|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:626824..628812- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042013 ID=XLOC_042013|Name=XLOC_042013|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:626824..628812- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCAATATAAAGTTCACAGAGTTAGATTTATTCAACACAAGCCAAA
AGCTACTATTTCAGCAGCACTTGATGTTAATTGTAATCCTCCAAGGCTGG
CAGTCTCTTTAGATGATGGTAGTATTGAAATAAGAGACCCTTCAAACCAT
TTCATGGTAGATATTACTATCCCTGGCCAAAATGGTAGAACTGCTGAACA
TCTTGCGTGGAACAATGGGAGACTCTTTTCTGGAGGTTTAAATGGACAAA
TTATTGAATGGGATTTGAAAAACCTTGTTCCCAAATATTCAGAGGACTCT
TGTGGTGGTCCTGTATGGTGTCTGAAATTCAACCATAAAAAGAATTTACT
GGCTGCTGGTTGCGAGGATGGAAGTGTTCGTATTTTCAAATTGATGTCTC
ATGGGTTGAACTATGAAAGAAGTTTACACAAGCAAGAGAGTAGAATATTA
TCTCTTGCTTGGAGTAAGGACGATGCTAACTTGGTGACAGGTGGATTTGA
AAGTACAATTCGCATTTATAATTTTGAATCAGGTCAAATTGTATCACGAA
TCACAACAGATGGAAAAGGAGATGAGAATACAATGGTATGGGCTGTTGAA
GTTATGGATGATTTTACAGTTGTGACAGGTGATTCAAAAGGCTGCACACA
GTTCTGGGATGGTCACACAGGGACTCTGCTGACTTCTTTCAAGTCACACG
AAGCTGATGTGTTAACATTAGCCCCTTGTGATGAGGAAGTTTATTCCAGT
GGTGTTGATGGTAAAGTTGTTCAGTTCAATTCTCGTTTAGTTGATAATGA
GAAGAAATGGACAATGAACAAAAATATTCAATTGACTGATTATGATATCA
GAGCCCTTGTGTGCTTTAAAAATCCACAAACTGATCGCAATTTTGTTATT
GCTGCTGGTGTTGACCCTTACCTTTATGCAGTCCCAACTAATAAGTTAAC
AATTGCTAAAATGAAGAAATATTTCAATACGCCAACTGATGTTTGCCAAG
TCGCCCCTGATGCAAATCAATTGCTTTATCGGTCCAATAACAAATTAAAT
TTGTGGCAATTGGAATCAAACCAAGATTTGAGTTTGAAGGAAAGTAAGCA
ATTGCTAGAAATTAATTGCGATGGGGATGACCATATCTTTTGCTCAGCTC
TCTCAGCTTGTGGTAAATATGTTTGTTATTCTACCATTGGTAAATCTAGG
CTTTTTGAGATAGAACAATCTCCATTGAAGTTGAATAAGATCTACAGATC
TTTACCTCCACTCTCAAAAATTGCATTCACTCCTGATTCACGCTACATGG
TTGGAGTAACCTTTGCCAAGAAACTGCATTTAGTTGATTTTCAAAATGAG
AATGAGTTTGAACTCAGTATTTCAAAAATCAAAATTAGTTTACCGTATCG
TTTCTTGAAAGTTGCCAATGATAATGAAACCATTGGCCTGGTTGATGCAG
AATCGAACATTTTTATCTTTCGAATCTCTGAAAGTGGCCTTGAATATGCT
TCACAAGTCCCTTCCGTATCTGACAAAATCAGCAGTTTCACATTCCACCC
GCAAAGCTCACGAATCATGTTATCAACAAGTGCCAAAGATGTCTTTGAAT
TTGATTATAAAGAAGGTAAATTCACAACCTGGCTGTTTGATCTTAATGAT
GCTGGTATCTTTAAAAAGTTGAGTCGTGATCACCATTTATTAAATCAAGT
CTGTGTCAATCCTGTCAATCCAAGTGAAATCTTCGTGCAAGCTTTCAATG
AGTTTGGAAAATTGTTGGAAAACGCAACCGTGGATATTCAATCAAAGGAA
ACAGAGGATCAACCAGTCACTAAGAAAGCTAAAAAGTCAATGAACAACCC
ATTGAAAACAATCAACTCCTTCAAAAAGTTATTACATTTCAGTTTCAACA
ATCAAGGGGAAATGATAACTGTAGAGATTCCCCAATCGTTCAAAGAAATG
TTACCATTGCCTTTGAAACGAAAGCGATACCAAAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:626824..628812- >XLOC_042013 ID=XLOC_042013|Name=XLOC_042013|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3978bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:626824..628812- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCAATATAAAGTTCACAGAGTTAGATTTATTCAACACAAGCCAAA
AGCTACTATTTCAGCAGCACTTGATGTTAATTGTAATCCTCCAAGGCTGG
CAGTCTCTTTAGATGATGGTAGTATTGAAATAAGAGACCCTTCAAACCAT
TTCATGGTAGATATTACTATCCCTGGCCAAAATGGTAGAACTGCTGAACA
TCTTGCGTGGAACAATGGGAGACTCTTTTCTGGAGGTTTAAATGGACAAA
TTATTGAATGGGATTTGAAAAACCTTGTTCCCAAATATTCAGAGGACTCT
TGTGGTGGTCCTGTATGGTGTCTGAAATTCAACCATAAAAAGAATTTACT
GGCTGCTGGTTGCGAGGATGGAAGTGTTCGTATTTTCAAATTGATGTCTC
ATGGGTTGAACTATGAAAGAAGTTTACACAAGCAAGAGAGTAGAATATTA
TCTCTTGCTTGGAGTAAGGACGATGCTAACTTGGTGACAGGTGGATTTGA
AAGTACAATTCGCATTTATAATTTTGAATCAGGTCAAATTGTATCACGAA
TCACAACAGATGGAAAAGGAGATGAGAATACAATGGTATGGGCTGTTGAA
GTTATGGATGATTTTACAGTTGTGACAGGTGATTCAAAAGGCTGCACACA
GTTCTGGGATGGTCACACAGGGACTCTGCTGACTTCTTTCAAGTCACACG
AAGCTGATGTGTTAACATTAGCCCCTTGTGATGAGGAAGTTTATTCCAGT
GGTGTTGATGGTAAAGTTGTTCAGTTCAATTCTCGTTTAGTTGATAATGA
GAAGAAATGGACAATGAACAAAAATATTCAATTGACTGATTATGATATCA
GAGCCCTTGTGTGCTTTAAAAATCCACAAACTGATCGCAATTTTGTTATT
GCTGCTGGTGTTGACCCTTACCTTTATGCAGTCCCAACTAATAAGTTAAC
AATTGCTAAAATGAAGAAATATTTCAATACGCCAACTGATGTTTGCCAAG
TCGCCCCTGATGCAAATCAATTGCTTTATCGGTCCAATAACAAATTAAAT
TTGTGGCAATTGGAATCAAACCAAGATTTGAGTTTGAAGGAAAGTAAGCA
ATTGCTAGAAATTAATTGCGATGGGGATGACCATATCTTTTGCTCAGCTC
TCTCAGCTTGTGGTAAATATGTTTGTTATTCTACCATTGGTAAATCTAGG
CTTTTTGAGATAGAACAATCTCCATTGAAGTTGAATAAGATCTACAGATC
TTTACCTCCACTCTCAAAAATTGCATTCACTCCTGATTCACGCTACATGG
TTGGAGTAACCTTTGCCAAGAAACTGCATTTAGTTGATTTTCAAAATGAG
AATGAGTTTGAACTCAGTATTTCAAAAATCAAAATTAGTTTACCGTATCG
TTTCTTGAAAGTTGCCAATGATAATGAAACCATTGGCCTGGTTGATGCAG
AATCGAACATTTTTATCTTTCGAATCTCTGAAAGTGGCCTTGAATATGCT
TCACAAGTCCCTTCCGTATCTGACAAAATCAGCAGTTTCACATTCCACCC
GCAAAGCTCACGAATCATGTTATCAACAAGTGCCAAAGATGTCTTTGAAT
TTGATTATAAAGAAGGTAAATTCACAACCTGGCTGTTTGATCTTAATGAT
GCTGGTATCTTTAAAAAGTTGAGTCGTGATCACCATTTATTAAATCAAGT
CTGTGTCAATCCTGTCAATCCAAGTGAAATCTTCGTGCAAGCTTTCAATG
AGTTTGGAAAATTGTTGGAAAACGCAACCGTGGATATTCAATCAAAGGAA
ACAGAGGATCAACCAGTCACTAAGAAAGCTAAAAAGTCAATGAACAACCC
ATTGAAAACAATCAACTCCTTCAAAAAGTTATTACATTTCAGTTTCAACA
ATCAAGGGGAAATGATAACTGTAGAGATTCCCCAATCGTTCAAAGAAATG
TTACCATTGCCTTTGAAACGAAAGCGATACCAAAAATAAATGTCTCAATA
TAAAGTTCACAGAGTTAGATTTATTCAACACAAGCCAAAAGCTACTATTT
CAGCAGCACTTGATGTTAATTGTAATCCTCCAAGGCTGGCAGTCTCTTTA
GATGATGGTAGTATTGAAATAAGAGACCCTTCAAACCATTTCATGGTAGA
TATTACTATCCCTGGCCAAAATGGTAGAACTGCTGAACATCTTGCGTGGA
ACAATGGGAGACTCTTTTCTGGAGGTTTAAATGGACAAATTATTGAATGG
GATTTGAAAAACCTTGTTCCCAAATATTCAGAGGACTCTTGTGGTGGTCC
TGTATGGTGTCTGAAATTCAACCATAAAAAGAATTTACTGGCTGCTGGTT
GCGAGGATGGAAGTGTTCGTATTTTCAAATTGATGTCTCATGGGTTGAAC
TATGAAAGAAGTTTACACAAGCAAGAGAGTAGAATATTATCTCTTGCTTG
GAGTAAGGACGATGCTAACTTGGTGACAGGTGGATTTGAAAGTACAATTC
GCATTTATAATTTTGAATCAGGTCAAATTGTATCACGAATCACAACAGAT
GGAAAAGGAGATGAGAATACAATGGTATGGGCTGTTGAAGTTATGGATGA
TTTTACAGTTGTGACAGGTGATTCAAAAGGCTGCACACAGTTCTGGGATG
GTCACACAGGGACTCTGCTGACTTCTTTCAAGTCACACGAAGCTGATGTG
TTAACATTAGCCCCTTGTGATGAGGAAGTTTATTCCAGTGGTGTTGATGG
TAAAGTTGTTCAGTTCAATTCTCGTTTAGTTGATAATGAGAAGAAATGGA
CAATGAACAAAAATATTCAATTGACTGATTATGATATCAGAGCCCTTGTG
TGCTTTAAAAATCCACAAACTGATCGCAATTTTGTTATTGCTGCTGGTGT
TGACCCTTACCTTTATGCAGTCCCAACTAATAAGTTAACAATTGCTAAAA
TGAAGAAATATTTCAATACGCCAACTGATGTTTGCCAAGTCGCCCCTGAT
GCAAATCAATTGCTTTATCGGTCCAATAACAAATTAAATTTGTGGCAATT
GGAATCAAACCAAGATTTGAGTTTGAAGGAAAGTAAGCAATTGCTAGAAA
TTAATTGCGATGGGGATGACCATATCTTTTGCTCAGCTCTCTCAGCTTGT
GGTAAATATGTTTGTTATTCTACCATTGGTAAATCTAGGCTTTTTGAGAT
AGAACAATCTCCATTGAAGTTGAATAAGATCTACAGATCTTTACCTCCAC
TCTCAAAAATTGCATTCACTCCTGATTCACGCTACATGGTTGGAGTAACC
TTTGCCAAGAAACTGCATTTAGTTGATTTTCAAAATGAGAATGAGTTTGA
ACTCAGTATTTCAAAAATCAAAATTAGTTTACCGTATCGTTTCTTGAAAG
TTGCCAATGATAATGAAACCATTGGCCTGGTTGATGCAGAATCGAACATT
TTTATCTTTCGAATCTCTGAAAGTGGCCTTGAATATGCTTCACAAGTCCC
TTCCGTATCTGACAAAATCAGCAGTTTCACATTCCACCCGCAAAGCTCAC
GAATCATGTTATCAACAAGTGCCAAAGATGTCTTTGAATTTGATTATAAA
GAAGGTAAATTCACAACCTGGCTGTTTGATCTTAATGATGCTGGTATCTT
TAAAAAGTTGAGTCGTGATCACCATTTATTAAATCAAGTCTGTGTCAATC
CTGTCAATCCAAGTGAAATCTTCGTGCAAGCTTTCAATGAGTTTGGAAAA
TTGTTGGAAAACGCAACCGTGGATATTCAATCAAAGGAAACAGAGGATCA
ACCAGTCACTAAGAAAGCTAAAAAGTCAATGAACAACCCATTGAAAACAA
TCAACTCCTTCAAAAAGTTATTACATTTCAGTTTCAACAATCAAGGGGAA
ATGATAACTGTAGAGATTCCCCAATCGTTCAAAGAAATGTTACCATTGCC
TTTGAAACGAAAGCGATACCAAAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:626824..628812 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1989:1990 |
|
