|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000251_pilon:380309..382306- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041892 ID=XLOC_041892|Name=XLOC_041892|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1998bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:380309..382306- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTTTTATTCTCTCTCTCAGAATTATTGCAAACAGAAAAAAAAGTGTGC
TCACACAAGATATCTTTTGCAACAAAAGAAAAAAATGGTTTCTATAAAAA
TGATGTTGATACTCAGCGTAATTGCTATTTTAACTTCAATATTTGGTTTC
ACGAATACAATATTAACGACCATGACATTGCTATTGATCACAAATTACCA
GAGGTTACCAGTAATGATTTATTGCTTGCCAAGAGAATTGAAATTTCTGT
CCAAAATCATTCGGATGGTGATTAACTTGAAGAAACTACAAAGAAAACCT
TTGTGTGAATTATTTGCCAACATTGCCAAAAAGTATCCTGACAAAATTGC
CATCATTGATGCTGAAACTGACCAGAGCTTAACATTCAATGAATTCTTAA
AGCTCACTCACAAAATTGCTAATTTCTTTCAAGCAAATGGTTTTACTAAA
GGAGACAATGTTGCAATAATGTTGCCTAACCAAATCGAGTATATTCCAAT
GTATCTCGGCTTATCAAGTATTAGTGTTAGCGCAGCATTCATAAACATCA
ACCAAGTGGGTGAAACATTAAAACATTCCTTAAATGTTATGGAATTTAAA
GCCATCATTTACCATACTGATTTGGAAGAAACCTTGCGTAATTTAAACCT
TGTTGACAATGACTCAGGTAAATTATTTTTTACTTTTGGTGAAAAATCGA
ATAGTAAAAATAATCTTGAATTGCTGCTAAAGAATGTCTCTTCTGACCTT
CCTCAAATAGACTATGGCATTTCTCCTGACTATCCAGTAGCCTATGTTTT
CACCTCTGGCACAACGGGACATCCAAAGCCAGCAGTGATGGCACGCAAGA
AGTTCACTGCAGGTTATCTCATCTTCAGATACTTAACCAGTATTGACACC
AATGATATTGTTTACAACACATTACCAATGTATCATACCAGCGGTAGTTT
AATATTCTTTGCTGGAACCATCCTTTGTGGCTCTACTATGGTGTTTAGAA
AGAAGTTCAGCGCATCAAAGTTCCTTGAAGATTGTAGGAAATACAATGTA
ACCTATGTTGGTTATATTGGCGAAATGATGAGATATCTTTTAGCGCAACC
AGAGAAAGAGATTGATCGCCAGCACCATATTAAAAAGATTGTAGGTAATG
GTTTACGAAGATCCTTGTTCACTCAGCTCAGATCTAGATTCAATATTGAG
CACATTTATGAGTTTTATGGTGCAACTGAATCTAACGTTGGTTTCATTAA
CGATGATAATACTGATGGTGCTGTTGGTTTTCTCTTCAAATGTTTTCCAT
TTTTGAATCTAAAGACATTGGTTAAAATTGATCAAAATACTGGTGAATTG
ATCAGAGACGATAATGGATTCTGTATTGAGTGTGAGCCTGGTGAGCCTGG
CACTATGGTTGGACTGATCAATAATAATCAACCGTATTATGGATATGTAC
AAAAGAATGATTCCGTCAAGAAGGTGGCCCGTAACGTTTTTCAGTCAGGT
GATAGTTATTTTATGACTGGAGATTTACTTATGACTGATCAATTCGGATA
TCTATATTTCTTAGATCGTTTAGGAGACACATTTCGATGGAAAGGTGAAA
ATGTATCAACGGTTGAAATCGAGAATATTGTTTCGTCGTCGTTTGAAAGT
TATACCCATTGCATTGTATACGGTCAAGCTATCCCTGGTTACGAAGGCAG
AGCTGGTATGGTGTACATTAATGATCCATCTATAAATTTAAGAATGATCA
ATACAGTTTTCAATGATAATTGGAAACACAATTTACCATCTTATGCGCTA
CCTGTTTTCGTTCGTGTTGGCAATGAAATGCAAGTGACAAGCACTTTTAA
ATATCAAAAAGAACAATTGAAGAAAGAAGGCTTTGACTTGGAATATTTAA
TGGATGATGAGAAAATATTCTTTTTGTTTGGAGATAGTTATGTGGAGTTT
GATGAGTTATTGTTTCAAGATTTAAAGGATGGGAAAATTATACTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000251_pilon:380309..382306- >XLOC_041892 ID=XLOC_041892|Name=XLOC_041892|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3996bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:380309..382306- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTTTTATTCTCTCTCTCAGAATTATTGCAAACAGAAAAAAAAGTGTGC
TCACACAAGATATCTTTTGCAACAAAAGAAAAAAATGGTTTCTATAAAAA
TGATGTTGATACTCAGCGTAATTGCTATTTTAACTTCAATATTTGGTTTC
ACGAATACAATATTAACGACCATGACATTGCTATTGATCACAAATTACCA
GAGGTTACCAGTAATGATTTATTGCTTGCCAAGAGAATTGAAATTTCTGT
CCAAAATCATTCGGATGGTGATTAACTTGAAGAAACTACAAAGAAAACCT
TTGTGTGAATTATTTGCCAACATTGCCAAAAAGTATCCTGACAAAATTGC
CATCATTGATGCTGAAACTGACCAGAGCTTAACATTCAATGAATTCTTAA
AGCTCACTCACAAAATTGCTAATTTCTTTCAAGCAAATGGTTTTACTAAA
GGAGACAATGTTGCAATAATGTTGCCTAACCAAATCGAGTATATTCCAAT
GTATCTCGGCTTATCAAGTATTAGTGTTAGCGCAGCATTCATAAACATCA
ACCAAGTGGGTGAAACATTAAAACATTCCTTAAATGTTATGGAATTTAAA
GCCATCATTTACCATACTGATTTGGAAGAAACCTTGCGTAATTTAAACCT
TGTTGACAATGACTCAGGTAAATTATTTTTTACTTTTGGTGAAAAATCGA
ATAGTAAAAATAATCTTGAATTGCTGCTAAAGAATGTCTCTTCTGACCTT
CCTCAAATAGACTATGGCATTTCTCCTGACTATCCAGTAGCCTATGTTTT
CACCTCTGGCACAACGGGACATCCAAAGCCAGCAGTGATGGCACGCAAGA
AGTTCACTGCAGGTTATCTCATCTTCAGATACTTAACCAGTATTGACACC
AATGATATTGTTTACAACACATTACCAATGTATCATACCAGCGGTAGTTT
AATATTCTTTGCTGGAACCATCCTTTGTGGCTCTACTATGGTGTTTAGAA
AGAAGTTCAGCGCATCAAAGTTCCTTGAAGATTGTAGGAAATACAATGTA
ACCTATGTTGGTTATATTGGCGAAATGATGAGATATCTTTTAGCGCAACC
AGAGAAAGAGATTGATCGCCAGCACCATATTAAAAAGATTGTAGGTAATG
GTTTACGAAGATCCTTGTTCACTCAGCTCAGATCTAGATTCAATATTGAG
CACATTTATGAGTTTTATGGTGCAACTGAATCTAACGTTGGTTTCATTAA
CGATGATAATACTGATGGTGCTGTTGGTTTTCTCTTCAAATGTTTTCCAT
TTTTGAATCTAAAGACATTGGTTAAAATTGATCAAAATACTGGTGAATTG
ATCAGAGACGATAATGGATTCTGTATTGAGTGTGAGCCTGGTGAGCCTGG
CACTATGGTTGGACTGATCAATAATAATCAACCGTATTATGGATATGTAC
AAAAGAATGATTCCGTCAAGAAGGTGGCCCGTAACGTTTTTCAGTCAGGT
GATAGTTATTTTATGACTGGAGATTTACTTATGACTGATCAATTCGGATA
TCTATATTTCTTAGATCGTTTAGGAGACACATTTCGATGGAAAGGTGAAA
ATGTATCAACGGTTGAAATCGAGAATATTGTTTCGTCGTCGTTTGAAAGT
TATACCCATTGCATTGTATACGGTCAAGCTATCCCTGGTTACGAAGGCAG
AGCTGGTATGGTGTACATTAATGATCCATCTATAAATTTAAGAATGATCA
ATACAGTTTTCAATGATAATTGGAAACACAATTTACCATCTTATGCGCTA
CCTGTTTTCGTTCGTGTTGGCAATGAAATGCAAGTGACAAGCACTTTTAA
ATATCAAAAAGAACAATTGAAGAAAGAAGGCTTTGACTTGGAATATTTAA
TGGATGATGAGAAAATATTCTTTTTGTTTGGAGATAGTTATGTGGAGTTT
GATGAGTTATTGTTTCAAGATTTAAAGGATGGGAAAATTATACTGTAAGT
TTTTTATTCTCTCTCTCAGAATTATTGCAAACAGAAAAAAAAGTGTGCTC
ACACAAGATATCTTTTGCAACAAAAGAAAAAAATGGTTTCTATAAAAATG
ATGTTGATACTCAGCGTAATTGCTATTTTAACTTCAATATTTGGTTTCAC
GAATACAATATTAACGACCATGACATTGCTATTGATCACAAATTACCAGA
GGTTACCAGTAATGATTTATTGCTTGCCAAGAGAATTGAAATTTCTGTCC
AAAATCATTCGGATGGTGATTAACTTGAAGAAACTACAAAGAAAACCTTT
GTGTGAATTATTTGCCAACATTGCCAAAAAGTATCCTGACAAAATTGCCA
TCATTGATGCTGAAACTGACCAGAGCTTAACATTCAATGAATTCTTAAAG
CTCACTCACAAAATTGCTAATTTCTTTCAAGCAAATGGTTTTACTAAAGG
AGACAATGTTGCAATAATGTTGCCTAACCAAATCGAGTATATTCCAATGT
ATCTCGGCTTATCAAGTATTAGTGTTAGCGCAGCATTCATAAACATCAAC
CAAGTGGGTGAAACATTAAAACATTCCTTAAATGTTATGGAATTTAAAGC
CATCATTTACCATACTGATTTGGAAGAAACCTTGCGTAATTTAAACCTTG
TTGACAATGACTCAGGTAAATTATTTTTTACTTTTGGTGAAAAATCGAAT
AGTAAAAATAATCTTGAATTGCTGCTAAAGAATGTCTCTTCTGACCTTCC
TCAAATAGACTATGGCATTTCTCCTGACTATCCAGTAGCCTATGTTTTCA
CCTCTGGCACAACGGGACATCCAAAGCCAGCAGTGATGGCACGCAAGAAG
TTCACTGCAGGTTATCTCATCTTCAGATACTTAACCAGTATTGACACCAA
TGATATTGTTTACAACACATTACCAATGTATCATACCAGCGGTAGTTTAA
TATTCTTTGCTGGAACCATCCTTTGTGGCTCTACTATGGTGTTTAGAAAG
AAGTTCAGCGCATCAAAGTTCCTTGAAGATTGTAGGAAATACAATGTAAC
CTATGTTGGTTATATTGGCGAAATGATGAGATATCTTTTAGCGCAACCAG
AGAAAGAGATTGATCGCCAGCACCATATTAAAAAGATTGTAGGTAATGGT
TTACGAAGATCCTTGTTCACTCAGCTCAGATCTAGATTCAATATTGAGCA
CATTTATGAGTTTTATGGTGCAACTGAATCTAACGTTGGTTTCATTAACG
ATGATAATACTGATGGTGCTGTTGGTTTTCTCTTCAAATGTTTTCCATTT
TTGAATCTAAAGACATTGGTTAAAATTGATCAAAATACTGGTGAATTGAT
CAGAGACGATAATGGATTCTGTATTGAGTGTGAGCCTGGTGAGCCTGGCA
CTATGGTTGGACTGATCAATAATAATCAACCGTATTATGGATATGTACAA
AAGAATGATTCCGTCAAGAAGGTGGCCCGTAACGTTTTTCAGTCAGGTGA
TAGTTATTTTATGACTGGAGATTTACTTATGACTGATCAATTCGGATATC
TATATTTCTTAGATCGTTTAGGAGACACATTTCGATGGAAAGGTGAAAAT
GTATCAACGGTTGAAATCGAGAATATTGTTTCGTCGTCGTTTGAAAGTTA
TACCCATTGCATTGTATACGGTCAAGCTATCCCTGGTTACGAAGGCAGAG
CTGGTATGGTGTACATTAATGATCCATCTATAAATTTAAGAATGATCAAT
ACAGTTTTCAATGATAATTGGAAACACAATTTACCATCTTATGCGCTACC
TGTTTTCGTTCGTGTTGGCAATGAAATGCAAGTGACAAGCACTTTTAAAT
ATCAAAAAGAACAATTGAAGAAAGAAGGCTTTGACTTGGAATATTTAATG
GATGATGAGAAAATATTCTTTTTGTTTGGAGATAGTTATGTGGAGTTTGA
TGAGTTATTGTTTCAAGATTTAAAGGATGGGAAAATTATACTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000251_pilon | genome | sc0000251_pilon:380309..382306 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1998:1999 |
|
