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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000233_pilon:30947..37873- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041760 ID=XLOC_041760|Name=XLOC_041760|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6927bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:30947..37873- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCGGAGGGGCGGCTTGTGAAAGTACACTCTCAGAACATGAGTCATGT
CGAAATGGTTGGTCGATTTTTTTATATCATGGATCCTCATAAGCATATGT
TTGAAACACCAATTGAAGTACCAGATTACTTGATCGAGGTATGGATTTCT
ACCCCTAATATGTTAAACTAGAGTCGTTTATAATGTGTGTATAAAATAGA
TTATTGTTACGGGATTTAGTTTTTATCCCGGGGGGGGGGGGTGGTACTTA
GGCAAAATGGGTGCCGGGTATGTGCGAGCCATAAGGGTACCTTTTCTCAT
TCCTCAAAAGTCTCTCAAAGGGGTACAAATTCAAAAGTTAGTCTCTGAAA
GGGTCCCAAAATCACGAAAATCAAAAATTTCTCTCTCAAAGGGTCACGAT
TTCCAAAAATTTTGACCAAAATTTGGTGACAATCAAACCAAAATTTGGAA
AAAATGGACCAAAATTTAGGAAAAAGTCTCTCAAAGGGTTCCAAAATCAC
CAACATTTTGTCTCTCAAAGGGTCGATTTTCGATTTTAGGCTCGGACATA
CCCGTCACCTCGCAAACCTAGTACCCCCCCCCCCCGGGGGTTTTATAGAC
TAAAATTGTTCCCTCCATTACTTTTTGCTTTATTTCTACCATTTCTGAAT
TAGTCGTCTAGCTTGCTATTAAAGAAAATCTACATTTTAATTGGGCGTGA
TTTCAAAAACGCCCCTAATTTTTAACGTACGTTCTTTTTAATAAATTAAA
GCTGCTGGAAGTTTTAAGTCGTTGATGAGTAGCTCTCGAATCGATCTCTA
ACATAAGAGACAGCTCTGATTTCTTTTGATAATCTTTTTAGTTCTGTTGG
AAATCTATCGACTCTTCAGTTTCAGAAGCATATAAAGATTTCCATTTACG
TTATTTCTTTTAAAGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTTGA
GATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGATACAATCACAAGTTATTTTACG
TTTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAATAAATTG
GTCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGCTATGTTCACCAACACTA
CAGGTTAGTTTGAAATAAGTGCGATCGGGTTGGAGCTCTTTTAAGCGAAT
ACATTTTTCTTAAGGGGAATGGCTTCAAAAATTGTAGTGGTTATCGTTGT
TTTTTTCAGCTAAAGTAACGATACAGTGACATATTTCGATTTATCCTATC
TATGTCAAGACCAAGCTATTAAAGAAACTTTTATCTTATAGATTGACAAC
ACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCGCTATTG
ATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGGTATGTATATAAAC
TTGAGAAATGCAACTAATAGACACTCGATAGAAGTAAAAAAGTGTCTGTC
CGCTATTATTTGCAGTGTCCGTTGATATTAGTTAGAGCTCACTAAATCTT
AAATTATTATTATGATAAGCTACAATCTTGGAAAAAATATTTAAGACAAA
GAAGATTTCCCTGAAAAATCTTAATTACCACAAATTATTTTAGGCGCTCT
GATTTACTTCTGGAATCCCCACTAAATAAGCAGTTACTACTACGCCGTGA
CTGAAAATATATACTTCTATTTGTATTGCAAAACTCAATATTCAGAAGTG
AATTTGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAA
TTTAACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAGTAA
GTTTAACTAAACCTATGATTTAAACCTTCAGTCCCGAAATATGTATTGAA
GACTATTTGATAGTTATGAAAAACCTCGAGACTAAAAGGGTTAATATGTT
GTTCAAAAAACACCCCTGTGTCCGCTGAGACCCCAGCCCAACTGAAAAAA
TTTGCCAAAATTTCGTCCCCAGTGGACAAAATACCCTACAATTTCAGTCC
CACCGGGAAAATGATTTTGATTTCATCCTCTTTGGAAATTCAATGCAAAA
ATTTGCTGTCCAAAACCACTAGATACTTTAAAGCTCGGGAACGATAAAAT
TTCTATCCCCATTGGGATTTCAATAAAAAACGAGTGTTTTAGAACAATTC
AATTTAAAATGTTGCGTCGAATTCCTGAATTTCTTTTTCATTTTCAGTTG
GTTTACATCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCA
TGCGCAGTTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGGTAAATA
GTAAAGAACTACACCTAAATGTGCAGAGAGCCGGCATCAAAAGTTACAAA
TAACTCTAAGTTTCTCAAAGGGGTGTAGTTTTCTAAGTCGGTACGAAAGG
CGCAGGTCATTTTGGAAGTTTTTTATGAAAAAAAAAACAGTTGGTCTAAA
GTTTTATAGCAGAAAAAAAGAAAAAAAGCTGATATCACGGTCATCAAAAA
CCTTGAACCCCTTCAACTATTTATCTTATTGATAGAGACTTCTTTGATAT
AAAGTTATGAGACGATTATTTTCGTAGTTTTTGCCGACGAATATTCTTTC
ATCACAAATTTTCTACAAATAATGTACCTATTACTTAATCATATTTAATC
GAAACTGAATATGAAGATTTAAATAACTAGCTATGTGTTCTTCTCTAACA
GGTTGTTCCAAAACTTGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTC
ACCATCGAGTTCATCATGGTATGTAGACGGGAAACTTAATTTGAATACTA
CTCTACCAGGAATATTACCATGGTCCAATTAATTAAGGGAATTACTACAC
TCTACAATACCCACTGTAATACTTGGCACAAAAGGGGAATTCCCTCAAAT
TTGAAAACCGCAAGTGATTTTTAAGTGCTTTATAAAGTACGGTTGGAAAG
TAGAGTTTTAATTCTGAGTTTTAGCATGAAGACTTACGACCTTAGGATCT
CAAAGCTCAAAAATGTTCCTGAGAATGTAGCCTGGAATCCACTTAACCCC
TCCCAAATCGAAAGATCCAAAGCAACAAAGTGCCAATAACATTTCGGCGC
CGATAGTTAAAAGAAACATTCTTAACTAAAGATTTAAGTTTTTCCTCATT
TACGCTAATTTTAACACCAGAAACCTAACCTTTTTAATTGTAAACTTTTT
TTCTTCCAGGAAGGAATATATATTGTATCGATACAAACTACGGTTAGTCA
TAGTTGTATGTTAAAATCTGAATCTTAGGCTTGCGATTAAATCGAAGAAA
AGATTTGTTTTGAGCTCCAATCATGGATCATACATCATCCACCTAAATTT
TGGTGTGCGTGTATGCTCAGAAGAATTATAATTCTTGTCTTCATCCGGTA
AATACTTTGTCTTTTCATTTATAGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGA
ATTCTGGGTAAGTAACTTTTTATCTTATTGACCATTTGAATTATGAAAGA
TTTAGGGTTATAAATACTTTTTTATAAAAGTTTTACATAGGACCACAGGA
ACATTGTTCTAGTGAAGGAGAGATTCGAATTCGAGTTTAAAAGACTTCAC
TGTACTCTATTCGATATAGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATC
ATATGGATTAGTTTATCCAGAATATACAGCGAACCCACTTTTGCTACAGG
TAGCCCAACTAGCCATACACCCTTTACTTCAACATATAATAAACGTGTCT
TTTACATTTCCAAGTGAAGAGTAAAATTTCAAGCCAAGCATCACAAAATC
ACGAAATTTCCTCTAAAAACTTTATTGAGCTTGATTGACATTGCTTGAGA
TTCATCCCCTCGTGCTCTCGTCCCCTCGTACTCCCTCTTATTGGCAAGTA
TTTTTATGACTTTCAGTTAAAAACATCACCTGCCTTTTACAGGGTGGCCA
TTTTTATTATCTCTATCGACGATTTTGTAAATTGGAAAAATGGTCTGACA
AGGTAAGCTTTGGACAGGACCCTAACATTTCTTGATATTTCAACATTGGG
TTAGTAAGATAGAGAAGGGTTTCCATTTTTTTTCAATCGAGAACTTAGTA
AGATTAGAAATCTGTGTCTAAAACTTTTTGAATAACTGTTTTTCTGGTAG
TTTTGAGACCCATAAGGAAGCTATCTACAAAATTTCAGTCACATTATATT
AATATTAAGGTGTGGGCCTTTTTTGAGATAATTCTACTAGTCTTTTCGAT
TTCATTCAACTATCAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGG
CAGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAATGGAAATACCAGAG
GTTCGTACTCAATAACAATTTTTTTTTAAACTCAGATAGTTTTTCTAAAA
GGCCTCTTTTCCATATTGTACGCTACACAAAAAAAGCATTTCAACGTTTA
CGTAACGTTTGTTTGAATCCATAGCGAAATTTAAATGATATACTAGTAAG
GGGGGGTTTCAGGGGTACCCGATTCCGCAATTCCGTCAATTTTTTCTCCA
ATTTCCGTCAAACCGTCCTAAATTGAACCAAAATTCCGTCACCGAAAATT
CGTTTGAAATTCAATATTTTTGTCGAAAATTCCGCAAATTTTGAATATTA
TTATTATTATTATTATACAGTATACAAGTTCACAGGCCCGAGGTGGGCCT
CTACGAACCGGTTTGATTACAATTCTAATTTGTTAAATATCTAAGTTTGT
GTCTTTTCCACGCTTCATTAAGGTTTTGTTTAAACAAGTGAATGGAGGTC
GACTCGACGACAAATCGTGGCAATGCATTCCATGTAGGGATTGTTCTATA
GTAGAATGACTTTGTTTGCGCTCCTCGAAGACCATCAGCAGCAAAGTTTG
GAACGAATTCGTGATCGTGAAATCTGGCTGGACGAGTTCTTTTAACTAGC
TTGTCCCGAGTTGTTTTTGGATCATAAAAATGGATATGCTTATACATTAT
ATACTTATACAATATCTTTTACCAATTCCGAAATTCCGCAAATTTTTTTG
CTAAATTCCGTTTTTCCGCACTAAAATTGTCTAATTTTCCGTCTTCGTCA
GAGAACCCAATTTCCGTAATTCCGTCCAAATTTTCGCCAAATTCCGCCAC
TCCGTCCGAAAAAAGGGCCGATTCCGCTCCTCCGCCAACCATGAAACCCC
CCCCTACTAAGGTTGCTACTGAATATTACGTGATTGAACAAAGACATAAT
CGAAAAAGGGAAGCGGGAATCCCCAGATACAAGCACTCTCTTAGATGTAA
CACTTCCTGAACCTTTTTAATACTTTTTGCTACAGGTGGAGTCACCAGTT
CAACTACGTGTCTTGGAACATTTCAAAATGGAAGATCGCTTAGAGACGTA
TTACGTGCTTTTCCATTTCCTCATTTCCACTTTCGTTTTCGTCACTTTCT
TCGGAAATTATATGGTAAAATCTTTCTTACTTAGTTTCTTACTTAACTCT
AGATAGTGTTCATACCCCATTTTTAAATCAGTTTTTAAAACATGGATGCC
GGCATCTTTAGCTCTATGAACCTCAATGCTCCAGTGGAGCGTTTTACCAT
GGGGGATGAAATTTTTTATTTAAATTCCTATGGGGGTAGTTTTGATATTC
CCAGCTCAAAGACTCAAAAAATCTAGTGAGTATGCTTTTGGAGTGCAATT
TTTCCAGTGAATTTTGAATAAGAATGAAATCAAAGTTCATTTTCATTGGG
CTGATGTTGTAAGATATTTTTTCCAACGGTGACAAATATTTTGGCAAAAA
TTTCCAGTGGGGCAGGGATTCCACCGGGTCTCTGGTACAGGGATGTTCTT
TCTGACCATGTTGTGTATTTGTCTTACATTTCAGTCGTTATCAGTGATAA
CAGCATATGGTTGTATGTGCTATCTTTTCTTGACGTTGACTTCATGTGGA
TTTATATTGGAAGGGAGGTAAAAATTACTGTATTTCTTCAAATAAACGCC
CTGATCGACTGTGGAGCTGTTTGAATCTTAAAAGATTAAATGATTAAGAT
TAGATAAGCGCTCTTTAGAGGGTGACGCTGAATAGAAGGAATATATAAAG
AGTAACGTTTTAACATTTTCATCAGTAAGGAAGCTGAATGTCTAGTTAAT
ATTGAGATTGTTGAGCTTTCTGAGCTTTCCTCTTTTTTCATATTATCTTT
AAAACTTAAGGCAAAATGAAAAGAGTGTCCAAAGGTTATTCCATACTTTC
TTCTCAAAATCCAACAGTGCCAGACAATTTCAAAAAGTATAAAAAGAAGC
ATAACCCATAGTTTCTTCTCATTGGTTTAGTGAAACAGGACCCCCAAACA
AGGGTGTTACTGCATGCTTACAGCTAGATACACTGCCAATCAATATAAAC
AAAAGAGGATCTTAATAAACTCACGCCAACTAGTACTGTACTCTACCTAC
CAGGGAGTTCTCTTCCACCTTTTCTTTTACAGGTGGTTTTGGTGTCATGT
GGAAGTGATACGATGTCTTTCAGTTTTTGCAATTGATGCATATTTGACAT
GGAAAAGTATCGATAATCCTGGTAAGCTTTTTCCTTTAGAATATTCAAAT
AGTAGACAGTGTGGTACCCAGTTGGCGTACACAGTTTATGAATATCAAAC
TGTGATGACAGATCGGGATTCTAAATATCCGAATTCTGAAAATCATTTCT
GAATCTAAATGTATGAAGGACAGCAAGAGAAATTAAGAAACAAGATTCCC
ATTCAGATGGCAGAAAATCCTTTGAAAACTTCTTCAAACTTTTCTCTAAT
TTCAGTGTTCCGGATGAAGTACGTTTTATATGGCGTTCGAATAATCCATT
GTTTATCACTTTTGATTACGTCATTTCAAATACTCACTAAAATAGACGAC
GTGGCGAGTAAGAAAAAGAAGAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233_pilon:30947..37873- >XLOC_041760 ID=XLOC_041760|Name=XLOC_041760|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2796bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:30947..37873- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCGGAGGGGCGGCTTGTGAAAGTACACTCTCAGAACATGAGTCATGT CGAAATGGTTGGTCGATTTTTTTATATCATGGATCCTCATAAGCATATGT TTGAAACACCAATTGAAGTACCAGATTACTTGATCGAGATGGCGGAGGGG CGGCTTGTGAAAGTACACTCTCAGAACATGAGTCATGTCGAAATGGTTGG TCGATTTTTTTATATCATGGATCCTCATAAGCATATGTTTGAAACACCAA TTGAAGTACCAGATTACTTGATCGAGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGCA GTATTTCTTGAGATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGATACAATCACAA GTTATTTTACGTTTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCA TAAATAAATTGGTCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGCTATGTT CACCAACACTACAGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTTGAG ATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGATACAATCACAAGTTATTTTACGT TTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAATAAATTGG TCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGCTATGTTCACCAACACTAC AGATTGACAACACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTT CGTCGCTATTGATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGATT GACAACACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCG CTATTGATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGAAGTGAAT TTGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATTT AACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAAAGTGAA TTTGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATT TAACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAATTGGTT TACATCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATGC GCAGTTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGTTGGTTTACA TCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATGCGCAG TTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGGTTGTTCCAAAACT TGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCATC ATGGTTGTTCCAAAACTTGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAG TCACCATCGAGTTCATCATGGAAGGAATATATATTGTATCGATACAAACT ACGGAAGGAATATATATTGTATCGATACAAACTACGGTGGGACTTTGATA ATATGGGACAGAATTCTGGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGAATTCT GGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTATC CAGAATATACAGCGAACCCACTTTTGCTACAGGGACATTTGCTGAAGAAG AAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTATCCAGAATATACAGCGAACCCA CTTTTGCTACAGGGTGGCCATTTTTATTATCTCTATCGACGATTTTGTAA ATTGGAAAAATGGTCTGACAAGGGTGGCCATTTTTATTATCTCTATCGAC GATTTTGTAAATTGGAAAAATGGTCTGACAAGCTCAATTGCTTGTTCCGT AAACCTTGTTGGATGGCAGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACA AATGGAAATACCAGAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGG CAGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAATGGAAATACCAGAG GTGGAGTCACCAGTTCAACTACGTGTCTTGGAACATTTCAAAATGGAAGA TCGCTTAGAGACGTATTACGTGCTTTTCCATTTCCTCATTTCCACTTTCG TTTTCGTCACTTTCTTCGGAAATTATATGGTGGAGTCACCAGTTCAACTA CGTGTCTTGGAACATTTCAAAATGGAAGATCGCTTAGAGACGTATTACGT GCTTTTCCATTTCCTCATTTCCACTTTCGTTTTCGTCACTTTCTTCGGAA ATTATATGTCGTTATCAGTGATAACAGCATATGGTTGTATGTGCTATCTT TTCTTGACGTTGACTTCATGTGGATTTATATTGGAAGGGAGTCGTTATCA GTGATAACAGCATATGGTTGTATGTGCTATCTTTTCTTGACGTTGACTTC ATGTGGATTTATATTGGAAGGGAGGTGGTTTTGGTGTCATGTGGAAGTGA TACGATGTCTTTCAGTTTTTGCAATTGATGCATATTTGACATGGAAAAGT ATCGATAATCCTGGTGGTTTTGGTGTCATGTGGAAGTGATACGATGTCTT TCAGTTTTTGCAATTGATGCATATTTGACATGGAAAAGTATCGATAATCC TGTGTTCCGGATGAAGTACGTTTTATATGGCGTTCGAATAATCCATTGTT TATCACTTTTGATTACGTCATTTCAAATACTCACTAAAATAGACGACGTG GCGAGTAAGAAAAAGAAGAAATAATGTTCCGGATGAAGTACGTTTTATAT GGCGTTCGAATAATCCATTGTTTATCACTTTTGATTACGTCATTTCAAAT ACTCACTAAAATAGACGACGTGGCGAGTAAGAAAAAGAAGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000233_pilon | genome | sc0000233_pilon:30947..37873 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1279-1398:121 |
| Aaloc | 1189-1275:445 |
| Aaloc | 1105-1185:1044 |
| Aaloc | 976-1104:1593 |
| Aaloc | 892-975:2662 |
| Aaloc | 832-891:2986 |
| Aaloc | 754-831:3307 |
| Aaloc | 721-750:3502 |
| Aaloc | 688-717:3717 |
| Aaloc | 619-684:4227 |
| Aaloc | 523-618:4731 |
| Aaloc | 424-522:5231 |
| Aaloc | 328-420:5636 |
| Aaloc | 139-324:6013 |
| Aaloc | 1-138:6928 |
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