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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000487_pilon:17160..22126+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042041 ID=XLOC_042041|Name=XLOC_042041|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4967bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000487_pilon:17160..22126+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTTCCTAAAGTTGATGCCATCGAAGATTTGTTCAAAGCTTGGTTTAG
GATGAACAAAAGCATGTACACAAACTCTATGAAGTCATTGCCTGCCCGTA
TTTTGACAATTGATCATACATTCAAGGTTAGTTCTCAAACAGTTTTTCAT
GGCAATTATTGTTGAGTTTTAAAAGAGGTGGGATTATATAtaacttattt
aaaaaaatcagaaagtggTGTAGTAAATAAATTATACTGACTAGATCAAA
TTTGTTTACCTAAAGGGatgaaatttttgcgaaatctAATTTTGCGGTTG
CAGTTAATTTGGGCCGTTAATTTCGcagttaaaaagattttttgtttaac
ATTTTATATGGCCTactttgccctaaaaagactaATTTTATAGGTATGAT
TATTTAAATCATGAGAATAGTCGTGTTTTCTGGAATTTAATTAGgcagat
ttgtcaaaaaacctgGGAAATTGAattccacaaaaatttcttccacaTGG
CTGTTCACAttgtacgtacgcactaagggggaggGGTATCTTATCGAAAG
CTTGCGTATAGGGGGAGGGTGGGTATTGCACGCCAaggcggaaataaata
ctatctttcattttgCGACACTATCTCttcccaaaaaaacattatcttaa
ttaaaacgatactatctttatTACAGAATCTTTATTATGGAAACCGAGAA
GTCCCATAtctaattttggtaaaaaaattaaattaaaaaaaaatatcaat
ttagagaaaaattaaattttagaaaaaaattaattttaggaaataaaatt
ttgtttcagagaaaaaagagaaaaattcaccgtctgaaaaaaaattctaa
aagagaaaaacttGTTGGCCTGATTCCTCCGTGCACACTtgcaacttttg
ttttcatgctTCCTGGATTTGTGACCagatgattttttgcacatagttGT
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atagctaatcgatactcacaattttttagcactcaattaaattatcacca
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AATTAatatcgatataatcgataccTCGACCTTATCGGTTCTTAATCGAT
AATATCGATGACACTTCTAATTGATATAATGGATATCTTATATCtgatcg
atataatcgatactCACAACATTTTAGGCgctgattatttatcgattatc
gTTTTCatcgatatttaatcaatttaattaattatcgattagctatcgat
tttaatcgataatcgattttattgattaGTAACGTCTGGACAAACAATGC
AAGTTGACAGAACcaaactttgaagaaaaaaaattatttgggcaaATGGG
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TAGGTAaaatgttttctgattttttatcaTATCGTAGGTAACGGTTGAGT
TAGATTTCAgtaacaaaaataaatctacataacaaaccctttttataaga
atatttttgattgcattcaaaaatagaaccccaaaaagtgaggttttcaa
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AGTAcaaaattctataaaataaggaaattgatgagctttccaaaaatgtg
gctccctttgaagttgagtgattcagtcttgaaatataagatggcaaagt
gagggcaggttttgtggctgtatgtcatgtggctcactcaacgggttggc
ttatatgtgctgtcctgctttaagacttcaatattttttaaccgtttttc
ttggAATTGGTAGTTTGAggtctgataaagatacttatgggtttaatttg
tggctgcaggattttcaatgggcttaaaacagcttaaaatgtggcttcaa
tcactaatttatcaatttacaaaatcctaacctgagatcagattgtgaat
gttttctgcacaccacgctgaagctctaaagggatgtgtgaaaacaaaca
atctgacgaatatgcaatctcgaaatcgtaaggaccgcgttcgtctaaaa
ggactgggaatgataacaaagttgcgcgattgtgtttatgaaaagggcgc
cgtatcagtttttatttttccggcgcacaacaagattcttgttgtagaat
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gatgcaaaacaaacacaatctgacacaatacagtgttattttaagaaaaa
gtgtacattttgtggctgcaaataccattttttgtacataaaaccttctg
agctgttacatataagtattagttggcatttttagggttggctcatgtgc
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tAGTTTAATGTCTcataaagatacttatgggtttaatttgtggctgcagg
gttttcaatgggcttaaaatgtggcttcaatcaaagcatatatgaaaaaa
tcGTCAACTTTGAGCCGCAATTCTAGCCCAGTGACCCAATGattttggtt
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gtttcgtttgaaaagagttatttttaaaaaggatattcaaatttcttttt
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ttctcggcttccataaaaaagatagtatcccctaaaaaagatagtatcgt
ttaaaaaaagatgGTGTCGTTTTAATAAAGATAATGTCGCGAAATGTGTC
GGGaaataaaagatagtgtcgcaaaatgaaagatagtacttatttccgct
ttggcgtgCCATAGGTGGATTGACTGAAAATGTACCATATATATCATAGC
TTTGTGTTTAATGtcgacataccttgtctaattctgccatagcaactatc
tggtctgcaaagtagttTAGTACGGTATAATTATGTAAAAATTGTGCACA
AAGAAAGACGTGCAAGCATGAGACTTGGCACTAttgtagtttaggggtca
aaatTGGATTTAAATCTTATACCCCAAAAATTGACACATGtctgtgtatt
ttacagaccagaacaggtttccaggctaaaatgaatttttttttctccaa
agtatgtcatgttcAGACCAACATAGGTAGGGTGTAACTCCAGAACGACC
CAAgaggtttattttttttattgttgtaCCTATCAGGTACGATTAATTAG
ATCAGATGCAAActtgagtctgctaaatcacaTGCCTCAAGTGCCCTGAA
TTTTTAACGTGCCCTATTTCTTTACGTGCCTAGAATTTTTTATGTGCCCT
AAtttttttATGTGCCCTAATATTTTCATGTGCCCTAATATTTTCACTGG
CCTTACTTTTTTATGTGCCCTAtttttttCCACGTACCCAATTTTTTCAT
GTGCTCTAAATTTTTCACattcacaaaattaaaaatcacaTGAAAGTTGG
CACAAATCACTAAAAACTTAAAGTATAAGCTGATTTTTTAAACAGCTTAT
TCAGAAGGTTTCATctataaacattttaaagaccagatagTTCCTATGAC
AGGAATAGACAAGGTGTGTCGGCATTACACAAagttgctgatgtcagcat
ctTTTCGTTTTTGCTTAGTAATATATTTTCTGGGTGAAAAAAGTAATTAC
GACACAGCCATTCTAgtgatgtatgaagtgatataaTTTGACAAGTAAAA
ACGGTGATTAAAAATTTgggtgaatttgaaaaattgggacATGCCTTGAA
TCGCCTGAGTGCAAAATTAATCGATTTTTTGACGAACTAGAAATGACGCT
AGTTACTTGTTGCCAACTAGCCAAGCATCTGTCTGCTCCTGACACGAGGC
AGTATTTGAGAGGTAATCATTGGTCTAGGCATTTATACAATTCTGCTTCT
CTATTAGATATTAAATTGCTGTATAAACTAATTCAGAacaaattttttgt
tcttttaggTGACGTCCAATGTTGGAATGTTCAGACAAGGTGACAATAAG
GAATGGGTAAAGCTTTACAATTCTCTCTTTGTTGCActtaataaaagaaa
acaaatcgTCACTTGGCATTTTACTCAAGGGGAAAAGTTCAGTTTGGTAA
GAGATATCCTTGACAAACTCAAGGAGcgagaaaactttaaaattgaaatg
gttcTGTTGGACAATTGCTGCAAATACGATCTTGTCATCAACGACATATT
TGGAAACCAAATCTTCATTAAACTGGACCCGTTTCATGGGATTCAAAGGA
TCACATCTACCATTAGGAAGAAGCATCCTTTCCACCAACAACTATGTAGT
GATCTGCACAATCTTTTACGCCATCCAACAGACCTATCCTCGAAACGAAG
AACTGTGGAAACTGCCTCTAAAGAAATCATTCTGGAACTTCTCGATAGAA
TAGTTGCGAAATGGGAATCGTTGGAGTTTATGTTGGACGAAAGGTCATTG
ATAACGATGGAAACAAGAGAAGCCTTTCTCAACTTAAGGAAGCATATTTC
TAAAGGATGTTTATCCAATATACCCGCTGGTTGTTCTACAAGTGTCAATG
AGAATCTTCACAAGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000487_pilon:17160..22126+ >XLOC_042041 ID=XLOC_042041|Name=XLOC_042041|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1470bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000487_pilon:17160..22126+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTTCCTAAAGTTGATGCCATCGAAGATTTGTTCAAAGCTTGGTTTAG
GATGAACAAAAGCATGTACACAAACTCTATGAAGTCATTGCCTGCCCGTA
TTTTGACAATTGATCATACATTCAAGATGCTTCCTAAAGTTGATGCCATC
GAAGATTTGTTCAAAGCTTGGTTTAGGATGAACAAAAGCATGTACACAAA
CTCTATGAAGTCATTGCCTGCCCGTATTTTGACAATTGATCATACATTCA
AGgTGACGTCCAATGTTGGAATGTTCAGACAAGGTGACAATAAGGAATGG
GTAAAGCTTTACAATTCTCTCTTTGTTGCActtaataaaagaaaacaaat
cgTCACTTGGCATTTTACTCAAGGGGAAAAGTTCAGTTTGGTAAGAGATA
TCCTTGACAAACTCAAGGAGcgagaaaactttaaaattgaaatggttcTG
TTGGACAATTGCTGCAAATACGATCTTGTCATCAACGACATATTTGGAAA
CCAAATCTTCATTAAACTGGACCCGTTTCATGGGATTCAAAGGATCACAT
CTACCATTAGGAAGAAGCATCCTTTCCACCAACAACTATGTAGTGATCTG
CACAATCTTTTACGCCATCCAACAGACCTATCCTCGAAACGAAGAACTGT
GGAAACTGCCTCTAAAGAAATCATTCTGGAACTTCTCGATAGAATAGTTG
CGAAATGGGAATCGTTGGAGTTTATGTTGGACGAAAGGTCATTGATAACG
ATGGAAACAAGAGAAGCCTTTCTCAACTTAAGGAAGCATATTTCTAAAGG
ATGTTTATCCAATATACCCGCTGGTTGTTCTACAAGTGTCAATGAGAATC
TTCACAAGTGAgTGACGTCCAATGTTGGAATGTTCAGACAAGGTGACAAT
AAGGAATGGGTAAAGCTTTACAATTCTCTCTTTGTTGCActtaataaaag
aaaacaaatcgTCACTTGGCATTTTACTCAAGGGGAAAAGTTCAGTTTGG
TAAGAGATATCCTTGACAAACTCAAGGAGcgagaaaactttaaaattgaa
atggttcTGTTGGACAATTGCTGCAAATACGATCTTGTCATCAACGACAT
ATTTGGAAACCAAATCTTCATTAAACTGGACCCGTTTCATGGGATTCAAA
GGATCACATCTACCATTAGGAAGAAGCATCCTTTCCACCAACAACTATGT
AGTGATCTGCACAATCTTTTACGCCATCCAACAGACCTATCCTCGAAACG
AAGAACTGTGGAAACTGCCTCTAAAGAAATCATTCTGGAACTTCTCGATA
GAATAGTTGCGAAATGGGAATCGTTGGAGTTTATGTTGGACGAAAGGTCA
TTGATAACGATGGAAACAAGAGAAGCCTTTCTCAACTTAAGGAAGCATAT
TTCTAAAGGATGTTTATCCAATATACCCGCTGGTTGTTCTACAAGTGTCA
ATGAGAATCTTCACAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000487_pilon | genome | sc0000487_pilon:17160..22126 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 127-735:4359 |
| Aaloc | 1-126:1 |
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