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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000437_pilon:81510..88445- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041563 ID=XLOC_041563|Name=XLOC_041563|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6936bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000437_pilon:81510..88445- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGATGGGCTCACCCAACGCTGAAGGCTCTGGTAAGTTAGTATTTGA
GACTGGGATTGCGATTGATGGACTGACGTTATTCCCGAGGGAAGAGTGTG
CGACTTGGCACTTCCACTTTCGTTTTGAACAAAAGGAGGGGAAAAAACTT
GCGACATGAAAGGGAAGTGGTACGATCACCAGCGGGAATGACTTTTAGAT
GGTTCTTATCCTATGCCTACTCTAAAAAATTTTTGTTTACACTGTTTCAG
ACCTCCCTTAGAATATTATTGTTTCAAAAAGGAAATGAGTTGACTCTGGA
GCTTATTATAAGCTTATTTTTGTGTTGTGATTTTTTTTGAAATATTTGCT
ATAATTTGCTTTGCGAAGTCCTGAGCCATTTTTTGGGGGCAAATGGGTAC
TGTTTAGTATGTCTCAGCATCAGAGCAGTACAGGGAACCTTTTCAAACCC
TGAAAATGTCTTTAAGAGTTGTGAAACCAGCCTTCAGCAGCCTGTAGAAG
GTTCTCAAAATCTGATCAAACAAACTTGTCGAATCCAATCAAACAATTGA
ACTAATCAAACTCCATCGAACGATTAAAGTTCAATTAAAAAAATTAATCA
AACCTAATCAAACACTCACAATTTTTGAAGCAATAGCAGTTCGATTGGTT
CGGTCAGGAAAAAAACTTCGATTAGTTCGATGATATTAAATCCTCATATC
TTCCCTTGCTTGCAAAAACTTTATCCTGCCACGCGATTGCCATTTCGACA
GTTCCCGGACTTAACAACTTAAAGTTTATTGTACCCGGATATTTGTCCGC
GGCCCCTTTGTTGCGATTTTGCACGCAGCCGAGTGGTGGATTCCTACGCC
TCAACAAACCGCCTCTGGCGCTAAAAGGATACAGGGAAAGTGCGTAATCC
ATAATCGGTTTAATTTCCCGATTTACATTCTGAATTTGGCTTTGAAAAGA
AGCTAATATACGGTGGTGGAGCAGCACAAACTTGTCGAACAATTAATTGG
TTTATCGAACTGATTGAACCGAAACCCATTGATAGAACTTATTAAACACT
CAGGATCTTTTAATAAATCTTAGAGTTCGATTAATTATTTTAATCAATCT
TTAATCGTTTGATGAAGTTCGATTAGTTCAATTGTTCGATTGGTTCGACA
AGTTTGATTGATCGGGTCTGGTATATTCCTTGAAGTCAGGTAACTTGCAT
CAGTGGAGGGAAACATACATACCCCTCAAATGAATGACCTGTCTGGTCAT
TAAAATACAAAGTTAAATACAAACAAAAATGGTAGAGTAGAGCTGCGAGC
GGAGCTGCATGGTTCATTTGTTTTGAAATTTTTCTGCTTTGTTTGGTCAG
TCATTTGAGGGCTAATAGACCTTTTTTCAAAGAGGACGTCTTGTTGAATG
ATTATGTAGTCCAGCCGTAAAAACAATGATAGAGCCATGCATAATTACTG
TATCATGCATATTGTAATAATTATGCATGGTTTTATCATTGTTTTTCTGC
TGGACTACATAATTATTCAACAGGGTGGCCTCTTTGAAAAAGGTCTATTG
AAGTTTCCCTCCACTGATGATGCAAGTTACCCAACTTCACGGTATAGAAA
TGTAGGGCTCCCTAATTTTAAAATATATTTTTTGGGAGATCGTAAAATAC
AGTAGTTGCTTCCTCAAGATTTCTAAGCCAATCAAAATATGTGCACAGAA
AACTGTGCTAGCAGTGGCGTTGTGACAAGCGGAGCTTTTTTGAAAGGGCG
CCAAAAGAGACTTTTTTAATTGCCCTATCCTTAAATATCATACTTTAGGC
GCCTTAAATCGCGCCCCTGGATCAATTTTACTGAGATAGTTTTAAAATAC
TTGCAATTTTTTTTTGCTCACTTCGCTTGCAATACAGCTAATTGGTAACT
TCATGCAATCTTTAGCTAAATTTACAAGTTTTTTTGTGTACAATATAGCA
TTACACTCATTTTGTTTTATAAGCATAACGTTTATAAGCATACTGAAGCT
CAAATTTCCAGAAAAATTAAGCATATGCTAAGCATACCTTGAGGCTCAGC
CAAAGAAATTTTTAGAATCATAATTTCCAAAACTTCAGAAAATAACAGAA
GAATGAAGAAGAGAATTACAAACAAAATTGGTGATTTTATTTTTGTTTGA
TCTCTTATAAGTAACACAACTTATAATAACAACAACATTCGAAAACAATA
GAATGTCTTCATTTCTCTCAAGATTAAAGATAGGGGATAATGCGCGAAAT
TTTTTACCCCCCCCTTCATAATTTTTTTACCAAGCATAGGGTTAAGCATA
TATAGTCGAGGCTCAAAATTGAGCTTTACTTAAGCATAGTGAGCTTCAGC
CGAAATTTACCGTATGCTTATAAAACGAAATGAGTGTATTGAATGAAAAG
TTAACTGCGCCCCAAGACCAATTTGCTGACAAGGGGGCTTGGAAGCTTTG
GCAATTTGCAAGAGTGTTTTCCATTCATTTTTGGATTTCTCAACAATTAT
TATATTTTATAGTTAGAGATTGTAAGAGTTTGTGCTTAAAAGGACGAAAA
GAGAGGGGGTTGAGGAATTTTCATTTTTAAGAGGGGTTGATCTAAAAAAG
GGGGTACGCTATCAAAAAATCAGAAAGATAAGATCTAGCATACAAATTTT
TGTTGCTAGTTTTTTCACTGATTACCTTTTTCCTCAAATCAATGTAGTTT
TCTTCAACAAACTTCACATGCAGTGTTGCTGAACAATGTCTCACAACCCT
TCATTTTTTAGTACAAACAGTTTCCACACTGGCGCTTGCGGAAGCTGCTC
ATCGAGAATACCAAGCTGGTAACTATGAAAGTGCTGAAAAACTTTGTATG
CAGTGGTGGAGAAGGGAGACTGATAGTACTGGATGCCTCTTACTTCTATC
ATCCATTCATTTTCAATGCAGAAGGCTGGACCAATCTGCACAATTCAGTC
AACTTGCCATAAAACAGAACCCGATGCTTGCAGAAGCTTTCTCCAATCTT
GGGAATGTGTTGAAAGAAAAAGGCCAAGTTAAAGATGCACTCGCAAATTA
CAGACATGCAGTCAAACTCAAACCAGATTTCATTGACGGCTACATTAATC
TTGCTGCTGCACTTGTTACTGCTGGTGATTTAGAGGGAGCTGTGCAAGCT
TATGCCACTGCCCTTAATTATAATCCTGTAAGTCAAATTTGTAGAGATTT
CAGCATTCACTGATTGGGGACTTGCTAAATCATTTTCAGGCTCTTATGTT
TGTATGTCATACACTAATCTGTGTAAGGCTCATTTTCTATATAGAGCCAA
TTTATTTTATGCTTATAGAAAAGTGAATGAAATTTTATATACTTTTCAGG
AACTATATTGTGTACGAAGTGATCTTGGAAATCTACTGAAAGCACTTGGT
CGACTTGAAGAAGCTAAGGTATGTAATGAGAATTCTTTTATACCTCTTTA
CTTTATGAACAGTTTTTCGCTTCCCTAAAGAGAAACATCTGAATCTAATT
GCCTCTTTCTTTATTTTCTCTATGGTTCCAAACAGGGTATCAACTGTGAA
TCAACTACATGGAATCCTCAATGATGCTGTTTATCCTGACCAGTCACACA
TATTTTATCTTAGCACTAGAGGATTGTGAAAGCTATTACTAGAAAAACTC
TTTCTCACTAGACCTAGAACATCTAATGACTAAATCTTAAGTTAATAGCC
TTTTCAATCTTCTGATAATAACTTGTGATTGTTACATTGGCCATGATTAT
TTTTCTTCAATGAAGGCATGTTATCTCAAAGCCATTGAAACTCAACCAAA
CTTTGCTGTGGCTTGGAGCAACCTTGGATGTGTATTTAATGCTCAAGGGG
AAATATGGCTTGCCATTCACCATTTTGAGAAAGTAAGTTTTGTCTATCAG
AGGGAGTTGGTACTCAAATCTCAGACATAGTGGTGTTGCAAAAGGTGGAA
TGCAAAATACAAAGATTTGAGATTTTTTTTTTGAAAAAACTTTTGTACTC
ATTGACTATTTGACAAATTCAATTTGTGCCAAAAAGGGTTTTTGCATTGC
ATCGGTGTCAAAATGTTTTGAAAGAATTGGTATAATTCATGTGTACTAAA
ATGCCACTTTCTAAATCTTTGGGGGGGGGGGTGGTATGTAAAATATTCTC
AAAATCCCCTTTCAGCAACACTTATCTAGGTCTGACTCTTCCTGTCTATA
AATTAATCGTATTCCCTGTCTTTTTCTATCATTGAAGCTTTTGACATTAA
CAGATTCTGTGAATTAAAGCTCCCATTTCTCTTGTTTGCCAATTCATATT
GCATTAGGAAGTGACATACATTTTATTTTTATAAGCAAGTGTATGCCCCT
TGGTCAGGCTCAAGTATGATTAAGTTCTCAAAGCATCCAGGCATAGTTTA
TGCTTATTATATGCTGATGAATCATGCTTATGATTCACCTTGAGCCAAGT
TTTTAGTGAAATTACAGAAATGTCGTAAAAATTTGTTCATATTTTGGGAG
CAGTCGAATGTAGCTAGCCGTGGAATTTCTTTTTTTTTTACTTGACCTCT
CTACCAAACCTTTTTAAACAGATAAGAAATGGCAACTTGAAAAATATTTC
AGGCTGACACATATGCTTATGCTATGCTTAGGAATTCAGCAAATCTGAGC
CTTCATATGCTTATAAGCGTTCTGCTTATAAAAAAAAAACATGTAGTGTC
CTGTCCTCATGATTGAAAAATTCAGTCTGCTTTTCTAAGCATCTTTGTTT
ACATTAACCCATTTTCGTTCTATTTTGTCTAGTATTCCTTTTGCAACAAA
ATTTTACGTTTGTGTCAGGTTGACATTTGAGAAATTTTTATGGGTATATT
GGAGGAACTGATATTTTCAGAATTTTTTGGGGGGAAATCAAAAAAGGGGG
CAAACAAAAAAACTGTCATAGGAGAAAAAAGAATTTGGTGGGGGGAACAA
ACCCTGGAGTGAGTGGGTAAAACCCATGTTGTTCACAAAGAACCTCATTA
AGGCTGACTTTATCAAGATCTGTATCAGATAACTAATTTTACCCCATTTT
CAGTTCACATTTACTTTTCTTTGAAATAACTTCAGCCACTTTTGAAACAC
CTCAAGAAAACAGAAAATGAAAAGTTTTGAAAATTATTTTTCAGGCTGTT
CAAATTGACCAAAACTTTCTTGATGCCTACATAAATCTTGGCAATGTGCT
CAAAGAAGCCAGAATATTTGACAGAGCTGTGACTGCCTACTTGCGTGCAC
TAACAATAAACCCAAATCATGCTATTGTCCATGGAAATTTAGCATGTGTT
TACTATGAGCAAGGGTAAGAAATCTTTTCCAATATTTTTTCATTTCTTAA
TCCACACATTGCTTGGATTAGTTTCCCTGTAATAATGTGACACCTACTTC
CAGGTTGGCCACCCTTTGCTTTGTCCAAAGTAATTTTATTGCAGCTGTTC
ATAGCTCTTTATGATTTGAAGGATGGATCAACTATAAAGTGAATTGTTTT
AGTTCTGTTTATTATGACAGCATACCTATCACATGCAGCTACATTTAATC
TTTGAGCATCAACACTGTCACTTTGAAGACTTATTGCTGACAGAAATCTC
ACAAATTTAGTGAGCAAAATTGTCTTATTCATTTTCAGGCTCATTGATTT
GGCAGTTGATACTTACAAAAGAGCTATTGAACTACAACCAAACTTCCCTG
ATGCTTACTGTAATTTGGCAAATGCTCTTAAGGAACAAGGCAAAGTTGAA
GAATCAGAGGAATGTTATAACACAGCTCTAACCCTATGTCCATCACATGC
AGACTCGTTAAATAATCTAGCAAACATCAAAAGGGAACAAGGCAAAATTG
AAGATTCCATTGGATTGTACATGAAAGCGCTACAGGTGAGCCTAATAAAC
TATGTAATAAGATTGAAAATTGATTTCAGATTTTTTTACATATTAGACAG
AAAGGGTAATTGAGTTGAGGGTGTGGTTAACAATACCCAATTTATATTTG
TCACAGGTCTTTCCAGAGTTTGCTGCAGCCCACTCTAATTTAGCAAGTAT
TTTACAACAACAAGGAAAACTCCACGAAGCATTGATGCATTACAAAGATG
CAATAAGGTATTTAAAATGATTGTGTAATGCACCTTATTCATTTTCCATA
AATACTGTCCTCTTGCAGGTATTACCCGATTTTGCAGTGGGATACTCCAA
TTTAGCTTGTGTCTTACAAGAGCAAGGACGCCTCAAGGAAGCTTTACTGT
ATTATCAAGAGGCAGTGAGGTATTGTAATGGCATTTTTTAATAAGCTGAA
AGTTTTTCTCTTACATGTCCAATTTAACCTTTCATTACAAGTTATAAGTT
TATTTTTTGTAAGATTTAATTTGCTTGTTTTGTTTCTACTAAAATGACAC
CTTTTAAAATGCTAATGTAATGTGTTTCTTCTCATTTGAAATAAACTTTT
TTTCAACAATTTTATTTCAGAATCCATCCGACTTTTGCTGATGCATACTC
AAACATGGGGAATGCCTTGAAGGAAATGCAGGATATTCAAGGTGCAATCC
AGTGCTACACCAGAGCCATTCAAATAAATCCTGGTTTTGCAGATGCCCAT
AGTAATCTTGCATCAGTATACAAAGACTCAGGAAATATTGCTGAGGCTAT
TCAATCCTATAGAACTGCTCTTAAATTGAAACCAGAGTTTCCAGATGCTT
ATTGTAACCTTGCACATTGCTTACAAATAATTTGTGATTGGAATGATTAT
GATAATCGTATGAAAAAACTGTTAACAATAGTTGATGATCAACTTGGTAA
AAATCGATTGCCTTCAGTTCATCCGCACCACACCATGTTATATCCTTTGT
CCCCACAACAAAGAAAGGCTATTGCTAATCGTCATGGAAACCTTTGTCTT
GATAAGGTATGTAATGACTGGTTTTCAATAACTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000437_pilon:81510..88445- >XLOC_041563 ID=XLOC_041563|Name=XLOC_041563|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3240bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000437_pilon:81510..88445- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGATGGGCTCACCCAACGCTGAAGGCTCTGATGGTGATGGGCTCAC
CCAACGCTGAAGGCTCTGTACAAACAGTTTCCACACTGGCGCTTGCGGAA
GCTGCTCATCGAGAATACCAAGCTGGTAACTATGAAAGTGCTGAAAAACT
TTGTATGCAGTGGTGGAGAAGGGAGACTGATAGTACTGGATGCCTCTTAC
TTCTATCATCCATTCATTTTCAATGCAGAAGGCTGGACCAATCTGCACAA
TTCAGTCAACTTGCCATAAAACAGAACCCGATGCTTGCAGAAGCTTTCTC
CAATCTTGGGAATGTGTTGAAAGAAAAAGGCCAAGTTAAAGATGCACTCG
CAAATTACAGACATGCAGTCAAACTCAAACCAGATTTCATTGACGGCTAC
ATTAATCTTGCTGCTGCACTTGTTACTGCTGGTGATTTAGAGGGAGCTGT
GCAAGCTTATGCCACTGCCCTTAATTATAATCCTTACAAACAGTTTCCAC
ACTGGCGCTTGCGGAAGCTGCTCATCGAGAATACCAAGCTGGTAACTATG
AAAGTGCTGAAAAACTTTGTATGCAGTGGTGGAGAAGGGAGACTGATAGT
ACTGGATGCCTCTTACTTCTATCATCCATTCATTTTCAATGCAGAAGGCT
GGACCAATCTGCACAATTCAGTCAACTTGCCATAAAACAGAACCCGATGC
TTGCAGAAGCTTTCTCCAATCTTGGGAATGTGTTGAAAGAAAAAGGCCAA
GTTAAAGATGCACTCGCAAATTACAGACATGCAGTCAAACTCAAACCAGA
TTTCATTGACGGCTACATTAATCTTGCTGCTGCACTTGTTACTGCTGGTG
ATTTAGAGGGAGCTGTGCAAGCTTATGCCACTGCCCTTAATTATAATCCT
GAACTATATTGTGTACGAAGTGATCTTGGAAATCTACTGAAAGCACTTGG
TCGACTTGAAGAAGCTAAGGAACTATATTGTGTACGAAGTGATCTTGGAA
ATCTACTGAAAGCACTTGGTCGACTTGAAGAAGCTAAGGCATGTTATCTC
AAAGCCATTGAAACTCAACCAAACTTTGCTGTGGCTTGGAGCAACCTTGG
ATGTGTATTTAATGCTCAAGGGGAAATATGGCTTGCCATTCACCATTTTG
AGAAAGCATGTTATCTCAAAGCCATTGAAACTCAACCAAACTTTGCTGTG
GCTTGGAGCAACCTTGGATGTGTATTTAATGCTCAAGGGGAAATATGGCT
TGCCATTCACCATTTTGAGAAAGCTGTTCAAATTGACCAAAACTTTCTTG
ATGCCTACATAAATCTTGGCAATGTGCTCAAAGAAGCCAGAATATTTGAC
AGAGCTGTGACTGCCTACTTGCGTGCACTAACAATAAACCCAAATCATGC
TATTGTCCATGGAAATTTAGCATGTGTTTACTATGAGCAAGGGCTGTTCA
AATTGACCAAAACTTTCTTGATGCCTACATAAATCTTGGCAATGTGCTCA
AAGAAGCCAGAATATTTGACAGAGCTGTGACTGCCTACTTGCGTGCACTA
ACAATAAACCCAAATCATGCTATTGTCCATGGAAATTTAGCATGTGTTTA
CTATGAGCAAGGGCTCATTGATTTGGCAGTTGATACTTACAAAAGAGCTA
TTGAACTACAACCAAACTTCCCTGATGCTTACTGTAATTTGGCAAATGCT
CTTAAGGAACAAGGCAAAGTTGAAGAATCAGAGGAATGTTATAACACAGC
TCTAACCCTATGTCCATCACATGCAGACTCGTTAAATAATCTAGCAAACA
TCAAAAGGGAACAAGGCAAAATTGAAGATTCCATTGGATTGTACATGAAA
GCGCTACAGGCTCATTGATTTGGCAGTTGATACTTACAAAAGAGCTATTG
AACTACAACCAAACTTCCCTGATGCTTACTGTAATTTGGCAAATGCTCTT
AAGGAACAAGGCAAAGTTGAAGAATCAGAGGAATGTTATAACACAGCTCT
AACCCTATGTCCATCACATGCAGACTCGTTAAATAATCTAGCAAACATCA
AAAGGGAACAAGGCAAAATTGAAGATTCCATTGGATTGTACATGAAAGCG
CTACAGGTCTTTCCAGAGTTTGCTGCAGCCCACTCTAATTTAGCAAGTAT
TTTACAACAACAAGGAAAACTCCACGAAGCATTGATGCATTACAAAGATG
CAATAAGGTCTTTCCAGAGTTTGCTGCAGCCCACTCTAATTTAGCAAGTA
TTTTACAACAACAAGGAAAACTCCACGAAGCATTGATGCATTACAAAGAT
GCAATAAGAATCCATCCGACTTTTGCTGATGCATACTCAAACATGGGGAA
TGCCTTGAAGGAAATGCAGGATATTCAAGGTGCAATCCAGTGCTACACCA
GAGCCATTCAAATAAATCCTGGTTTTGCAGATGCCCATAGTAATCTTGCA
TCAGTATACAAAGACTCAGGAAATATTGCTGAGGCTATTCAATCCTATAG
AACTGCTCTTAAATTGAAACCAGAGTTTCCAGATGCTTATTGTAACCTTG
CACATTGCTTACAAATAATTTGTGATTGGAATGATTATGATAATCGTATG
AAAAAACTGTTAACAATAGTTGATGATCAACTTGGTAAAAATCGATTGCC
TTCAGTTCATCCGCACCACACCATGTTATATCCTTTGTCCCCACAACAAA
GAAAGGCTATTGCTAATCGTCATGGAAACCTTTGTCTTGATAAGGTATGT
AATGACTGGTTTTCAATAACTTGAAATCCATCCGACTTTTGCTGATGCAT
ACTCAAACATGGGGAATGCCTTGAAGGAAATGCAGGATATTCAAGGTGCA
ATCCAGTGCTACACCAGAGCCATTCAAATAAATCCTGGTTTTGCAGATGC
CCATAGTAATCTTGCATCAGTATACAAAGACTCAGGAAATATTGCTGAGG
CTATTCAATCCTATAGAACTGCTCTTAAATTGAAACCAGAGTTTCCAGAT
GCTTATTGTAACCTTGCACATTGCTTACAAATAATTTGTGATTGGAATGA
TTATGATAATCGTATGAAAAAACTGTTAACAATAGTTGATGATCAACTTG
GTAAAAATCGATTGCCTTCAGTTCATCCGCACCACACCATGTTATATCCT
TTGTCCCCACAACAAAGAAAGGCTATTGCTAATCGTCATGGAAACCTTTG
TCTTGATAAGGTATGTAATGACTGGTTTTCAATAACTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000437_pilon | genome | sc0000437_pilon:81510..88445 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1156-1620:466 |
| Aaloc | 1054-1152:931 |
| Aaloc | 808-1053:1298 |
| Aaloc | 637-804:1793 |
| Aaloc | 520-636:3172 |
| Aaloc | 451-519:3588 |
| Aaloc | 37-450:4174 |
| Aaloc | 1-33:6937 |
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