XLOC_042146 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042146
Unique NameXLOC_042146
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042146 ID=XLOC_042146|Name=XLOC_042146|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7228bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCACAAGTGTTCACTCACAGGCTGAAAACAATTTCCTAAAACAAGAATT TCATAACAggtttattatattttcttgGAAATGTTGAATTATTTCAGGCG TTTGCTTTTCCCGGGCCATAATATTATATAATCGAAACAATCAAACTTGA TCAAatggttaaagtttaattttaatGAATCAAAATTTTCCGAAAGACTT ATTACTAAAGACTAATTAGGCCTAGAATTAGTCAAACTTTAATTGAACTG ATATATTTGTCCAACTTATCAACCAGATGATTAATTGTAATTTGTCAATC TTGAAACAAATAATCAAACAAttcaaccaatttttttttacaatttcaaa aaaaagttcaattaaTCAACAAAATTGAGCTTTTGTCTTTTAATCAAGTC TGATAGAGCAGATTTAAATGTGGCCTAGTTTTCCATAACTgctgatttta atttttgattttaccaCAGCTCTTTCATTCAATCAGGCAGATTACAAAGA TGGCATTCAATAGATCTTTTCTCAAGTAATCAGATGAGAACTGGAGAAAA AATAACTGTTTTATTCCCACACTGCGccgaaaaaatttgaaaaactcaaT CTCCCAAAAATACTTGAAAGGtttttttACCGTTCTTACTTTGACAGAGT TAATTAATGtattaaataatgtttttttttcaggactGGAAGGCGAATCG CTTGGTATGGTGGAGAGAAAAGGAATGGTGTATTTATCTGGTCTGATGGA ACCagttttacaaaaactttttggaaaagtGGCGAACCAAATAACTTAAA CGGAAATGAAAATTGTCTTTTAACAAATGATGGTGCGTGGAATGATGAGG ACTGTTCAGTTACCAAGTACTACGTGTGCAAACTTGATTCTGGTGAGTTT CTCATCATTTGTTGTTTGGTATTAATAAATTAGTTCATTATCCAGCGCGT 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CAGTGGAGGGGCTGAGGATTGTTTACAAGGTTGGGCTGCTAATGATCATT GGAACGATGCATGGTGTggaaagaaatttcattttgtgTGCAAAATTTAT TCAGGTTAGTTACCAGTTTACtaagttttccattttttgtttatttgtga CAGAGAAATTGACCCTTCCCCTCTCCGAAAGATTACCCTTGGAAAACTTT ATTAAATCTAATTTGACCGACATTCACTATTCGCATTACAAATGCTTGAA AAATAACTCTTTGAAAAACTCCTGCTTAAATCAAATCGAAGATCAACCCT AAGAAGGTACGGTAATTGTCTTTGCCGTTGAGGGAGCACGAGCAAAGCTT TGTTTTGTTACAATAGATTTGTGCTTTTACGCCTAAAATGGTCAATCAAG GAACGATTTCGGGGGTGGAAGGCAAATATCCGGGGTAACAGTCCGAATAA AGTTAAAGTTACAGTTAGAGTTTCTCTGGGGCATTTTTCAAAAGGCGAAA TTCCAGGGcgtaaatttcaaatttcaattctaGTTTCAATAGTTTTGATA CCaattaatgttttaaaatttcaatgtgaaaatatcaaatattattgtca aatgcaaaataattgCCTTTGTGTTCTTCTCCaattagctttttttataa tttttctgaaTATTTATTTATCATCTTAAACCTTGGTTAAAAGTTAAACG ACTCTCATTTCTGAATTGTGAAAACTTGGAAAGTTATTTTAACTGAACTC TCTTTTAGATTTTACATTGCAATTCCTCACAAAGCCATCATTAAGAAGAA GTGAGAGCAGAAAAGAAACGATTGTTTCTGGCTGCAGTTATTCTTCGTCA ACTCACTCCAGTTGGACGGCAAAATCTTTTATTCAAAGAAACAACGATGA CTTGATTGCGATTTCTACTGCAGTGCAAGTTACTAATGAAACAAGTCGTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+

>XLOC_042146 ID=XLOC_042146|Name=XLOC_042146|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3174bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCACAAGTGTTCACTCACAGGCTGAAAACAATTTCCTAAAACAAGAATT
TCATAACAgCTCACAAGTGTTCACTCACAGGCTGAAAACAATTTCCTAAA
ACAAGAATTTCATAACAggactGGAAGGCGAATCGCTTGGTATGGTGGAG
AGAAAAGGAATGGTGTATTTATCTGGTCTGATGGAACCagttttacaaaa
actttttggaaaagtGGCGAACCAAATAACTTAAACGGAAATGAAAATTG
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AACATTTGCGAGAGAATCACAACATTTGCTGTCTGGATGTAATTTCTTGT
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GCAAAACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACCATCAAAAACTCCACAAT
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GAGAGAATCACAACATTTGCTGTCTGGATGTAATTTCTTGTATCACGAGG
CACCACAAACTGACAACGTTTTCTTCAATCTCTACAACAATGCAAAACAA
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GTATCATTTCAACCAATGCAAAACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACC
ATCAAAAACTCCACAATTCCAAACCAGTATCATTTCAACCAAGTTACAGT
TACCAATTATACAGATGTGGGAAATTACATTCGATGTCAAATTGATGCAA
AACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACCATCAAAAACTCCACAATTCCA
AACCAGTATCATTTCAACCAAGTTACAGTTACCAATTATACAGATGTGGG
AAATTACATTCGATGTCAAATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042146XLOC_042146-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000133_pilongenomesc0000133_pilon:205968..213195 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1459-1587:7100
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