGGTTTGCACAGAGCTTGTAGACCTTTG
TAAACAAAGTGAAACATGGTTACCAAAACATAACATTATTCACACAGACT
ATACTTTTGTCCCTTTTAACCCTCatttacatcaaaatttattggatGTG
GTGTTGAACTCTCAATATAATTGGCTTAACAGATATCTGAGTTCCTTGAA
TCAATGCCAGCCTTTAAATAAGACATCTAATATCTTCGTTTGGTCAATAT
ACACAATATACGAGGATGTTAATGATCAAAGTTATTTTTCTATTGCCCGA
TTCATACATAGTAGTTTGGATGCTTATTCGGGTGTTTTCTATGGCCGCAA
AAATATGGCTGAATATGAAAACCTCTATTATATGAAGTCAATGAAAGATT
GGTTCGAAAATTCAATAAAGATAGATGAACACTCAGAAGAAATAACGCGC
CGAGTGAACAGAATTGGAGGCGATATTCAGATACACATTTGCatttttcc
acaaaaatttaCTCCAGATCTCAACACTCCACCGTTTTCATTCAATAATA
CAATTAAAGTCATGATCGATAACAACATTAAGGAATCACCGATGCTTTAT
GAAGATGGACTTATTAAGATCTGGGATACAGACTACATCAGTCCTTTCTT
CAACAAGATGCTTTCACAAAGAATAAACTCTATTTTATGTAATTAAGATC
TAACCAGTCATTATTGTTTTAGTTTGtaacagaagaaaaaatattatatc
aaaaaaatcttcaacTTTTACCGGTTGACCCACAAAAACGTAAAGAGTAA
TTGTATCCGTAATTCCgtgaattttaacaaaatatacGTTTTAAAAAGTT
CATCAGGGTTACTTCTGCttttttttCCTATTCCAACTCTGAAACTTCTT
ACATCATGAACGGCTTCAAACTAGTACTGCTAAgctttttgttttccttt
aaaCTTATCATAAGCATCTTTTGTTATTGTCTTTTACAGATAAATTTCCT
GGTATCAATTTGGCGAACCATTGCAATACAACATTCAAAGGATATCCAAC
ACTATTGAACTGCACAGACATTGGTCAACAGATTCAAACATGTCAAAAGT
CTGGCAAAAAGATTCTACTGTCTTTGGGTGGAGCTGCTGGATTATATTAC
TTCAGTAGTTCATCACAAGCTACTCAATTTGCCAGTACTGTATGGAAACT
GTTCCTCGATGGTACCTCCAAGATCAGACCCTTCCACAATGCAGTATTAG
ACGGTGTAGATCTTGATATTGAAGGTGGTACTACAACGTATTATGCAGAT
TTCGTTAAAGCTATCCGACAACTTATGAACACTGACAAAAACCGTAAATA
CTTTATTACCGGTGCACCTCAATGCCCTTATCCTGACGCCATTATGGGCC
CAGGTGGCACCAACATGGTCCTAACGACAGTACCTCAAGAATTTGATTAC
CTTTTTGTGCAGTTTTATAATAACTATTGTTCAATCGATAAGACGAAATT
CTTTAATCAAAGCATTGCAAGTTGGTTTAATTTTGCAATGACCACCAAAC
AAAAGTATGGCAAAGGACCTCTTATTTTCATTGGTTTGCCGGCTTCTCCT
CGCGTTAATGGTTATCAATCACCTGATGTCGTCAGAAAGGCTTGGCAGGT
AAGATTATTGCTAACTCCCCAAAATTACAGAGCTGGTGTTTCCCCTTACT
GGAAACATCAGTCATATTATTCATCCAACAGTGAGAAAGAATCTACATAT
TTTGAAAACTAGATATTTCAAGGCTAGTAATACAATCTTGATTCGTAAAT
GTTCTTTCACACTAGAGACGACTATTTTAGCCAAATTTCTAGAGGTTAAT
TAGTACCACCGGGTCAGTGATACTGGGATGTATCATAAAAAGTTTCAGAC
TAATAAATCTCGTTCAATACTCAAAATAATACCTCGAGATTCTCTTGTTT
ACAATTGAGCAATTGTCTCAAACCCAGCTTTGAACCAACGTATgtgtcat
tttttaaagaaaaatatgcaTTGTATTAACTAAAAGTTCAACAGAAAAAT
TTCCCTCGACACTGcatgtttactttgaaaaataatcATACATTACTTTA
ATTGGTTTTCTCCTATTTTTTCTTAGACTGTAAAAACAAACGAGAGCCTT
GGTGGATTTATGTTATGGGATGCGAGCTTCGATATGAACAACGTCATCAG
TGGACAGCATTACAGTACCATAATCCGTACTATTATGAACGACCAATATA
AAAGCATTCATCATTCGGTCACGGATTTCTTTTACGTGATTCGCGTGCGT
GGAGACGGTAATTTCTTTACGCGCGTTCACGTTTCGCACGCTTTACTGTT
gggtttgtttttggttgttttcgttTTGCTTCTGGCCGTAATGATGCGCA
TGTCTCGACATGAGAAATTGCTATCGGTGAAAAGTCAAGAAGTCAAAGTT
AGTGGAGATAAAAAGTATGTACCATTGGGATTCTATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:1289967..1295905+ >XLOC_042262 ID=XLOC_042262|Name=XLOC_042262|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2508bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1289967..1295905+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgatacTGAGGTCTGTCATTTTGTTGGTTGCTTTTTGCTCATTGGCGAA
TCAAGatgatacTGAGGTCTGTCATTTTGTTGGTTGCTTTTTGCTCATTG
GCGAATCAAGCTAATGGATCACCGGCCACGAATACCAACAAACAACTAGT
TGTGTACTGGGGACAAGATTCAGCTGGTTCACTTCGACTCACTCTTGAGA
AAGGATTAGATTATTATTGCAAGAACTATGATTATGATATCATCCCAGTA
GCTTTCCTCAACGTCTTCTTCGACACTGCTAATAAAGCTAATGGATCACC
GGCCACGAATACCAACAAACAACTAGTTGTGTACTGGGGACAAGATTCAG
CTGGTTCACTTCGACTCACTCTTGAGAAAGGATTAGATTATTATTGCAAG
AACTATGATTATGATATCATCCCAGTAGCTTTCCTCAACGTCTTCTTCGA
CACTGCTAATAAAGATAAATTTCCTGGTATCAATTTGGCGAACCATTGCA
ATACAACATTCAAAGGATATCCAACACTATTGAACTGCACAGACATTGGT
CAACAGATTCAAACATGTCAAAAGTCTGGCAAAAAGATTCTACTGTCTTT
GGGTGGAGCTGCTGGATTATATTACTTCAGTAGTTCATCACAAGCTACTC
AATTTGCCAGTACTGTATGGAAACTGTTCCTCGATGGTACCTCCAAGATC
AGACCCTTCCACAATGCAGTATTAGACGGTGTAGATCTTGATATTGAAGG
TGGTACTACAACGTATTATGCAGATTTCGTTAAAGCTATCCGACAACTTA
TGAACACTGACAAAAACCGTAAATACTTTATTACCGGTGCACCTCAATGC
CCTTATCCTGACGCCATTATGGGCCCAGGTGGCACCAACATGGTCCTAAC
GACAGTACCTCAAGAATTTGATTACCTTTTTGTGCAGTTTTATAATAACT
ATTGTTCAATCGATAAGACGAAATTCTTTAATCAAAGCATTGCAAGTTGG
TTTAATTTTGCAATGACCACCAAACAAAAGTATGGCAAAGGACCTCTTAT
TTTCATTGGTTTGCCGGCTTCTCCTCGCGTTAATGGTTATCAATCACCTG
ATGTCGTCAGAAAGGCTTGGCAGATAAATTTCCTGGTATCAATTTGGCGA
ACCATTGCAATACAACATTCAAAGGATATCCAACACTATTGAACTGCACA
GACATTGGTCAACAGATTCAAACATGTCAAAAGTCTGGCAAAAAGATTCT
ACTGTCTTTGGGTGGAGCTGCTGGATTATATTACTTCAGTAGTTCATCAC
AAGCTACTCAATTTGCCAGTACTGTATGGAAACTGTTCCTCGATGGTACC
TCCAAGATCAGACCCTTCCACAATGCAGTATTAGACGGTGTAGATCTTGA
TATTGAAGGTGGTACTACAACGTATTATGCAGATTTCGTTAAAGCTATCC
GACAACTTATGAACACTGACAAAAACCGTAAATACTTTATTACCGGTGCA
CCTCAATGCCCTTATCCTGACGCCATTATGGGCCCAGGTGGCACCAACAT
GGTCCTAACGACAGTACCTCAAGAATTTGATTACCTTTTTGTGCAGTTTT
ATAATAACTATTGTTCAATCGATAAGACGAAATTCTTTAATCAAAGCATT
GCAAGTTGGTTTAATTTTGCAATGACCACCAAACAAAAGTATGGCAAAGG
ACCTCTTATTTTCATTGGTTTGCCGGCTTCTCCTCGCGTTAATGGTTATC
AATCACCTGATGTCGTCAGAAAGGCTTGGCAGACTGTAAAAACAAACGAG
AGCCTTGGTGGATTTATGTTATGGGATGCGAGCTTCGATATGAACAACGT
CATCAGTGGACAGCATTACAGTACCATAATCCGTACTATTATGAACGACC
AATATAAAAGCATTCATCATTCGGTCACGGATTTCTTTTACGTGATTCGC
GTGCGTGGAGACGGTAATTTCTTTACGCGCGTTCACGTTTCGCACGCTTT
ACTGTTgggtttgtttttggttgttttcgttTTGCTTCTGGCCGTAATGA
TGCGCATGTCTCGACATGAGAAATTGCTATCGGTGAAAAGTCAAGAAGTC
AAAGTTAGTGGAGATAAAAAGTATGTACCATTGGGATTCTATTAAACTGT
AAAAACAAACGAGAGCCTTGGTGGATTTATGTTATGGGATGCGAGCTTCG
ATATGAACAACGTCATCAGTGGACAGCATTACAGTACCATAATCCGTACT
ATTATGAACGACCAATATAAAAGCATTCATCATTCGGTCACGGATTTCTT
TTACGTGATTCGCGTGCGTGGAGACGGTAATTTCTTTACGCGCGTTCACG
TTTCGCACGCTTTACTGTTgggtttgtttttggttgttttcgttTTGCTT
CTGGCCGTAATGATGCGCATGTCTCGACATGAGAAATTGCTATCGGTGAA
AAGTCAAGAAGTCAAAGTTAGTGGAGATAAAAAGTATGTACCATTGGGAT
TCTATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000044_pilon | genome | sc0000044_pilon:1289967..1295905 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 892-1254:5577 |
| Aaloc | 235-891:4442 |
| Aaloc | 58-231:285 |
| Aaloc | 1-54:1 |
|
