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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000287_pilon:350685..356587+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041815 ID=XLOC_041815|Name=XLOC_041815|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5903bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000287_pilon:350685..356587+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTACGAAGACATGGAAggtcagccattttgaattttcattttttc
taagtttATTATATTATGAGATAACTCTGCGTGATGATTTTATTAACTCA
CAGCAGTTTAATAATATTATTATTCCTGTTTAGAGTTTATGCTTTCCACT
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AAATTGGGATAAATAGGATGGCAATTTTATACCCTGTATTTTAATAGTAG
TTACAGTAATGGATTATCTTTCCAAAGTCGAATAACTTATTTTATCAGTG
GTAAAATAACACCCCCTAATTTTAATCATAATATTTATTACTTACaattt
ttataaatcaaaacatGTTCGTGGGCCTTTTAGATTTATACTTGTTCAAT
TTTTTGTACACCGTCGAAATATTTATCTGCTTAAAGAATCTATGAAATGG
TTTTATTGGTTAACACGTTGGTAACTTTTTATGTAAGCCTCttgaataat
aaaatttatGTGCtttttttCGTGAATTATTTTGTTACGTGTGTCATATC
TCATAAACCTTTTTAATTTAACACTAAATCGATTTATGCAAAAATTATAG
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TACCTCCTTAATGTAGTATATGAAAAAACTTCCGCTgctttttgaaatga
aaaagctTTTTCATTCCTCACCCTAGCATGTGAACTTGAGACAAGCCTac
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GCAACCCAACTCAAGCCGAAGTCaaaaaaaTCGTCGCCGACATCGACTCC
TCAGGTATCTTGAACTCGACATTTTAGCGGTAATTTTTAAGTATAAACCT
ATAACCTTATCTTCATAATTTTGGATTGTATTTGAGTTTAACAGGACCag
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TGGAATTCGGCAacagaacctaagaatgccatttttagagcatttgtcaa
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TCTGTGTTTACAATTTTTGCAGAAATCATTCAGGGAGGATCAACGATAAT
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CAAAATGTTCTTGCATTTGTGCTATTTGGATCAAGAATGACTTGTGATGC
GAATGCTGCTAAGAAATAATCCAAGCAATTGTAAAGCCAAATCTTTTAAT
caataaaaagattaaaatacCAAACATAGGGATTGATTGGAGGTCAAATA
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AGTCGTAGCCTAAAGGGAACAACTATAACGATAGTGACTTAGTTAAATGA
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TCTTTCACACGATGAGCAAAAAGAAAAGCTCGTGCGGTTTCGAAGCGTTC
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AGACTCCTAAAATACCTTATTTGCTTTTCATAATAACTCACATTAGTTAT
Aaacacttttttgcaaagtaaagattttttattgcgcctccttagactct
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AATACACTTTGAGATCAAGTTTTAGGGTGTTGAATCAATAGCTGCTGCct
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ATCAACTACGAAGGTTTGTACCCATACTCACAATTCAAAATCCATGCATG
TTTCTTGGGGGAAACTTATGATGCTTGCTCTATTAATCTATATTATTATC
TTCCTCTTTTTAAGTGCTTGACATGTAGGCCTTAGGGATAGacataaaat
ctttatttttacaCCTTTGTgttacagacccactggaaccccagccccac
tggaaaatttggcaaaaaaatcgtccccggctGGAAAATACCGTGGAATT
TTAACCCCACTGggaatttgactttgatttcatccccattcgagatTCAA
TGcggtttaaaaattgcactccaagaccatccccactggattgagatttc
aataggaatttttattcccacCGAGGAAAAAGTTCCcaccggagctgtga
gacaggggtgtatttttgAAAGGTATTAAAAAACTAACAAACACTTTCTG
TATCCCTACAAAGGTCATATGAGtcttgaaaaaatttccgcCAAGGCTTG
GTTCTCAACACAAGATATTCTACTATGAAGTTTGATAAggttatcccttt
aaaatgGCTTAAGTTGGGGATCAAAATTAATTTGCTTTATTCACAGATAG
TCTAAACACTATTCAAAAGAAAGATCTTATATCAAAATATTGATTCTAAT
AACATATTTGACTATGCTGACTATGACAGTGATCAAAACTTTTGAGTCAC
AGTCAAAAAGTTCTTAGTCAACAGAGAGGCGTTCAAGTTACTCTAAATTT
TGTTAGGACCAATCTTTCACCGGtggaaaacttaaaaaatcaacatttaa
aTCAATGAATGTGTACCAAATTTAAACATATATCAAATACCCCCTACCAT
AAAGCCAAGGAGATCCCAGCCAAATTGGAAAGTTCGTCCCCAATGATCAG
ATACTCTATTATTTTATTACCCGGTGGATAAGTGGTTTCAACCCCATTGT
GAAGGGGGCGGTAAAGTTATAAAGTTGAATCCCGCCCGTCTTCAATTACT
TCAATAGAAACTTAAAACCCCTTCAAACAAATTGGGATTTCTAATTATAC
TGATATGTGGCTCATGGGCTTGAAAAACTCTCGCCAGGACACCGAGACAG
GATTGTAGAGAAagaaagttagatttttttctctcaatatTTCAAGtctg
aaaattagatttttcaagaGACGGCAATTAGATGTGACTTAGTTGATAAT
AAGGTCTGCATTTTTCTCTTTCAGAATTTGTTCGTGGAGTAATGAACGCT
Taa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000287_pilon:350685..356587+ >XLOC_041815 ID=XLOC_041815|Name=XLOC_041815|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=882bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000287_pilon:350685..356587+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTACGAAGACATGGAAgATGAGTTACGAAGACATGGAAgAATACC
GTGATACCTTCTCACTTTTCGACAAACAAGGAGATGGAAAAATTGAATGT
GGCGATATCGGAGATATCTTACGCGCTCTCGGATGCAACCCAACTCAAGC
CGAAGTCaaaaaaaTCGTCGCCGACATCGACTCCTCAGAATACCGTGATA
CCTTCTCACTTTTCGACAAACAAGGAGATGGAAAAATTGAATGTGGCGAT
ATCGGAGATATCTTACGCGCTCTCGGATGCAACCCAACTCAAGCCGAAGT
CaaaaaaaTCGTCGCCGACATCGACTCCTCAGGACAAAAGCGAATCACCT
TTGAAGAATTTATTCCAATCTTTCACACGATGAGCAAAAAGAAAAGCTCG
TGCGGTTTCGAAGCGTTCTCCGAAGGATTCAGGATTTTCGACAGAGATAA
CAACGGTATGGTCAGTGTGGCCGAAGTCAGACATTTATTGACCAGTTTAG
GACAAAAGCGAATCACCTTTGAAGAATTTATTCCAATCTTTCACACGATG
AGCAAAAAGAAAAGCTCGTGCGGTTTCGAAGCGTTCTCCGAAGGATTCAG
GATTTTCGACAGAGATAACAACGGTATGGTCAGTGTGGCCGAAGTCAGAC
ATTTATTGACCAGTTTAGgtgaaaaattaaattccagTGATGTCGATGCT
TTAGTACAAGGACTTGAAGATTCAAGTGGCATGATCAACTACGAAGgtga
aaaattaaattccagTGATGTCGATGCTTTAGTACAAGGACTTGAAGATT
CAAGTGGCATGATCAACTACGAAGAATTTGTTCGTGGAGTAATGAACGCT
TaaAATTTGTTCGTGGAGTAATGAACGCTTaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000287_pilon | genome | sc0000287_pilon:350685..356587 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 415-441:5877 |
| Aaloc | 337-411:4588 |
| Aaloc | 169-333:4067 |
| Aaloc | 25-165:2913 |
| Aaloc | 1-21:1 |
|
