XLOC_041561 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041561
Unique NameXLOC_041561
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000014_pilon:679755..688855+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041561 ID=XLOC_041561|Name=XLOC_041561|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9101bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:679755..688855+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCAGCTATGTAACagtggatttttatttttatactcCCAATCAAAAGT ACAATCACTGCTAATTACAAAGGTATcagattttctttaattttctccct tcttttcaaacatgaaaaataacttaactttaaaatttgaaacccATCAG TGTTTTTCATCGAAATTCCCTCTTCGTATTTCACGCCTTCCATGAAAAAG AGCTGTTTTCAGAATCAACCAATCGAACCCACCTAAAAGGCAAGAATTTT TGGCAGAATAAAAATTTGGTGGTTTTGGCCAAAATGCGCCAAACTAAGTT CCCGCTAAATTAAATTtcctcataattttttttttttgttcatccTCTCA ATTTTACTCCCTTAAGGTATATCGATGTTTCGTTTATAAAttagggttgg aaaaatcagaaaatctcagCCTCAGAAAATCTCAGGAAGAAAGGGGAGTa aatcaactttttgaaatctggtcaaattagtcccgataagggtcggaaaa aaacaaaaattttcctaatttgtgtttttttattcacGCTAAAGGTAGGT TCGAAAGTCGGGTGGTTCGTACCCGTCAGCTCAGTACCCCTATTCCccct gtaaaaaaattcaaaccctGTAGAAGAAAGAATCCATTCAGCGCTACGAA CATTGGGGTGTTCGTTCTATAATTCTGAATCtcattgatttttttaactC ATACGTATTTCTTTTCAGGACTCTCCGATCGacaaagatttacaaaaatt aaaagaagtAGCATCAGTTGGTACGTTTCTTATTCACCAAGTACAGTTCT GAAATTCATAaactatttatttttgaattgacTTTGCATCCCCTTTTTGT CGCCAAATTTCTTGACTtgaatttctatatttttttaaatgcctcAGAAA ATAACGACAATAAAAAATcttaaagccagattgacattatgttttccgag 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CAAACATATTTCGCAAAgaagtaaattttgaaaatgtatgattttttaca tttttagtcTTAATGGACATTATGTTTGATTCCGACGGttgatatttttt aagaaaacttgccaagaaaattaaaaaatatataccttaAAGAGGTACTC GTGTACTATTTCATTTTGTTCTAGATTTACCGATTATTTTACAATGTAAA TCCCTTTATCTTTCAGCAATCCGTGTTAGCTTCATTATACAGTTCAGCTG GTTCAGTGTTAGAACGTCACCATTTCGCACAAGCAATGTGTATCGTTCAA ACGGAACACAACAATGTCTTCGAAAGCCTGTCAAGCACTGTAAGTGAATT ATGTTATCGTCGTGGTCTATCAGCTTAAAGCCCTATCCATATTACGGTCA AATAAAAGTCGAAAAGTGGGACACTAAACACCGTTGTCTCATCAGAAATT TTTTATCCTACCAAATAATGTAGTTAAActgaaaaaggaaaatcgttAAC GGGGATAGAACATCTATTTTTGAACAGGTAGGGATTCCACTTTAAAATCT ATGGTTTACAGTAAAACTTCGTCACttcttaaaaaatctttgtcacAGCT AAATTTCACTTTTCCAGAGTAACTTTACCTCTTTAAGGTAGTAATTTAAC CATATCACTAGCTCAAATTTACTTGCGGCTATGTCTCTTTGCATTTGATT TAAAACATGAATCAAACCGACTTTTCAGGATTACAAAAGAGCATTAGATT TGATGCAAAAGATGATCTTGGCCACTGATCTTGCCAACCATTTCAAGATT TCCAAGCAGTTGGACGAACTCGCTTCCAGTAAGTACGCTATAAAAAGCTT TGGATTTaaactttatgtttttttttctcgatagaATTGTTGAACTCATT AACATCTGAATCTCAACGAAGTTTATACTCAATCATATAGAGagcgattt 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000014_pilon:679755..688855+

>XLOC_041561 ID=XLOC_041561|Name=XLOC_041561|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3738bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:679755..688855+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCAGCTATGTAACagtggatttttatttttatactcCCAATCAAAAGT
ACAATCACTGCTAATTACAAAGTTTCAGCTATGTAACagtggatttttat
ttttatactcCCAATCAAAAGTACAATCACTGCTAATTACAAAGGACTCT
CCGATCGacaaagatttacaaaaattaaaagaagtAGCATCAGTTGGACT
CTCCGATCGacaaagatttacaaaaattaaaagaagtAGCATCAGTTGAC
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TCGCTAAAGTTTTTGACGGCATCGAATCGGAGAATTCTTCAGAAATACGT
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GTGTAGCTCAACTATGTAACAAATTAAATGGGAATTGTTTTACGAAATTC
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TGACGTTCCATATCACAATTGGACGCATGCGTGGACTGTGGCTCATTTCT
CATACACTTTATTAAAGAAAACAAACGCGTTGGACTACTTAAGTGATTTG
GAGGTGTTTGTCCTTCTGGTCTCTTGTTTATGTCATGATATTGATCACAG
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AGAGGGTATCGTGACGTTCCATATCACAATTGGACGCATGCGTGGACTGT
GGCTCATTTCTCATACACTTTATTAAAGAAAACAAACGCGTTGGACTACT
TAAGTGATTTGGAGGTGTTTGTCCTTCTGGTCTCTTGTTTATGTCATGAT
ATTGATCACAGAGGAACCAATAACTCTTTCCAAATATCATCGCAATCCGT
GTTAGCTTCATTATACAGTTCAGCTGGTTCAGTGTTAGAACGTCACCATT
TCGCACAAGCAATGTGTATCGTTCAAACGGAACACAACAATGTCTTCGAA
AGCCTGTCAAGCACTCAATCCGTGTTAGCTTCATTATACAGTTCAGCTGG
TTCAGTGTTAGAACGTCACCATTTCGCACAAGCAATGTGTATCGTTCAAA
CGGAACACAACAATGTCTTCGAAAGCCTGTCAAGCACTGATTACAAAAGA
GCATTAGATTTGATGCAAAAGATGATCTTGGCCACTGATCTTGCCAACCA
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GCATTAGATTTGATGCAAAAGATGATCTTGGCCACTGATCTTGCCAACCA
TTTCAAGATTTCCAAGCAGTTGGACGAACTCGCTTCCActGGAATACAAA
AAGACGAAGCAGCTCACCGTGAACTTTTGTTGTCATTATTCATGACGACT
TCTGATTTGTCAGATCAAACGAAACCTTGGGAGAGTGCTGTTAAAGTTTC
TGATTTGTTATACCAAGAATTCTTCTCACAAGGAGAAATGctGGAATACA
AAAAGACGAAGCAGCTCACCGTGAACTTTTGTTGTCATTATTCATGACGA
CTTCTGATTTGTCAGATCAAACGAAACCTTGGGAGAGTGCTGTTAAAGTT
TCTGATTTGTTATACCAAGAATTCTTCTCACAAGGAGAAATGGAAAAATC
ATTGGGCTATCAACCAGTTAAGATGATGGATAAGGATTTGGCAAGCATTC
CAGATCTTCAATATTCCTTCCTCAATAATATCGCATATCCTATTTATGAG
AAAAATCATTGGGCTATCAACCAGTTAAGATGATGGATAAGGATTTGGCA
AGCATTCCAGATCTTCAATATTCCTTCCTCAATAATATCGCATATCCTAT
TTATGAgAAACTGTCCCACTTCTTTCCAGAAACCAATTGCATCTTGGGTA
AtatcaaagaaaatcaaaaccaaTGGTCCAAAATTAAGGAGGGTTGAgAA
ACTGTCCCACTTCTTTCCAGAAACCAATTGCATCTTGGGTAAtatcaaag
aaaatcaaaaccaaTGGTCCAAAATTAAGGAGGGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041561XLOC_041561-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000014_pilongenomesc0000014_pilon:679755..688855 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1780-1869:9012
Aaloc1672-1776:8558
Aaloc1522-1671:7782
Aaloc1420-1518:7379
Aaloc1297-1419:6867
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Aaloc1015-1083:5903
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Aaloc661-693:3830
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Aaloc127-225:1270
Aaloc73-123:719
Aaloc1-72:1