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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000062_pilon:561137..570839- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042226 ID=XLOC_042226|Name=XLOC_042226|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9703bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000062_pilon:561137..570839- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TATATTCAGTTATATTATTCATTCCCATTTTTAATACAGAAAATCGAAAG
AGCGAGTTTCTGTCGAAAATTTGGTCGAGCGAGAGCAAGTGAGACGTTTT
ACGAAGCAAGAGGTATTTCAGACGAAAGGTGGCCATCCCTTTATTATTCA
GTTATATTCTTTAGAACTACGAGAAAGAAGTGAACAAGCTCAACCACCGC
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CAACTGCCATCACCTCAAGATATCGGCAACATTTATTTCCTTTTGAAGTC
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TTATTAGTGAGTGGTCTTCATCTTTTTCAAAGTTTGATCTTTCTAGGCCT
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AAAAACAAACTAATAAGAACTTTACAATTCACCAAGAATTTATTGCCAGT
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TTTTTGCATGGACTTAATAACATAAGGGGTTACAGTGGTATTTAAAAGGG
TAACACAGAGTATTTCATACAGGGCTTTTAAACTGAAAATAATTTAATGA
GTTTTAAAAGATCCTTCTAGAATTTTTCAACAAACGTATCCTGTGAAAAA
AGACCCTATTCCAATCATGAAGTAATAAAAACAATAACACATTGATGTGT
AGTTTTAGTAATAATGTAGTCTTTCTCGTCATTGTTTTGATTTTGTAGTT
TTAAAATATTATTATAGTAAATGTGACATTGTAATATGGACTTTTTGATA
GTTTAGGATGTCATAACTAAAAGTGGTAAAGAATAAAATTTATATTTACA
AAAATATCACTAATTTATAATTCACTACTAGTTTTCATACATTCATGCAA
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ATTATAAGGCAGCGATCACGAACCTCTTCGGATGCATTTCATTTTGCCAG
TATACATGTCCAAGAATTTCGAGGAAAATGCTGTGAAAGAGCTTATTTTA
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TGATAAGGTCCATTAAAAAATAATGTGTCTGTTCTTCGCAGCATACCTCC
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TTATGATATTTTTCGTAAAAGCGTTTTTACTCAAATACGTTGAACCGTGT
ATTGTATTGACAACATGACAAAAAAATCATTGTTCGGCTGAATGTAAAGT
TTAACCATGACATGACATTTTCAATAAAATTATAAAGTCTAAATGTTAAA
TTATTTCGAAATCCAAATGTTGCTTTAAATCTGACTTGACCAGTTGACTA
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CACAAAAATGTGCCATGCAGTATGGATGCCACAAGGTAAACAACCATCTG
TCAGTCAGACCATTTATCGAAAATTTCAGTTGACAACAAAAAAAACAGCC
ACACACATATTATTGTCACATTAGCAAGTGGATGGTAGGACAGCTCTCCT
CTCCCAGAGGAAGTGGTAAAAAGCCTCAAGAATGATAATCAAGTAAAATT
TACAATAAGTGTGAACAGCAGCAATGTTATTTTACAAGCAAATGATGCCT
TCCAGCTTAAAAAATCAGCAGGATCCTGCCTTGACAAAAATTGCCATCTT
TGTTTCGCAAGTGTGCAAAAGTGAAAGTAAAAAACAAACATCTCGCACTT
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AAAAAAGAAAAGTCTACTTTGCTCGGGGTTTTTTCGTGAGCCAAATCGGT
AGCATTTCTCGAACATATACAAATTTACGTCCCGCGTACGCAGATCTTGC
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GTTCCGCAAAAATGTCCAAGCCCTAACACCAAACCCTCATATTTACAAGG
ATCATTGTTTTTTGCCGAGGCATCGTATTTTTCGAAAACTGTGTGTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATCATTAATTTCTTGAT
CTCCAAAAGTATATTGGTTCTTCTTACAAGAAGTTGAAATATTTTATGTA
TATGTTATGTATATAAATGTTTATAAAACTCTACGATTCAAACTGATACG
AAGTGGACAGCTAAATCATTAAATGGAAGCTTAGTGGGCTGGTCGGCTAC
ATAGTATAGAAATAGTAAATCAATGGGCAACCTAATATAGAAGACGCTGA
AAAATAGGTTCGTCGGATAAGATGATATAGATAAAAAATCACATAGGTCG
AATTGTGTAGGTTGTCAAAGTCCTAGTTATGCAATGAAATAGTAAATATT
AAATATTAGGGAGAAAAACTACTTATATGAGAATATTTTAATATATTCAT
AGGAGATCAAACTGAGAAGAAAATTCGAATGTAGAATAGACTAGACGTAA
TAGTGCAACATCGAATTAACATCAAAACTAAAATCATTCGGTTAAATTTG
TAGATATTGTGATGGCAAAATTGTGGAATGGCTGCGGTAAAATAGAATAT
AGGTTCGGTCTCAATTAGGAATATAAAATGCTAGAACAATGTTTTAGATA
AAATGAAATAAATATTAACATAAAATAAATATATCAAAAGGGGAACGCTA
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TATGTCAGTTTACTGAGAACCAGTGACTCCATAAGCATCTTGCGCTGCTG
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AAGATCTCATGGTATGGTTGACATGTTCAGTCCAGTCTAGATGCTCATTA
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AGCGCTTTTGATAACTGTGACGAGTTCCGCGAGGGAATGGCGTTGTGCAA
GTTGTCTGGTCGAAAAGATTGTCATTTTTGTCTTTTTTGTGTTAAGACAA
AGATTGTTTTGCTCAGACCAAAGGTTGATGTTGTCTATTTCATTTTGGAC
CGATTCGATGGCGCTCTGCAGTTCTTGGATCTTTGTGTGTCGGAGTAGCG
TAGTATCATCGGCATATAGCAGGTATGTGCTCGGACCGTTGGTGTTTATA
GTGGTCACATACAAGTTGAACAAGATCGGGCCAAGTATACTCCCCTGTGG
AACGCCAAACTGTACGTCTAATTTGCTCGATGATTTATCGTCGATTTGGG
CGTATTGTTTGCGTTCTGATAGATAATCTCTAATCAAATAAAGTACTTTT
CGAGAGAAGCCAAGGTTACTAAGTTGTTTTATTAAAAGTTCGATAGTCAA
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CTTCTGCTCATTGCAACTTTAATATCGTTTTTCAGCTTGAGTAGGACGGT
TATAGTTGAATGCGATTTTCTGAAACCAGATTGACTCTCGAGGTAAATCG
ATTTTTCTTCGATGTGCTCGGTTAATTGTTGGAGGATAATTCTTTCAAAG
ACTTTTGACAAGATTGGCAAGATGCTGATTGGTCTGTAGTCTGTCAAGGA
TTGGGGGTCGGTGACTTTGGGAACTGGGCAAATTCGACTAGTTTTCCATT
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GTCGGGTCCGGTGGAACAATCTGATCTAAGTTTCTGGATAGCTCTCGAAA
CTTCATCGTACGTAGCAGGACGGAGATGGAAGCTGTCTGGATGTTCGGGT
AAGTTCTTCAATGAACGATTTTGAGAGGTCTCCTGCATTTCTTCCTGTTT
GTCCTCATGGCAGTTGAGTTGAAAAAACTTGTTAATTTCGTCTGGATCAA
CGTCCATGCGTTTTTGTCTGGGATGTAGTAATTTGTTGATGACTTTCCAT
GTTTCGGCTGAGGATTTGTTAGCTAGGAGGTTCTTAAGAAATTTCTTTTT
CGCTCCCCGGATGGTCGATTTGAGGTTGTTCCTCACGTTTCTTAGTTGGT
CAAGTTGTTCATTGTTGCGGTTGGTATTTTTCAAATTTAGCCGTAGTTCA
TTTTTCTGCCGTTGTAAATCTCGGACATCAAGATCTTTCATCCATGGGGA
CGAAGGACGGGTGAGTTTGATCTTACGTACAGGTGCGTGACGATCGATGC
ACTCCGTGATAAGTTTATTAAGTGCATTGACTTTGTCTGAAGTGTTATCG
AAAGCATACACAATGTTTAATGGTAGTTGTTGAAAATCATTGATATAGTC
TGCGAGTACTAAAGTTCGTTCGTCTCTAATGTATTTGTGCCGCGGTTCAT
ATCGGGTTTGTTGATTTTGAGGATACAAAAAGGTGAATCGTGGTCTGAGA
TTTCGTCACATAAAACAACATCGCTCGCTATAAGTTTGGTGTCAATGTTT
GTGATAACATGGTCGATTAGAGTTTTGGAATTTCGTGTTGGTTGGGCTAT
AAGTTGTTTGAGATTGAGCGTTCCCAGTATGTTCTGGTAAGCTTCGTTTG
CTGGTGACGGTACAAGTAAATCGATGTTAAAGTCACCTGTAATTATTATT
GGACCATGATGAAACAATTGCGGCTTGGGAAACAAGTGATTCGAATTTGT
TGAGCCACTCAAGTTTTTCATTTTGTTTACTGCTTGGCTGATACACAATG
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GTGTTCGATAGTTGTGTCAAAGGATTCAATATCTTTACGGGCTTTGTGTT
TGATGTCTGTTTTGATGTAGTATCCGACACCACCGCCACGTTTAGCATCT
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GTTCTTGTTGTCTTTCAACCAGGTCTCGGACATTGTGATGATGTCGAATT
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AGCAACTGATGGACTGACAAAGTCGTTAGGAATATGGTCGGCAGAGGCGT
CCAGATCTTCAAAGTTTCGAATGTTGAAGAACGGTTGGATGACCAATGTG
CAATGTTGCTTAGAAACAGGACCCTTAAGGGGTTACGTGCAGTAGGTCGT
TTACCTTGATTTTCCCCGTAAAGCTTACTTGAGTGACTTATCATTCCCTT
GTCAATCTTCTTATAAAAAACCCTGACTGATTTCCATAGTATTTCTCACT
CATTGTCTTTAATACCTTATCGACCCTGTTTATGCCGAGCCTAATTTAAC
GCCAGTCCGTTTTACACCGGACCTATTACGCCAGAGCCCAGTTTGGCCTT
AATTAAGCCAATTCGTCACATCAAAATGAAAAAGCTTTTTTGTCCATTTT
TTAGAAAATTGAGTTATGACCGTACCGTACACTCCATTTTTTATTGATTT
TTTTATCCATCAAAAACCAACCTAAATTGGTCTAATTTTAAGCTTTTAGA
AAAATAAGAATCATCAGTTTAGGGCAAAAAAGCCTTAAGTCCAGCGTGGA
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GAACTACGAAAGGGATGGCCAGGGCCCCCAAGGAATTGGCAAGTCTACCT
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ATGCTGCGGACAATGGCAACATGTTCGACATGGAGGTGATTAGAGTACTT
TGTTTGTTGTGTCTTAAATCTATGGAGTTAGACGTAAGAGTGTGCAATTG
TCTTATCATTTTCGTGGGTTATCTTTTTGTGGTATTTTCTTATTTCTTAT
TGGGATTAAAGCTTCTGGGTACCTGGGTTTCTTATTTAAGTTTCAATAAT
GGCAGATTTTTTGGTACCTGAAGGGAATAAATTTTCGCGGGGGTTATAGT
TTTTCTCGTTTCTTGTTGCGATTAATTGTTAATTATTTCAAGTTCCTGGA
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TGGTATTTTTTTAAATTCTTACAGTGTTTTATTAAAGTAGACATTACAGT
ATCATATACCAATCGACCGAAAATTTGGTACTGATTACTAAAAATAAAAG
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AATAAAAAGATTGTGATATGTATTTCATTTCCCTTTCAAGTTATGTTCAG
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CATGTCAAAGATAGCTGATGCCAGTGGTTATTGTACCGGGTAGGTACGAA
TTTCAAAACGGACAACGAAAGGGATGGCCAGCGCCCCCAAGGAATTGGTA
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CTTATTGACCAGAGAACCAGAGAGACATATCTAAGCTAGAGATATTTCAA
ACAAAAATATCTTTTTTTTCATGAGAAAACAACGACTATTGCAAATCCCG
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ATTAAGGCTAAATTTGATAATGGGCAAATATCTAGTTTCTGGAAAAGACT
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ACGTAAGAGTGTGCAATTGTCTTATCATTTTCGTGGGTTATCTTTTTGTG
GTATTTTCTTGTTTCTTATTGGGATTAAAGCTTCTGGGTACCTGGGTTTC
TTATTTAAGTTTAAATAATGGCAGATTTTTTGGTACCTTAAGGGAATAAA
TTTTCGCGGGGATTATAGTTTTTCTCGTTTCTTGTTGCGATTAATTGTTA
ATTATTTCAAGTTCCTGGACACCTGGATTTCTTATTCGGGTTTCAATAAT
GACAGATTTTTTGGTTTTTTGGTATTTTGAAAATTCTTACAGTGTTTTAT
TAAAGTAGACATTACAGTATCATATACCAATCGACCGAAAATTTGGTACT
GATTACCAAAAATAAAAGTAAATCTTCATATATTACAGTCCGCAAAAATC
TAAGAACAAGTTAAGTAAGTTCTTGCTTTATTAGAACATTTATTATTCAG
TTATAATATTCATTCCCATTTTTTATACAGAAAATCGAGAGACCAAGAGT
TCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000062_pilon:561137..570839- >XLOC_042226 ID=XLOC_042226|Name=XLOC_042226|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=394bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000062_pilon:561137..570839- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TATATTCAGTTATATTATTCATTCCCATTTTTAATACAGAAAATCGAAAG AGCGAGTTTCTGTCGAAAATTTGGTCGAGCGAGAGCAAGTGAGACGTTTT ACGAAGCAAGAGGTATTTCAGACGAAAGTATATTCAGTTATATTATTCAT TCCCATTTTTAATACAGAAAATCGAAAGAGCGAGTTTCTGTCGAAAATTT GGTCGAGCGAGAGCAAGTGAGACGTTTTACGAAGCAAGAGGTATTTCAGA CGAAAGAACATTTATTATTCAGTTATAATATTCATTCCCATTTTTTATAC AGAAAATCGAGAGACCAAGAGTTCTAACATTTATTATTCAGTTATAATAT TCATTCCCATTTTTTATACAGAAAATCGAGAGACCAAGAGTTCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000062_pilon | genome | sc0000062_pilon:561137..570839 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 235-294:61 |
| Aaloc | 229-234:70 |
| Aaloc | 199-228:9606 |
| Aaloc | 103-198:9704 |
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