XLOC_041996 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041996
Unique NameXLOC_041996
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041996 ID=XLOC_041996|Name=XLOC_041996|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7757bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGGCTAATGACATGTCATGTGTTTTTGGATTAATGCAATCTCGCCA AGGTGAATGAATTTATtataaactttcaaattttaccaCGATATACAGAT TGAAAATAGGGCAATGGTTTTGTTTGAGATCTTAAATAAAACGTCAGCAG AAAAATTACTCAAGTAACCCTTCTCTTTTTGCGCTTTAAAGTAGGCTTCG TTTTGATTCCCTTACCAAAACATAACTAATTTAGTTTCTAAAAAGTTGTT TCTACTTCTGGTAAGCTTGGCACCTTTTTAATTTATAACTTGCCAAGTTT TTTAATCAGTATAGTTTCGAAGTGCCTTTCATTAGGTACATGGTAGAAAA TGAAACGCCGCATAATTCGTTGAATTTGCGTTGCTTAATTCCGGAGTGAC AATAGTGAGTAAAAGTCGACTAATGTACTTTTCGTATGAAATAGGGAAAG AGAAAGCCGCCTTCATTACCCTTTAAATATCTCAGTCTCATCGATAATCA ATACATCTAACATTTCCAGTACTTCATGCATGGAACGTCAACGATGTCTT TACTCTCAAGCttttaaattattaaaatttagataatacataattttgtt ttgttaaagTACTCAGCGcttttttcgtctttctgaataattttgttttc tctttgttttctcttttcttttttcgtcGTTGTCGACTTTCGAATATTCG AATCGACGATCACGCGTAATAAAGTGACGTCAATAATTGTTCTCGATAAC ATTGCAGTGTGCTAGTCGTTTGGCACTCATTCTAACGTCAAAGTAGTTAA TTTACTCACGTCAAAGATGGATGCAGAGGACTACGCTCATGCTATCCTAC GAATTGTTATTGACATTCTTATTACTAATTGAAGAATATATTAGAAGTAT CTTTACTTGGGCAAATGGCTTAATAGAGCAGGCTATGTTTGCTATTATGA 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ACCGCTAGAATCATGGTGGGATTGTTGAGAgggggtagcatcaaatttta aaagggagAAATAGTGACGCCCTTCACTTTTCAAGAGTCGGGGTAAACAT TTAACTTggggaaaagaatttttcggatttttcagcctaaatttagaaat tttctaaCGGAtatataattctttttttctaggAGATATTTTACTTACCA ATTTTTTGCacttataaaaatgtttttgaccTGAAAACTCGTTTATTCCC TGTGGTTGTAGCCCAGAAACCTGGCGACGAAAAGCCATTTGCCGAATCCG ATTCTGATTTTCATGATAGCGATGGCTTTAGTAACGGCTTAGGTCGCCAA GACAGACCGTGGAGAGTTTTCTGTGCTCGTACTTTGATTGGTTAAATCTT TATAAAGCAATTATCTTAGGCTTAGTGacttttattttggaaattctCTA TATCACGTCTAAAGACGAAGGATGTTTCAGAGATGAAAAGGcgaatattt tttaacaaaaaagttaattgtGTTACTTCATAAAGCTATGAGATTGGGTG TGTAGGTGTAATTTGGTTCAATGCCAACAGTGTAACAGAAAAGAGTCAGG GCCAGATTCTGTGTCTACTATTGTTGCGATTAATAGTTCAGTAGCAGTTT CTTTAAATAACCATTACACCTTTATGATTCTTCTAGAGACCAGTGGTCAG TTTCAGACATCGCTCCTATGTCTGACCGCCGCTCATTCCCGTGTGCTGTA ACAATCAACGATGATATTTATGTCATGGGTGGCTATGATGGTCACGATAC GCTACGAACGTGCGAAATCTACAATATGACACGTAACGAATGGACCAGCA TTGAGCCGATGAATACTGCTAGATCGAATGCTGGTGCAGCACATATCAAC CGTAAAATCTTTGTCGTTGGTGGCTGGGACGGCGTTAGTTTGAATTCAGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+

>XLOC_041996 ID=XLOC_041996|Name=XLOC_041996|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3702bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGGCTAATGACATGTCATGTGTTTTTGGATTAATGCAATCTCGCCA
AGATGTTGGCTAATGACATGTCATGTGTTTTTGGATTAATGCAATCTCGC
CAAGCCCATAACAAGAAAGAAGGGGAAATTCATTTCGAAGAAAACCACTT
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GGACGTGAAGGACAAACAGAACTACTAGACACGGTTTTTTCATACAACAT
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ATCATGGACTTGCTACTATTGATGGTGAAATGTATCTTGTTGGAGGCATT
ACAACAAGCCGTGCAGAAGGACGTGAAGGACAAACAGAACTACTAGACAC
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TGGGTCAATTTGGCAGCACTACACGTCAAACGAAGCAAGATGTCAGTCAT
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CCTTGAACTCGGTTGAATGCTACAATCCCGTAAATAACCGTTGGAAGTTT
GTGGCACCTATGCTGACACATCGGCGATGCACGACATCTGTATCTAATGG
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ATTACGATCTTGTTACACACGAATGGGTCCGCGTTACTAGTTTGCCGAGA
CCAACAACTGGAATTCGTTGTGGAATCTTAGTCAATCCTTCATCAAGTGA
ACaaaaaccgaaaaacaaaaatggccgCGGTGCCAACTGCATTATTTCAT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041996XLOC_041996-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000019_pilongenomesc0000019_pilon:514131..521887 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1432-1851:7338
Aaloc1297-1428:5088
Aaloc1129-1293:4372
Aaloc961-1125:3741
Aaloc55-957:965
Aaloc1-51:1