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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:89188..98051- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041611 ID=XLOC_041611|Name=XLOC_041611|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8864bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:89188..98051- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGACCAGGAGGAGCAACATAAACATAAACAAACCATTATAAATGT
TGACTCCGACGAACCTTTTGCGTATCGATGTAATGTCTGCGAGCTCGATT
TTTCCATAATCGAAGAGTTACTCGCTCATGTTACAGAATCTCACACGAAT
CCAAATGGCTCTGTCTCCTGTACAGATTGCCAAGAAACACTTAGTAATGC
TGATGGTAAGTTGTTTTCGTTTTTAAATCTCTCATCGCTGATTTTGAATT
CATTTTTAAAACTGTCTTTTCTATTTAGGAGGATGAGCTTTGGGAAACTT
TTGTCACAAAAAAGGCAAGTTTTTGTGGTTTTGTGACATTTTTCAAACCA
ATGAATACAAAAAATTAGCCTATATCTTTTTAACAGGGTGGGATTGATCT
TTCTTGAAGAATTATCGTAACTTGGTCTAATATTGACATCCCTCATCTAA
TTCCGACACTCTTTTTATCAGCTGAAATTAATTGAAAACTGTTTTTCTTT
ACTTACCGTCAACTGCTCTAAACTTGGGACTTGTTGATATCTGGCCTGTA
TTTTCACTTACTGTTAAATCTCTTTGACAACAAATTTGTTTTGATAACTC
CACCAAGTTTATCAATCATACTTCTTCGTTCCTCTTAGAGTGCACAGACA
GTTCAGACATTCGCGTGTGTTCCACTACAGACTTTTTTCATATTTCAATT
TAAAAGCCTACTCGGTGCGAAAGAGAAATTGTGTATTTTTTATTACGCCG
TTTATTAACTCAAATCAAATATGACTTTGGAGGTTCGGTGAAATAGACCT
TTTTTCAAAGAGGACGTCCTGTTGAATAATTATGTAGTCCAGCCATAAAA
CAATGATAGAGCCATGCATTATTACTGTATCATGCATATTGTAATATGCA
TAATTATTACAATATGCATGATACAGTAATAATACATGGTTTTATCATTG
TTTTTCTGCTGGATTACATAATTATTCAACAGGGTGTGGCCTCATTGAAA
AAAAGGTCTATGGTGGCCGAATTACCGTCCCATGTTTTGTCAGATAGTCC
CAAGTCAGTTAGTCACACTAGCGTCCCGCCAAAATGTGTATCAAAGATTA
ATGCTGCGAAAGCGCTATATCGTTTACTTGACTCTCAAGGATAAAAATGT
GGCGCAAAACTTCTAAAGGGATTCATGAAAAAATAACCCGGCGCTTTTTA
ATGAAATTAACATTTTCAAAAACTTTGAGAAATTGCCTAAAATTTGAACC
ATAGATGAAAAAATTTGAGCCAAGCCAACCTTGAAAACTAATTTGAAGAT
CAACTTCCCAAGAAAAAGATCTACGGGGGAGGCGGAACCCACCTAGATCC
GCGCACCACCGGATAGGCTGTTTCCCGGAATTTTGCCGGACCTCAAATAA
TGACCCATTCACATATGCGGAATTGTTTTTACTTTAGCGTATAAACCAGG
CCTTAAAAAACAAAGCGCTGTCTCGGGAATTGAATGACAAATTTTGGTTG
GTTGATTTTGGCTGCTGCACGTTTTATTTTGTTCCAAACTTTCAAGTTTT
ATAATTGTTTTGCGAACTTGATTCAGGTAACTCTCATCCTTGTTGTGCAA
ATACATCCTGTAGATGACTGATGTTGTTTTTTCTGAAAGCTAAATTTCCT
AGTGTGACTAACTGCAAGTTAGAGCAGTTGACGGTATTATAGTGGTGGTC
GGTCAGAGAGGAATATATACCGTGAAGTCGGGTAACTTGCATCAGTGAAG
GCTAACATGCATAGCCCTCAAATGAATGACCTGTCTGGTCCTTAAAATAC
AAAGTTAAATTAAAACAAAAATGTTAAAATAGAGCTGCGAGCGAAGCTGC
GTAGTTTATTTGTTTTGAAATTTTGCTGCTTTGATTGGTCCTGATTGGTC
AGTCATTTGAGGGCTATACATGTTAGCCTCCACTGATGTAAGTTACTCTT
AGGTGCAAAATAAACCCCCCCCCCCGCTTGTTAATTTTTCAAACATTTTC
CAACCCCCGGACATTATTATTAGGACCCCCCCCCCCCCGTTTATTAATTT
TTAAGAATATTTTCAGCTGTCAAAGAGAAGGACCCTTATTTTGCTCTAAA
TAGCCTGATTTTAGACTATATTTACCGTATTTTGGGAAGTACAATTTCCA
ATCCCCCTGCAATTAGGTCCCCCCCATTTATTAAAATCTCGAAAATTTTC
CAACACCGTTTATTTGAACCCCCCCATTTATTTATTTGGCACCTAAGAGT
ACCCTTCAACTTCACGGTAATCCTTTTCAATCAGTGATTCAAACTTTCAT
ATTATTCCTGTCTCTAAAGAAGGGTGTGAGAATTAGACAAGGGATGTCGA
TATTAGACCAATTTACGATACATGATGGTGTTAGCTCATTCAGTTAGTCA
AACGCACTAGGAAATCAAGGTTGAAGAGATAACAACATCCGTCATCTACA
GGATATATTTTATTTGAAACAACTAGGGTGAGAGTTACCTGAATCAAGTT
GAAGATCCCAAGACAATTACCGTCAACTGTTCTAACCTGGGACGATTGGT
CGAAACATGGGCCTGTTTGATATCTGGTCTTTATTTTCACTTACTGTTAA
ATCTCTTTGACAACAAATTTGTTTTGATAACTCCAAGTTTATCATATCAA
TCATACTTCTTCAGAGTGCACAGACACTCGCGTGTGTTCCACTACAGATT
TTTTTCACATTTCGATTTAAAAGCCTACTCGGTGCGAAAGAGAAATTGTG
TATTTTTTAATACGCTGTTCATTAAGTCAAATCAACTGACTTTGGAGGTT
CTGTGAAATGGTGGCCGAATTGCCGTCCCATGATTTGTCAGATAGTCCCA
AGTTAGAGCAGTTGACGGTAAGTAAAAATTGAAAGCTTGAAACAAAACAT
AATGACCAATTACTAATGTGCTGTATGTTATTCAATTCCCAAGATAGCGC
CTCCCCTTGATTGCTCACTAAACTAAAAATAATTCCGCACATGTAAATGG
GTCCGTGGATGAGCTCCGGCAAAATTTCCGGGAAGTACCCTATCCGAAGA
TGGGATGATGTAGTTAATACACTAAAGTTTCATTTCCAAACTTTGCTTTA
ATAATTTTCGCCTGAAATAAAAATCTAGGTCATTTTTAACAAAAATGTTA
CATTGTTAGCAATCTTTGGCAAAACCTAAAAATCAAATATCTTTCAACTC
TAGTGCTTTTGGACCTGTATTACCTTTTTAGCACAAAAATCTATTATAGA
AGCTATTTCAGAAGCAGCCATCGCTCCAATTTCCCCAAAATATCTGTTTC
CCTTTTTCAAGGAGAGAGCTTTTTTTGAAAAATGGGGAAACAGATCTAAA
GACCTTTTCCTTAAAACTATCTGTTTCCCGGCTCCAGCTGATGACGTCAT
CAGGAGATGACATAATAAATTGGGAAACCAGGCAGAACCAGGGGAAACAG
ATATCTGTTTTCAAAAAGATGATATTCATTGGAAACAGATTGAACTTTCC
GGGGGTAAAACAGATATCTAGCGCTGTGATCCTTGTCCTTAGGGCAAGGC
CTATGCCCTATGCTTAGGGTAGGCTCATTCTTCTTCTATCACAAAAAGCA
AAGGAAACAGATGAAAATTTCCAAGAGAGGGAAACAGATATCCTATTCCT
TATAAGTTTGGGAGAACAGATCAAAATTTTAATTTTGAAAATTGTGGAAA
CAGATCAAGTTTTCCAGGAAGACTATTATGCCTGGGAAACAGATGTTTAA
AAAAAGATCCTCACTGCATGATTTCGCTTTTTTGAAAGTCATAGAGCTTG
CCTTTTTTATGAACATGTCCCTCAAGACTGAGGCCTGGAATAAGAGCCAT
TTTTGGTTATGTAATTTTTAAGCTCCTAGGTTTTTTCATTTGATTCTCAC
AGGCCATAACACATGTCTCAAAGTCTGATGCGTCGGTGCAAACTATTTTG
TCGTGGCCATTCTTGCACAGAAACCAGACTCATTGGACATAATAGTATAC
GCAAAACAATGATATAAAAATATAAACACAGACATAAATAGAAATTCTAC
AACAAAGGTTCCTAGCCTCCAGACATAATTAATTGAACCAATCAAACTTT
GTTGTCCAATTAATGTTCGACTAAGTTCGGTTGTCGAACTTTAATTAAAT
ACTCATATATTTTTCAAAATATAAAGTTTGATTAATTTTGATTAAAGAAA
TCGAACTTAATCGAACTTTTAAAAGACCTTTAAGGTATGTGTACACCCTT
TATGACACATTCTCTTGAAGTATATATTTTCTGAAAGCCCTTAAAATTTC
GTAAGGGATGGTGTTAAAATCTTATTTAGTATACTGAGTAAGAGTAACAG
ACCAAATTTTGACCTAGTTACATTCAAAAGGGATGAATCCACCCATAGCT
TTGAGCTATCGAGATTATCAATTGTCAAAAATGTCCGTGCTCGCTTCGAT
CGTTATTTTTAATTTCGCCTAGCGAAAGTATTACGATAGCCTTTCGCGGC
GGCGGCGGTGTAATAAAAAAATTAGAAAACGAAAGTACTCGATACGGTGG
ACAAACTCACTAAATTTAATTTACAAATTACACGCTCGTATAACCACGGA
CGATTTTTGCGGGTTTTCTTTGGATTACGTCATATATCTTTGTGTCTTTA
GCTTCACAGTTTCGCTTTTTCTTATTTTCTTATACGCATATACTTATAAG
AATCAAATCAATAACTCTTGATAAACGGTGAAATACCCTTCGGTAATTAG
TTCTTACAAAGTAAACAAGGGATGGCGCACAATATGAGCATATTTATTTT
CTCATTAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGAT
GGTGATATACCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAGGGATGGC
ACATATGAGCAGTGGCGTGTGGCGGGGGGGCTGGGGGGGGGCCATGCCCC
CCCCCCATGGAGCTTTTTTGAAAGGGCGCCGAAGAGCAAGGGGCACCAAA
AGAAATTTTTTTGAACGCCCCAATCTTAAAAATCATACTTTATGAGCCTT
AAATTGCGCCCAGGACCAACTTTGCTGAGATAATTTTAAAATACTTGCAA
TTTTTTCGCTCGCTTCGCTCGTTTCGCTCGCAATACAGTTTAATTGGTAA
CTTCTTTGCAACCTTGCTAATTTATAAGTTTTTTTGTGTACAATATAGCA
TTATTAAATGAAAATCTAACTGCGCCCCAAGACCAATTTGCTGACAAGAA
TATTGAAATCATAGAACATCAATTTTTTCACTCGCTTCGCTCGCATTTCA
CATTGTTTCTTTAAGTCTCTTTTCACTCTAGCAAGTGTGAAATTTGCCTA
TTTTTATTTAGTGATTTAGGGTGTCTTGACAGTCGATTTTTAAAATTTTT
CTAGTCGGCCGCAACCATGGTGGGGCCTGCTTTTCCATTCATCAAAGATA
TATCTACTCTTCTCCACTAAATATTTCCTTCCTCATTATGTCTAGGCAAA
TGAATTAGTAAAGGTTTAGAAACTAGTGAGTGGGGGCACCACTTTGGAAA
ATTGAAGGGGGCGCCATTTAAAAAAAATTGACTTTGGCCCCTCCAGAAAA
ATTTTCCCACAACGCCACTAAATATGAGCATATTTATTTTTCTTATAAGC
ACACACTTTATAAGAATCAAATCAATAACACTTGATAGATGGTGATATAC
CTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAGATAAACAAGAGATGGCACACAATATA
AGCATATTTATTTTTCCTATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAAT
AACGCTTGATAGATGGTGATATACCTTTTGGTAATTAGTTCTTACAAAGT
GAACAAGGGATGGCGCACAATATTAGCATATTTATTTTTCTTATAAGCAT
ATACTTTATAAGAATCAAATCAATAAGTCTTGATAGACTGTGATATACCT
TTCGGTAATTAGTTCTTACAAGGTAAACAAGGGATGGCACACAATATGAG
CATATTTATTTTTCTTATAAGCATACACTTTATAAGAATCAAATCAATAA
CTCTTGATAGACTGTGATATACCTTTTGGTAATTAATTCTTACAAAGTAA
ATAAGGGATGGCGCACAATATGATCATATTTATTTTTCTAATAAGCATAT
ACTTTATAAGAATGAAATTAATAACTCTCGATAAAAGGTGATATAGTCTT
CGGTAATTAGTTCTTACGAAGTAATCAAGGGTTGGCGCGCAATATGAACA
TATTTACATTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGGAAAAATATTCGTCATTTG
CTGGTAGTTGCTAAACGCCTTAAGGCCGGGGTAAATTTTCGTCGGGGAAA
AATATTCGTCATTTGGCCAAAATTTCGTCACTTTTCCCCGACGAAGTTTT
CCCTGATAAGGTTTTTTTTTCAATAAGAATCAAATTAATAACTCTTTATA
GATGGTGATATGCCCTTCAGTTATTAGTTCTTAAGAATTAAACAACCATT
GTTCGTAAATTGATCTTATCTTTTTAGCGATTTTGAGCCTCGTTGTTCAT
ATAAAATTGTTTCATCAAGGCTCGATGTAAAGTAGACTTCAGATTAGCTT
GATCATCTCTACTTCTTGTTTTTTCCCATGCAGTTTAAACTTTAGGCGAA
ATTTTCGACTTCAAGTCGTCTTGTTTTTTAATGTTTACTTTTCATAGGCG
AAAGGGGGTGCCAAAATCAAAATCTTCTAAAATTGCCTCCCCAGTTTGCC
TGAATTTTAGTCGACCCACGACGCTACTGCTTTGATGGATACGTCTATAT
GATGGTAAACGAGTCTGAAATATGTTAGGGGGAATCAAATAATAATAGCC
GCATTTTTGGGCCTACCCCGGTGGAGGTCCTATAAATAAACCTGTGTTTG
TTCGTCCGTTCGTCCGTCCGTTCGTTCGTCTGTTACCACTTTTCTCAGGA
TTGAATCATAGGAATCTTTTGATTTTTGGTATAAAGGTGCAAAATGGTGG
TGGCCAAAATGTGACGGAGCCCGATCTTCGAAAAAAAATTTTTGGGCAAA
TTAGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGTACTTTGTGAAAAA
TTGGATCATTAATTTTTTCTGAATTTTTGCATGAAATTAGGGTACCATCC
TAGGTAAAAGATGATTTTAGCAGATTTTTGCAAAAAAATTTTGTTGGCTC
AAAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATCAA
TGTTCTTATTCAAATTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTTG
CCCACGAGGGCTTACTTTTGAAAAATATGTGTGTTTAAACATGCAATTTT
AGTTGCTTGGCGTGTTTTTATAGAAAAACTGGCCAAATTAGATATTTTTT
ATAAGCACATTATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTAGCTC
TTTCATTTTTTATGATTTTTTGCACAAAGATGCATAAACTATAAACCCTT
GAATGTGTCGGAGCCCGATTTTCGGGAAAACAAATTTTGGTCAAATTTGA
GCCAAAAAACGGCTAAAAAACAGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAATTCGA
TCATTAATTTTTTCTAATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTACCATCATAGGT
AAAAGATGGTTCAAGCAGATTTTTGCAAAAACATTTTGTTGGCTCAAAAA
AACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTT
CTTAGTCGAATTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTGCTCAT
GAGGGCTGAATATTTAGACACGAAATTTTGGTTGCTTGGCGTGTTTTTAT
AGAAAAACTGGCTAAATTCGATATTTTTTTATAAGCACATTATCAATTAC
TTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTATCATTCTATATGATTTTT
GCACAAAGATGCATAATTATAAACCCTCGAATGTGACGGACCCTGATATT
TGAAAAAAAATGTTTTTGGGTAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAGG
GTTTTTGGACTTTGTGAAATATTGGATCATTGTTTTTTTCTGAATTTTTG
CATGAAAGTAAGTAAAAGATCGCTCAAGCAGATTTTTGTAAAAAAAGAAT
TTTTTAACTCAATAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAG
GATACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGACGAGATAGAT
GTATTTCTTGCTCACGAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTTCAAGGGCAT
GAAATTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTTATAAGAAACAAACGACTAATTTT
AATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAACGGTCATGCTC
ACGTAGATATCAATTATATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAA
AAGTATCACTTGTTTTTCACCGTTCAACATATATGGCGATGATCAGAGTT
CAAAAAAATCACACAATGAATAATGATGATTATCTTGACAATTATGATAT
TTGATCGAAAGTCTTCTACAGACTTTGTAGGAACTTTTTAAAAGATCTAA
AAAATTGTCTTAGGGATTTTGGGAAATTATGGGAAATGTTTCTCAACTTT
GAGCTGTTAAAATTAAACTTTAAAATTCTCTAAACACAAAAACATGTATT
TTGGTGGTTTTTAGTAATCTGAATCCCTGTATTGGCATAGCACCATGAAT
GGATAATTCACTGATAATGTTTTCTTTTTTCTTTTAGAGTACATAGAACA
TCACCATAGCCATCATGGAATTAATTTGAAATCCAACTCAGTTGCTTCTG
TGCCACATACTGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:89188..98051- >XLOC_041611 ID=XLOC_041611|Name=XLOC_041611|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=564bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:89188..98051- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGACCAGGAGGAGCAACATAAACATAAACAAACCATTATAAATGT
TGACTCCGACGAACCTTTTGCGTATCGATGTAATGTCTGCGAGCTCGATT
TTTCCATAATCGAAGAGTTACTCGCTCATGTTACAGAATCTCACACGAAT
CCAAATGGCTCTGTCTCCTGTACAGATTGCCAAGAAACACTTAGTAATGC
TGATGATGTCTGACCAGGAGGAGCAACATAAACATAAACAAACCATTATA
AATGTTGACTCCGACGAACCTTTTGCGTATCGATGTAATGTCTGCGAGCT
CGATTTTTCCATAATCGAAGAGTTACTCGCTCATGTTACAGAATCTCACA
CGAATCCAAATGGCTCTGTCTCCTGTACAGATTGCCAAGAAACACTTAGT
AATGCTGATGAGTACATAGAACATCACCATAGCCATCATGGAATTAATTT
GAAATCCAACTCAGTTGCTTCTGTGCCACATACTGAAAGTACATAGAACA
TCACCATAGCCATCATGGAATTAATTTGAAATCCAACTCAGTTGCTTCTG
TGCCACATACTGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:89188..98051 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 208-282:76 |
| Aaloc | 1-204:8865 |
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