|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000064_pilon:474507..480995- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042033 ID=XLOC_042033|Name=XLOC_042033|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6489bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:474507..480995- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTGTGGTTCAGCAGCAGTTCGATCGTTCGATAGTGGATGTTTGGATGG
TGTTGATGGTTTTGCATTGATCGCTGTTTGTGGTTCAGCAGCAGTTCGAT
CGTTCGATAGCTGGATCTGATAAGAAATATTTCATAATGAATTATTTCAA
TAGTTTTCGGGTAAGTTACTTGGTAAGTTATGACCCTTCGATGATAAAAT
TTGGATAAAAGTCAATGGCCGAAATTAAAATCAGATTTGACACCCCTGTT
TCGTTAAACTGACGAGATTGTTTCACAAGTGAATATACTAACACAAAATA
CTCTCTAATTTCATCCCAAATTATCAACCTTCATCCCCTCTAGAAAGAAC
ACAAAACAACACTCAGATTTTGATAATTCCTATCGATCTTTGAGATTTTA
AGAATTTCAGAAATTTTAAAAGAAAAACAAAAGAAAATTTTGGAAAACCC
TGAAAAAATTCAATGATAATGAAAAATGATAGAAAGAATTAAAGGCTTTA
TATTTTAAAACATGTACAGTATGTATAAACGAAACTGGATCTACTAACTT
GGAACTCGACATCGATTGATTTATTTGGAGTTGAAACTTCTATTGGTCGA
ATTGGTGCACTATCGAAACTTAAATCTGCTATTGCCTTGTCGGACTCCTC
GGTCTCAAATTGGTCAACATTTAGACTTTCTTCCTCTGTGATGCTGTCCA
TTATACGAAACTTAGGTTTTGACGCTGCTGCTTTGTCCAGAAAACTACTT
TCGATATTGACTAAATTGACAGGGTTGTCGCATTTGGTTAACTGAAACTC
TTTACTCTGATCAAGGATTTCAGTGTGGATTGATTTTTTCTTGGCCTGCT
GGTATTCAGCGATCTGCCTGCTCCACTCTTTGATTGTACTGCGATGGTCT
TTACCCAATTCAGTCTGCTTTCCCAGTGTATTTTGATAAGAAACGCACGT
TTGAAGAGCATTAAATCTAGCAAAACATTGCTTATCAGCTTTTCCTCTCT
TGAGAATGATGCTGTTCAACACAGCACATTGATTCAACGTTTGATTCCGA
CACATTAGCAGGGAATTCACGGCGTTCATGACTGCTGGTATACATGTCGC
TAAAGTTTTATTCTTATTACGATTTTCTCTTGGGTTTTTAGCGATGCTGA
CAATAGAATTGAATGTGAACGGAGCATTAGTTTCAAGTTCTTGATATTGA
GTATCATATGAGAATTCGGTCAATTTCGAAACATCGTTACATCGAAAGGT
AGTTGTTTCATTTTTGCTTGAACAGATCTGTTTGATTTCACTTTTGATGT
TCTTACCAATGAACTTAAGAACAATGGAATTCAGTTCAGTATCTTCAGGT
GTCAGATTCGATAGAATGTAATTTAACAGGTGCTTCTTATTGTTTGCCAT
GGCAAGTTTAATCAACTTTTGTTGTTGTTTTGTGACGTGGATTTCTGTTT
CAGCCGATCCATTCTCTTCAGAAACAGTCACCTTAAAATAAAGAAAGCTC
AATTTACTTTCAAATCTCTATTGTCATTAAATTTCTATTTTAGGAAGAAA
GCTTTGAAAAATTTTCCCTATTAACCTGAAATAAGGCAAAAATTAGACAG
AAATTTAAAGGTTTTTGTAATTTCTATCCTAAAAATTGTTAGAATAGATA
AAATAAAACAAAGAAAAAAAACAAAAAAAAACACTTTTCCAAAGAAAATC
CCCCAAAAAATCCCAAAAATCCTAAAAATTTTTCGAATTTTACAGCCTCA
AGATCATATTATAAAAGAGCTTATTGTCGAAGTACACGTTTTATTATTTA
TCAGAACCCAGTTTATAAGGACATTTAGGCTGAAATTTAGCAAAAATTTA
AGAACATCTTAAGAACATGTTCAGCCCGAGAATCGAAAAAAATTGCTGAA
AACCTCATTAGGAGTCATTCAGGAATTTTGTGTCATGCTGTAACTAATTT
TCTCCTCTAAAAAAAGTAGCAAATTTACTCGATTTTGAAGCCAATTTTAA
CATTTAAAGGTTTCATTAGATTTTAAGTGAACCGAATTCAAGAACACCAA
TAAAAACATTTTAGACTGAAAATTGATAAGAAAATAAGAACATCCAGCCT
CAGCTGAAATTAGGACGTTCTAGTAAAAGAGCGTGTATATATCATTATCA
CATGAAAAAGAAATTAAAATACAAAACATCAATAAAAAATATTTAAACTC
TAAGATTCTAAAATCCCAAAATAAAACGAGGCAATTTTGCCAAAACCTAG
GAACAAATTATTTACAATCTGAGCCTCAGATTTCAAGAATTACTTATTAT
AAGCATATTCAGGCTCAATTCTTGCAAAAACTAAGACTTTGCCTAAGCAT
ATGCTTGGCCTCAATTTAAAAAAATTTCAAAGCATATATCCCACAAATTA
CAAAAAAACACCCATAATGTTCAAATTGAACTATCAAATAAGTATAGCAT
ATGCATATTCAACCAAGACTCAAAAAATTAATTTTGCTAAGCATTAGGTA
AATGAGGCTCACAAAAGTTTACACCATGCTTATAAAAAACATGTACTGAT
TTAAAACCGGTTTAAAGTTCCTTTTATTGATGTACAAGAAAAAGTTTGAA
AAATAAATACTCACTTTCATATGCAAATTCTCTGCTCCAATTTTCAAGTG
TTCAAATTCATTTGTCAATTTCTTTCGACTTTTTGGTGGTTGTATGGTTC
CTTTTGACAGCCTTTTTAACTTTGTCCTCACATATTTCTGCTCGGCTACT
TGCCTACCTCTCTGGAATTTACCTCTCTTTACCCCTCGTTTTTTAATGTC
AGTATCGATAGATCTATTACAATTTTCACAAATAATTCGAAAGTCTGTTG
TTTGTTTGATTGTGATACTTAAACACTGTTCAAGATCTTTACATGGTTTA
GTCTTTCGATCATTCTCGAACAAGCAATGACGACGTTTTGAAACTATATC
TTTTTGACATAGAATACATATGCTATGAGCACTCGGAGATAACGATCTGA
TATATTTCTTTGGAGTTTCGACTGCTTCTTCAACTTCCATAATCACAATC
TCAACATCTCTCACTCCAAGCGCTTCAACATTTTACTTTTGCTCTTTTTC
AAGTCTTTCCAAAGTTAGAAAAAAATTTTATTTGATAGCAAATTCTCTGA
AAAACTACATAGTTTATCACCTTTCTTTTGTCTTAATTTTTTCAAATAAT
TTTTATCACTATTAGCAACAAACAGATTTCTCCTTTTAATATGTTAAGCC
AATGAAAACGCAAAATTGATTTTCTCTCAGCCAATAAAAACGCGAGACAT
TGTCTCTCTTCGCCAATCATATACAACAAAATATATAAACAAATAAAAAT
TTCAGCCAATGAGAATTTCTAAGTGAAAGAAAAAAAAAACCAAAACAAAC
CAACAAGACCCCCTGAAAATGTCATCCAAAAACATGAAAAAAGAGAATGT
TTATGAAAAGTTTGTTGTGCACAAAATATTCTAGACGACTATATTGATGC
TCCTGTCAAGTTTTCTACTTCCTATTTTTTACTGAGTTAAGTCGTCTAGC
ATGCTAGACTATATTTAGATCGATGATCAATTTTGAACAACACCATGAGA
AACTTGTACAATCTTATGATTCGCTCACCATCTCCATATCTCCTGGCGTC
AGCAAAGTTCTTAACCAAATAGCCTAACATCAAGGCATTTTTGCTGTAAT
TGACGATACAATCATCTCCAGATTTTTCACTTTCATCTTGTTCATTCCCA
GGATGTTGCTTTTTGAGATGGTTTACCAAACCAGCCTTTCGTTTGTACGA
CTTAGTGCAAAATTGGCAATCATAACTGATAGCACTTGCAGCAATATCTG
GGGTTTCAGCAATGACATAGCTCTCGACAAACTTGCTGATCACATTTTTC
AACGATTCCTTATTCTGCGCGGTTGGTTCCTTCAGTTTTGATAGATCAAT
CTTGTTGGTTTCGATATATTCATGGAAGGCTGCAAGAGTTAAAGCCTCAG
TGTACTTGTTCAACAACTCTTCACATGCGTTTACGCATTTCATAGGCTCT
TTTGACACGTTTCTAGCGTTCAAAAAATTTCTTGCCTGGTAAAGTGTGCC
AACGTCGCTCGATGAGGAGGCGTCATACAAGAAGTGCCAAACAACCTTTA
AAGTAAAATAAAGGGATAAAGATTAAGGATGAGAGCTTAAATTCTACTTT
CTTTCATATTATAAAGTTGAAGTCTTAAAACTCACCTGCAATTTATTCAA
AATTCAAATCATTAGAACTATAATTTATACAATCAATCTTAAAATGATGT
TGAGATTCAGATTCACAGTCATTCTCAACAAAGTGTACCAACAAGTTTAT
TAATCAAGACGAATAAAATTTCTTTAAAAAATCTTTTTCTTTCATTAAAA
TATAGTATACCTCCATAAAATTTCCATATGTATGAAAGTCTGCTAGTCCT
GGAATTAAACCTTCAAGCCTTTTGATGGCTGTTGTGGAACACCTTAAATC
TTCTTGGCTATGGATTTCTCTCTCCAAGGTCAGCAAATCTCCTATTGCGA
ACGTTTTGACCAGCTCTCCGTCTTCGAGACAGGGTACCATTGTATGCAGG
TCTTCCATGATCTCAATCATATCCTCAGTCTTGTTCTCGTTTTTATTGAG
AATGCCCAATGTTGTCTGTAAAGGAAACGTCAAAAACATTTTTGATATAC
CTGCATCAAATTTTTTGTTTAATAGAAAACTGATTCGTTTCTCAAGAGAA
AGAAGGCCATCATTTAAAATAAACATAATGCTAAGCATTCCTCCAAGCTA
AAATGCAAAGATATTCAAGCCTTTACTAAAAACTTGGACCTTATAAGGGT
TACTTTTAAAACTGTTTGAGCTTTCTTAGACCAAAGATTTTCGCCTGAAG
TGCCAAATTACAAAGAAAACTCTAATTTTTTGAGCCAAATCAATGCTCCA
AATTCGAAATTTTCATTAAGTCAAAGAAAATCAACAAGTTGAAGTCTAAG
CATATCATTAAGCATAAAATAAATTAAGGCTGAAAATGAAATTGAGCCTC
GACAAGATTTTCCTGTATGCTTTAAAAAAAGAAAAAAAGTGAAAATTTCT
TACTATCTCTGATTTTCTTTTGGTCTCTTCCATATAGTCATGGGGTATCA
CACTTCGCAAATGATTTCTCATGCGAGACATGTCCTCTCGGTATTCCGTA
AGAACTCGAAACACAAGTGTTGAAAATTCTGTTGCAAGTTTGCTTTCGTC
ATTTTTATTTGGAAAATAATTTGACAAATCGATATCCAATTTATTTTCCA
ATGGCGGTTGTATCATATCTTCCAATTCAACGGGTGCATTGACTCTGTTT
CGAACACCCATCATGTTAAACATATGGTAGTCTATGTTTTGTTTTGACGT
TGTCATATGCCTCCTCACCACTTTATATTCTAGATTGTCACCGACAAGAA
CAAACTTTGGAGGGCGATAAGTGCGACAGATATCATAAAGTTTCACGAAA
TCAGGATTACTGTTCGTATCTTGACTGAATGCGGTATGATCATTAGGTAG
CTGATGTTTGGATGGTGTTGATGGTTCTGCATTGATTGCTGTTTGTGGTT
CAGCCGCAGTTTGATCGTTCGATAGTGGATGTTTGGATGGTGTTGATGGT
TTTGCATTGATCGCTGTTTGTGGTTCAGCAGCAGTTCGATCGTTCGATAG
TGGATGTTTGGATGGTGTTGATGGTTTTGCATTGATCGCTGTTTGTGGTT
CAGCAGCAGTTCGATCGTTCGATAGTGGATGTTTGGATGGTGTTGATGGT
TTTGCATTGATCGCTGTTTGTGGTTCAGCAGCAGTTCGATCGTTCGATAG
TGGATGTTTGGATGGTGTTGATGGTTTTGCATTGATCGCTGTTTGTGGTT
CAGCAGCAGTTCGATCGTTCGATAGCTGGATCTGATAAGAAATATTTCAT
AATGAATTATTTCAATAGTTTTCGGGTAAGTTACTTGGTAAGTTATGACC
CTTCGATGATAAAATTTGGATAAAAGTCAATGGCCGAAATTAAAATCAGA
TTTGACACCCCTGTTTCGTTAAACTGACGAGATTGTTTCACAAGTGAATA
TACTAACACAAAATACTCTCTAATTTCATCCCAAATTATCAACCTTCATC
CCCTCTAGAAAGAACACAAAACAACACTCAGATTTTGATAATTCCTATCG
ATCTTTGAGATTTTAAGAATTTCAGAAATTTTAAAAGAAAAACAAAAGAA
AATTTTGGAAAACCCTGAAAAAATTCAATGATAATGAAAAATGATAGAAA
GAATTAAAGGCTTTATATTTTAAAACATGTACAGTATGTATAAACGAAAC
TGGATCTACTAACTTGGAACTCGACATCGATTGATTTATTTGGAGTTGAA
ACTTCTATTGGTCGAATTGGTGCACTATCGAAACTTAAATCTGCTATTGC
CTTGTCGGACTCCTCGGTCTCAAATTGGTCAACATTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000064_pilon:474507..480995- >XLOC_042033 ID=XLOC_042033|Name=XLOC_042033|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:474507..480995- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTGTGGTTCAGCAGCAGTTCGATCGTTCGATAGTGGATGTTTGGATGG
TGTTGATGGTTTTGCATTGATCGCTGTTTGTGGTTCAGCAGCAGTTCGAT
CGTTCGATAGCTGGATCTGGTTTGTGGTTCAGCAGCAGTTCGATCGTTCG
ATAGTGGATGTTTGGATGGTGTTGATGGTTTTGCATTGATCGCTGTTTGT
GGTTCAGCAGCAGTTCGATCGTTCGATAGCTGGATCTGGAACTCGACATC
GATTGATTTATTTGGAGTTGAAACTTCTATTGGTCGAATTGGTGCACTAT
CGAAACTTAAATCTGCTATTGCCTTGTCGGACTCCTCGGTCTCAAATTGG
TCAACATTTAGACTTTCTTCCTCTGTGATGCTGTCCATTATACGAAACTT
AGGTTTTGACGGAACTCGACATCGATTGATTTATTTGGAGTTGAAACTTC
TATTGGTCGAATTGGTGCACTATCGAAACTTAAATCTGCTATTGCCTTGT
CGGACTCCTCGGTCTCAAATTGGTCAACATTTAGACTTTCTTCCTCTGTG
ATGCTGTCCATTATACGAAACTTAGGTTTTGACGGACTCCTCGGTCTCAA
ATTGGTCAACATTTAGGACTCCTCGGTCTCAAATTGGTCAACATTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000064_pilon | genome | sc0000064_pilon:474507..480995 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 295-324:31 |
| Aaloc | 121-291:5938 |
| Aaloc | 1-117:6490 |
|
