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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000471_pilon:49876..65710+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042054 ID=XLOC_042054|Name=XLOC_042054|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15835bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000471_pilon:49876..65710+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTAACCAGAATTTTAAGCAAACTCAAATAAACGTGCAAGATGGTATTCT
TCCGCTCAATGACCAAACACTCGAACTACTCCGTGCCAAACATCCTGAGC
CAAAAGATGTATGCGAATCAATATTGCTTCCTGATAAACCGAGAGATGTA
CATCCGATCCTGTTCGAAAGCATTACATCTGAAACCATCATGAAAGCTGC
CGTCAAAACAAAAGGAGGATCTGGCCCTTCCAACATGGATGCAGACGGTT
GGAGAAGAATTCTTCTTAGCAAATCATTTGGCAACAGCTCGTCAAATCTA
TGCCAAGCCATAGCCAACGTCACTAAAAAGTTATGCACTGAAGAATGTAA
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TCTCCAAGTTTGTGCCGGACAGGAAGGTGGCTGTGAGGCTGCCATCCATG
CCATGAAATCAATTTATGACGACGAGGAGACTGAAGCCGTCCTGCTAATT
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CATCAAAGTCGTCTGTCCGGAAGTCTCAGGATTTGTTTCGAACTGCTATT
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CACGATACCTCTGCTACTGAtggggaaatcccacttgttcgacagtatac
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GATCAGTTGTTCGACAGCGCATCAGTTCGACGGACCAGTTGTTCGACAAA
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ttcaggttttttttctttcaaagtggcgatgttcaaactttaatttcaaa
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GCAACTTTGGGCCTGGATTTCAAAAAACCCTAAGCAACTCTAGGCCTGAC
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GTTTTTTCatcgatttctcgtgtactagccttgtccgcagtaatgacatt
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gcatttttcatcaaaacacaatTATACGATTCTCAAATGAGACCTAAAGT
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atgacgtttcaaactatgataaaaatatgacaaacatgctatgtaaaaga
aattgaatgttgacaccagaaaatttcaaacttccacctcgccaaaacca
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ATACTCCGGTCTAACATATGTCAATCCTAGCTCTTCccagaaaaaatttg
gaaagatattgccaaCTTTGTCCCAAAACAAACGGTACTTACCTGTAAGT
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ATGCTGGCATGATGAAGGATGAGGATAAATGGGAGGGTTTCATCCTGTGG
TGGGCACTTTATACTCATCCATCTGGAATAATTTATTAATAAAACTCCCA
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CAGCATGATTAGTCTCCTTAAATGTTAGAAGGGAAGCAGTGAGAGGTTGA
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TCTTGCGTTAGACCAACCCGCCTTCTTCAGTATTTCAGTCAACGACATGT
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AAATGGAGGATTGGACAGAGTTTTGGTTCTTGGGCGAAACCTTTTAGCTC
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TGGGAATAATAACTTTATCTGCTAAGAAGTTGATGTTTTTAATGTCCAAA
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CGCTAGCTTTAAGGATAAGAGTTTTAGGTTAAGATTTTCAACATCTTGAA
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GTCTATAGAGTTCCCACAAAACTTAAGCCATTTTTTAAGAGCAGGTTCAT
ATTGTTTTTGGGTTGATTCCCTCCAACTGTTCATTATAATATTTGTAGTA
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tCATCCAGTTGCTGTCACTATAGTCTTTTCTGGATTCTTCATCAGCTTCT
ATATTTTCCTTACCTGGTATATAGGTGCATGTGACCCAgatattgtttgt
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TGCAGCTCCCCATTTTATTTATGATGCCTATGGCAGTTGTATTGTCACAG
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TGAGACTTCTCTGGGTGTATTACAAACCCTATTATAGTAAACATTTGTGC
TGATTTAAGTGTAGATTGCATACAatctataaatttatttttggcaaGTA
GGAAGTCATCTATAAAGCCACATATTGGTATTCCCAGTGTCCTCAGTTTG
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TTGAGGTCTATTGAAGTCAAGTAGTCCCCTTTTGATATCATAAGTAAAGC
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TTAGATTTCTTTGGATCATAGCCATGGATACATCACTTTTTCGTTGAAAA
CTGTTGAGTAATTGCCATAACTCAACGTTTAGTTTAGGCACTGGTATGTT
GCAGTTTTCAGGTAGAGGGTAGCTCTGTCTGAGCTTTTTGATATTCTCCT
TATCTTTCTTGGAATTGTAGCTGTCAAGAATTATTCTAGCAAAgtcatct
tttattttttccccCTTGTCTTCTTCTGTTGAGACAATCCTTATGTCAGA
GAAAATATCGTCATCTTGTGTGCTTGTAGATGGTTCATTTTGCACTTGGA
TGCTGGTGGGGACCGCAGAAGGGGTGTCGTCCTTAGTTTTAGAGCTAGTA
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TAATTCTTCGTCAAAATCAAGTTCATTAAATTCCATATCCTCATCCTCCT
CTTCATAATAGTCCCTCTGAGGGGAGGTATCTATGCCCTGCTGAGGGGTT
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TTCTCCGCCCTGTTGCTTGATCCGTCATGAACTGACCAGCTTGCCGTTCT
ATCTCGCTTTATACTCGTAATCTCGgaataatttatgcaataaaattatt
tttagcgtcattctaggctttttactaaatttttcttgtttgatgatgtt
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TTGTTCGGCTACTCCATGGATTATGGTGTTCCTTTGGCGTTGGTCGTGAT
CTctcttttctttgatttcagcGTACCTTGTCTCTTTTACGATTGATTTC
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ctagcgttaaaactctacctttcgaacctactttagagcacttacaaatc
gattgtggtttcaaaacaccccggtgaatttcccttttgtgccaagtatt
ttgtccctgattgtaactcaaaaaaaggttttgtgaaaaaaaatccgaGT
TAGCCAACtcgagaattttttttgcgaaaaaaaagattccagttaattct
aactcgaaaaatcttttttggaaaagaaaaatccagTTAGAATTGAGTAT
ACgtcataattttcatttttatgacgtcataatttagctaactcgaaaat
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TTACCGTGTCGGAAGagaatttctgcatctgggagCCAGATAAGGGCAAA
CCGTAGGCTACGATTTTATGTGAAATATACTTTGGTACAGGGTAATGTAC
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ACGATCACTTGTTCGacgcccacttgttcgacaattaatgtcgaacaagt
gggcgtcgaacaagtgggtgtcGAACAACTAtagattgtcgaacaagtgg
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acccacttgttcgacaattttacgaatttgtcgaacaagtgAGTTGTCGA
ACAAATGGGTTGTCGAACATGTACTACTGATGGTGATAAATGCAACGTCA
GAGAGCCATCTGGATCAAACGAAAGCTGAAGCCTACGCTGACGATTTTTC
TGCTGCAGGCAAGATCAGTGGTATCAGATGTTGGTGGAATAATCTGTGCA
GACTCGGTCCATTGTTCGGATACTATCCCGAAGAAAAGAAATCTTGGCTG
ATCGTCAAACCAGGTCAACGTTCGAAAGCTGAAGTCGAATTTCGTGATAC
CAACATCAACATTACTACAGAAGGCAAACGTCACCTTGGTGCTGCTCTCG
GGCCAAATTCATTCCGAGATACATACGTTGACGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000471_pilon:49876..65710+ >XLOC_042054 ID=XLOC_042054|Name=XLOC_042054|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2250bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000471_pilon:49876..65710+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTAACCAGAATTTTAAGCAAACTCAAATAAACGTGCAAGATGGTATTCT
TCCGCTCAATGACCAAACACTCGAACTACTCCGTGCCAAACATCCTGAGC
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CATCCGATCCTGTTCGAAAGCATTACATCTGAAACCATCATGAAAGCTGC
CGTCAAAACAAAAGGAGGATCTGGCCCTTCCAACATGGATGCAGACGGTT
GGAGAAGAATTCTTCTTAGCAAATCATTTGGCAACAGCTCGTCAAATCTA
TGCCAAGCCATAGCCAACGTCACTAAAAAGTTATGCACTGAAGAATGTAA
AAACATCGATGCACTCCTAGCAAGTCGCCTGATACCACTAAACAAAAACC
CAGGACTCAGGCCGATCGGTGTTGGAGAAATCCTCCGAAGAATTGTCGGT
AAAGCTGTTGTCGCTACCACTCGCGATCATATCACTAAATCAGTCACGTC
TCTCCAAGTTTGTGCCGGACAGGAAGGTGGCTGTGAGGCTGCCATCCATG
CCATGAAATCAATTTATGACGACGAGGAGACTGAAGCCGTCCTGCTAATT
GACGCAAGCAACGCATTCAATGCAGTAAACCGAAAAGCCTTCCTACACAA
CATCAAAGTCGTCTGTCCGGAAGTCTCAGGATTTGTTTCGAACTGCTATT
CAAACCCAGCTCGTCTTTTTGTTATTGGAGGCTTCGAGCTGCTCTCACAA
GAAGGTACGACTCAAGGAGACCCGATCGCTATGGCAGTTTATGCAATCGC
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CGTGCCAAACATCCTGAGCCAAAAGATGTATGCGAATCAATATTGCTTCC
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CAACAGCTCGTCAAATCTATGCCAAGCCATAGCCAACGTCACTAAAAAGT
TATGCACTGAAGAATGTAAAAACATCGATGCACTCCTAGCAAGTCGCCTG
ATACCACTAAACAAAAACCCAGGACTCAGGCCGATCGGTGTTGGAGAAAT
CCTCCGAAGAATTGTCGGTAAAGCTGTTGTCGCTACCACTCGCGATCATA
TCACTAAATCAGTCACGTCTCTCCAAGTTTGTGCCGGACAGGAAGGTGGC
TGTGAGGCTGCCATCCATGCCATGAAATCAATTTATGACGACGAGGAGAC
TGAAGCCGTCCTGCTAATTGACGCAAGCAACGCATTCAATGCAGTAAACC
GAAAAGCCTTCCTACACAACATCAAAGTCGTCTGTCCGGAAGTCTCAGGA
TTTGTTTCGAACTGCTATTCAAACCCAGCTCGTCTTTTTGTTATTGGAGG
CTTCGAGCTGCTCTCACAAGAAGGTACGACTCAAGGAGACCCGATCGCTA
TGGCAGTTTATGCAATCGCCACGATACCTCTGCTACTGATGGTGATAAAT
GCAACGTCAGAGAGCCATCTGGATCAAACGAAAGCTGAAGCCTACGCTGA
CGATTTTTCTGCTGCAGGCAAGATCAGTGGTATCAGATGTTGGTGGAATA
ATCTGTGCAGACTCGGTCCATTGTTCGGATACTATCCCGAAGAAAAGAAA
TCTTGGCTGATCGTCAAACCAGGTCAACGTTCGAAAGCTGAAGTCGAATT
TCGTGATACCAACATCAACATTACTACAGAAGGCAAACGTCACCTTGGTG
CTGCTCTCGGGCCAAATTCATTCCGAGATACATACGTTGACGAAATGGTG
ATAAATGCAACGTCAGAGAGCCATCTGGATCAAACGAAAGCTGAAGCCTA
CGCTGACGATTTTTCTGCTGCAGGCAAGATCAGTGGTATCAGATGTTGGT
GGAATAATCTGTGCAGACTCGGTCCATTGTTCGGATACTATCCCGAAGAA
AAGAAATCTTGGCTGATCGTCAAACCAGGTCAACGTTCGAAAGCTGAAGT
CGAATTTCGTGATACCAACATCAACATTACTACAGAAGGCAAACGTCACC
TTGGTGCTGCTCTCGGGCCAAATTCATTCCGAGATACATACGTTGACGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000471_pilon | genome | sc0000471_pilon:49876..65710 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 889-1194:15530 |
| Aaloc | 70-888:1 |
|
