XLOC_041704 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041704
Unique NameXLOC_041704
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000404_pilon:117224..133229-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041704 ID=XLOC_041704|Name=XLOC_041704|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16006bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000404_pilon:117224..133229- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACGGTCCAGTCACCCCATAAGATTTGAGTTTAAAGAGTAAGCCATCGTG CCACACCCGATCGAATGCCTTTGAAATATCTAAAAACACCCCCTGGTATC TAGAGAAGGATCTTTGTCAAACCCTGTATAAATATCATGCGTTATGGATA ACAACTGAGAAATGCAGGAATCCCCCTCCCGAAAACCAGACTGACAAGGA GAAAATAAGTTGTTATTTTCAAAATATCTGTAAAGTGTATCATAAATACA CTTTTCATATATTTTTCCAAACACAGGAAGAAGAGACACTGGTCTGTAGT TTTTGGCTATGCTCCTGTCTCCCTTTTTATAGACAGGAACCACGTTTCCT TTCTTCCACTGTGATGGGAAGATGCCAGAGTTGATAGAAAGATTGAATAT ACTAAGCAAAGGTTTTACTAGAGACTTACCACAGATTCTGACCATACGAG TAGAAATATTATCCCACCCATGGGCCTTGTTAACATTCAAAGAATTAATA ATAGACTCGATTTTTTCTTCTTCAAATACAAGACAAGAAGCCCGTTGGGC GTGAAGGCCCAGCGAAAAGTAACGTGTTGAAAACGAGCGTGCAAAACAGC AAATGCATGACCCCGTTGACATGGATCAAAGTGAAGACAGGAAAAAAAAT TTCAAAATCACCGCGGTACTTCTCATTGGTTAGACGCTTGAAATTTATTG AATGGTTTCCTACCAACCGGGCCTACACAGGCGCAGGTTCAACTTTCCAA TAAAATTCTAGCCTGTGTATCTAGACTCAAAATTTCAGAAAAAAAAATCT TATAAGGTGTAACTAAAAATGTCGGGTACAGTTTGTTTGATACTGCCTGT GAGTGAACCCTTGGTGACAGACTATCAAAACCCAGGCAGACACACATAAT TAACTTACCATATAACCTCTTTTACAAACTCAAAAAATTTCAAAACTACT TTAAACTACATCAAAACATCAGCCACATCAGGCCACATTTTAAAAAGGCT CCTTTCTATTTTTTTAGAAATGAACCTGTGTTTTCATTTTCATTTGTTCA TCTTTTTTCACAAGGTCAGCTTTTTCCATAAATTTCCATTTTCACTGTTC ATGCCTTGCAACCATGAGAAATGTTCAATCTAGTTTGAATTTACCCATGA GCTGCATTTTAGGGCCATTAACAGATTCCAGAATTAGTTTATATACTTTA AATAATTACCATCAACTGCTCCAACTTGGGACTATCTGAAAAAACATGGG ACGGCAATTCGGCCACCATTTCACCGAACTTCCAAAGTCATTTGATTTGA GTTAAGGAAAGGCGTATTTAAAAATACACGATTTCTCTTTCGATTTTACA GTAAGTGAAAATACAGACCAGATATGCAACACTCCCATGTTTCGACCAAT CGTCCCAAGTTAGAGACGGTTGACGGTATGTGAGTCGAGTTTGAAAAATC AAGCCACCAACTGTTTAATGCGACAGATCCAGAATTGACCATTTTATTTA ATGTGTAGAATCATGAAAAAAAGTCCCAATCTTGTTAAAGTTTACACATG AGCTGCATTTAGTCTCCGCTAAATATCCAATTCCAATAATCAGATTTGAA ATAATTATGTGTCGAGTTTGAAAAATCAAGCCACCGCACCAATCGTTAAA CGAGACCGATCCAAAAATAACCATTTTCACGCGTAGCCTCATGGAAAAAG TACCAATCTTGTTCCAATTTACACATGAGCTCCATTTTAGTGTCCATTAC CAAATTCTAGAATCAGTTTACTTTTAATAATCATGTGTTGAGTTTGAAAA TCATACCACGTCCCACCAGCCACTGACCGTTGTTAGCGACAGATCCAGAA GTGACTGTTTTCTTGTGTAGCATCAAGAAAAAAGTTCCAATCTTATTCAA ATTTACACATGAGCTGCATTTCAGTTTATTTATTTCTATATCAGAAGCCA TTATTTTCTAAAAATAAAGTCTTTTCGAAAAACCAATAAACTAAAAATAA AAGTGATTTAAGGTAGAATTTTCATCATTTCACTCATAAAACTTTATGAA ACTTGAGCAAAGACTATAAGATATGGCAGAATGTTGAAAAAGGTTTATAA AAAGAAAATCATTACAAAATATCTTTGGTTTGAAAGTCTCTTGACCACTA AAGCAAAGAAAATGTTCAAGAAAGTATGAATCAACCTCCTCGCTTCGACC GCCATCTTGATTTGTTTTGAAATTTGTTTTTGAAGGAGCGCGAAATCAGA AAATATATCTACTATAGCCAGTATCCGACTTTAGCAACCTTTTCCCTCTC CAAACGGCAAAACTAAAAAGTGTGTTACTATGGTTTCAAGCGCCGTTTCT ACCAAAACGGACGGACAGACAGCGGACGGAAAGTTGCAAATGAAAGGCCC TATCGCTAGCGCTGGGCCAATTATCGAGTCTGGAGTTAGTAAGAAATTGT TCAGGTGGCAAAACACTGCCAGTATCGATAAGTGAGCATTGGTTTGAAAA AAAAGAGTTGAAAATATCGGCCTTCTCAGAAACATCGCTTACAAGGACGT TTCTTTCATTTCGAATAGGTGGAATTTTCGGGGTTTTACGTACGTTCAGA AACTGCTTCAGAGTAGACCAGTATTTCTTACTTCCTATGTTTGGATCATT TAAAGAGTTGCCAAGACGAGAAAAATAGTTATCCTTGGCAGTCTTGATGG CCAATCTACACCTGTCAACCATGTCAACAAGTGCCTGACCATCTAAAGGA GGATTTCCCCATTTTCTCCAACGACGATATATCTTAGCCTTATCCAAAAG CATCTGCTTTATCTCAGGAGTCATCCATAACGCATCTTTGTCTCTGATGG 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TAGGTATTTCAAATAAAAGATTTTTCTTTGATATACAGAGTACTTGGTAC ACCAAACGAGAAACTTTGGCCTGGTGTCACCCAACTGAAAGACTACAAAT CCGATTTTCCGAAATGGAATCCGAAAGATCTCTCCGAAGTTCTACCTGAA CTAGACGATGATGGAATTGATCTTTTAAAGGTATAATGCATTTTGAATAA TTCACCGATTGATTTAGTTTTTAAGGCGTAGTTTATATGGTGTCTAATTC AAATAACTTCATCAAAAAAAAGGAAGTCGAATTGAGTGCGGTAAAAGAGC GGCTGTATAAACCAAATCTTGATGTGAGATTGAGCTTAACAATTTGAATA CTTGACAATGAAGATCGACAAAAAACCGGCACTGGTTTAAACGGCCTACT TTTTTGTCGATCTTAATTCAAACAATAATGTTTTCATGTGAAAAGACACC AAATTTCTTTGTTTCTTTTGTTTAAAGTAGGGGTTTCCTCAATTCATTAA AAGTCGAGCTCAAAATAGAAGGTTATTTAAAGTCGACTTAATCCCTAATT TTCAGTTTATACTGTCAAGTTTTATTATATTGAAAAGTGCTCGATGGAGA AATTCGTTTATCTTAAGTAATAAATGTTTTTTTTCAAACTTGTGAAGCAC AATGTCATCTCATTCTGATTGAAGATTTTTTTTAAAAATATTTTGCTTTC TCACTTCTAGATGCTATTGACTTATCAACCATGTCGTCGAGTTTCCGCCC GCAACGCGCTCGCTCATTCATACTTTAATGACATTCGTAACACTGCTGTC TCGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000404_pilon:117224..133229-

>XLOC_041704 ID=XLOC_041704|Name=XLOC_041704|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1824bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000404_pilon:117224..133229- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATGGTTCTGTTAAAAACATTCAAGACATTTTCAAAAAGATGGAGAA
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CTGTTAAAAACATTCAAGACATTTTCAAAAAGATGGAGAAAGTTGGTGAA
GGCACCTATGGAGTTGTATACAAAGCTCTAGACAGGCAAACTGGTAAAGT
TATTGCACTGAAGAAAATAAGATTGGATGCTGACACTGAAGGGGTTCCAA
GCACAGCAATCAGAGAAATTGCAACACTGAAAGAACTCAACCATCCCAAT
ATCATCCATGACACTGAAGGGGTTCCAAGCACAGCAATCAGAGAAATTGC
AACACTGAAAGAACTCAACCATCCCAATATCATCCAGTTACATGATGTTA
TCCACTGCGATTCAAAGTTGTTTTTGGTTTTTGAGTTTTTAACACAAGAC
CTCAAGAAATACATGGATGATGTTAAACCCCCTGGAATCAAGCTCAGTCT
TGTTAAGGTTACATGATGTTATCCACTGCGATTCAAAGTTGTTTTTGGTT
TTTGAGTTTTTAACACAAGACCTCAAGAAATACATGGATGATGTTAAACC
CCCTGGAATCAAGCTCAGTCTTGTTAAGAGTTACCTGTACCAGCTGTTAA
GCGGAATAGCTTACTGCCATGCAAATCGCGTCTTACACAGAGATTTAAAA
CCGCAGAATTTGTTGATCGATACTGAAGAGTTACCTGTACCAGCTGTTAA
GCGGAATAGCTTACTGCCATGCAAATCGCGTCTTACACAGAGATTTAAAA
CCGCAGAATTTGTTGATCGATACTGAAGGCAATATAAAACTTGCAGATTT
TGGCTTGGCACGAGCTTTTGGCATCCCTGTTCGTTCTTACACTCACGAAG
TTGTCACCTTGTGGTATCGTGCACCTGAAATTCTCCTTGGTTGTAAAATG
TATTCTACTGCAGTCGATGTCTGGAGTATTGGATGTATCTTCGTTGAAAT
GGCAATATAAAACTTGCAGATTTTGGCTTGGCACGAGCTTTTGGCATCCC
TGTTCGTTCTTACACTCACGAAGTTGTCACCTTGTGGTATCGTGCACCTG
AAATTCTCCTTGGTTGTAAAATGTATTCTACTGCAGTCGATGTCTGGAGT
ATTGGATGTATCTTCGTTGAAATGCTCACAAGAAAAGCATTGTTCCCTGG
AGACTCAGAGATCGATCAACTCTTCAAAATGTTCAGCTCACAAGAAAAGC
ATTGTTCCCTGGAGACTCAGAGATCGATCAACTCTTCAAAATGTTCAGAG
TACTTGGTACACCAAACGAGAAACTTTGGCCTGGTGTCACCCAACTGAAA
GACTACAAATCCGATTTTCCGAAATGGAATCCGAAAGATCTCTCCGAAGT
TCTACCTGAACTAGACGATGATGGAATTGATCTTTTAAAGAGTACTTGGT
ACACCAAACGAGAAACTTTGGCCTGGTGTCACCCAACTGAAAGACTACAA
ATCCGATTTTCCGAAATGGAATCCGAAAGATCTCTCCGAAGTTCTACCTG
AACTAGACGATGATGGAATTGATCTTTTAAAGATGCTATTGACTTATCAA
CCATGTCGTCGAGTTTCCGCCCGCAACGCGCTCGCTCATTCATACTTTAA
TGACATTCGTAACACTGCTGTCTCGTAAATGCTATTGACTTATCAACCAT
GTCGTCGAGTTTCCGCCCGCAACGCGCTCGCTCATTCATACTTTAATGAC
ATTCGTAACACTGCTGTCTCGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041704XLOC_041704-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000404_pilongenomesc0000404_pilon:117224..133229 -
Properties
Property NameValue
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