|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042146 ID=XLOC_042146|Name=XLOC_042146|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7228bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTCACAAGTGTTCACTCACAGGCTGAAAACAATTTCCTAAAACAAGAATT
TCATAACAggtttattatattttcttgGAAATGTTGAATTATTTCAGGCG
TTTGCTTTTCCCGGGCCATAATATTATATAATCGAAACAATCAAACTTGA
TCAAatggttaaagtttaattttaatGAATCAAAATTTTCCGAAAGACTT
ATTACTAAAGACTAATTAGGCCTAGAATTAGTCAAACTTTAATTGAACTG
ATATATTTGTCCAACTTATCAACCAGATGATTAATTGTAATTTGTCAATC
TTGAAACAAATAATCAAACAAttcaaccaatttttttttacaatttcaaa
aaaaagttcaattaaTCAACAAAATTGAGCTTTTGTCTTTTAATCAAGTC
TGATAGAGCAGATTTAAATGTGGCCTAGTTTTCCATAACTgctgatttta
atttttgattttaccaCAGCTCTTTCATTCAATCAGGCAGATTACAAAGA
TGGCATTCAATAGATCTTTTCTCAAGTAATCAGATGAGAACTGGAGAAAA
AATAACTGTTTTATTCCCACACTGCGccgaaaaaatttgaaaaactcaaT
CTCCCAAAAATACTTGAAAGGtttttttACCGTTCTTACTTTGACAGAGT
TAATTAATGtattaaataatgtttttttttcaggactGGAAGGCGAATCG
CTTGGTATGGTGGAGAGAAAAGGAATGGTGTATTTATCTGGTCTGATGGA
ACCagttttacaaaaactttttggaaaagtGGCGAACCAAATAACTTAAA
CGGAAATGAAAATTGTCTTTTAACAAATGATGGTGCGTGGAATGATGAGG
ACTGTTCAGTTACCAAGTACTACGTGTGCAAACTTGATTCTGGTGAGTTT
CTCATCATTTGTTGTTTGGTATTAATAAATTAGTTCATTATCCAGCGCGT
GTTTAAATAGcgtaaaatgataaaaaatgggTATTGCTCCACAACAGAAT
TTAAAATAATTCCCGCCCAACAACATTTAATTTGCTttcctgtccaatat
tttcTGATTAATAGCTTCTGTAGAGGCTATATATTTCCAATACTGTATTG
ATGTCACATAAAGAAATGGAACATTTGAACATTCTACTCTTTTCGTTTGA
TTAATTGTTAATTTTATTTAATGACTTAAGTGATTAAATAGTTCACAAAT
ccccccccTTTTATCAACTATCTTTAAtaacaacaaaatgaaaatgacag
ttttcaaattcagaaagcaaaatttgaaaaataaattctgcAGTGGTATA
ACAGTGGTTGTATATCATAAGGAAAATTATTCAATGCTATTTTTGCCTAC
GGGCATATAATAATTAATTGAAATATGCTTGAAAATGAGAATGATTATTT
AGTGATGAACGAATAATACACCAATTATATTGACGCAGTCTCAGCCAACA
TGAAAATTATTGGGCTGTGACGAGAACATATATTTTTGTATATCGGATTC
AACTTTTTCCAATAACTGATATGCTAACTTATATTAGGAAACTAATTCTT
GGTTATAACAACAATTGCTTTTTAATTCTGTATTTTTTATTTGCTCTTTC
AACAGAATTTACTCTGCGATTCCTCACAAAGCCATCAGTTAGAAAAAGTG
AGAGTGGCAACGAGGTAATCATTTCTGGTTGCAGTTATTCTTCGTCAACT
CATTCCAGTTGGATGGCAAAATCTTTTATTCAAAGAAACAATGATGACTT
GATTGCAATTTTCAATGCAACCCAAGTTACTGATgaaacaaaagatgaaa
atgttttcaCTCTACCTTCTGTCAAATTGTCCAATGTTGAGGGTGGTGAT
TTCAGTTGTGTGGTTGTTATTGACAACATGACGtttttttCAAATACAAC
AAAATTCATTCCTGGTAAGTAAATTTACCATTTTAATGATGCTGATCCTT
AGTTCAGCTATTTTACATTGCAGTCAATACACACCAGATACACACCATGC
TTTCCATCAGAATTTTTATCACTTTGCACACAGACCAAGTGACAAGTAAA
GGTTTTATTATTGTAACCTGAGttcttttttgtgattttttagaGAACCA
AGTCACAAGTTTCAATGAAGCTCAATATTACTTTAGCATTTCCAAGAAGA
ATTGGCAGTCTGCAGAAAATGATTGTATTTACCTTGGAGGTCACCTAACA
AGTGTCCACTCTCAGGCTGAAAATGAGTTTATTAACCAAGAAATCAAGAG
GTTTGTATCATCAAGTTTCATTTCATGGTGAAATTTGCTTAAATACATAT
TGACTAGATTATAGTCCTTCTATAATGATATTACCCTCTGAGAAGTCACC
GGGTTCTTTGGAAAACTAAcaattttacttttactttattATCAATTCAG
AGTTTTTGGGACAGCCAGCCATATGAAtaagatttaaattttaaattttt
tgattatactaaagattttttatttactatTCTCTGATAGGACAACAGGG
AATGTTATTGTTTGGTACGGTggtgaaagaaaaaacaatgtttttgtttg
gaCTGATGGTACAATTTTTACCAAAACTTTCTGGAATACTGGTGAACCAA
ATAACTTGGGTGGAAATGAAAATTGTCTTAACGTATATGCAACTGGAATG
TGGAATGACATCAGCTGTCATAACTTGTTTTATTACGTATGCAAACTTCG
CTCATCAGgtaaaagaaattattgggTgggggggggttgataACTCTTCC
ATCAGCTGACTATAGCTAACAGTAGTTTGATCGCTCATCTGTTAAAGATA
TTCTATCATTCGAGCAATACTTTCTTTAGTGAGTTAATTTGCGTCCACAG
TACAACCTTATTACATACTATTAACCCAAAACTAGGGGAGGTACCCGCCC
TTTCTCCCTAAATTACTCCGTTTAATTTTTCCTGATAGTTATTGTGTAGA
GACATCAAATAAAAGTTTAGGTTCTTAGAAACATCCTTGGACAATTTAGA
TGaatcaaattcaaattaatCACCTTTACGCTACCTCCAAGTCTGGGCCG
TGATAACATTTCCACTTGGAAACATTTTCGATCTTCTTTTAAAAACCCAC
AATTTATGTTatttaatttgtatttttgaaattcttatatAGATTTTACA
TTGCAATTCCTCACAAAGCCATCATTAAGAAGAAGTGAGAGCAGAAAAGA
AACAATTGTTTCTGGCTGCAGTTATTCTTCGTCAACTCACTCCAGTTGGA
TGGCAAAATCttttattcaaagaaataatGATGACTTGATTGCGATTTCT
ACTGCAGTGCAAGTTACTAATGAAACAAGTCGTGACAATGTTTTCACTCT
ACCTTCTGTTAAATTGTCGTATATTGAACATGGAGATTTCAGATGCGTGA
TAATCCATGACAGTATAACGTATTACTCTTTTGCATCCAAATTGTATAAA
TCTCCAGgtatatatttctttttcagctAATAATCACACAAATGTTATTA
CTTTAGTAGTAGTAAGTCTGCGGCCCGAAGGCTTGTCTTtcaatagctat
ctacccgaaggtaggagagggcgccattctctccctggattgctccactt
acccttaatccttctcttaattgctaagcatcaagcagagagacatcaag
taccatttcgggaatctttggtatgacccggctggaaATTTACCTCCACA
ACCTTGCGAAAactagccggatgctctaccactgcactacgatTGCTTTA
CCCTACGGTAGTTACTTTAAGGCGCCTGATAAGTGCATTCCTGTTgtcag
tttttttcattttgcttcCAGCTCTCGTTCATTGCACCCTCTGTTTATGA
AGACACATTAGAGTAAttgtttcaaatgaaaattgtcAGAAATTAACCAC
CTTTCAAGTTTACCGTGAGTGGAAATTCATGTAACTAATCAAATTATTGT
TCAACGTTTCAGATTTTATCGATGTTCCAACATTTGCGAGAGAATCACAA
CATTTGCTGTCTGGATGTAATTTCTTGTATCACGAGGCACCACAAACTGA
CAACGTTTTCTTCAATCTCTACAACAATGCAAAACAATTGACAAACAGAA
GACGCACAACCATCAAAAACTCCACAATTCCAAACCAGTATCATTTCAAC
CAAGTTACAGTTACCAATTATACAGATGTGGGAAATTACATTCGATGTCA
AATTGATATCGAAACAAACACTACCATGTCCAATTTCTCAGATATCATCA
ATGTTCATTGTAAGTTTTCGGTAACATCTAAGTCAGAATATTATAATCTT
ACACTGTTATCTGGATTCCATGTATTTTTAGATAAACATCCCAGTATAat
aatttaatgttttttttcgacaAATGACCAGATCCTCCTTGGATAATTTT
GTATTCTGCAGACCTTGATTTATATTTGCTATTGTTATGTTTTTAGACCC
ATCAGTTATAGACCACCCTACATCAAATTCCACCATCTATTTTGTTGGTG
ATCCAATTCAAATTGGTGGTTGCGCATTTAAGTCCACGTTTCGTCAAGGT
GTCCAAGGTTACTGGTTAAAAAATGGTGACGTGTACAATGAGAACGTAAA
CTTGGTGTACGAGATAGCAACAGATGGGTTGATAGTGTTGAAACTACCTG
ACCTTATCATTGACAAGGCAATTGAGAGTGCTAATTATTCTTGCCAACTT
GATGCTATAGTTAATGGTGATGGTGATATTAGAATCACTCATTCAAACCC
TGTTCAGGCACTTGTGTATGGTAAGTTCATCTTTGATTTATAGTTGATTG
TCCTCTGGTCTTTGTAACCTTATAAACTGCTTATATGTACCAAATTGTTG
CAATATTTTTCGTTGTATCATCTTTGATATAGTTGATtgtcgcttcgcaa
cttttatacatatacggctCAAGTCTCTGTAACCTTATTAACTACTTATA
TGTACCAAAGTTCTGTACTGTTGCAATGTTTTTCGTTGTATGATCTTTAA
AACTCTAAAAGTAGTTCACATCGATACTTTGTCATAGATCCGTATGCTAC
TTTCAATGGAGTTCGATACTACTTTAGTATAACaaaaaaaGACTGGCAAT
CTGCAGAAAATGATTGTGTAGATCTTGGAGGACATTTAACAAGTGTTCAC
TCGCAAGCTGAAAATGATTTCCTTCATCAGCAACTTCTGAACAGGTTCGT
AAGGTACCTAATTTAATTGCTTGTCTGTTAATAAGGGGGACATGGCACAT
CTTTTTCACTGGATATTGACACTTGGTTTATTAAATTGGGTTatcccaaa
aaataaaaaataaaaattgaaccCCCTCCCTCATATCGAGGAAAATCCAG
GGTTCCCTGAAATTTTAGGAAACTCCATTGAGTTTTTAAAATAACTTAAT
TTATTTATCGTCATTACAAGAAGACGATAAATCAAGGGACATTTAAAAAT
TTGTTATAAGACTTGTCCCAAAGGTGATCACCTCGACAAGGGGCAATCAA
TTTCTATTATGGCCCATCTTTTTATTAAACTGTActtaatttattaattt
tgaatcaaatttcATAATTATTCTCTTAATATACAGAACAGGGAGTGGAG
ATGCTTGGTATGGTGGTCTTAGaagtgaaaatgttttttttctttggtcA
GATGGCTCAGGATTTCTCACAACATTTTGGAATCCTGGAGAGCCCAATGA
CAGTGGAGGGGCTGAGGATTGTTTACAAGGTTGGGCTGCTAATGATCATT
GGAACGATGCATGGTGTggaaagaaatttcattttgtgTGCAAAATTTAT
TCAGGTTAGTTACCAGTTTACtaagttttccattttttgtttatttgtga
CAGAGAAATTGACCCTTCCCCTCTCCGAAAGATTACCCTTGGAAAACTTT
ATTAAATCTAATTTGACCGACATTCACTATTCGCATTACAAATGCTTGAA
AAATAACTCTTTGAAAAACTCCTGCTTAAATCAAATCGAAGATCAACCCT
AAGAAGGTACGGTAATTGTCTTTGCCGTTGAGGGAGCACGAGCAAAGCTT
TGTTTTGTTACAATAGATTTGTGCTTTTACGCCTAAAATGGTCAATCAAG
GAACGATTTCGGGGGTGGAAGGCAAATATCCGGGGTAACAGTCCGAATAA
AGTTAAAGTTACAGTTAGAGTTTCTCTGGGGCATTTTTCAAAAGGCGAAA
TTCCAGGGcgtaaatttcaaatttcaattctaGTTTCAATAGTTTTGATA
CCaattaatgttttaaaatttcaatgtgaaaatatcaaatattattgtca
aatgcaaaataattgCCTTTGTGTTCTTCTCCaattagctttttttataa
tttttctgaaTATTTATTTATCATCTTAAACCTTGGTTAAAAGTTAAACG
ACTCTCATTTCTGAATTGTGAAAACTTGGAAAGTTATTTTAACTGAACTC
TCTTTTAGATTTTACATTGCAATTCCTCACAAAGCCATCATTAAGAAGAA
GTGAGAGCAGAAAAGAAACGATTGTTTCTGGCTGCAGTTATTCTTCGTCA
ACTCACTCCAGTTGGACGGCAAAATCTTTTATTCAAAGAAACAACGATGA
CTTGATTGCGATTTCTACTGCAGTGCAAGTTACTAATGAAACAAGTCGTG
ACAATGTTTTCACTCTACCCTCTGTTAAATTGCCGTATATTGAACATGGA
GATTTCAGATGCGTGATTATTGTTGCGGACAAAACATATTATTCAAACAG
CTCCAAGTTGTATAAATCTGCAGGTGATTTTATTTGgaaacttgaaaaaa
ttgctGCTTTGTtagtttcactttttttatgtCAAAGTTGATTTCACATT
GTTTGGTCAGGGTCTTACTTAAGTCATTTGCCTGGCAAATGTATCAATCA
TCTATTCAATCGTTTTTGTTATACATGAAAGCTTCTGTCACCACTCCAAG
ACAATCAAATTAATAATAAATTCTAACACTTTAGAATTTACCAACGTCCC
AACATTTGAAAGCGGAACACAACATTTGCTGTCTGGATGTCATTTTTTGT
ATCACGAGGCACCACAAACTGACAACGTTTTCTTCAATCTGTACAACGAT
GCAAAACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACCATCAAAAACTCCACAAT
TCCAAACCAGTATCATTTCAACCAAGTTACAGTTACCAATTATACAGATG
TGGGAAATTACATTCGATGTCAAATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+ >XLOC_042146 ID=XLOC_042146|Name=XLOC_042146|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3174bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:205968..213195+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTCACAAGTGTTCACTCACAGGCTGAAAACAATTTCCTAAAACAAGAATT TCATAACAgCTCACAAGTGTTCACTCACAGGCTGAAAACAATTTCCTAAA ACAAGAATTTCATAACAggactGGAAGGCGAATCGCTTGGTATGGTGGAG AGAAAAGGAATGGTGTATTTATCTGGTCTGATGGAACCagttttacaaaa actttttggaaaagtGGCGAACCAAATAACTTAAACGGAAATGAAAATTG TCTTTTAACAAATGATGGTGCGTGGAATGATGAGGACTGTTCAGTTACCA AGTACTACGTGTGCAAACTTGATTCTGgactGGAAGGCGAATCGCTTGGT ATGGTGGAGAGAAAAGGAATGGTGTATTTATCTGGTCTGATGGAACCagt tttacaaaaactttttggaaaagtGGCGAACCAAATAACTTAAACGGAAA TGAAAATTGTCTTTTAACAAATGATGGTGCGTGGAATGATGAGGACTGTT CAGTTACCAAGTACTACGTGTGCAAACTTGATTCTGAATTTACTCTGCGA TTCCTCACAAAGCCATCAGTTAGAAAAAGTGAGAGTGGCAACGAGGTAAT CATTTCTGGTTGCAGTTATTCTTCGTCAACTCATTCCAGTTGGATGGCAA AATCTTTTATTCAAAGAAACAATGATGACTTGATTGCAATTTTCAATGCA ACCCAAGTTACTGATgaaacaaaagatgaaaatgttttcaCTCTACCTTC TGTCAAATTGTCCAATGTTGAGGGTGGTGATTTCAGTTGTGTGGTTGTTA TTGACAACATGACGtttttttCAAATACAACAAAATTCATTCCTGAATTT ACTCTGCGATTCCTCACAAAGCCATCAGTTAGAAAAAGTGAGAGTGGCAA CGAGGTAATCATTTCTGGTTGCAGTTATTCTTCGTCAACTCATTCCAGTT GGATGGCAAAATCTTTTATTCAAAGAAACAATGATGACTTGATTGCAATT TTCAATGCAACCCAAGTTACTGATgaaacaaaagatgaaaatgttttcaC TCTACCTTCTGTCAAATTGTCCAATGTTGAGGGTGGTGATTTCAGTTGTG TGGTTGTTATTGACAACATGACGtttttttCAAATACAACAAAATTCATT CCTGaGAACCAAGTCACAAGTTTCAATGAAGCTCAATATTACTTTAGCAT TTCCAAGAAGAATTGGCAGTCTGCAGAAAATGATTGTATTTACCTTGGAG GTCACCTAACAAGTGTCCACTCTCAGGCTGAAAATGAGTTTATTAACCAA GAAATCAAGAGaGAACCAAGTCACAAGTTTCAATGAAGCTCAATATTACT TTAGCATTTCCAAGAAGAATTGGCAGTCTGCAGAAAATGATTGTATTTAC CTTGGAGGTCACCTAACAAGTGTCCACTCTCAGGCTGAAAATGAGTTTAT TAACCAAGAAATCAAGAGGACAACAGGGAATGTTATTGTTTGGTACGGTg gtgaaagaaaaaacaatgtttttgtttggaCTGATGGTACAATTTTTACC AAAACTTTCTGGAATACTGGTGAACCAAATAACTTGGGTGGAAATGAAAA TTGTCTTAACGTATATGCAACTGGAATGTGGAATGACATCAGCTGTCATA ACTTGTTTTATTACGTATGCAAACTTCGCTCATCAGGACAACAGGGAATG TTATTGTTTGGTACGGTggtgaaagaaaaaacaatgtttttgtttggaCT GATGGTACAATTTTTACCAAAACTTTCTGGAATACTGGTGAACCAAATAA CTTGGGTGGAAATGAAAATTGTCTTAACGTATATGCAACTGGAATGTGGA ATGACATCAGCTGTCATAACTTGTTTTATTACGTATGCAAACTTCGCTCA TCAGATTTTACATTGCAATTCCTCACAAAGCCATCATTAAGAAGAAGTGA GAGCAGAAAAGAAACAATTGTTTCTGGCTGCAGTTATTCTTCGTCAACTC ACTCCAGTTGGATGGCAAAATCttttattcaaagaaataatGATGACTTG ATTGCGATTTCTACTGCAGTGCAAGTTACTAATGAAACAAGTCGTGACAA TGTTTTCACTCTACCTTCTGTTAAATTGTCGTATATTGAACATGGAGATT TCAGATGCGTGATAATCCATGACAGTATAACGTATTACTCTTTTGCATCC AAATTGTATAAATCTCCAGATTTTACATTGCAATTCCTCACAAAGCCATC ATTAAGAAGAAGTGAGAGCAGAAAAGAAACAATTGTTTCTGGCTGCAGTT ATTCTTCGTCAACTCACTCCAGTTGGATGGCAAAATCttttattcaaaga aataatGATGACTTGATTGCGATTTCTACTGCAGTGCAAGTTACTAATGA AACAAGTCGTGACAATGTTTTCACTCTACCTTCTGTTAAATTGTCGTATA TTGAACATGGAGATTTCAGATGCGTGATAATCCATGACAGTATAACGTAT TACTCTTTTGCATCCAAATTGTATAAATCTCCAGATTTTATCGATGTTCC AACATTTGCGAGAGAATCACAACATTTGCTGTCTGGATGTAATTTCTTGT ATCACGAGGCACCACAAACTGACAACGTTTTCTTCAATCTCTACAACAAT GCAAAACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACCATCAAAAACTCCACAAT TCCAAACCAGTATCATTTCAACCAAATTTTATCGATGTTCCAACATTTGC GAGAGAATCACAACATTTGCTGTCTGGATGTAATTTCTTGTATCACGAGG CACCACAAACTGACAACGTTTTCTTCAATCTCTACAACAATGCAAAACAA TTGACAAACAGAAGACGCACAACCATCAAAAACTCCACAATTCCAAACCA GTATCATTTCAACCAATGCAAAACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACC ATCAAAAACTCCACAATTCCAAACCAGTATCATTTCAACCAAGTTACAGT TACCAATTATACAGATGTGGGAAATTACATTCGATGTCAAATTGATGCAA AACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACCATCAAAAACTCCACAATTCCA AACCAGTATCATTTCAACCAAGTTACAGTTACCAATTATACAGATGTGGG AAATTACATTCGATGTCAAATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000133_pilon | genome | sc0000133_pilon:205968..213195 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1459-1587:7100 |
| Aaloc | 1270-1458:3965 |
| Aaloc | 955-1266:3145 |
| Aaloc | 736-951:2492 |
| Aaloc | 580-732:2096 |
| Aaloc | 271-576:1608 |
| Aaloc | 61-267:685 |
| Aaloc | 1-57:1 |
|