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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000376_pilon:265468..272625- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041844 ID=XLOC_041844|Name=XLOC_041844|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7158bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000376_pilon:265468..272625- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGATATAATGGAGTTGCGAATCTAGCTTTGGTGATTATATTGTTGAA
ATCTGTTACAGTTTTATCGGAATCGGTGAGTTTTGAACGGAAACAGAATG
TGGATATTTTTAAAAATAATGGACGAAAATGCTACCAAATGGCAGCCAGT
GTTTATGAGCAGGGCTGGTGTAAATGTGACTTTGAGAAAATGTTTGTTGG
CGATAAATGCGTTGTAAAGAGAACCATGAGTGGTAAGTGTCATCAATGTT
GCGATCATCTCAGTCATAATATGTGGTTTTTTATTACATTGGGTGAATAT
TCCTAAAGGTTTAGAAAATTTGTCTTTTGACTATTGAATTATAAATTTAT
CATTAAAAAACATGACCTTTTACTGTGTAATGTTAGTAACCTATCATATA
GTAGTAAAGTACACCCCCTTCTCACAGAACCGGTAGGATTCTTCCAGCCA
GTGGGGGTAAAAATAACGGACCAAAACTCGATGGGGATTGATATATCAAT
GTTTTTTATGGCTGGGGATTCGAATTCCATTGTTTTAGAGCCAGAAAATT
CAGTGGGGATGGAAAGAATAGCACAATATTTTGCAGTGAGGATCTGCTTA
CCTGGTTATGTTCAGTGGTGACAAAAATTACAGTATAATTTTACACGGGG
GACAATATTTACACCAATTTTTCCATTGGGAAAGGTCCCAGTGGGTCTGT
GAGAAGAGGGTGTTAAAGTATTCAATGTATTACCATATTACATGTGTCAA
CTTTTTAGCTTGCATCATGGCACAAGTAATAGATGTAGTCAATTTAAACA
TAGCTGACATCAACTATATCACTGTTCTGGATTTCAATTTCGAAACAAAA
GAAAGCTTTTGGAATTATGCGTTTAGTGATAACGTTATCAAACTGATCAG
TGAAAGTCAAGGTGTCTCCACCAACCTGGTAAGTTGATTATTATACATTC
TTGTAAACAACTTACCGTAACTTGGTCTAATGTCGACATCCCTCACTAAT
TCCGACACTTTTTTTTAGAGCTGCAAATAATAGAAAGGTCGAAACTATTT
TTTATTTGTTTAGTGGTCAGTGAGGAAAAATCCTGATTCCAGTGATTTCA
ACTTTTATATTATTCTTATCTCTTAAGAAGGGTGTCGGAATTAGATGAGA
GGGGTGTCGATATTAGACCAACTTACGGTATCACTTTTCTTCACTCATTA
ATGAAGTCATTTTGAAGGCTTTGTGTGAGCAGTAAGTAGCAGGTGCCAAG
AATTATATCATATTATATGGCAAACAGTGGAAATGATTAAGAATATTATA
AAACGTGGGTTGATTAATGGGAAATGCGATGGAAAAGTCAGTCTCTACAA
ACTTGTTATCCAGTTTATTCTTTTTTTTCTTTGGCATAGCTCCAGAGTTT
AGACTACAAGCACTAGTCAAAAATAATTTTTTTGAATCTGCCATTCCTTG
GTAAATTTGGTCTTTTAAACCCAAACTAATTAAGTTGTATTTGGTATTTT
ACCTGGTTAACTAAGCTTATCTTATTGGATCAGGCTCTCTCTTTTCTCAG
TAAAAAGTAGCCTACAAAACCTATCAAAATGCCAAGATAATTGCCAAGGC
TGTTCATATAGGAGATGACATATATTCCGCTCGAAAAACGGATAGAGAGA
AAACGAGGAGAAACGTTTCGAAAGATAAAAACATCATTTTAATTTGGTGA
TTCAAGTTAATGATTTGATACCAAGAGCCATACTTTAATCATGCTGAATA
ATCAAATAAAAACATGCGGAAAAATTTGTTTATCATATAAAGACTGTTTC
ATGATGACGCTGTATTTTCTTTTAAGCATGATAATATTGACTTCCGACAC
GAAACTTTCTCGGAAAACTGTTTTCCAAAATAACATCATTATCGAGTTTC
TTTTTTTTTCATATAAACCTATTCTTCGAAATTTGAAATGGACAGAAGAA
AAAAAATCTTTAAGAATTTCAAGCTTTCAAAAAAGGAAATTTTAAGAAAA
TATCAAGGAAAATTTTTCGAAAAAAGAAGGACTAAATAATAATTGTATGA
CAGAAATACGTACGATACAATTTAAAAGAAGGCATCAATTGGAATAGAGT
AACTCGAAAATCAAGGCATTTGACCTACATTAACTCCACTATAATTCAAA
ATTAACCTTAAGATGAAAACGTTATGAAAAATAAAATCTAGTCTCATGAA
CTGCAAATTATACACGATCATCTTCGTGTCAAGAAATTCGTAAAAAGATG
TCAAATTCGGTCAAAGTTTAACCATTTTATGTGATAGAAATTAAACATAA
AATGTTCAAAACTTTTGGACGTTCTTATAAACAAAAATATGCACATTTTT
AATAACAACCCTTGGTCTGTAAATCGTGTCTCTAAATTGCCTTCTTTTGC
TCAGCTTTTAATCACGAATGATGATGATCCAATCCCAAGAGGAGTATTGG
CAAAATGATAAAAAAATTAAGTTTTCAAATTTCATTATTTAGAATAGGAC
AGTGTTAACTGGAAGTTATAACAGGAAACTTCAATACAAGGGTTTTTTCA
TACGGACTGTGGACTTAGTATACAATTGAGCCGTAGCCTAGAATTTTGAA
ACTGTTCCTCCAAATTTTCAATATGCACAATACGAGACAATGATATACAA
TGCAGTGGTTGAAAATTTGAAGATAGAATTAGTGGTCAATTATAATTTTG
ATCATTACATAATTAAAACAATTTCATGGTTTAACCACCATCATCAGGCT
CCGTACCACCTTTTAATATCGTGAACAATTAACAGGGACTTTCTGGAAAA
AATACTAAAATATTCCGTAACTCAAACGTCAAAAGGAGGGGGCAAGTAAT
TGGGCTGTTCCATTAAAAACCATACAGGGGGGAGGAAGAACCTTTTCAAG
TTAAAATAAAATTATTGAAAATGTGTGGATACCCCCTGGAAAGTGGCAAA
ATTTGCAAAAATACCCTTGTAAAGATTCTTTTCATACCTTAAGGTGAGGG
TGGGCGAACTAAAATCAATCCTTTATCTCTGGAAATTTCAGAATAACTTT
TTACCCCCCCCCCCCCCCCGGAAAAATGAAAAAACACCCCCTGGAAATTT
TTCTATGGTTACCTTCTTGAAATGTTCGTCCACCCCCCTGTATGGATATA
AAATGGAACGGCCCATTATACTATAAGGTTTTTTAATTGAAGGGGCCCGA
AAAACTACTCTAGTAATGGTAATCCTAGTTATAAAGTTTTGACTTATGGG
CTCTGCATTTTATAATAATTTGTCGTCATGTTTTTCTATTCAGAAAGTGG
AACTTGCTGGGATGATCATGAAGATCGCATTGAATGGCAATCCGCAATGC
ATAATGGTTAAAATCTTAGGTCCATCCAGATGTAAGTAACATACGATATT
TTCTTTGTGGGTGTTCAGAGGTAGGATAGGGTTGATATTTTATGTGGATA
GCACAATAATCGAAGACTTTTTTGGACAGTATTGCGACTGATTTCATGGG
GTCCAAGATTCGGAACATTGGAAGGAGCTGGGATTCGAACCAAGAAACTC
TAGTTTGTGGTACTGGCGACTGAGATCTCAAAAGGGTTATATTTTATCGA
ATTTTACATACAGTAAGATGGGTAGAACATTTGCAACATGAATAGTTTTC
GATATAAGTCAAGCCGGTTCACTTTCATTTAAAGAAGCAGCGGGTTATAG
CTGGCCAACATTTGTCACTTCAGCTTAACTGTATAACGCAACATTATTTC
TGCATTTTGACTAATACTAAAGCACCTCTCTCAAATAAGTGATTTCCTTA
ACCAATAATCCCATCAAAAATCGGATTAATTAAAACACGTTCAACAGATT
TCCAGAACACATTGCACTTGAAAAAAGCCGTTTCTTTGATTTTCGGAGCT
GGGATATTGCGCTCAGCTTTCAAGAAAAACAAAGCGGGAATGAATTATTG
AGCTTACGACATTAATTTCCTTCCGAAACTCAATATTGATGAGTTAGAAA
GAAGGAAACTACGGAAATCTTTTTTCCAAATAATCATAAGATTTTCATCG
ACCAAAATGGAAACAAATTATTATCACAACGTGCTTCCTAACTTTAAATG
AATGGTTATTGACCAAACTGACAATTTAGGAGGACCCTGAAATATAATAG
GAGGACACTTAAAATGATAGCTTGCGAACTGAGGAATTAGTGGCTTTAAG
TGCCAATTAAAAGTGCCATTATGAGAGAGCCTATTGATTCCTTTCTAAAA
ATGACTCACAATAATGACCTTTACTCTTTTCTATGAGAACAACAAGGCTC
AAAATTCATAAAAATTAGAACAATGCTGAGCCTTGAGCTGTTCAATTTTA
GACAAATTAAAGAGTCTAAGTATTAAGAAAAGGTTTCGAACCTTAAAATA
CCTTAAACTTTTGGACTAAAATTAAAAGCATTTTGATGCTCGAAGTATCA
AAAAAAATCAGAACAGTGAAGCCTGACAAAAATTTACTGGTTCGTATGAA
AAAACGATGTAAACTGCCGGGTGTCCGTCATGAAAACAATGTTCCGATAT
AAAAAGAGGAAACCTTTCCTAACAGAATCTCACTTATACATCATTCTAAT
AAGAGGCCCCAGCGGACCTTCAATTCCCGCAATCACGCAATTTTTTCCCC
AAATTCACGTATTCACGCAATGTTTTTTAAATTTTCACGCATTCACGCAA
ACCACTGCTATCCCATCAGCATCGCAGATTGAAAAAAAAAAACAATTTCA
TTTTGAATTTTTGAGTGACATGTGGTTCTAATGGTGGAGGGTTGAAATAG
GGCTTGATTATTGCTTCTAGCGACGCTTACTGTGTCAATGTCCTTTAAAA
GGAAACCGATAAAATATGCAATATACTCCACAGTGAGATAAAAATACCAT
ACGTCACAAGAATTCAAAGAAAGTGCTTTGGAAGTAAACAACAATCAGTA
TCAGAGACGTCATTAAGGATAAAGGATGACATCACGAGTCATATTGAAAG
TAATGAAAGTAATCTCTTCCGTTTTACAACAACACACAAAGTTTCTTATA
ACTCTAATGGATGGATAGAGAACTTATTTCCACGTCTTCGTGAATTAGAA
ACTAGAACGTAAAACATCTTGTAAACGTGAAGGAATTCTCGTTCATATTC
TAAGGAATGATAACTGCCATGTTCTAGTACGATGTGGGGGTTGAAGAATT
TTATCAAGACCGAGGCAGTATCAAATAAGCGTTTAAGGCGTTGCCATGGC
GTCCAAAGTATCGCTTAACGACCATCGAAAACGGATAAAATAAATACTTC
AGCATGTTTTAGGTCGGAAATTTACAAAACAAGTTTCGCGTGGCGCTCTC
TAAGGATATCGTTTTCAATGTAAAAACATCATTGTCGACATCTACAGTGA
TTGTATAACACAAAGGAACCAGAAGCATGATAAGAAAAAAAGAAAGTAAT
TAATGCCTTTTTTAACGGATGATTGAAAACATTGTCTCTTTTATAAAACT
TGACGTCATACTTAGAAAATAAGTTATGTGTAATCTAGAATGGAGATCTT
AGGGGGTTAAGTAGGCATTCTAAGAGAAATGTGTTCCGTATTTATATGAT
TGCTAAAGTAGAAGAAATCTTATTAGTATTTCTTTATTGAAATTAAAATA
CTTGACCCTTGTGTCAATGACTGCAGGGGTAGTTTAATGGGCAGCTCAGT
GTCTTCTTCGAGCATCAGATAATAATTTTTTAGTCATTAGTGTAGCGTGT
GGCAACAGACAAGAAAACAAACTGATATTTGCTTTTTAACGATCTCTCAG
TCATTTTATCATTTTGAGGATCAAACAGGAAATTAGATACTGCACCAAAG
ACAATAATCTAAATACTTGTTTTTCATTCCACTAACAGATCCAGTAGATC
TTAGTCACCTTGGAGAATCGAACACTGAATTAGATACTGCATCAAAGAAA
AAACATTTACCAGAGATGGCAACAACTACATCGACCACCACGGATGTTTT
GAAAACGTTGGAAAGTCAACAACCGAACAACCAAGATACAGAGAATAATA
TGTTTAATTCAACCACTGGGATTATTGTTTCAACCATCGCAGCTTTGACA
TTGATTTTACTGGTAGTGGCAATCATTCTGTTTAAACGAAGCAAAATGAA
AAGACGAAGAAATGATTCAGCCGCCAGCATCGAGGTAAGAAAATTTGGTT
GTTTTGTGTTAAATCTTTATCAAACTGCAATCAATAGAACAATTTCGTTT
TCGCTTTCAATGGGCCATGAAGCTCAATTCTTTTCGTATTAATAATTGTG
TAGGAACAAAGGCATTTCAAAGTGTAATCGAATTGCACGAGCGAAAGTGA
CTCGAACCTATATAGCTCAAATGTCTCCCTACTCGAATGAGTTTTGTGGT
CTCTTCAGTTAAAAATGCCTTGTAAACCAGCCTCCACAACTCCAAGTTTC
GCTTATTCGAACAAATTTACGTTCCTTGTGCGCGTTCGAGCTATGGAGAC
TACCATAAATGTTATGTTGAAAATTTGTTTCTTTTCGAAACGTTTATGAA
GTACAAGGTAGAATAAATAAACAATCATTTTTTATTTTTAACAGACACCA
GAGATTGCTTCCGTATGCTCGTTATCAAGTAAAATGGATCCCACATTCTG
TTCACCAGCATTAAGCAGACACAGTCTGGAAACAATCATCACAGACGGTA
GCGATCAGGAATCGCAGAATGAGAATATTTACCAGCAACCAGACGATGTG
GTCAAATCGAATTCATACAAACGACATTCTAACATACCAGCTGCTTATTT
CCAACAGATCAGTTTAGATTATGAAAATCCTGATGATGTGCGCCAACAAG
TTGAGAATCTCAGCCCTGAATATCATGAATTAGAGATTGAAGATTTACAA
AGAAGGCCCATGCCACAACGTAGAAACGATGAGATCAACGACGATAATGT
ACAACAATGGAAACCAAAGTTACCAAGAAAACCAACCATCCTCCAAAACA
TTCAAAGTAACCGACAATTGCTTAATAATGGTTCATTTGAATCTGATGAA
GATTATTATAGTGAAGCTCTGGGAACTCCCAATCAAGTTTCACCAGACCA
ATTCGAAGAATTGTATGCTAAAGTTGATAAATCACGGAAGAGACAAAATA
ACAGTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000376_pilon:265468..272625- >XLOC_041844 ID=XLOC_041844|Name=XLOC_041844|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2700bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000376_pilon:265468..272625- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGATATAATGGAGTTGCGAATCTAGCTTTGGTGATTATATTGTTGAA
ATCTGTTACAGTTTTATCGGAATCGGTGAGTTTTGAACGGAAACAGAATG
TGGATATTTTTAAAAATAATGGACGAAAATGCTACCAAATGGCAGCCAGT
GTTTATGAGCAGGGCTGGTGTAAATGTGACTTTGAGAAAATGTTTGTTGG
CGATAAATGCGTTGTAAAGAGAACCATGAGTGATGGGATATAATGGAGTT
GCGAATCTAGCTTTGGTGATTATATTGTTGAAATCTGTTACAGTTTTATC
GGAATCGGTGAGTTTTGAACGGAAACAGAATGTGGATATTTTTAAAAATA
ATGGACGAAAATGCTACCAAATGGCAGCCAGTGTTTATGAGCAGGGCTGG
TGTAAATGTGACTTTGAGAAAATGTTTGTTGGCGATAAATGCGTTGTAAA
GAGAACCATGAGTGCTTGCATCATGGCACAAGTAATAGATGTAGTCAATT
TAAACATAGCTGACATCAACTATATCACTGTTCTGGATTTCAATTTCGAA
ACAAAAGAAAGCTTTTGGAATTATGCGTTTAGTGATAACGTTATCAAACT
GATCAGTGAAAGTCAAGGTGTCTCCACCAACCTGCTTGCATCATGGCACA
AGTAATAGATGTAGTCAATTTAAACATAGCTGACATCAACTATATCACTG
TTCTGGATTTCAATTTCGAAACAAAAGAAAGCTTTTGGAATTATGCGTTT
AGTGATAACGTTATCAAACTGATCAGTGAAAGTCAAGGTGTCTCCACCAA
CCTGAAAGTGGAACTTGCTGGGATGATCATGAAGATCGCATTGAATGGCA
ATCCGCAATGCATAATGGTTAAAATCTTAGGTCCATCCAGATAAAGTGGA
ACTTGCTGGGATGATCATGAAGATCGCATTGAATGGCAATCCGCAATGCA
TAATGGTTAAAATCTTAGGTCCATCCAGATATCCAGTAGATCTTAGTCAC
CTTGGAGAATCGAACACTGAATTAGATACTGCATCAAAGAAAAAACATTT
ACCAGAGATGGCAACAACTACATCGACCACCACGGATGTTTTGAAAACGT
TGGAAAGTCAACAACCGAACAACCAAGATACAGAGAATAATATGTTTAAT
TCAACCACTGGGATTATTGTTTCAACCATCGCAGCTTTGACATTGATTTT
ACTGGTAGTGGCAATCATTCTGTTTAAACGAAGCAAAATGAAAAGACGAA
GAAATGATTCAGCCGCCAGCATCGAGATCCAGTAGATCTTAGTCACCTTG
GAGAATCGAACACTGAATTAGATACTGCATCAAAGAAAAAACATTTACCA
GAGATGGCAACAACTACATCGACCACCACGGATGTTTTGAAAACGTTGGA
AAGTCAACAACCGAACAACCAAGATACAGAGAATAATATGTTTAATTCAA
CCACTGGGATTATTGTTTCAACCATCGCAGCTTTGACATTGATTTTACTG
GTAGTGGCAATCATTCTGTTTAAACGAAGCAAAATGAAAAGACGAAGAAA
TGATTCAGCCGCCAGCATCGAGACACCAGAGATTGCTTCCGTATGCTCGT
TATCAAGTAAAATGGATCCCACATTCTGTTCACCAGCATTAAGCAGACAC
AGTCTGGAAACAATCATCACAGACGGTAGCGATCAGGAATCGCAGAATGA
GAATATTTACCAGCAACCAGACGATGTGGTCAAATCGAATTCATACAAAC
GACATTCTAACATACCAGCTGCTTATTTCCAACAGATCAGTTTAGATTAT
GAAAATCCTGATGATGTGCGCCAACAAGTTGAGAATCTCAGCCCTGAATA
TCATGAATTAGAGATTGAAGATTTACAAAGAAGGCCCATGCCACAACGTA
GAAACGATGAGATCAACGACGATAATGTACAACAATGGAAACCAAAGTTA
CCAAGAAAACCAACCATCCTCCAAAACATTCAAAGTAACCGACAATTGCT
TAATAATGGTTCATTTGAATCTGATGAAGATTATTATAGTGAAGCTCTGG
GAACTCCCAATCAAGTTTCACCAGACCAATTCGAAGAATTGTATGCTAAA
GTTGATAAATCACGGAAGAGACAAAATAACAGTTAGACACCAGAGATTGC
TTCCGTATGCTCGTTATCAAGTAAAATGGATCCCACATTCTGTTCACCAG
CATTAAGCAGACACAGTCTGGAAACAATCATCACAGACGGTAGCGATCAG
GAATCGCAGAATGAGAATATTTACCAGCAACCAGACGATGTGGTCAAATC
GAATTCATACAAACGACATTCTAACATACCAGCTGCTTATTTCCAACAGA
TCAGTTTAGATTATGAAAATCCTGATGATGTGCGCCAACAAGTTGAGAAT
CTCAGCCCTGAATATCATGAATTAGAGATTGAAGATTTACAAAGAAGGCC
CATGCCACAACGTAGAAACGATGAGATCAACGACGATAATGTACAACAAT
GGAAACCAAAGTTACCAAGAAAACCAACCATCCTCCAAAACATTCAAAGT
AACCGACAATTGCTTAATAATGGTTCATTTGAATCTGATGAAGATTATTA
TAGTGAAGCTCTGGGAACTCCCAATCAAGTTTCACCAGACCAATTCGAAG
AATTGTATGCTAAAGTTGATAAATCACGGAAGAGACAAAATAACAGTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000376_pilon | genome | sc0000376_pilon:265468..272625 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 787-1350:565 |
| Aaloc | 493-786:1269 |
| Aaloc | 403-489:3866 |
| Aaloc | 235-402:6399 |
| Aaloc | 1-231:7159 |
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