XLOC_041573 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041573
Unique NameXLOC_041573
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000014_pilon:413630..426569-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041573 ID=XLOC_041573|Name=XLOC_041573|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12940bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:413630..426569- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATGACCTTCTTAAAGTAACTCTCACAGGAATCTGCAAAGACGTCATCCT AATAGACGTAATAAAAAACTTACCATTGTTGAAAGAATAACTTTTCGTAA TCACTTGGGAATATAATTACTACTTGCATCGTGTGTACGTCATATTTCTC ATCTCTTCACTTTTTCTACCGTGTAGGAGTGCCAAACATGAGATTTCTAT AAGGAAATTTGAAAAACTTCACCGCAGAAATATTTTCAATAATTTGCTCA ATTTTTCGACTGCAAGTTGTGGGGTAGCAGAAATATATATCAATGTGTTC CTTATAAGAGCCGCTAAACGAATATCGTATTATTGTTTTCACCACGACGT GTTATTGAACGTTTTAATTACTTTTTGTTTTAAGCCTTTGATCTTTCTTT TTTTTTCTTTTGCTTAGCGTGGCGCTAAATGATGTGATTACTCATTTTTT TGTCGTTTAAAATATGACAGTGTGCTCGACTGTATTTTAGAGACGCAAAA GTCCCCCTCGAAAGATAGCCGTTCTGGTCATCAAAATAGATACCGAGTTG TAATAAATGAGTTGATGATAATAGCGAAGAGGCTCGGAAATCCCGAGTTA TTTTTCTCGAGTTAAAAAAACGAGTTACGAACCTGTGACTCTTGATATGA ACAACTCGGAAATGTTAACTCATTTTGCGTAACTTGACATTCATTTTAAA GACCGAAAAAAAATTCATCGCGCGGGCCGCTCGCTTGGAAATTTCCCGCC CTGACAAAAAGTCAGAAGTGCGCAGTGTCACTTGAGCCTTCTGGGCCATT GATCCTAGGCAGTTCTAATTCACAAATTTTATAAGAACTGGCAGTGCGTA AAACTAGAAGTGCGTGTTTTGAGCCTTCTGGGCCATCGTAATTTTCTGTG CGCGAAGTGGATGTTGTTTATAGAAGAATCAAAGCAGTCAGTTAAAAAAG AACCGCAGGTAAAAAGGAGGTAATTTTTTTTTGATTTTTCCGACTCAAAG TGAAACACTTTTTCTAAAAAATTTAGAGTCGGTCAGAGGACACGAACCAA GCTATCAATTGGGCCTGGCCTTATATTTGTTTATGAAGCTTTCAATTTTA ATCGCACGATGAGTTATTTTTTCTTATTTGGCGTGCCTTCAAAGAGAGCA ATTAATCGTTAATCAGTCAAGGACTATTGCAAATAAATTTAGCCTAATTA GGAGGAATGGTACATGATATTTTATGTGTTACGCGCTTTTCCCGTCATAA AAAAATAAAGATCTTTAAAACAAGCTTGAGTGAATGAAAGTGTCAAAAGT GTTAATTCTACTTAAAAAACTAATGTAAATAACGCCGTGTTATATCTTAT ATTGTTTATCAAGATCTCTATTTGAAATTTTCTTTGAAAAACAACCATCA TAAAAGCAAAGTTATCACTAAGAAAGTTCAATGCTTAAAATTTGGAGTTT ATAAAGTACTTCTTAAAAATTGAATAACTTCTGAACATACGCTGACTGGG AGATAACACTTCTCAAGCATCCTTTGCTGGCTCTAAATTACTCAAATTCA TGCAAATCTTGACGCGGATATCAAAGTTTATTCAATAAATCAAGTTTTTC TTCCTTTTATCCTAAATAGGCTAGAATATTTATCCTAGTTAGGATAATTT ATCCTATTTAGGCTAAGTACTCGCATTTATCCTAATTTTCAATAGTTCTT GACTGTTAATTGCATCCTGTAGAAAGCAATTAATATCGTTAATCACACTC TTCGATGCAGCGCCAATGTTTTTACAAAATTGATTTTGATGTTTTTTCTT ACATTCTTTTTCATCAAACGTTTTAATTGCATTCGAAATTCATTTTGTAA GAAAGAAAATCTTCAAACAACAATAAAAGAAAAACAGAGAGAAGAGAAAA 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TGCGCTGTGATAGATCATTTCGATGGAATTTGTTGGAATGTTTACAAGGC TCTTGACAGAAAATCATTTGTTTTATTGTCAATGATGACAGTGCCGTTAT TAATTTTGTTAGATCTGGCAAATTGATGTTTGTAAGTGCACTTTATAATT TTGATTCCCCATTGAAGAATCATATTCTGGTTTTCATGTTATTAGATGCT GTCTGGAGGTAAACAAACCCGTTTTTGCCTGCGTTTTTCTTAGAGAAAGT TGTTTTTTGAGCTTTTGTTAAGTTCTGTCGAACAAAATCCCCTCAAATTT TAGTATGTTCAATCTATTCATGATATTATACCACCCTGAAAATCGTTTGC AAAAAGAAGATCGCTATCAAAAGTTAGAAGCTGAAAACCCACTTTCCCTA ACCCCTCGCAGGCAAAAACGCGTTTGTTTACCTCCCAAACAATTTTATAC ACAACGGTGGAGCGCACATTTTCCCAGGCCATTTCTGAGAAGGTTGAATT ATGAAAAATTACGTTGAATGGAAAAAAACGTGAAAATTAATAAAACTCGC GAAATGCAATTTTTAGGATATTTTTTTTCGACCGCGAAAATTAGTTCCAA TAAGGTAATTGTCTTGGAAACTTTTCATTGAGGTAACTCTCTGAAACATG GATTTCTTAGTTTGACTAACTGTCATTCTGTACGTTTTTCATCTACCTTG TGGACTGGTCTCCGCCATTTCCTGATAATTAAAAATTGAAATTTTCCTGG GCAGTCTAGACATAACTCCTAGTCTTACCGCTTTTATATTTCCCTTTGAA ATATATAATACAATGCTGACAAGTAGACCCAACGCATTGACAAGTTATCG GTCCATAACAATCCTTGATATTAAAAAAACTGAACATCCTTACAAAAGTT GTCTTTTTGATTTCCCAAACATTCGTTTTAAGCATTCACTTTGCGCTTCC GTGCGATTGAAATATCGCAATTATACCAAAATCTGCAACAAAAGCAAAAG TAGTGTCTTCTACTGATGCCTTAGCGGCACTTAGGACTTCTTAGTGCCAT GAATGAGGGGGGATTGTAAAATCTCACCACTTATAGCACCTCTTTTATTT GTTTTTATCTTGTTTAGCATTAGTCTACACAATAGACAGCTCCAGGCTTT TAGGCCTTACTCTTGGTTTATAGGCACTGCTATTGGCAGCCACTAGTAAC CCCCCACTGGGAATTGCTTTTTAATAGGTTTAAACATAATAGACAACTTT CACAAAAGATGTTTATCAATAGAGATTTCGAATAAAAGAAAGTTTAAAAC ACAGCTGATTGGCTTAGGTTTCGAAACTCTCTATTGTTTCATTAAAAACC TCAGTGCGCATGCGATTTATCCGGAGAATTTCAATATTCAAAACAAGAGC AGTGCTCATATCCCGAACAGTAGGAGTTTTACGCTCGAAACGAAGGAAGA TATGACATAGCCTAGTTTAGCATAGACTATTTCTCATCTTCAATTTCCTG AAGAAAGCAATCTTGATATCTGTTGACTTGATATCTGTTGATATAGGAGT TTTATTCTACACTGTGTTGGTGTATATACTGACATTGCGAAATATTTTCC ATGATGCCGTCAACTGCTCTAACTTTGGACTATCTGACAAAACATGGGAC CGTAATAGGGCGATAGGTGGTTAGATGGTGGGCGTTCTCTAATTCTCCAG TCAGCGTCCAGTCATTTTGAATGAAAACAAGAAAGTTAAAAAGGGTGCGC TATCAGTGAAAGTTATCGTGACATGTCGACTCTTTTACTTATAAATTTCA TGATAAAAAGAGCTGTTTGCAATTTATTTTCTTTAACAGGCATTGAATTA ACATTGACATATTTTTTATCCTTTTCATGGGATAAATACCACTGAAATAT 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AATTATCATTATAATCCGTACATATTTCACGCGTACTACTTTAATTGCAC ATTCACACAGAATAATCAATTCGCCCACAAAATTTAGTACAGAATTTGCG CGGGAAATAGGTGTGTAAATTTGTACAAATAGGGTAACAGTAAACAACGT CAACATTTACATTACTTAATAACCTACTCTCTAGCGTTTGAACAACCTTG ACAAAGAAAAATCAAGAAGATTTATAGGATGTTTGAGATTACTTTTTTGG TGGATCATCGTAATCTTATAAAATTACCCAGTTTTGATAGCTCTATCGTA CCAGGTCGTACTCATTGACTATATTTTCAAATTATTTCACTTCAAGAATC CTTAAATAATCACTTGTTTTTAAAGCATTATGACTGACCTTCAAGCCTTG GCTGGTTTATTTATAAATGTTATTGGAATTATAACGTATAACGGTGATAA TTCTTTTTATAGGGCTTGATCATTCTTTATTGGACAACAACAGACAAAAT ACCAGTCATCAAGAGGTATCCTAAGGAGAAAATATTTTGTGATGCAAAGA CTGATGAAACTAAAGAATTTCCTTTCAACGAAAGTAATGGTGATGTTTCA TTATCTTTAGTTGTACCAGCTTACAATGAGGAAGAAAGATGTGAGTTTTA CTTCAGTCTATTTTCTCAAGTTGTCCAATTTCCCCCCCCCCCTTTTTTAA TCCATCCCCCAGCCAAATTTTTTTTTTAATATCTTTACAAATATCTTTAC AAATATCTTTAAGTTGTAAAGTGAGAGGTTTTCTATTTTATTTGGGTGGT CGTCTTTCTAGAATTATTTTGGGAAAAGTGTCGGAAATGTCTAGAGGCAC TAAATTTATTACCCAAATTTGTTTCCTTGATAAGTTACTTGGCATAGTTT TTGAACCAGAATTCAGTGAAAAGTATCCATCCACATTGCAAGCCCTTATT 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AATGTTTTTACTCATTTTTTTAAAGGGGGATCCAAAATTGTTTAAGCCTT TGTCTGTTCTTAACATTTTGATTACTAAGCTTTAAAATGCCCTCAATTTG CTTTTAAAACCATCGAAAACTTATGTCCTGATATGTTTGTTCTTATGAAA AGTGTGGACTAGATTTGTTATATCATGTAAAAAAGTGAAAATATATAAGA AAGGAGAAAAGAAGCTTACCGAAAAAGGTGAAAAGAAAATGAAAATGATC CTCATCTGTACTATTTATGGAGCTTATTGTATTGTAATTAAAGGTTTTAT TTTTAATAAGTGTTTCCGTTTCATATCAGATACATATTTCATATCAGGAC AGTGTCTTGCTATTGTTATATTATGCTGATATAAGCAGAAAATGTTTATT CTTTTCCTCTTTCTGACCAATTTTTCTCCACATCCGTGTCAATCCAACGG GAAAAAGCTTGTGAATTAAAATGATGAGTAAGCAAACGATATCAGTCTTA TTTAAAAACAAAACCTTTAAAATGTAATTTGGTGCCAAAAATTTACCATT GTAAGCTAACTATATAGCCTGTATAGTGATTTTCTTCTAATAACCGTTGG CTTTTTAGACGCATTTGAAGAATTGTAAAGGTTTCAGACTGATAATTTTG TTTTAAACCCCTACTAGTCAAGGGTATGTTCGGCTAATCTGAAAATACCT GTCTGCCTATTGAGCCACATACAATTTATAGCATGTAACTCAAAGAGTTT AATAATCTAAAGGGTCCAATATGGTATCGCGAGCTTTAAACAAAGCTACC TGGTATCTCAGGCTCCTTGATCCGCTGCGCTGGAAGCAAAACTTTCTAAT AGGGTTAAGAAGAATTAGGGAGAGAACTTGAATATCTATGATTTATTTTT TTTCTAGGTTGGATTGGGTTATTGTAAAAAATATGGATCGGAAAAAATTC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000014_pilon:413630..426569-

>XLOC_041573 ID=XLOC_041573|Name=XLOC_041573|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1074bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:413630..426569- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTATCCCAATTATTGGCTGTACCCTTACAGCAGCATTTCAATGTCT
TGTTCTTCTTGGACTTCTTGTCATTTTTTTGATGGTTATCCCAATTATTG
GCTGTACCCTTACAGCAGCATTTCAATGTCTTGTTCTTCTTGGACTTCTT
GTCATTTTTTTGGGCTTGATCATTCTTTATTGGACAACAACAGACAAAAT
ACCAGTCATCAAGAGGTATCCTAAGGAGAAAATATTTTGTGATGCAAAGA
CTGATGAAACTAAAGAATTTCCTTTCAACGAAAGTAATGGTGATGTTTCA
TTATCTTTAGTTGTACCAGCTTACAATGAGGAAGAAAGATGGCTTGATCA
TTCTTTATTGGACAACAACAGACAAAATACCAGTCATCAAGAGGTATCCT
AAGGAGAAAATATTTTGTGATGCAAAGACTGATGAAACTAAAGAATTTCC
TTTCAACGAAAGTAATGGTGATGTTTCATTATCTTTAGTTGTACCAGCTT
ACAATGAGGAAGAAAGATTACCTATAATGTTGGATGAAACATTAGAATAT
CTAGAGAATAAACAGTACCTATAATGTTGGATGAAACATTAGAATATCTA
GAGAATAAACAGAAGTCCGATTCTTCTTTTACATACGAAATCATTATAGT
TGACGATGGGAGCAAGGACAAAACAACACAGAAGTCCGATTCTTCTTTTA
CATACGAAATCATTATAGTTGACGATGGGAGCAAGGACAAAACAACACAG
GTTGGATTGGGTTATTGTAAAAAATATGGATCGGAAAAAATTCGTGTTTT
AACCTTCCATAAGAACCGTGGAAAAGGAGGTGCTGTCAGGATGGTTGGAT
TGGGTTATTGTAAAAAATATGGATCGGAAAAAATTCGTGTTTTAACCTTC
CATAAGAACCGTGGAAAAGGAGGTGCTGTCAGGATGCTTGGAAAGCTTAA
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AATGACTTGGAAAGCTTAAGAAGACGTCAATTGACGTCGTTGCTATGAGT
GCCCTGTCTTATACCACGGAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041573XLOC_041573-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000014_pilongenomesc0000014_pilon:413630..426569 -
Properties
Property NameValue
Aaloc469-537:70
Aaloc376-468:634
Aaloc307-375:1946
Aaloc262-306:2377
Aaloc82-258:2979
Aaloc1-81:12941