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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:389404..398432+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042001 ID=XLOC_042001|Name=XLOC_042001|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9029bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:389404..398432+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGACTGGCGTTGTGAAagtaaagtaaaagaaaaatcgATACCGTT
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GGCTTCTCAATAGTAATTCCTTACCCAAGCTCTTTTAAGACACCCTAATT
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CAGATTCGCTGCCATTGAGAATAGGGAATACTActacataattcaaaaat
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TAGAACAAAAAGGGTAGGCCCTAGGACACTACCTTGGGGTACTCCACTAA
GAACTAATTGTTTTTCGGATTCAGCTCCATTTACTTTAACTATCTGAAAT
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cctttgcaaagtcaaagtaTACTGCGTCAACAGCTTTGCCGTTAGCAATG
TCTTCGGTACACACATCTAGATAGTTTAGCAGTTGTGTTACTGTTGATCG
GCGATTGATAAAACCATGTTGCTTGTTAGAAAGCAGTTTCTCTTGCTCTA
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GCTAATCGGACGGTAGTTTTCagctatatttttgtttccttttttgtaaa
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GGATGTTTTCCCGTTCTTGCTTTCAGATTGCTGCGTACatatttccagaa
tctttttggatttgtttttgattgttcgCTGATCtttttttCGAACTCTC
TCTTGGAGCGAGTCAGGGCACTATTAGCGGCGTTGCGCCATCTTACGTAC
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GTCCCAACTCTCATTCACATCTAATTCAATCGAATTTTGGATGAATTCGA
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ATTTTATCtcggaaatttgattttcttccccTGTAAGGATGAGATCGAGT
ATTGATGGTTTGTCGGTGCCTCGTCGCCGTGTCGGCTCAAGGACATGTTG
GTATAAAAAACAGTCTCTTAAAGCATCAAGGAATTTCTCCTCGTCGCTAT
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TTTTATGAGCTTATTCATgttcttgttattttcatcGAAGATATTTGTTT
CAGTTTTTGTCGGGCTTCTATAAAGGCATCCGAGTAACATGGTGTCTTTG
TTCTCCATTGCAATTTCTAATAGACAAGtctcttcaaattcaactttcgt
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TTCCTCTCtttttttGTATTCCTATGTTAGTTTTATATGGTGTAGAATAA
TTCTCAATTGAGTAGTCTTGATCTTTTCTCTCAGAGATCCGTTTGGTGTT
GACTTCGGTGATCGCAATTATATGAGGTTGTTCAGCAGCAACGTGCTTTA
AAAGTTCGTTTTTCTTCTTAGATGTCATTTGGTCTGCATTTGTGTAGATG
ATAGTAAGTTCACTAATTGTTGTGGTTGTGTTTTTTGAATCGTTTTTGTT
AGGTGGGTTTTCATTCAAGCTGTCGTTATCGTTATCGATCGGTTTTATTG
ATTGATAGGGTTGTTGTatcgtttttgtgttttgttgtacACCTTCTTTA
TGTCGAAGCCGTTTTTTGACGATCCTCGAACCCGATAAATAAATTCATCG
GTTTCTAGGTCATCATTTAGGTCTTTCGCCTGCTGTGATAGCTCTTTATA
CTTTTCACGTTGGGACCTACATAGATCTTCTGTGATACTTATGCCTTTAT
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TCATCTTCACTATCGAGGCAAATTAACAGTGGACGATTTGGTTTCTTAcc
tattctaaatatttttttgatcttaGAAGAAACATGTAAATCCTTAACTA
ATTGATCAGCCCATTCGCAGTCCCTAGTAtgattatttttgtcactaTTA
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TCTTTATTGTTGACAGGATACTGTCCTTGAATTCGTCAAgctttcgttcg
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ACATTTTCCACAGGTTAGCGAATCTGAATCCCTGTCGTCAACACATCGAT
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CAtgatgtaatagttatcggacagttgcgagtagaatatgagaaatattt
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AGCCCTTTTCCCTGACTGGGAGTCCCCCCTTGATTagagtttaaaagatt
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atatcaaatttcttCAATTATTAGCTGTAAACTTTCTTGTAGGTGACGAT
TTGGACAACCTGCTTTCGATTGCAACTACcttcaaaatgacaaaatttca
agtctttCTAGAGAAACACATACAATCTGACTACTTGAATACTGTACTGA
CACTGAGTTTATCAATGATTCCCTGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:389404..398432+ >XLOC_042001 ID=XLOC_042001|Name=XLOC_042001|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:389404..398432+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGACTGGCGTTGTGAAagtaaagtaaaagaaaaatcgATACCGTT
cgaatttgatgaaaatgattgtgacgtcatcattattaCGAAAGACATAA
ATCCATTTACCGTCAAGTTTCTTGGTTTCAAATGATGGGGGTCAAATTTT
CAGCACAGGAGCCGAAACAGAAGAATTTTCATCTGAAGACGTTTTAAGGG
CGTTATCGTTTTACTACCCGAAATATTGGACATCCCACATTGAATATGGA
AGACTGGCGTTGTGAAagtaaagtaaaagaaaaatcgATACCGTTcgaat
ttgatgaaaatgattgtgacgtcatcattattaCGAAAGACATAAATCCA
TTTACCGTCAAGTTTCTTGGTTTCAAATGATGGGGGTCAAATTTTCAGCA
CAGGAGCCGAAACAGAAGAATTTTCATCTGAAGACGTTTTAAGGGCGTTA
TCGTTTTACTACCCGAAATATTGGACATCCCACATTGAATGTGACGATTT
GGACAACCTGCTTTCGATTGCAACTACcttcaaaatgacaaaatttcaag
tctttCTAGAGAAACACATACAATCTGACTACTTGAATACTGTACTGACA
CTGAGTTTATCAATGATTCCCTGTTAAGTGACGATTTGGACAACCTGCTT
TCGATTGCAACTACcttcaaaatgacaaaatttcaagtctttCTAGAGAA
ACACATACAATCTGACTACTTGAATACTGTACTGACACTGAGTTTATCAA
TGATTCCCTGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:389404..398432 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 250-384:8895 |
| Aaloc | 103-246:101 |
| Aaloc | 1-99:1 |
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