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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041996 ID=XLOC_041996|Name=XLOC_041996|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7757bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTGGCTAATGACATGTCATGTGTTTTTGGATTAATGCAATCTCGCCA
AGGTGAATGAATTTATtataaactttcaaattttaccaCGATATACAGAT
TGAAAATAGGGCAATGGTTTTGTTTGAGATCTTAAATAAAACGTCAGCAG
AAAAATTACTCAAGTAACCCTTCTCTTTTTGCGCTTTAAAGTAGGCTTCG
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tctttgttttctcttttcttttttcgtcGTTGTCGACTTTCGAATATTCG
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TTTATTGACAGTAAACAACTGCTTGGGAATGCAAAAGTTTGCCGAGTCAT
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ACTTGTTCCTATAATATCTAGCGATGAATTGCGAGTTTTAAACGAAGAAA
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aagaaatatttccCGGAACTTGTACAACACATTCGGTTACCAATGTTACC
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CCGAATCGCAGAGGTGTTATGGCGCAGACGGCAAGAACAAGACCGAGGAA
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ggagatttagaaaaacattagaaccataggtcaaaaatgaagcgaatgaa
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tccatcagcttgagtatcccgttagcaagggtcggactttgtggttttta
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AATACTTAACATACGGGAACATcccatgaattttttttactaaaagcCTT
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GAAAATCCTTTCATTCATAATttcttacacgcttttttttataagaacac
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AGATTTTAGAAATTGCTAAGACATTACTCAGCAGACTTTAAGcaaagaaa
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CGTGCAGTGGTTTGATTTTCGTTGTTGGTGGTTTTGATGGAAGTCAGACC
TTGAACTCGGTTGAATGCTACAATCCCGTAAATAACCGGTAATCAACAAt
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TGGAGTCTCAGTAAATCGAACACGAGCGGGGTAGTAGCATAGAGAGGCTT
TTGTGTTGCAAAAATTtttaggagagcagatttttatagcacagtaatta
tctttttatgaTATGAATATCTACTCTCCTACacagttatagaggttcga
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TATTCCGATTTTTAAACTACACCTGAGAGTAGAAACAAATTGAAAGTCAC
TTAAGTATAGCCGTTTCTTAggacaattttcaaacttcaaagcaattttt
atgattttcaagtctCCCCTTCTTTCAAGTACTGTAGTGCAAGATAGCTT
TTAGCACTTTTACCAGTACTTATACAGAAAATGGTTAATTACATTTAGGT
TCTAAATTAATGTGTAATGTATATTTATTTCTTTAGTTGGAAGTTTGTGG
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TTTGTTTTCATTATCGGTGGTCACGATGGGGCACAAATCTTAAACACCAT
TGAAACTTATGATGTCGAAAGGTTCGTTTTCTGTTGCATTTCCTTAGATT
TATTTGATTCGACTATTATGACCTTGAAACTTTCAATGCTATACTCTTCA
TGATTGTGTAAAGTCATCATCAGCTTAGCTTTCTGGCCTTTTCAATAAAT
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GTTCCGAAActagtgtgaacgtcaaaattcgaaacgtcaaaaaagaagac
gttacaaagtaaaacagatcgaaacagcTTCGCtcaactattttcatcgg
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taaggtatgaaaataatttttccaagggttattttacaaattttgtaatt
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AGGGATAGTTTTCTGTTATTACTCCAGAAAAATCCAACATAATTGGATTT
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TTGTATTTCTATAAATGTCTGAGTCCGAGACTTTTTATAcggtttgaata
tattttcatatttcctCGGGGAAGCCATAGCTCGCAACGCCGGGGGTAGC
TATGTTCAAAAGATTTCAGAAAGAGGGGAGGGGAGAgaattttttgtaga
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GCTGTCAGTGGtgtgttttttgtgttttccaaattagaagtttgaatttt
gattATTAATTTACAATGCACTGCCTTCTTTCTTTATGTTATACACCAGT
TAAGATTTCTTTATTATTTGCTTATTTACACTGTTCGTTCTTGCTTTTTT
ACCGCTAGAATCATGGTGGGATTGTTGAGAgggggtagcatcaaatttta
aaagggagAAATAGTGACGCCCTTCACTTTTCAAGAGTCGGGGTAAACAT
TTAACTTggggaaaagaatttttcggatttttcagcctaaatttagaaat
tttctaaCGGAtatataattctttttttctaggAGATATTTTACTTACCA
ATTTTTTGCacttataaaaatgtttttgaccTGAAAACTCGTTTATTCCC
TGTGGTTGTAGCCCAGAAACCTGGCGACGAAAAGCCATTTGCCGAATCCG
ATTCTGATTTTCATGATAGCGATGGCTTTAGTAACGGCTTAGGTCGCCAA
GACAGACCGTGGAGAGTTTTCTGTGCTCGTACTTTGATTGGTTAAATCTT
TATAAAGCAATTATCTTAGGCTTAGTGacttttattttggaaattctCTA
TATCACGTCTAAAGACGAAGGATGTTTCAGAGATGAAAAGGcgaatattt
tttaacaaaaaagttaattgtGTTACTTCATAAAGCTATGAGATTGGGTG
TGTAGGTGTAATTTGGTTCAATGCCAACAGTGTAACAGAAAAGAGTCAGG
GCCAGATTCTGTGTCTACTATTGTTGCGATTAATAGTTCAGTAGCAGTTT
CTTTAAATAACCATTACACCTTTATGATTCTTCTAGAGACCAGTGGTCAG
TTTCAGACATCGCTCCTATGTCTGACCGCCGCTCATTCCCGTGTGCTGTA
ACAATCAACGATGATATTTATGTCATGGGTGGCTATGATGGTCACGATAC
GCTACGAACGTGCGAAATCTACAATATGACACGTAACGAATGGACCAGCA
TTGAGCCGATGAATACTGCTAGATCGAATGCTGGTGCAGCACATATCAAC
CGTAAAATCTTTGTCGTTGGTGGCTGGGACGGCGTTAGTTTGAATTCAGT
CGAATATTACGATCTTGTTACACACGAATGGGTCCGCGTTACTAGTTTGC
CGAGACCAACAACTGGAATTCGTTGTGGAATCTTAGTCAATCCTTCATCA
AGTGAACaaaaaccgaaaaacaaaaatggccgCGGTGCCAACTGCATTAT
TTCATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+ >XLOC_041996 ID=XLOC_041996|Name=XLOC_041996|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3702bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:514131..521887+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTGGCTAATGACATGTCATGTGTTTTTGGATTAATGCAATCTCGCCA AGATGTTGGCTAATGACATGTCATGTGTTTTTGGATTAATGCAATCTCGC CAAGCCCATAACAAGAAAGAAGGGGAAATTCATTTCGAAGAAAACCACTT ACGCGATGTCTTGAAACGAGTTGACGAATTGAGACAGGCTGGACAATTGG GCTTTTGTGATGTTATCTTACGAGTATCCAGTCAAGAGTTTCATGCTCAC AAGCTCATTCTTGCTTCTTGCTCAGACTATTTTTATGCTATGTTCAATGG CAACATGAAAGAGAGTAAAGAACGGATTGTGGATATAAATGGCGTCGATG TAGAAGTAATGAAgcttgttttaaattttatatacaCCGGAGGTATTCCA CTTAGTAATGATAATGTAGAAGATATTTTGCAAGCAGCCAATCTTATGCT TATAAAATCACTTAAAGATGTTTGTTGTAGGTTTTTAGAAACTTTATTGA CAGTAAACAACTGCTTGGGAATGCAAAAGTTTGCCGAGTCATATTCCTGT GAAGGTTTATTTGAAAGTACGACCAATTTCATTTGTGACAACTTTGGATA TATCACCGAAAGTGACGAGTTTCTTCAACTGCAAGCTGTGCAACTTGTTC CTATAATATCTAGCGATGAATTGCGAGTTTTAAACGAAGAAAAGGTTTAC GAAGCTTTGATTCGATGGACAAAGTACAGCTTGTCcgaaagaaagaaata tttccCGGAACTTGTACAACACATTCGGTTACCAATGTTACCGCCGGATT ACTTAGTGGATCAAGTAGAATCTGAATCTCTGTTCGTGGAATTTCCAAAA TGTAAAGAACTTTTGGTAGAAGCTCACCACTATTTACTTCTCCCGAATCG CAGAGGTGTTATGGCGCAGACGGCAAGAACAAGACCGAGGAAATACGAAA ACAACAACGAAATCTTGATTGCATGTGGTGGAAACGGCGAATCATCAATG AACACTACTACCCATAACAAGAAAGAAGGGGAAATTCATTTCGAAGAAAA CCACTTACGCGATGTCTTGAAACGAGTTGACGAATTGAGACAGGCTGGAC AATTGGGCTTTTGTGATGTTATCTTACGAGTATCCAGTCAAGAGTTTCAT GCTCACAAGCTCATTCTTGCTTCTTGCTCAGACTATTTTTATGCTATGTT CAATGGCAACATGAAAGAGAGTAAAGAACGGATTGTGGATATAAATGGCG TCGATGTAGAAGTAATGAAgcttgttttaaattttatatacaCCGGAGGT ATTCCACTTAGTAATGATAATGTAGAAGATATTTTGCAAGCAGCCAATCT TATGCTTATAAAATCACTTAAAGATGTTTGTTGTAGGTTTTTAGAAACTT TATTGACAGTAAACAACTGCTTGGGAATGCAAAAGTTTGCCGAGTCATAT TCCTGTGAAGGTTTATTTGAAAGTACGACCAATTTCATTTGTGACAACTT TGGATATATCACCGAAAGTGACGAGTTTCTTCAACTGCAAGCTGTGCAAC TTGTTCCTATAATATCTAGCGATGAATTGCGAGTTTTAAACGAAGAAAAG GTTTACGAAGCTTTGATTCGATGGACAAAGTACAGCTTGTCcgaaagaaa gaaatatttccCGGAACTTGTACAACACATTCGGTTACCAATGTTACCGC CGGATTACTTAGTGGATCAAGTAGAATCTGAATCTCTGTTCGTGGAATTT CCAAAATGTAAAGAACTTTTGGTAGAAGCTCACCACTATTTACTTCTCCC GAATCGCAGAGGTGTTATGGCGCAGACGGCAAGAACAAGACCGAGGAAAT ACGAAAACAACAACGAAATCTTGATTGCATGTGGTGGAAACGGCGAATCA TCAATGAACACTACTATTTTTTCATACAACATGGCGAAGAGCAGCTGGAA TGAGTTACCTCGATTGATTCCTGAGCGTGGATATCATGGACTTGCTACTA TTGATGGTGAAATGTATCTTGTTGGAGGCATTACAACAAGCCGTGCAGAA GGACGTGAAGGACAAACAGAACTACTAGACACGGTTTTTTCATACAACAT GGCGAAGAGCAGCTGGAATGAGTTACCTCGATTGATTCCTGAGCGTGGAT ATCATGGACTTGCTACTATTGATGGTGAAATGTATCTTGTTGGAGGCATT ACAACAAGCCGTGCAGAAGGACGTGAAGGACAAACAGAACTACTAGACAC GGTCAAGAAATTCGACACAGAACAGAATGCTTGGGTCAATTTGGCAGCAC TACACGTCAAACGAAGCAAGATGTCAGTCATCGCGTGCAGTGGTTTGATT TTCGTTGTTGGTGGTTTTGATGGAAGTCAGACCTTGAACTCGGTTGAATG CTACAATCCCGTAAATAACCGTCAAGAAATTCGACACAGAACAGAATGCT TGGGTCAATTTGGCAGCACTACACGTCAAACGAAGCAAGATGTCAGTCAT CGCGTGCAGTGGTTTGATTTTCGTTGTTGGTGGTTTTGATGGAAGTCAGA CCTTGAACTCGGTTGAATGCTACAATCCCGTAAATAACCGTTGGAAGTTT GTGGCACCTATGCTGACACATCGGCGATGCACGACATCTGTATCTAATGG CAACTTTGTTTTCATTATCGGTGGTCACGATGGGGCACAAATCTTAAACA CCATTGAAACTTATGATGTCGAAAGTTGGAAGTTTGTGGCACCTATGCTG ACACATCGGCGATGCACGACATCTGTATCTAATGGCAACTTTGTTTTCAT TATCGGTGGTCACGATGGGGCACAAATCTTAAACACCATTGAAACTTATG ATGTCGAAAGAGACCAGTGGTCAGTTTCAGACATCGCTCCTATGTCTGAC CGCCGCTCATTCCCGTGTGCTGTAACAATCAACGATGATATTTATGTCAT GGGTGGCTATGATGGTCACGATACGCTACGAACGTGCGAAATCTACAATA TGACACGTAACGAATGGACCAGCATTGAGCCGATGAATACTGCTAGATCG AATGCTGGTGCAGCACATATCAACCGTAAAATCTTTGTCGTTGGTGGCTG GGACGGCGTTAGTTTGAATTCAGTCGAATATTACGATCTTGTTACACACG AATGGGTCCGCGTTACTAGTTTGCCGAGACCAACAACTGGAATTCGTTGT GGAATCTTAGTCAATCCTTCATCAAGTGAACaaaaaccgaaaaacaaaaa tggccgCGGTGCCAACTGCATTATTTCATAAAGACCAGTGGTCAGTTTCA GACATCGCTCCTATGTCTGACCGCCGCTCATTCCCGTGTGCTGTAACAAT CAACGATGATATTTATGTCATGGGTGGCTATGATGGTCACGATACGCTAC GAACGTGCGAAATCTACAATATGACACGTAACGAATGGACCAGCATTGAG CCGATGAATACTGCTAGATCGAATGCTGGTGCAGCACATATCAACCGTAA AATCTTTGTCGTTGGTGGCTGGGACGGCGTTAGTTTGAATTCAGTCGAAT ATTACGATCTTGTTACACACGAATGGGTCCGCGTTACTAGTTTGCCGAGA CCAACAACTGGAATTCGTTGTGGAATCTTAGTCAATCCTTCATCAAGTGA ACaaaaaccgaaaaacaaaaatggccgCGGTGCCAACTGCATTATTTCAT AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:514131..521887 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1432-1851:7338 |
| Aaloc | 1297-1428:5088 |
| Aaloc | 1129-1293:4372 |
| Aaloc | 961-1125:3741 |
| Aaloc | 55-957:965 |
| Aaloc | 1-51:1 |
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