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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000251_pilon:67319..69478+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041819 ID=XLOC_041819|Name=XLOC_041819|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2160bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:67319..69478+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aacatcattGTCAAATTTGGAATGGAAGAAAGTCCTGAATACAAAAAATG
GACAGATCGGCTCAAGAAAACAACCTATATTTcttatttaataatttttc
ttggtGGTTTGGAAGTCAATGCTGTCCAAATTGTACTTTTATATTATTTG
GAGGAGAATTTTAACATGACTCCAAACCAAAGCAGACTGTATTACAGTCT
TGCTGAAATGTTTAACGCTTTTGGGCAGATGACAAGTGGATTAATGATTG
GACGTTTTATGGACAGAACAAGGAATTTAAAATTAACctgtttattgatt
ttatgtGCTACCATCGTTGGGAATTTGTTATATTCCTTGCCTTTTCATAT
TTCGTTTATTCTGATTGGACGATTTTTATGTGGCTTTAATGAGGCGTTCC
AAGTTGCTTTATGTGGTAAGAAAACATCACACTTTCCccctaaaaagttt
aaaaaaacttctCTCGATATTGAGATGGCTATCATTGGAAGGTTCACCCC
TTGCATTTTCGGTAAATTATCGAGTCATCCTCATGGATTTTGTCTAAATC
ATAGAGAACTCCGCTGAATTTTGCTCATTTTTAATTGACCTCAGCCTTGG
ATTTTCCCACAAATTTCACCGACCCCTGAGTtgttaaattttgttatttt
agcaCTTCCCTCTAAATATCTCCTAATAGCTTTGCGAATAGCTAAATATC
AAGACGAGTTCATATACCAGTAAATAGAATTTTGATTGATCCTTTCTTTT
GCTGCCGAAGTCCATAGGTATTTTCGAGAGATTTTAATTTGCAGACTAGC
AGGTCAAATTAGTAAATGACTTCACGTATAACAGTTTCGTGGCATGTCGG
GCTCACACCTTGCCGAGTGAGATTAATTCTATCTTTGttatcttcaattt
tcattAGGCGAATTCAAAAGATGTTATAAGGAAGACGATCTGATCAGAAT
TTTGAGTTGGTACGAGCTCTTCTTCGCCATTGGCATGGCTGTTGGACCTG
GTGCACCAGTCATTTTCTCGTGggtgaatttgaaaattggtaaatataat
atatttcataaattcGTGTAAGATAGCTCTAGTTTAGTGATCGACTTTCT
ACCTGTCTATTATAATTCGGAATAAAAGTTGGCAGAGAGTTGCTGGCTGT
CTAAAGACAAGTTAAAGCTAATAAGGGATGCCGGATTGAATATAGGATAT
TTAGGTACAAAAATGGGCTAAAGGTTTGTATGGGAATCATTCTCATTTGT
AATGAAGCCTCTCCAGTTTTATTTCATTAGTTGTCAATACAATTTTACAG
GACATTGGTGGATCAATAAATACAACGCATTGCATGTTTTCCTGACACTC
TTATTGGTATTATTGTTAATTTTACTATGGTTCCAACTCACTGATCTATC
GAAAGATCTAGACtgtatgaaagaaaaacatttgcgTCAGCGATCACAAT
TGCAATGTAAGAAAGATGAGCAACGTGGTAGCTTAGCTTCTACAGAGCAC
CATGATAACGAGAGGTACAATAAGAAAGGACAATCACGAAAACTCATGAA
ATGGAAAGAGCTTTTGCAAATTGATATTATTACATTGTGCGGTTGTTATA
CTATTTTACGATACGCTGCAAATGCATCCGCAGCATTAATTGCAATGGAC
GCTACTACATTATTCCATTGGCCAGTCAGTTGGATTTCATGGCTCACCAT
AGCTGGAGCTGGCACTAATTTTCTTGGAATAACAATGTTGATAAAATGCG
GTGTCTTCAAAGGAATAAAACgaaattatttttgctttttatcgGCGATA
AATACAACTATGTTTATTCTTGCACTGATGCTGTTACCGAAGATTACAAG
CATTAAGAGTTACACTTTTCAATTACTTTATTTGACTTTCCAAATACTTG
CTAAAGGATGGATTTATTTCAATGCCCAGTCAGCAGGGAAGATTTTGGTT
TTTAATACTGTAACACCAGAGAATTCTTGTCTGATTGACAGTATCAGGTC
AGCTGTTGGTTGCTTGGCTCGACTGTTTGCTTTTGCTACAAGTTTCTTAT
GTTTTAATTACccagaatttttctttttaccaatTGGAACAATTTTGTTT
CTAGGGAATTGTGTTATAGTTTACAGATATAAGGCTCATATTTATAGACA
GGGTCAATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000251_pilon:67319..69478+ >XLOC_041819 ID=XLOC_041819|Name=XLOC_041819|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2814bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000251_pilon:67319..69478+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aacatcattGTCAAATTTGGAATGGAAGAAAGTCCTGAATACAAAAAATG
GACAGATCGGCTCAAGAAAACAACCTATATTTcttatttaataatttttc
ttggtGGTTTGGAAGTCAATGCTGTCCAAATTGTACTTTTATATTATTTG
GAGGAGAATTTTAACATGACTCCAAACCAAAGCAGACTGTATTACAGTCT
TGCTGAAATGTTTAACGCTTTTGGGCAGATGACAAGTGGATTAATGATTG
GACGTTTTATGGACAGAACAAGGAATTTAAAATTAACctgtttattgatt
ttatgtGCTACCATCGTTGGGAATTTGTTATATTCCTTGCCTTTTCATAT
TTCGTTTATTCTGATTGGACGATTTTTATGTGGCTTTAATGAGGCGTTCC
AAGTTGCTTTATGTGaacatcattGTCAAATTTGGAATGGAAGAAAGTCC
TGAATACAAAAAATGGACAGATCGGCTCAAGAAAACAACCTATATTTctt
atttaataatttttcttggtGGTTTGGAAGTCAATGCTGTCCAAATTGTA
CTTTTATATTATTTGGAGGAGAATTTTAACATGACTCCAAACCAAAGCAG
ACTGTATTACAGTCTTGCTGAAATGTTTAACGCTTTTGGGCAGATGACAA
GTGGATTAATGATTGGACGTTTTATGGACAGAACAAGGAATTTAAAATTA
ACctgtttattgattttatgtGCTACCATCGTTGGGAATTTGTTATATTC
CTTGCCTTTTCATATTTCGTTTATTCTGATTGGACGATTTTTATGTGGCT
TTAATGAGGCGTTCCAAGTTGCTTTATGTGGCGAATTCAAAAGATGTTAT
AAGGAAGACGATCTGATCAGAATTTTGAGTTGGTACGAGCTCTTCTTCGC
CATTGGCATGGCTGTTGGACCTGGTGCACCAGTCATTTTCTCGTGggtga
atttgaaaattgGCGAATTCAAAAGATGTTATAAGGAAGACGATCTGATC
AGAATTTTGAGTTGGTACGAGCTCTTCTTCGCCATTGGCATGGCTGTTGG
ACCTGGTGCACCAGTCATTTTCTCGTGggtgaatttgaaaattgGACATT
GGTGGATCAATAAATACAACGCATTGCATGTTTTCCTGACACTCTTATTG
GTATTATTGTTAATTTTACTATGGTTCCAACTCACTGATCTATCGAAAGA
TCTAGACtgtatgaaagaaaaacatttgcgTCAGCGATCACAATTGCAAT
GTAAGAAAGATGAGCAACGTGGTAGCTTAGCTTCTACAGAGCACCATGAT
AACGAGAGGTACAATAAGAAAGGACAATCACGAAAACTCATGAAATGGAA
AGAGCTTTTGCAAATTGATATTATTACATTGTGCGGTTGTTATACTATTT
TACGATACGCTGCAAATGCATCCGCAGCATTAATTGCAATGGACGCTACT
ACATTATTCCATTGGCCAGTCAGTTGGATTTCATGGCTCACCATAGCTGG
AGCTGGCACTAATTTTCTTGGAATAACAATGTTGATAAAATGCGGTGTCT
TCAAAGGAATAAAACgaaattatttttgctttttatcgGCGATAAATACA
ACTATGTTTATTCTTGCACTGATGCTGTTACCGAAGATTACAAGCATTAA
GAGTTACACTTTTCAATTACTTTATTTGACTTTCCAAATACTTGCTAAAG
GATGGATTTATTTCAATGCCCAGTCAGCAGGGAAGATTTTGGTTTTTAAT
ACTGTAACACCAGAGAATTCTTGTCTGATTGACAGTATCAGGTCAGCTGT
TGGTTGCTTGGCTCGACTGTTTGCTTTTGCTACAAGTTTCTTATGTTTTA
ATTACccagaatttttctttttaccaatTGGAACAATTTTGTTTCTAGGG
AATTGTGTTATAGTTTACAGATATAAGGCTCATATTTATAGACAGGGTCA
ATAGGACATTGGTGGATCAATAAATACAACGCATTGCATGTTTTCCTGAC
ACTCTTATTGGTATTATTGTTAATTTTACTATGGTTCCAACTCACTGATC
TATCGAAAGATCTAGACtgtatgaaagaaaaacatttgcgTCAGCGATCA
CAATTGCAATGTAAGAAAGATGAGCAACGTGGTAGCTTAGCTTCTACAGA
GCACCATGATAACGAGAGGTACAATAAGAAAGGACAATCACGAAAACTCA
TGAAATGGAAAGAGCTTTTGCAAATTGATATTATTACATTGTGCGGTTGT
TATACTATTTTACGATACGCTGCAAATGCATCCGCAGCATTAATTGCAAT
GGACGCTACTACATTATTCCATTGGCCAGTCAGTTGGATTTCATGGCTCA
CCATAGCTGGAGCTGGCACTAATTTTCTTGGAATAACAATGTTGATAAAA
TGCGGTGTCTTCAAAGGAATAAAACgaaattatttttgctttttatcgGC
GATAAATACAACTATGTTTATTCTTGCACTGATGCTGTTACCGAAGATTA
CAAGCATTAAGAGTTACACTTTTCAATTACTTTATTTGACTTTCCAAATA
CTTGCTAAAGGATGGATTTATTTCAATGCCCAGTCAGCAGGGAAGATTTT
GGTTTTTAATACTGTAACACCAGAGAATTCTTGTCTGATTGACAGTATCA
GGTCAGCTGTTGGTTGCTTGGCTCGACTGTTTGCTTTTGCTACAAGTTTC
TTATGTTTTAATTACccagaatttttctttttaccaatTGGAACAATTTT
GTTTCTAGGGAATTGTGTTATAGTTTACAGATATAAGGCTCATATTTATA
GACAGGGTCAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000251_pilon | genome | sc0000251_pilon:67319..69478 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 550-1407:1303 |
| Aaloc | 418-546:910 |
| Aaloc | 1-414:1 |
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