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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000139_pilon:827258..834794- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042254 ID=XLOC_042254|Name=XLOC_042254|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7537bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000139_pilon:827258..834794- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAAGCAAAGATGATGAATATGATTATTTGTTTAAAGGTAATTGGAC
TTATCCATCTGTGACTGTATCATATCTGTGACTCTCCACCATTTGCAAGT
TAGAAAACCTGTGCTCACCTTCAGCAGCATATTACAAAGGGTTGCAACTT
ACTGTTTTGATGTTTGAAAAAGTTTTTGTCTGGCAGTATGAAGTCTGAGA
CATTCCTCAAGTTAACTTTAAGTTTGGTCATTGCTAGGACTGCTAGACTG
TAATAAAAGAATCCTTTGTGTACCGCCATGGTAAAAGATTGCACTGAACA
GGAGGACAAAGATTCAACTGCCACTTTTCTAGCAGAAAAAGACCAAAACT
TTGGGTAGTTGAAATTTTTTCAACCGTAGTCAACACAAGATTTTTTTGTA
CCTCTTCTCTTGTAAAAATCCTTTCCGAACCATGTCTGTCAGATATCAAG
GAAAAAATTACAGTAGCCGAAAATAAATTTCCAAAAAAGTCAGTGGGTTC
TAGTTCCTAAAAGGAAAGAAATTTAAAATATTAATATTCCCTCTTTAATG
AGCTCTTCCAGTGAAAGTCTATTACAGGGGGTGGACAACAGCAGAATTCC
GAGGTAAAATGTTTCATGAAATTCCTGGATTTCCAATATTAACAAAAGCA
ATTGGAACTCTTGGATTTCCCACATAAAATAGATTTTTTGGAATTTCTAA
CAAATTCTATGGAATTTCCAAAGGTTAAATTAAAAATTGAGTGGAATTAG
TGGCTGAATACACCTTTCCCGTAATTCAAATTTCTCAGAAATGGCCTGGG
AAAATGTGCGCTCCACCGTTGTGTATAAAATTGTTTTTGCGTTTTTTACC
TGCGGGGGTTAGGGAAAGTGGGATTTGAGCCTCTAACTTTTGACAGCGAC
CTTCTTTTGGCAAAATATTTTCAGGGTGGTATAATATCATGAATAGATCA
TGAACATACTAAAATTTTGAGGGGATTTTGTTTGACAGAACTTAAGAAAA
GCTAAAAAAACCAACTTTCCCTAAGGGAACACAGGTAAAAACGGGTTTGT
TTACCTCCAGAGACTAAACGGTGGAGAGCATCAAAATAATGCGCGCGCAT
TAGTTTTAAGAATTACGGGAAAGGTGTATTGCCGTGGTGTAATTCCCTTA
GAAAGTATGCAAAACATATTAAGTATTAATAAGTATTAATATAAAACTTA
CATGCATAATTGGCATTATATTAAAGTGTAATTTTGTAAAAGAAAGATTA
AATTTGCTTCTCTTGAAAACTAAAACTAATTATATTCGCTCATCTCTTAG
AACTTAAGCCCTTCAAAAATCCATAACATTAGACATAAACTCAAACTGAA
AAATCACCAGCGAAGGTAAAAATTAATCCTTATTCGGCTGACGGTAAATT
ATTCTCCTGGGAATAGAGCCGCCAAATGATCAAATCAAAACATTGATAAT
ATGTGACATCATAATTACTGCTTTTCAGTTTGGGTGTTGTGAAAGTTTGA
TGTGTGTACTCCGTCTTCGTGGAATTTCTTAATGGCATGAAAACAGAATA
TGCTATGTCTTTAAGAACAAATTTCTAAAAGGCTTTTATTGTTCTGTAAA
TATTTCTTTTTGGATTAAGGAATTCCATCTTTTATTGTTCTAATGATTAT
AATCTGTTATAATATTTATTTATAAGATGCTTTATTGTCTTTTTAATCTT
TGCGTAAACTTGCATATGTTTTGCATACATTCCAACTAAATCCAACCACA
GCTTTTTGTGTTCCTCTATTTTTGCATACAATTCAAGATGGCAGATGGAA
AGGCGAAAAGGTCTATTCCAGGCCTGATCAATCGAACTTGTCGAACGAAT
CGAACTCTGAGATTTTTTAAAAGATTGTTGAGTGTTCAATTAAGTTCGAT
CAATGGGTTTCAGCATGGTTTCTGCCCCCTCCCCTTAAAAAGGGGGAAGC
AAAAAAATTACCTTTTTAAAAAGGGGGGATATTTGTAATTTTTTTTAAAT
AAGGGGGATCCTTTATCAAGGGCTGCAAGAATGAAAAGAAGGGGGACTAA
AATTTGAAAATTGTTGATTGAATTTCAGATGTTATGTCTTTGGTTTTATT
GCAATAATTTTCTTGATTTGATAATATCTTCTTTCACATTTTTGTGCTCA
CAATCTCATGCCCACTTTTTTGCAGACCATGCTATATTGAAACTTATGCA
TCATGGTATCAGCCCCCCCCCCAGAAATCTGAAGGGCACCTAGGCCAGGT
TAGTAGAGGGGGGGCTAATGCCTTGCAATTCTTTGGGGTTACCTATTCAT
TAAGGGTACCTAGCTGTCTTGATGGAGGCTCTGGGGGCTGGTTATATTTT
CTGAATCTAATATTTCAAAATATTTCAAATTATTGAATTTTTTTACCCCA
GCACCTAGTTTCCCATCCAATTTTTCTTTCGTTTCCCATCACGCCATCTT
TTGCTATATTTTTCTAATGTGATTGTTTTGATTTACAGCCGCCATCTTTA
TAGCATAACAACAAAGCTTATTAGCAGGCGTTCATGCGTGAGCATGATTT
TAGGAATGACAAAAGAACATGTGTCAATTCAAAGAAATTATCTGCTGAAT
TCGGGTACCTAACTCAAAGCAATTTTTCAAGGGGACCTAAATTGCTGGGG
GCACCATGCTCAATGGGGGCACCTGAAAAGTGGGCTGAAACCATGTGCAT
ATTAGAACAACTTTTAACAGACCAAACCAAACCATAAAATTAAGAAATAG
TATTAAAGTATAAAATGTAGTAAAAAGTAGTATAAAAAGTAGTATTAAAA
TGATTATTTCTGTGAAAGATTATTTCTGTGACACATTTTTCACTTAATGC
AAAATTAAAGTCTTTTTTATGTTGACAAAAAATTTTGAGAATTTCTTGTT
TGCAGCAAACAACTTTCCAACAGAAAATTTTTTCAAATTATAAATTTTTT
AGATTTTTTGAGAAAAGTCATCCAAAAAGTTAAAAGAATTACAAAAATAG
CTAAAATTTGCTAATTATACCTCTTTGTACCTCTTTTTGGCTTTTGCTTG
AACAGCTCATCCAACTCGTTGAGTCCGATGCTTCGACATTTCCTTGAGGC
TGTTGGAGTCAGCTTGCCTAAGGTTAAAATAGTGGGCTAGCAGAGGTTCG
TCCGGAACAGTTGTGAGGAAGGTGTCTAAGTGTTTTAAAGTTATGTCTGA
GATTTTACTTTCGACCCCCCCCCCTGATTAGATAGTGTTTTATTAAGGTG
TTTTGAGGGTGTAAAAAGTGAAAACATTTTCTTCGTCTCCCAACCATGGT
GGGCGACATTTTTTTCAAAAATCTTGGTCCCCCACTCAAAATGGCTTGCA
TCCTCTCTTCCCTCTCTCTATTGTAAAAAATTGTTTGCTGAAAGGTAGAA
AAATTCTCTTGAAATAGTTGCTTGACATCATTGATCTTTGACATTTGCAG
CAGAGACTTATTTTTACAAGTTCTTTCACATCCAAAATCAATGGGGGGAT
GACACCTTCCTAAAAAATGAAGAAGGGGTATCAGAAATTTTCATGAAAAA
GGGGGGATACTTTATAAAGAGGGGGCATACATACATATACATTGTAGATT
ATTTTCAAGCACTGTTATGAAATTTAGTTTTCTGTTAGAATAGTCTTTGT
CAAAAAGAAGACAGAACTGTTTGTTTTTTTTGTATTTTGTTTGTTATTTT
ATTTTTGTTGGACCACTTACAAGTCCCAGGGTGTCTACGGGACCTTGAAA
ACCTTGAAAATGAACCACCTAACCTTGAAAACCTTGAAAACTATCAATTT
TCTGAGAAAAACCTTGAAAACATTGAAAAATCGTTAAAAACCTTGAAAAG
CGCTATCCAGTCATTCGAAAAGTAAGAATAAGTAAAAAACCACCTGCGGC
GCTAAACCTTTATAACATTTAGAGAATTCCATATTTCCCGATTCTGTTGC
GATTCTGTTGCAACGAATGCAACATATTCTTTTACCATTAGCTGAGTTTT
TGTCACTAATTTTTCGTTCGCATGAGCCCTAAGAAATTGTTCCCCAATTT
TCAAATCGCTTCAGGGCGTCTGTGGAATAATGGCCGTTCATCAATAAAAT
TTTGAGGATTCCTTAAAACAACTCGTTTGGCAATTGATTTTTGTAAAAAA
CAAAATCAAAAACAAGGCGTTTTTTGGCCATTTGAAAGAGTCAAAATCAA
GATTTTCTCTCGTCTGCGCAAACCATGGTTGCACCTCTTCGGTCACTGTA
AACAATTGGTTTTGCTTCTAATTCTTTATTTCTACAGTTGGAAGACTAGG
GAGCTGGAGTTCTTCTTTTTCTGGTATTGTTCTCGAGAGGGAGTTAGGAA
TTTAACTGTGGAAGTAATTCCCCGGGCACCCAAAGTAAATAAATTGTATT
TGCTGTCCTCTATTTTTCTTTCACCTACCACTCTGAAAAAAAAAATCCTG
TAAAGAGCCATATCAACTGAGTATCAAAAAACCTTGAAAAGTGCCAAAGT
TTTTGCCAAAAAACCTTGAAAAAACACTTAAAAATGACCAAAAAAACCTT
GAAAACCTTGAAAATCTCAAGAAAAAAAATCTGTAGACACCCTGAGTCCT
CTAAATATAGCCATGTGTTAACTTTGAAGGCCCTTTTGAAGAGAGACAAT
GATCTGAAAAATAATTTGGGTCTGAACCAAAGAATTCTTCAAAAATCTCA
AAACACACAAATTGAACTTTCATAGCAAAATGAGGTAAGACAAGACCTTA
ATTTCAGTGATTTAGGTGTGTGATAAGGAGTACTATACACAACTTTTAGT
TGTGAAACTAACTTATAGAGTGTGATTGATTGCACTCCACAGACATTTTA
GGTGTGTGGAGGTGTGCTTGTGCTATCACTCGCCTCATCAAATGATGCAG
CCTGTTTTACACTGTCTTACGCTTATTAAATTCTTTTAAACTTAAAAAAA
ATATTTTCCTACAAAGAAAATCAATGAACCACCAAGTAAAACAAACATTA
TAACGAAAAATTAAAAGTTTAAGAAAAAATTGGAAAAATCTAAGAACGTA
AAAAAATATATTTTGTGGTAGGGTAGTGTGGTAGTTTTTTTTTGTCACCC
GCATTTCATTTCTTTTTCTTATCCTTGAAAAAAAAATTCATGAGGTGGTG
AGTTTTGTCATTGTAATGTTTAGACATTTTATTCTTTTACTGCCTAGTAC
TATGTTTTATATGGTAGGCTAAATTGTGATTTAAACTCATTTAAACAGTT
CCTTAGGTTACAAACTTTTTGAATAAGAACAAATAAATTTTGACTGAGCT
ATTTTTTTAAAAACGTTCTTGTGTTCTTATAGAATTGTTCTTAAGAAAGT
GTGTACTTTTTCTTTACATTGACAATTTTAGGAAAGTATGAATTCATCTT
GGCAATGAACTTATTTTACCATTAAAATCGATCTTATAATTTCAACCGTT
AAAACTTTTGATATTGTGTGTGATTTGGAGTTTAAGCTAAATTTAGTTTT
TCATCTTTCAGTTGTTCTGATTGGAGATTCTGGTGTTGGTAAATCTAACC
TTCTCTCGCGATTCACACGAAATGAATTCAATCTGGAATCCAAGTCAACA
ATCGGTGTTGAATTCGCCACAAGGAGTATCCAAGTTGGTGGAAAAGTTAT
AAAAGCACAAATTTGGGATACAGGTACTATTGTTGTTTTTTTTGTAGCAC
TATTAGAGGAGCATTAGTATTTCAGAAATGTACTGAAGTGTACTGATCGT
GTCTATTGAAAACTTCTTTGTTTTAGCTATAATTTGGTCGTTACAAAAAG
TTCAGAAAAAAACGGCTCGCCATGCGAAGAGGGCTGGTTTCTATATGCTG
TGTTTATAAAAGTGGTTTTATGTTTTTCGTTTTTGATCCATTACTTTTAA
ACTTTCAGTATCCAGTAACAAATTTTACACTAACTTATAGTCTGAAAAAT
TCTCATCACAATGATACCAAATTATTTCTAAAAAATTTGATAGAAATTCA
TCAAAGACAGATTTGATTTCTTATTTTCGTGCACTTTAGCTTTTAATCTA
ATTATGCGGTCATGATGCCGTTATATCATTAGAATCGCTAGAAAATTCTG
AGCAAGAAAATATAGGTATCTTTTGGTATAAAAGAGGTCTCCCCAAAATA
TAAGCCCCTAAAGTTTGCGCATAATTTGACCTGAAACAAAAGAATTTCGT
CATGCCACGCTAATTATACAACTTTTTTTAAACAACAACAAAAGAAATCC
ATTAGCTCGAAACAAACTCCCTTAAGGGCAAAGGACCTGGTATATGACAA
GCTGTTTGTCTATTGTTCTGAAGAAGCTGTTTTTCCATCTCTTTACATTT
CTCTGCTCCCATTCTTGAAAAAGGATTACCTGTTTTATTTTTTTCCGGTC
TTAGAATTTTCATATTTTCAAATTTGGCTAGTTTTCTTTTGGCGTCTTTT
TAAACGTTGTATGTCTTTCAATTTCAGCTGGTCAAGAAAGATACAGAGCC
ATTACTAGTGCGTAAGTAAATTATCTACTTTGTTTTTAGTAGCATTGTAT
TTTAAAACAATAATTTATTACCAACTCAGACCTTTTCCTCGTGGAGAAAC
TTTTGGTCACCTTGCCAAAAGCTTGTTGCACACCTGCTGTCGCTGACTGT
GTCACTTTCCCGAACCTTTATCCGTATGCTAATTAAAGCAGATACTGACT
AACTTTCTTTATTATTTTCAGATATTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTCTAT
TAGTTTACGACATCGCAAAACACATAACTTACGAAAATGTCGAAAGGTGG
CTAAAAGAATTGCGAGATCACGCTGATGCAAATATAGTTATTATGCTGGT
CGGAAACAAATCTGATTTGAGACATTTAAGGGCAGTACCAACAGAAGAAG
CCAAAGCTTTCGCCGGTATGTATATTTTCTTTTGGAAATTCAGCTCCTAA
GCTTTTGTTTTAAAATTAAATCAATGGCAAAACGAGGAAAGACTGTCTAA
AACTGTTATGTTGGATTTACAACTTGATTTCTTCGCTTTTTCAGTAGCTT
CTCAACAACTTTAGCAACCAAGTTTTTTTATCGGAAAGATATTGCATCTT
TTTATGGCACATTTTATGTTGAATTTTATTTATTTGTTTTTCCTTTTTAG
AACGAAATGAATTATCCTTTATCGAAACCTCTGCGTTGGATTCCACTAAT
GTCGAAGTAGCTTTTAGGAATATTCTGGAAGGTAAGAGATTTATCTCGAA
AATACGTAAAATACAGTTATGTTCTGACGGGTACTCGTATAATATGAAGT
TGTGAATACATATTTGGTCGTGACCTAATCTCGACTTCTTTAAGAATAAT
TCTGATATCATAACCATTTTAAAACCTTGACATTTTCATTTTTCTAGAAA
TTTATCACATCGTCTCACAAAAGCAAATTCGTGACGCTAACAGTTCTTCT
GGACCACAACCGAACGAGTACACTCAAACCATCCAAGTTGCTCCTACCGA
ATCAGACACTAAAAAACAAGTCAAATGTTGCCAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000139_pilon:827258..834794- >XLOC_042254 ID=XLOC_042254|Name=XLOC_042254|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1302bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000139_pilon:827258..834794- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAAGCAAAGATGATGAATATGATTATTTGTTTAAAGATGGCAAGCA
AAGATGATGAATATGATTATTTGTTTAAAGTTGTTCTGATTGGAGATTCT
GGTGTTGGTAAATCTAACCTTCTCTCGCGATTCACACGAAATGAATTCAA
TCTGGAATCCAAGTCAACAATCGGTGTTGAATTCGCCACAAGGAGTATCC
AAGTTGGTGGAAAAGTTATAAAAGCACAAATTTGGGATACAGTTGTTCTG
ATTGGAGATTCTGGTGTTGGTAAATCTAACCTTCTCTCGCGATTCACACG
AAATGAATTCAATCTGGAATCCAAGTCAACAATCGGTGTTGAATTCGCCA
CAAGGAGTATCCAAGTTGGTGGAAAAGTTATAAAAGCACAAATTTGGGAT
ACAGCTGGTCAAGAAAGATACAGAGCCATTACTAGTGCCTGGTCAAGAAA
GATACAGAGCCATTACTAGTGCATATTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTCTA
TTAGTTTACGACATCGCAAAACACATAACTTACGAAAATGTCGAAAGGTG
GCTAAAAGAATTGCGAGATCACGCTGATGCAAATATAGTTATTATGCTGG
TCGGAAACAAATCTGATTTGAGACATTTAAGGGCAGTACCAACAGAAGAA
GCCAAAGCTTTCGCCGATATTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTCTATTAGTT
TACGACATCGCAAAACACATAACTTACGAAAATGTCGAAAGGTGGCTAAA
AGAATTGCGAGATCACGCTGATGCAAATATAGTTATTATGCTGGTCGGAA
ACAAATCTGATTTGAGACATTTAAGGGCAGTACCAACAGAAGAAGCCAAA
GCTTTCGCCGAACGAAATGAATTATCCTTTATCGAAACCTCTGCGTTGGA
TTCCACTAATGTCGAAGTAGCTTTTAGGAATATTCTGGAAGAACGAAATG
AATTATCCTTTATCGAAACCTCTGCGTTGGATTCCACTAATGTCGAAGTA
GCTTTTAGGAATATTCTGGAAGAAATTTATCACATCGTCTCACAAAAGCA
AATTCGTGACGCTAACAGTTCTTCTGGACCACAACCGAACGAGTACACTC
AAACCATCCAAGTTGCTCCTACCGAATCAGACACTAAAAAACAAGTCAAA
TGTTGCCAATAAAAATTTATCACATCGTCTCACAAAAGCAAATTCGTGAC
GCTAACAGTTCTTCTGGACCACAACCGAACGAGTACACTCAAACCATCCA
AGTTGCTCCTACCGAATCAGACACTAAAAAACAAGTCAAATGTTGCCAAT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000139_pilon | genome | sc0000139_pilon:827258..834794 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 514-651:139 |
| Aaloc | 433-510:386 |
| Aaloc | 238-429:816 |
| Aaloc | 205-234:1059 |
| Aaloc | 43-201:2025 |
| Aaloc | 1-39:7538 |
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