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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:268384..276921+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041626 ID=XLOC_041626|Name=XLOC_041626|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:268384..276921+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCTTTGTGTCCTTGTTCTTCGCTTTCGCTTTTGCACTCTTTCTACT
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GGTGGAAAGCTCTCATCTTGATTATAACAGGTTTGTCTCtctgaaataaa
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TGTGAATACGTTGAGTGATTTCTTCGTTTGATCAAATTGTTTGTCATCAA
AGTCTTCTTGTACGTCCTTGAGCAAAATAAGTTTTGCTTGGACCATATCA
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tcttctttcttctttttaactcTATCTCCTAACTTACGTATGAAGCCAAT
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ATTCGATTATTGCCTGTAAAGTCGGCTCATCGAATTGTGTGTTTAAACTA
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GAATAAAAGCTAACAGTGTTCTCAGTaagtttttctgtaaatttatcacc
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CATGGAACCATTTTTCGTTGTTCTTCAATTGTGAGAAGAGAAGTCCTCTC
GAATTGTCATCAGATGGATTGTTCGAAGTGTCTACAAGTTTCCAAACTTT
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TGTAaagtttctcatttttcaaccagcaataaacaaTGCTTGAATCAGTC
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GCATTGTCTTTTTCTTGAGTGGAGCAACTCTCGATTTGCTCGCAACGAGT
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ACCGTAGGCGTCTTGCGACGCGTCGCTAAAACCGTGAAGTTCATGCGACG
TAATATTTCCATTGTATGTTGGAATCATAAGCTCTATTAAAACGAATTTC
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aaataacaGTTTAAATTTCACGACGAGTGGATTAATCAACCCCAATGGGT
CAAAGATTGATGAAGCGAATTGTATAACGTTTCTTTTCGTAGGGTTTTCG
AAATTCACTTTACGTAGAATTTCACTCAAACTAATAACCAGCGAGTCATT
AGTTTTATCCCAAGGAATACCGAGTGATTAATAGTTTCATGTAGATCACT
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ATTTTCGTAAGTTTAAGCTCGCAAGAGCAAAATGAGACTTACAGTTCTTG
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TGTTGACGTGATGACGTAATGTTGCGTTGAGCAGGAACGGCGACGATGTC
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GGGCTTTCAGTTCTACCCACTTCTTCGATTTcccaaaactttttcaaagt
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AATAGTTTTATTCTTTACAAATTTCCAGAAGTTATCGGCACCGATAAGAA
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AAATTTTGGAATTCGGGCAGACTACTAACATCATAAACGAAATCATTTCG
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CATTGGTTTGAACTTTCACTTTAAAAACGTCGAGGGTTTTCGATTCGACG
TGACCACCAAAAGTTTTAATAcaaatgttttttgtttcatcGGAACTAAG
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GATcaaataaaattctcatttctttggAGACGTTCGGGCTTCAAATCGTT
GCAGTAGCTGTTTGTAAGTATACTTAACAACTGTGTGTAGACAAACATGT
GATGTTATCACTCTCATCCTTTTCTTTATTATGTGTGCTCTCTCCCTTTG
AATCATTTGGCGTAGTCTTCATCTTCCTCACATTGATCACTAGATGTTGA
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tttttatttaaccatTGAACAATTTGTCCATGTAGTTCATGAACCCTGCT
CTCTgccttttaacatttttatctgcatctgtagacattttgatttttga
tttttgttttatttcttatttattttatatcttatttatttgaattactA
ATCTTCACTCACACCACCAGCGAGCACAAGTTAAGGCGAGAGAAACAGAG
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AATCCAGGAACAtcaagttccaaataaacaatTTAAATCAATAACAGGAA
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ACATTCAAGTTCAAAATAAGTTCACCATACATAAGCTACCAAgcttacaa
aaatcaaaacattgaacttCACCCGAGTTCAAACAAGCTACCAAGCTTAT
AAAAATCACAACATTGAACTTCACCCGAGTTCAAGGGTTCAAGCAAATAA
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atacataactTCTCAAATTTCATGTATTTCTAACATCCGGTTCGAAGGAC
CATGTTGTTTTATATGACCGTACACTATGAAGTTATGCTACCGACTGAAT
ATACTATCTTTCAAATGTAATAGATACGTAATATAATAATACGCACCATA
GACtatagacaggagacccgtcgtgtgtttttttacaagacgggttcgag
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atgttttcaaccgttattaggatctgagaaattcaaactctcagcccgta
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CAGTAGCGTTGACAAGGGGGCGCaaagagcagatttttatgacactgtaa
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TATTCTAACGTTATTATTCCGTGTGACGGAGAAAACGGCGACACCGACGT
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ATTATGATCACTCCAATAAATGTAGAGGCATGGAAATATGTAGGTGTGGC
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AGTGGAAAGAGTTTGTCTCCTAGAAGTGTGCAAAGATCCCCGTGGGATTA
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CTTTCTATTATGGGTTATTTCAGAAGTATCATATGGCTTATATACCCATT
GAGGAGGTGCGATGTTCAGGgtggtctgaaaaataaaaaatccaaagcAG
TCTGGTTTTTGCTGGAAAATCCAGGATggtcaaaaaaataaagaaaaaat
ccaaggggtcACTTTTCCTAAAAAATACCTCCTCAACATATGGGGTACAt
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GGCATCAAGATATAAGTGActcagaaaaaaaacagaatgaTTTTATAAAG
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agcaatgaaatctgtttgaaaacgaggacaacaataaatttatgcatctc
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ttttttgtttcaggcTCTGTAATTGGTTCTCATTTTCATCGTCAGGCGCT
CGCTGCGTTAAATTATATTACCGATACCGTAGCTTTGATAAGTGGTTTTG
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ATTATTGGTGGATTTCTTTTTTACTCTCTAATCACGTGGATTGGTGGACG
AATGCTAGATACGATCGTGGAAAGACAAGAGAGAAATGAAgttaatcaaa
atgaaaaagaagaactgAAAAACGTGTCAATCATGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:268384..276921+ >XLOC_041626 ID=XLOC_041626|Name=XLOC_041626|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1296bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:268384..276921+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCTTTGTGTCCTTGTTCTTCGCTTTCGCTTTTGCACTCTTTCTACT
GAACCGTGttcataaaagaaaaacgtttaaaatcaTCCCAGAGTTTTGTT
GGTGGAAAGCTCTCATCTTGATTATAACAGATGGGCTTTGTGTCCTTGTT
CTTCGCTTTCGCTTTTGCACTCTTTCTACTGAACCGTGttcataaaagaa
aaacgtttaaaatcaTCCCAGAGTTTTGTTGGTGGAAAGCTCTCATCTTG
ATTATAACAGGTTTTGTTGGTGGAGTATTTACTGGACTGTCTGGAACTGG
TATTGATATTTGTTGCTTCAGTATTCTAACGTTATTATTCCGTGTGACGG
AGAAAACGGCGACACCGACGTCTATTGTTCTCATGGCAATCAATTCAATG
TTTGGAATGTATTGGAAGAATATTATGATCACTCCAATAAATGTAGAGGC
ATGGAAATATGTAGGTGTGGCACTTCCGATTGTAGTAGTTGGAGCTCCGC
TAGGTTTTGTTGGTGGAGTATTTACTGGACTGTCTGGAACTGGTATTGAT
ATTTGTTGCTTCAGTATTCTAACGTTATTATTCCGTGTGACGGAGAAAAC
GGCGACACCGACGTCTATTGTTCTCATGGCAATCAATTCAATGTTTGGAA
TGTATTGGAAGAATATTATGATCACTCCAATAAATGTAGAGGCATGGAAA
TATGTAGGTGTGGCACTTCCGATTGTAGTAGTTGGAGCTCCGCTAGgcTC
TGTAATTGGTTCTCATTTTCATCGTCAGGCGCTCGCTGCGTTAAATTATA
TTACCGATACCGTAGCTTTGATAAGTGGTTTTGCAATCGTCAGACCGCTT
GATAGCGAAGTTGTTGGAACAGCTGTGGGAATCATTATTGGTGGATTTCT
TTTTTACTCTCTAATCACGTGGATTGGTGGACGAATGCTAGATACGATCG
TGGAAAGACAAGAGAGAAATGAAgttaatcaaaatgaaaaagaagaactg
AAAAACGTGTCAATCATGTGAgcTCTGTAATTGGTTCTCATTTTCATCGT
CAGGCGCTCGCTGCGTTAAATTATATTACCGATACCGTAGCTTTGATAAG
TGGTTTTGCAATCGTCAGACCGCTTGATAGCGAAGTTGTTGGAACAGCTG
TGGGAATCATTATTGGTGGATTTCTTTTTTACTCTCTAATCACGTGGATT
GGTGGACGAATGCTAGATACGATCGTGGAAAGACAAGAGAGAAATGAAgt
taatcaaaatgaaaaagaagaactgAAAAACGTGTCAATCATGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:268384..276921 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 376-648:8266 |
| Aaloc | 133-372:6342 |
| Aaloc | 1-129:1 |
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