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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000251_pilon:148680..153513+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041821 ID=XLOC_041821|Name=XLOC_041821|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4834bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:148680..153513+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTTCCATTATTCGATTCACACCTTTGTCAGGTGCACAAGATGAGAA
ACCATTGTGTTATCTCCTTCAAGTGGATGAATTCAGGTTTCTACTGGATT
GTGGATGGGATGAAAATTTAGACTTGGAAGTGGTTGAAAATATACGAAAG
TGAGTATGAATCAACTTTGTTATGCTTTgttatgtttaatttttttcagt
aaGGCGacaccaatttaatttgttgttctacgggcccaaCCGACcttatt
ttgctaaaatcaaaaaaataataatgaatttccactaaaatatatttcac
acactagttatttgtaagaattaaatttgaataaatctgaaaattaattc
aagaaaatttagaaaatgaagcaagcattccatacactaaaattttatta
tgatcttcatcgaagataaaaaagtgaacttttgaatattttcagtacct
taccaaccctgataaataaaaaatttattcttactttaccgaccgaccga
cccatatttttctaacgatctgcccgtagaaaacaaattaaattggtctc
gcctaacttAACTTCGTCCGATTTCTATCCgtataaaattgtatttttat
ttctgataaaaatgttaattcgaaattcaaatttttaccgTTTTTAAAAT
ACTCCTGGCACGAATGTTATTTAACTTAGCCCGTAACGTAATCataagtt
taaaaaattcaattttaatttgatttcaGGCATTTGCATTCCATAGACGC
TGTTTTATTATCACATCCAGACATATACCATGTTGGTGCACTACCTTATC
TTGTTGGAAAATGTGGTCTGAATTGTCCTATTTATGCTACTATACCAGTT
CATAAGATGGGTCAAATGTTTGTCTACGATTTTTACCAGGTATTGTGAAG
CTTTATTTAGctctttatacttttttgtaattttgttcgGGTACAGACAG
ATTTGAATTGTTTAGCTGTACTTTTGTTAAGTATAGATTACTGTAGTCCC
TTTTtactggaaaaaaaatcttttgatccaCCACCCTGTGTTGACTAACT
TCTTCCCttgtcatttatttttgtgGGGAAACAGTCTTTTAAGGCAAGAT
AGGGGTCTGTACGTTAATCAAATAGTTTCATTTTTCTATTATACTTGCTT
CACTTCAGTCTCATCATAATTACAAAAACTTTGAACATTATACTCTTGAT
GACGTCGACGCAGCTTTTGACAAAATTGAGCAATTGAAATACTCACAACA
CGTCAGTTTGAAAGGTATGATTATGACCaccttataattttttttttttc
atacttCAAGCCCGTTTTCTAAATGACAACTTTGAGCAATCCCAAATAGT
GAACAGTCAATGGCAACAGAGACACTCTacggaaaagaattttgaaattt
tgaaatattgggTCTGTTTACAGACAAAGtttttttGGCAACTTCATTTT
GTATAATGAAATTAATTTAGTGAGTTttgagaaagaaacaaaagtctgac
aaataaaattttctttgaacttTTGCTCAagctaaataaaaaatcttatg
AAATAGCTATTATTCGTTGGGtcaaaaaccatttttgagatccTAGTGTG
ATTGGACTGCTTCTGGAGGTGCTATCAAACGGTGTAAAGGTCTTGACGCT
CTTAGGTGCCTACACTGTGTTTCCTGTGCACTGTGTAGGGTCGTAACCAT
AGTCTTATGGGGAAAGCTTCATCTAGCAAGGGTAAGGGATTCAACTGAAT
AATTATTATTCTAGGGGTTACACTAAAAGAGTAAATCAGTTTTATTAACT
ATTTGCATGTTTTACATCTAAATATATTTATATAGTTTAAAGAATTCAAC
CTGttttttttGAGACAGTAGAGCATGTTTAAAACAAAGCTGGAAAATTC
AGGAACAGTTTTGAAGTAGATGAAAACTTTACCAATGCTGtttaaataaa
tcaatcctcTAGAAAACACCTCAATAATGAACAGGATTTGATAGGCTGAT
GATTAGACTGGGAGCTTAGCTATGTTCAATGCAATGGGAAATGCGATGTA
CAAGACTTTCCCCAAAACAATTGACACCGTAAATAAACCGATAAGGAGTT
TTAACGTCGCCAAAGCTTTCTGGTTTCGTTCTTTAGCTCTCCAGTGAGGT
GCATTTGCAAGCGCCTTTGAAATTCTATAGTAAAACAAGCCAGTCAAGGT
GAAGGATAGAACAACAGTAATGGCCGTTGAAAAGTCAGAAATTATGAAAT
GGACAAGTTGGTGATCTTGGTTAAACATTGGTAAAATAATATGTCCATGG
AAAGAATAAATGATGCCACAGAAATGCCAAATAAAATGTTGCTTCTTCCA
TTTAGCTTTTACCAAAGGTTGCACTTTACGTGTCTATTTTCCGACTCTTT
GTTTTACTTTGAGCATGTTCTTTCTCACCGTGATAATGATTCACTAACCT
TTTCTCTAAGTTCCAGTTGACGGCCTTCACAATAAGACTCTTTTTTGCTA
TCTTAAATTaattcaaatttgattaaaaatttggtttttatttacCTAAT
TACAATCGAATGAATATCGTTAGATTTGACGTCAAAGTATGATATATTAA
TAGATATTAATAGAAAATTAATTACtagaaatacaataaaaagcgaTATG
TTTTCCTTTTGAACGGTTTTTAAGAGGAAATTTTCCAATAAGAACTGCAT
GTGGTATAAAGGAAAataattgtttatttttcatcgaTCAATATCAAGAT
GATATTTggatatcttcaaaaaaatatcgagaaaaaaaggtgaagaaaag
aacaaagaatCTGTTGTTGAGTCGCGGAATTTCATCAGActttccatgtc
aaaatttattattttgttctgaaaaagaatttgttgaaagaattttgttt
tcAGTTTGCTTGACTCAACTTGACTCAGAATCAACCAAACAGAATTTCTA
TCAAATACAAAAAAGTTGGTATTCTCTCATATCAAGCCATTAGTTATAGA
GGAACATACTTATCAACGAATAAAGAATTAAACGtctaaaaagctaaaaa
tggtATTCAAGGTACCCAATAACACATTGAGAGACATTCTACAGAGCAGA
AATGACGCACTGGATGTAGTTATCGTTCAGATGCATAAAGTCATCAGAGT
TCTTGAAGTTTGCGTAGCGTTTGTTGGTCTTGTCGGCAATTTGATCATTC
TTTACTTCTTTATTCAAACGAATCGAAGAAAAATGAGAAGAATGACTTCC
TACCATTTCCTATTGATTCAATTGGCAATCATCGATTTTGTGATTTGTAT
CGGAGTTATTGGATCCTCCCGCTATTTATCTGATAGCTTTGGTGAAGTGT
ACAGTTCAGTGGTTATCAGCCTATTGAAGGTCTTCTCATTAGATTCCAAC
TTGGTATTGATCATAATCTCGTTCTTGAGATTTCTGACTTCCTTGGCTAT
ATTTATACCGTTGTTTAATAATAATCACCAAGCTGACCAATTCACAGCTT
TCGACTTGTCTACTGTAATTGTGACCATATTTTCCCTCACCTTGACTTGC
TTGTTTTACtatagaatttcaaaagcccTTGCAAACGCACCTCACAGCAG
AGCTAAAGAACGAAATCAGAAAGCTTTGGCGACGTTGAAACTCCTTATTG
GTTTATTTATGGTGTCAATTGTTTTAGGGAAAGTTCTGTACATTGCTTTC
TCGATTGCATTAGACAGAACAAATTTCACAGTCGATGCTATCGGCTATAA
AACTCTTTCAATGCTGGAGAACTTTTCTAgaggattgatttatttgaaCA
GCGTTGGTAACGTTTTTATCTACCTCAAAACTGTTCCTGGATTTTCTCGA
TTCATTTTGAACAGATTCTTTTGCCgtaaagaaaaacaatgaaaagtcag
aagaaataaaaaaggatgtcaaacttcttttttttttgtaactaATGGAA
ATAATTATATTTATGTCTTACTCTATGTGTCATTGTGTGAACTTAACTTT
ATGAATCACTTTGCCCCGtccctctcttctacttcctcctttccttccct
cttttctcctctcctttctcctctATTTCAGTGTTTTgcttaccttattg
gaactaatttttgcgggaactaattttcgcggtcgaaaaaaatatccgaa
aaattgcatttcgcgggttttaattttcgcaattttgcatttttttggac
aaatttttttcattttcctggggatttttcaaatttttcgataaaattgg
aaaaaattgtgtttcgcgggaattaattttcgcggtttttaacTCCCAAA
ATTATTCGCGAGTTCAaatttttcgcgattttgacgaaaaaccgcgaaaa
acgctaaaattaattcctgcgaaaattagttccaataaggtaaatCAAGG
CTTGGAGTGAAAGACACAGGTTAGATTCCCTCTCCACCCCTGCGGTGCAA
ATAACCAAAACAATCATGTTCTCTTTTAGAGTTTGAGCATTTCTCCTTAT
CATGCGGGGTATATGATAACAGAAACAACCATTTTCTCTTTCTAAGGGAG
TGGTTATGGGTTAAAAACACAACCCTTTACCTAGCACGTTACATTTCTTA
CCTAATGCAGCaaataaactaaaaatcaatGTTCTCTTGTCGGTTGTGTT
GACGGGGTTGACTTGCAGACTAATATTAAATCTCAGTCACGGTTTCTTTT
TAGGGCGTGGTCACGGGTTAAGCATCACCCCTTACCTTGCGGGACACATG
ATTGGTGGAACAATGTGGAAGATCATGAAAGAAGGGGAAGAAGATATTAT
TTATGCTGTCGATTtcaatcataaaaaagaaatg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000251_pilon:148680..153513+ >XLOC_041821 ID=XLOC_041821|Name=XLOC_041821|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1092bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:148680..153513+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTTCCATTATTCGATTCACACCTTTGTCAGGTGCACAAGATGAGAA
ACCATTGTGTTATCTCCTTCAAGTGGATGAATTCAGGTTTCTACTGGATT
GTGGATGGGATGAAAATTTAGACTTGGAAGTGGTTGAAAATATACGAAAA
TGACTTCCATTATTCGATTCACACCTTTGTCAGGTGCACAAGATGAGAAA
CCATTGTGTTATCTCCTTCAAGTGGATGAATTCAGGTTTCTACTGGATTG
TGGATGGGATGAAAATTTAGACTTGGAAGTGGTTGAAAATATACGAAAGC
ATTTGCATTCCATAGACGCTGTTTTATTATCACATCCAGACATATACCAT
GTTGGTGCACTACCTTATCTTGTTGGAAAATGTGGTCTGAATTGTCCTAT
TTATGCTACTATACCAGTTCATAAGATGGGTCAAATGTTTGTCTACGATT
TTTACCAGGCATTTGCATTCCATAGACGCTGTTTTATTATCACATCCAGA
CATATACCATGTTGGTGCACTACCTTATCTTGTTGGAAAATGTGGTCTGA
ATTGTCCTATTTATGCTACTATACCAGTTCATAAGATGGGTCAAATGTTT
GTCTACGATTTTTACCAGTCTCATCATAATTACAAAAACTTTGAACATTA
TACTCTTGATGACGTCGACGCAGCTTTTGACAAAATTGAGCAATTGAAAT
ACTCACAACACGTCAGTTTGAAAGTCTCATCATAATTACAAAAACTTTGA
ACATTATACTCTTGATGACGTCGACGCAGCTTTTGACAAAATTGAGCAAT
TGAAATACTCACAACACGTCAGTTTGAAAGGGCGTGGTCACGGGTTAAGC
ATCACCCCTTACCTTGCGGGACACATGATTGGTGGAACAATGTGGAAGAT
CATGAAAGAAGGGGAAGAAGATATTATTTATGCTGTCGATTtcaatcata
aaaaagaaatgGGCGTGGTCACGGGTTAAGCATCACCCCTTACCTTGCGG
GACACATGATTGGTGGAACAATGTGGAAGATCATGAAAGAAGGGGAAGAA
GATATTATTTATGCTGTCGATTtcaatcataaaaaagaaatg
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000251_pilon | genome | sc0000251_pilon:148680..153513 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 418-546:4706 |
| Aaloc | 310-414:1159 |
| Aaloc | 151-309:731 |
| Aaloc | 1-147:1 |
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