XLOC_041830 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041830
Unique NameXLOC_041830
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000251_pilon:458867..467034+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041830 ID=XLOC_041830|Name=XLOC_041830|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8168bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:458867..467034+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATTGTAAGTAGTTTATGGATGCATCCCTATTTAGTCTACTAAAGAAATAC AGAGATGAACTTGTTTTCATAGACGGACACAAATGACTAAAAGCCAAATA TTGATTGTTTTACTTCTTTCCTAGGGATTTGAGTAGAAATAAGTTATTTT GTGACTGGAGAATCTGGTGGTTAGTTCCTTTTGCACGAAAACTTGATTCG TTTACTGGTGCTTGTTTTCAACCAAGAGCACTTCGTGGAAGAGACATTAG AACCTTAAAGCAAGAAGACTTAGCaggtatttgaaaattttcaattagaA TAATGTGAGATAATTCTTGCTGCGATTAAGCACTCAATTTAGATGGCTTT CtctcaaaaatttaattgaTCCTAGGGGAGTGTCTTGTTTTAGCTTTCCT GAAAACTAAATGAAAAAGTCAAATATACTTACATTAACTTCAACATtgaa tgatattttttaaacaacctATGATTTTATTTAATCCAAACATGATAGTA TGTTTACATATAAATTTTTCCATGAAAACATTCAAATATGATATCAAGTT TCATATTCTTTTCAGTTGATTGTTTAAGTGTGAAGAAGCTGACAGGTGCA ACAAAAGATGGAGATTATGAAATGCGTGTGTTTGGGCATGACAACAGAAT CGCtgaaatctttatttattgCTACGAGATGGCATCAGATGACCCAACTG AGTTTCTTTCCTTACCATCTGGGGCTGATACAAATTTTGTAAAGATTGAT AAAGACGCATGTGACTACAGTGAAGGTAGTTATAATTTCAATACTATTCT GACCCTTTTAAAACTGATGTCTTTTTATGTCATTCCTATATCCTAAAAAG TATAATGATGAATTGCATTTAAATTCCAAAACTATCTTTATTTTTTACTC CTACTTGGAAACTCAGTTTCTAAAAGTAAGcaaattatttggaaatttct 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ATTAAgaatttataacatttttttcaaacttaaaactTACAGTaccattg tttttgttttagcttGTACCCTTCCACTTGGTatgcaaaacagcaaaatt cCAGATCTAGAATTGACTGCATCATCACATCGCAGTCCCTACTTTCCTTC ACATGCCAGAATCAACAGTATGAAACACATGGGATGGTGTGCAGAAACTA ATGATGGAAACCAAGAGTTTGTTATTCACTTGGGAAAGGTAATTGTGGTT TCAAAGTTACCATTGTTGAATGTCATAAATTAAACATATATATTTAGTAA TGGTTGAAACCAATTTGAAAGGTTGGTTGTGATCAATCTCTTATTTATTG CATAAttacacttttatttttatataggTTTCAAAATTAACTAAATTAAC TTTAAATTTTACATACTGAACCCCAAATTTTCTGACAAAGCTGGGATCTT TTGCCAGCTTTCTTCTTGatgaaaaagagagaaacaGTTTCAGCTCATTG CTTAACTTGTTACCCAGATGAACTTATAACTCATTTTCTCATAGAAAATG ACAATCTCTGGTATTTCA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000251_pilon:458867..467034+

>XLOC_041830 ID=XLOC_041830|Name=XLOC_041830|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:458867..467034+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGATTTAAAGATCTAGTAATTGTATTGGCAATTTTATTGCCATCTGT
GAGAACGTTGGAAATAACAGATTGTAAAGATGTTTGGGAAAAAACTGAGT
TGTCAACGTATTCATATACAGTGGATTGCTCGAATCTTGGTTTCACTGAA
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CTAGTAATTGTATTGGCAATTTTATTGCCATCTGTGAGAACGTTGGAAAT
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CGATCAAGCATCATTCGATGGATTGACTTCACTGCACTTTGTAATCTTGA
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AGACTGCAGCTGATAGCTAATGATTCTACCTTGCATCCAAGATCTCGAGT
GACTTATGGAAAACCAACTGTTTGTGATTCTGTTATGTGTACAAAAGGAA
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GATTTGAGAAGACTGCAGCTGATAGCTAATGATTCTACCTTGCATCCAAG
ATCTCGAGTGACTTATGGAAAACCAACTGTTTGTGATTCTGTTATGTGTA
CAAAAGGAATATCCTCAGTTGATCTTAGAGGAACACACTTCCAGTTGAAG
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GTCGTGCTCTCATCCAAACCATCTGACATTGAGCATTCTGAATCCAGTCA
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TTCTGAATCCAGTCAAAAATCCATTTGCAGcttGTACCCTTCCACTTGGT
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CAGTCCCTACTTTCCTTCACATGCCAGAATCAACAGTATGAAACACATGG
GATGGTGTGCAGAAACTAATGATGGAAACCAAGAGTTTGTTATTCACTTG
GGAAAGcttGTACCCTTCCACTTGGTatgcaaaacagcaaaattcCAGAT
CTAGAATTGACTGCATCATCACATCGCAGTCCCTACTTTCCTTCACATGC
CAGAATCAACAGTATGAAACACATGGGATGGTGTGCAGAAACTAATGATG
GAAACCAAGAGTTTGTTATTCACTTGGGAAAGAAAATGACAATCTCTGGT
ATTTCAAAAATGACAATCTCTGGTATTTCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041830XLOC_041830-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000251_pilongenomesc0000251_pilon:458867..467034 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1192-1215:8145
Aaloc1018-1191:7665
Aaloc901-1014:7271
Aaloc694-900:6797
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Aaloc1-183:1