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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1977289..1980898- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041638 ID=XLOC_041638|Name=XLOC_041638|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3610bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1977289..1980898- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAGAAAGTAGCAATAAAGATGGAGAAGAGGATAGAAATCCTTTATA
TAATTTTGAATGCCAACTCCATCCTACAAATTCCTTCAAAAATTTAAACA
AATATCGTCAAAATGGAACTTTATGTGATGTCACCATCAAGGTCAAAGAA
GAGCTTTTTCATGTACACAAAGTTGTTTTGTCCAGTGCAAGTAATTATTT
CCAAGCAATGTTCACGTCAGGGTTACGAGAAGGAACAGCTGAGCTGGTTG
AATTACATGAAGCTGATCCTATGTCAATCTCTATTTTGTTGGATTTTATT
TACACTTCAAAAATTGAAATTGTCAATGAAAATGTACAGAGATTATTACC
AGCATCTAAATTATTTCAATTAGACACTGTCACAGATGCTTGCTGTAATT
TTCTTCAACAGCAGCTTGACCCTTGTAATGCTTTGGGAATTCTTATGTTT
GCTGAAGATCACAGTTGTCAACAACTTGTGAACCATACTGCAACTTATGT
CATGCAAAATTTCTTACAAATTGTATGCATGGAAGAATTTTTAACATTAT
CATTTGAGAGAATGAAGTTTTTCTTATCAAGTGACACTCTAATGATTGGA
GAAGAGGAAGATGCTTACAATGCTGTCATAAGGTGGATCAAATCAGATAG
TGGGAATCGGAAAAAGTATTTACACGATCTAATGAATTGTGTGAGATTAC
CTCTACTAAGACGGGATTTCTTGATGCTTACTGTTGAGCCTGAAGAGTTG
ATCAAACAGGATTCAAAATGTAAAGACTTATTAATTGAAGCAATGAAGTA
TCATTTGATGCCAGAAATGAGAAGGTATCTACAAAAGAAACGAACTAAAT
ATCGCTGCTCTGAAGGAACTGAGCCTTTATTTTTCGTTGTTGGTGGTCAA
AGTTTATTTTCTTATCATTCCGATTGTGAGATTTATTGCCCTAACACAGA
ACGATGGTATTCTATTCAACCAATGACAATGCGACGATCAAGAGTCGGAA
TTGGAGTTGTTTATGATAAATTATATGTTGTCGGTGGGTTTGATGGAAGT
CAAGACCTAGCTTCTGTTGAAGTGTGTAATGGTAATACTAAACAATGGTC
TAGTGGACTACAAATGGGAACACAGCGTAGTTGTCTTGGTGTTGCAGTCT
TGCATAATTTGTTATACGCCATTGGTGGTTTTGATGGCTCGTCTTGTTTA
AAAAGTATGGAAAGATTTGATCCACTATCAAACCAATGGATGTCTGTTGC
TATGATGCATCATAAAAGGTAAGGAGTTCATAACGATAATCATTTACAAC
CATCGTCGCTATAATTTTTATTCTTTGGAAATCGCGAACTCCCTGGACTG
GATATTGCTTAAAACCTGTGAAGCTTTTATAATGGTCCCTCTGTTTTAAA
ACCTAAATAAATGAGTTATCCATCATATTTTTTGTCTATTATACTATCAT
ATTGTTTTCTGGTATTTATTTTGTCAAAACTTTCTGTTGTATTTTTTAAT
ACCTTTAAAAAGACAATAGTGTGTACGACGTTTCGACGGTTGTCTTTATC
AGGTTCAATGTTCACCTTTAATTTTTGACACAAATATACATTGACATTTA
CGTTCACTTTAATACCTTTATTTATAGAGCCTTGACACTTGAGTTGGAAA
ATTACTAATGATAGAATTATCATGACAAAATTTTATCTTGACAGAATTGT
TGCTAAAAGACTTTATATTGGGCTGTTCCATTAAAAGCCTTTTTGAACAA
GGAGGTGGATGAATCTTTTCAAGTCAAAAGAAAATTATTGAAAATGTGTG
GATACTCCCTGGAAAATGGCCAAATTTGCAATAATATAATACCCTTGGAA
AAACTTTTTTTCATACCTTAAAGTGAGGGTGGACGAACTAAAATCAGTCT
TTTAACCCCTGGAAATGTTAGAACTAACTAATAACTTTGTGCCCCTTTGG
AAAAATGAAAAAATACCCCTAGAAACTTTACTCAGATTACCCTCTAGAAA
TGTTCGTCCACCCCATGTATTGATATAAAATGGAATGGCCCATTGTTGTT
TATTATCTTTAAAGACGAAACCACAAAAAATACCAATCATGATCTTCAAT
TTTGTATTTCAGGCGCTATATTTCAGTAGGTGTCATCAATGAGTTCTTGA
TAGTGGCAGGTGGTTATGATGGGAACGAACACTTGAAATCTTGTGAAACT
TACGATCCAGTATCAAACATTTGGACCAAACGCGCAAATATGGCTTACAA
CAGAAGCAGTGCAGGGAGTTGTGTCTTAAACGGGATGTTTTATGTCACAG
GTATTTTTTTATCATTTATTTTTGTACCTCATTTCTCTTAATGGTGATCA
GGTCTGATTACTTCGAATTTAGAGGGACAAGCTGGAGTTTTTACAAGCTC
TCGTTTGATTTGGTTGGTCGTTAACCTGTAATAAAACAATTTTGTTACTT
TTTCTAAAGAACGCGTCATCTCTATTACTTTAAATAACCAATTAGTGAAG
TCTGTTGTAAAAACTCCAGCCCATCCCAATTTAGACGATGCTATCGTCCG
TGTAATATATTATTATGATATCACGATATAACATAATTGTATATTATAAA
ACGTAATATGTTGCGCGGCGAAAAATAGAGTCTGTGTTTACATTCACAAG
ACATTGAGCCCATCCGACTATTTACGGACAAAATTACCGCCCGACTGCTA
ATTTGCGTGGTTGAGGTTATTCTTTATTATTTGTCTTAGACTATAGGATA
GTCTACTTTGAATCAAAGTCTTCGCGAAGTCCGAAGGAGGTGTTTATTCG
AAATAGTACCATGTCTCTATCTATCGCTCAACGGGATAATTTTTATTTCA
ATTATGCGGATCAATTAATGATAAAACAGTGTTCTACACCGTATCCAATC
AGTGTGAAGTGGATAAAGTTGGCTTCAATTTTTAGTTATATATACGTATT
GGGTACAAAATTTGTACTGAATAAATAAAGTTATCATGGGATTGCCAGAA
TGTTTGACTCCCAAATCAATTTCTAGTAATAGATCATACGTTAGATAGTT
GCTCCAATAATACAACAGTTTGAAGATTGATCCACCCTAGAGGCTGTTCA
TTAAATTTGAGGGCCATTCCAAGAAATTGTCAACCAGGATAAGAGATTGA
ATTGCGTCTATTACGAGTGCTAAACGGTGCATGGGTCGCCTAGGTCCCTG
TGAGCGTGACATAGCGCACCCCTTCCTCAGGAATAGCCGTTGAGGGTTTT
TTTGATTTTTCGATTTCTTATCACACAGGAGGGACTGATGGAACATTAAT
CAATCACTCGTGTGAGAAATATGACATTCAGAATGATGAGTGGACAACCA
TCAACTCAATGTTAAGTGTTCGAATGACTCACATGCTTGTTACTGATAGC
AAAAATCTATTTGCTATTGGTGGAAATGACGGGAGTGGAAGCCTTAATAG
TGTTGAACAGTACTCACCAGAGAAAGATGAATGGATAGCTAAGAAACCTG
CTTCTTTGCGACGTTCTCATCTTGGTGCGGCAGTGATGTACACACATCTA
CCTGTACCTCCCGTCCTCAAAGATATTGCAGACTTAGATTTATCTACTGA
TTCTGTATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1977289..1980898- >XLOC_041638 ID=XLOC_041638|Name=XLOC_041638|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1977289..1980898- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAGAAAGTAGCAATAAAGATGGAGAAGAGGATAGAAATCCTTTATA
TAATTTTGAATGCCAACTCCATCCTACAAATTCCTTCAAAAATTTAAACA
AATATCGTCAAAATGGAACTTTATGTGATGTCACCATCAAGGTCAAAGAA
GAGCTTTTTCATGTACACAAAGTTGTTTTGTCCAGTGCAAGTAATTATTT
CCAAGCAATGTTCACGTCAGGGTTACGAGAAGGAACAGCTGAGCTGGTTG
AATTACATGAAGCTGATCCTATGTCAATCTCTATTTTGTTGGATTTTATT
TACACTTCAAAAATTGAAATTGTCAATGAAAATGTACAGAGATTATTACC
AGCATCTAAATTATTTCAATTAGACACTGTCACAGATGCTTGCTGTAATT
TTCTTCAACAGCAGCTTGACCCTTGTAATGCTTTGGGAATTCTTATGTTT
GCTGAAGATCACAGTTGTCAACAACTTGTGAACCATACTGCAACTTATGT
CATGCAAAATTTCTTACAAATTGTATGCATGGAAGAATTTTTAACATTAT
CATTTGAGAGAATGAAGTTTTTCTTATCAAGTGACACTCTAATGATTGGA
GAAGAGGAAGATGCTTACAATGCTGTCATAAGGTGGATCAAATCAGATAG
TGGGAATCGGAAAAAGTATTTACACGATCTAATGAATTGTGTGAGATTAC
CTCTACTAAGACGGGATTTCTTGATGCTTACTGTTGAGCCTGAAGAGTTG
ATCAAACAGGATTCAAAATGTAAAGACTTATTAATTGAAGCAATGAAGTA
TCATTTGATGCCAGAAATGAGAAGGTATCTACAAAAGAAACGAACTAAAT
ATCGCTGCTCTGAAGGAACTGAGCCTTTATTTTTCGTTGTTGGTGGTCAA
AGTTTATTTTCTTATCATTCCGATTGTGAGATTTATTGCCCTAACACAGA
ACGATGGTATTCTATTCAACCAATGACAATGCGACGATCAAGAGTCGGAA
TTGGAGTTGTTTATGATAAATTATATGTTGTCGGTGGGTTTGATGGAAGT
CAAGACCTAGCTTCTGTTGAAGTGTGTAATGGTAATACTAAACAATGGTC
TAGTGGACTACAAATGGGAACACAGCGTAGTTGTCTTGGTGTTGCAGTCT
TGCATAATTTGTTATACGCCATTGGTGGTTTTGATGGCTCGTCTTGTTTA
AAAAGTATGGAAAGATTTGATCCACTATCAAACCAATGGATGTCTGTTGC
TATGATGCATCATAAAAGATGTCAGAAAGTAGCAATAAAGATGGAGAAGA
GGATAGAAATCCTTTATATAATTTTGAATGCCAACTCCATCCTACAAATT
CCTTCAAAAATTTAAACAAATATCGTCAAAATGGAACTTTATGTGATGTC
ACCATCAAGGTCAAAGAAGAGCTTTTTCATGTACACAAAGTTGTTTTGTC
CAGTGCAAGTAATTATTTCCAAGCAATGTTCACGTCAGGGTTACGAGAAG
GAACAGCTGAGCTGGTTGAATTACATGAAGCTGATCCTATGTCAATCTCT
ATTTTGTTGGATTTTATTTACACTTCAAAAATTGAAATTGTCAATGAAAA
TGTACAGAGATTATTACCAGCATCTAAATTATTTCAATTAGACACTGTCA
CAGATGCTTGCTGTAATTTTCTTCAACAGCAGCTTGACCCTTGTAATGCT
TTGGGAATTCTTATGTTTGCTGAAGATCACAGTTGTCAACAACTTGTGAA
CCATACTGCAACTTATGTCATGCAAAATTTCTTACAAATTGTATGCATGG
AAGAATTTTTAACATTATCATTTGAGAGAATGAAGTTTTTCTTATCAAGT
GACACTCTAATGATTGGAGAAGAGGAAGATGCTTACAATGCTGTCATAAG
GTGGATCAAATCAGATAGTGGGAATCGGAAAAAGTATTTACACGATCTAA
TGAATTGTGTGAGATTACCTCTACTAAGACGGGATTTCTTGATGCTTACT
GTTGAGCCTGAAGAGTTGATCAAACAGGATTCAAAATGTAAAGACTTATT
AATTGAAGCAATGAAGTATCATTTGATGCCAGAAATGAGAAGGTATCTAC
AAAAGAAACGAACTAAATATCGCTGCTCTGAAGGAACTGAGCCTTTATTT
TTCGTTGTTGGTGGTCAAAGTTTATTTTCTTATCATTCCGATTGTGAGAT
TTATTGCCCTAACACAGAACGATGGTATTCTATTCAACCAATGACAATGC
GACGATCAAGAGTCGGAATTGGAGTTGTTTATGATAAATTATATGTTGTC
GGTGGGTTTGATGGAAGTCAAGACCTAGCTTCTGTTGAAGTGTGTAATGG
TAATACTAAACAATGGTCTAGTGGACTACAAATGGGAACACAGCGTAGTT
GTCTTGGTGTTGCAGTCTTGCATAATTTGTTATACGCCATTGGTGGTTTT
GATGGCTCGTCTTGTTTAAAAAGTATGGAAAGATTTGATCCACTATCAAA
CCAATGGATGTCTGTTGCTATGATGCATCATAAAAGGCGCTATATTTCAG
TAGGTGTCATCAATGAGTTCTTGATAGTGGCAGGTGGTTATGATGGGAAC
GAACACTTGAAATCTTGTGAAACTTACGATCCAGTATCAAACATTTGGAC
CAAACGCGCAAATATGGCTTACAACAGAAGCAGTGCAGGGAGTTGTGTCT
TAAACGGGATGTTTTATGTCACAGGCGCTATATTTCAGTAGGTGTCATCA
ATGAGTTCTTGATAGTGGCAGGTGGTTATGATGGGAACGAACACTTGAAA
TCTTGTGAAACTTACGATCCAGTATCAAACATTTGGACCAAACGCGCAAA
TATGGCTTACAACAGAAGCAGTGCAGGGAGTTGTGTCTTAAACGGGATGT
TTTATGTCACAGGAGGGACTGATGGAACATTAATCAATCACTCGTGTGAG
AAATATGACATTCAGAATGATGAGTGGACAACCATCAACTCAATGTTAAG
TGTTCGAATGACTCACATGCTTGTTACTGATAGCAAAAATCTATTTGCTA
TTGGTGGAAATGACGGGAGTGGAAGCCTTAATAGTGTTGAACAGTACTCA
CCAGAGAAAGATGAATGGATAGCTAAGAAACCTGCTTCTTTGCGACGTTC
TCATCTTGGTGCGGCAGTGATGTACACACATCTACCTGTACCTCCCGTCC
TCAAAGATATTGCAGACTTAGATTTATCTACTGATTCTGTATAAGAGGGA
CTGATGGAACATTAATCAATCACTCGTGTGAGAAATATGACATTCAGAAT
GATGAGTGGACAACCATCAACTCAATGTTAAGTGTTCGAATGACTCACAT
GCTTGTTACTGATAGCAAAAATCTATTTGCTATTGGTGGAAATGACGGGA
GTGGAAGCCTTAATAGTGTTGAACAGTACTCACCAGAGAAAGATGAATGG
ATAGCTAAGAAACCTGCTTCTTTGCGACGTTCTCATCTTGGTGCGGCAGT
GATGTACACACATCTACCTGTACCTCCCGTCCTCAAAGATATTGCAGACT
TAGATTTATCTACTGATTCTGTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:1977289..1980898 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1459-1788:331 |
| Aaloc | 1270-1455:1498 |
| Aaloc | 1-1266:3611 |
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