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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000076_pilon:244327..251072- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041453 ID=XLOC_041453|Name=XLOC_041453|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6746bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:244327..251072- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACTTTTTTTAAAAGTATTGGGTGGTCAAGAACTAACTTATACTGT
AAGTATATTACTAGACCATCCCAGAAAATTTTTGTTATATATATACCCCC
TGCATTTTTTAATTTTATCCAAACGGTGTCAATCAACAACTTCAAACAAA
AATCACAATAGACCTCTTTTTAAGGAATGAGGCCACCCTGTTGAATAATT
ATGTAGTCCAGCAAAAAAAATAATGATATAGCCAAGCATAATTATTATAA
TATGCATGAAACAGTAATTATGCATGGCTGTGTATTTTATGCTGGACTAC
ATAATTATATTCAACAGGGTTGCCTAGCCTCTTTAAAAAAAGGTCTATCG
AGAACCAATCGAATGTAGCTAATCGAATGAGACCAAATAACTGCGATTCG
ATTATCAAATGCAATCGAATCTCAATCCATCGGCCGATTCTTGGGTAATA
TTCGATTGTGTTTGATTGCGTTTGAGTAACGTTCGATTGGGTTCGATTGA
TCGTAAATTACCTTCGATTGATCTTCAATTATGTTTGATTACCATTATGT
TCGATAAGTTTGATTGCGATTAGATCAAATTTGATCATTCCTTTAGAGCT
TTTTCAGCGTGGACGACCGAATCATAACTTCTTTTCTTCTTGATAAATTT
TTGTGAAATATTCAGGAGAGATCCATAAAATTATCATTGATACCATGTTC
AAATATCTAAATCATTCTCTTTAAAGGAAAGAAAACAATTGACAATGTTT
ACATTCCTCTAACCTTCCACAGTACTAAAGTGCCCATTTTTACCTACTGT
TTTCACGGTGGAACACAGTGGAGATAGCGAGACTTCTAAATGGTGTATTG
ATTCCGCATTTGATTTGTTCAATTGACACTGTCTGGTCGAACCGATCAAA
TGTGGCTAATCGAACACGATCAAATAAAATTATTATCAAACGCAATCAAA
TCTTAATCGATTGGCAGATTCCTGGGTAATATTCAATTTGTGTTCAATTG
AGTTCGAATTACATTTGATTGAGTTCGAATTACATTTGATTGAGTTCGAA
TTACGTTTGATTGTGATTCCTTAATGTTCAATTAGTTTTGACAGCTGAAA
ATATTCTTAAAAATTATTAAACAAGGGGGTCCTAATAAGGTCCCAGGGGG
TTGGAAAATTTTCAAAAAATTAACAAGAGGGGGGGCATTTACTTGGAACC
TAAGAGTAAATCTTCCTCTAGAGCTTCATAGCTTAAGCGTGGGGTGACCG
GGCGAGCACTAAAATATGCCGTTGGAAAATCAGATAATGGTGCAAGCGAA
TGCAATTGAATCAATCGAAACGTAATTGTGCATAATTGAATACAATTGAA
CGTAATGGAACAGCAAATCCTGGGTAATATTCTATTACAATTCGATTGCG
ATCGCATTCAATTGAATAAATGTTTGACTTGTCAGATTGACACCGATTAC
AGGACTAATCAAACTTTGTCATGAGAACTTAATCGAACAATAAAAGTTTG
ATTAAATTATTTATATATATAATCGAACTTTGACTTTTTGAACTTTTGGT
GAACTTATAGTATTTGGGTAAAATGAACATTTCTCATCAACTCAACCGTC
AACTTTTTTTTAAATCTGAAAATCCTGTGATGCGAGGGATGTTTTAAATG
ACATCACTGCAAAAGAGACCATGACTATTGAACTTTCACTGTTAGAGCGC
ACTTTCTGATTTTTGTGTTCTATCAACATGGCCGAATTAGAGAGCTCCCA
TATTATCAAACTGATCGAACCCCAACTAGTGATCAAATCCTGAAATTTAA
ATCCAACAATCACAGTAGTTGGCTCTGGATGGCTCCCGGTTTCTATGGTC
CAATAACGAATAAAATGAGAAAGTCATGGTCAAAATTTAGAATGGAGAAG
CACACTTTATTTTTTTATGGTCGTTTTATGGAATGACGTTTTCCTTACTT
TATTTAAATCTTCCTTCACTATTCAAGGTTTGCTGGCAAAAATAATGGCA
TCCTATATATATAGCTGCAGTCTTGAGGTTTGAAGATGACAAAAAAATTA
TTTTGTTTTAAAAATTTACTGCACCTGCATAGCTAATCTTGATCACAGAT
CAGATCAAAGGTTCAATAACTTTACCAGCTCACACGATTCCTTTGAATCA
AGCTAATCGAATTTAATGAAACTTAAAGCAGCTTGTATGTACAGCTAATC
AAGTCCCATTCTGGTTGAAATTGTGTTAGTACAATAGTTTAATTAGGCAA
ACCTTGAAGAATCTAGAAATTACTGATGATAATTATCTAGCAGGGGTCAA
AATATCTTAAAGGAAAACAAAAGTGTTATGTTTTAGTTATAAACTTATCT
ATTTCAGCTCCATTGTTTTAGTAAGTGGAATCAGCAAATTAACAACATCA
AATGAATAATTTATAATTTGATTGATTTAACAAGATTTCATTGAGGGCTT
TTCCAGAAAAAATTTGTACCCCCTTTGTTAAGGTCTTTTTTTAAAAAGGT
GACCCCCTGGATTTTTTTCCAATTTTTCAGAACCCCCTTGGATTTTTTTC
TCCCATTCTTTTGGACCACCCTGGATTTTCGACCTCGTGATACTGACAAC
CCTGGATTTTCAACCCGATTTTACTGACCAACCTGGATTTTTTCATTCAA
AAACCCAGACCACCCTGGATTTTTTATTTTCCAGACCACCTTGGACGTCA
CACCTCCTCAACATAGGGGGTACAGACTATTTCTGAAATAGCCCAATAGT
AATTCGTTTGTATTTAGAAGCTCTTTTTTTTTTTAAAGTACGATGACAGT
ACAACCACGGTAAACGAAGTAAAGAAATTCCTTGTAACCAAATTGAATAA
ACCTCTCTCTCAAATCAAACTGGTCTACAAAGGAAAGACTTTAGCAGGTA
AACTACATGTTTTTTTATAAAAACATGGTTTCCTCCAGGTTTTCAGGTTC
TTCCCATCTGGGGCCTAAAACCCCCATTTGGTCTTCTTCCCCCACCTACC
CTCCCCCCATTGGAAAAATATTTTTGTGACCTAACGATTTGCCAGATTTT
GCATAAAAACTTAATAAAAATAAGAATTTCCTGCAATGAACATACAAATG
CTGGAAATAGACACATTTAATCATCTATTTGAAATATTATATCTAATTTC
TGCAGTTTCCACAATGCTCACAGAATGGTGAAAATAAGAAAATTTCTAGG
ACTACATAAAAATTAAGAACAATGGAAGGCTTGAAAATTTTTATAATGAA
ATAATGTGCACAATTTAGTAAAATGTAATGAATGGCGACCATATTTTATA
AAACTGCACTTTTAGGGCAATACAGTAGCATCAAACATTCAACAATTCTT
GTAAACATAAAAACAGAAAATATCGTTAACAGAGGTTCTGCTTTGTTTTT
GTTTTTGTTTTTGCCAGCCTGGTAGATTTAAGTTGACTCTAGATTCTAGG
TCAGTGGATTGTTAGCAATCCCCGTGTATTGATTAGCATGAATAGACTGG
CAAAATTTGCCGTTTGCAGGGGCTAAATAAGAGCCCCCTTTAAAGTGTTT
CAGATTTTCATTCAAGATTCATGTGAAGGGGGCAACTGTTACCCTATGAT
AGCATGTAGTAACTACCTTTTTGATGAAATGAAGAGGGATGGGTGTACCT
TATCGGGGAAAACTTCGTTGGGGAAAAGTGACGAAATTTTCGACAAGTGA
CGAATATTTTTCCCTGATGAAAATTTTCCCAGGCTTTAATGCGTTTACCA
ACTACCAGCAAGTGACGAATTTTTCCCCGACGAAAATTTTCACCGACGAA
AATTTTCCCCGACGAAGTTTTCCCCGATAAGGTATTCATTTTCTGAAAAC
TTTATCAAGAATAACATTATCAAAAGTATCTCAAAATGATTTTGAAATAA
TTATTATTATTAAAGGATATACAGTCCAGGCACACTATGCTAGGGCCTCT
AAACCTGTCTATCTACATAATATTTACAAAAGTGATCTTGAATCGTAACG
TAACGGATGCTTTACCCATGCCTGATCTTTTTGCCAAAACCTATTTTTGA
AAAGGATTTTCATGGCTATATGACGTGCTGTTATTCTTTCAGCTGAGAAA
AGACTTTCTGATTACAATATACAAGATCAGGCTAAGCTACACGTAGCAGT
CAAGAAAACACTGATCAGTTCATCTCTAAAGGAAGAACAAGTCACTCCCA
CGAAACCAAAATACAAACCAGAAGAATTGTGGTCTAAACTTTCAGAGGTT
CTTGCAAAGAATTATGGTCCAGATGAATCAGCAGTCATTATGATGCAATT
TCGAAAGGTTTGATATGGTTTGAAGCTCTACTAGTCATGTATTACAAAGT
GTGATACTTTTGGGGTAAAGTACGTTGGGAAAATTGAGGGATATACTCTC
GGGTACCTAATAGCTGGAGGGCCCGCTTATTAATTTTTCAAAAATTTTCC
ATCCAGGACATTCTTATTCCAAACCCCCCCCCCCCCCGGCTTATTGATTT
TTGGGAAAATTTTTTTGAAAGTTTCCTCTTTTGCCCTAATTCTGCTGTAT
TAGCCTCCTTTTCGAAAATTGTCCACCCAGGACATTTTTATTCCAACCCC
CCTGCTTTGCTTATTAAGTTTTGAGATTTTTTCCAAACCCCCGGCTATTA
GGTACCCAAGAGTATATAGTGGTAGAGATTTTGATGAGCAAATATTCTCC
AGATGAATCAACTCCAACATTTAACTTTCTTGATATGTATGATGACACAA
TTCAAAAAAATTGTTTTTGATCCGAACCATTGAAATAATTTCAGTGAAAT
TTTAAGGCTAAAGAGTTAGATGGAGGGGAGTAAAGTGAAATTTACTTATT
TTCAAGTTTTTGTAAGGAAATAAATTAGATATTTTCTGCCTATTTTAAGG
TATGTGTTCACCTTTCTTGACACATTCTCTTTAATTGATCATATCTTTAG
AACAACAAATTTTTATATATCAAAAGTATATATTTTCTGAAAGCCAATAA
TATTCTCTTTCTAATGGTAAAAGTTTCAGCTGAATTTAAAAAACTGGGCA
GGATATAATTAAAATCTTAAGAATTTTAACCTTACCTACTTCAAAGAAGT
TTAAAGTCACCCATAGCTTTTGAATTTTGAAAAAATAATTTCGATTCTAA
ATTCTGTAAAAATATCGATAAAAAAGTAAATTTAAATGTGATTTTTTTCA
GTTATCTGTAAATTGAGGAAAAACAACTCGGTTAGAAATAAAATCCTAAG
ACACTTTTTAAGTTTGATCTTTTGGGAATCTCATAAAAAAAGAATGAAGT
CGATATCTAAATGCTATGGGTGACTTTAACTTCGTTAAAATAGTATGTGG
TAAAATTTCGTTTTTTTCTACATCAATTTGAAATTTTTAACGAGATGATT
GCTGTTTATTTGAGTAATCAGTGAAATGTGTCAAAAATTTTACTATTCAA
TAGAGGTGAGAATAAACATCAGCTGAATTCTCTCTTTTGTCTTTGTTGTT
TCCGAAAGGGACAATTATTTGAGTAAATAATCCATCATAAGACGAACTTT
GTTTTGAAATTTAAATGGTTATAACTCTGGAACAAAAAAAGATTTTAAGA
TCGCGATTTTACCAAAACGAAATCCAGTAACTTTTCTTCCACTTTGACTA
AAAAAATTTTTTTGACAAAAAATCGGAAAAAGGTGTACACATACATACCT
TAAACTTTCCTTTTTATACAAGACAGTATGACACTTACTACCGTGTTGGT
ATTGTATTCAGAAGTTATGAAAACAGTTACTACACAGTGTAGTAACTGCT
GTTTGGGGGTGGTGCCAAACACTAAAACGAATTTTAAAGAACTTTCAAAA
ATTTTCAAAAAAAATGAATTTTTTTGTGAAAAAATTCTTTGTTAAAAAAA
ATATTTTTGTTATAAATAGACGAAAAAAAATTTGAAATTTTTCTCATCCA
ACTTTGAAATTATGCTTTCCCTAATTATCATTAAAATGCTGTAAAATGTT
CTCAACAGCTGTTAACCAAGTTAATTAGAAGAAAATCTAGCACGAAAATG
GCTTTAGGTTGAGAAATAATCGCAATTTAGGGTAATTTCGAGCATGTTTT
TGATGATATCACTCAAAAACAGGGGTGGTACCTGGAAATCTTTTCTGAAA
ACAGTTACTACCAAGGTGTAGTAACTGCAAAGGGTGGTGAAAAAAGTGTT
GAAAAAGCACTTACTACACTACACATCACGTCTTGTAGTAACTGCGTGTC
CCCCCTGTTTTATGTAATATCATTCATAAATTACAATAGTATTATTATTA
ATATTTTCACAATTTTGAATGCTGCAGTAAAAAGATAATGAATCATAGAT
ATCTTATATAAAACACTAGATAGAGCTACTCTGTATTTCCAAAGCAACGG
CAAGTGAAGCAAAATAATACGTCATCTTTACTGAAAGTAGGTCAGTAGGT
CACAGTTCAGTACCGGCAATTTGTTCAACCAAGCAAAAAAAACTGAATGA
CGCGAAGCGACGAGGCGAAAGGTAGACTTGATCAATCAAATTGTCGGCAC
CGAACTATGGTCTATTTATCAAAGATGGCAGATTATTCTGATTCAAACAG
GGACGGAGTAGCTCTGTCTTGTATAAGATATCTGTGTAATGAATCTGAAA
AATGATTTCTTTTCTTGCCAGGATTATGAGTGTATGTTGAAAACATTGAG
TCTGGATGATATTGAAAGGATAGCAGAAAAGAATCTAACAACTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000076_pilon:244327..251072- >XLOC_041453 ID=XLOC_041453|Name=XLOC_041453|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:244327..251072- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACTTTTTTTAAAAGTATTGGGTGGTCAAGAACTAACTTATACTAT
GAAACTTTTTTTAAAAGTATTGGGTGGTCAAGAACTAACTTATACTTACG
ATGACAGTACAACCACGGTAAACGAAGTAAAGAAATTCCTTGTAACCAAA
TTGAATAAACCTCTCTCTCAAATCAAACTGGTCTACAAAGGAAAGACTTT
AGCAGTACGATGACAGTACAACCACGGTAAACGAAGTAAAGAAATTCCTT
GTAACCAAATTGAATAAACCTCTCTCTCAAATCAAACTGGTCTACAAAGG
AAAGACTTTAGCAGCTGAGAAAAGACTTTCTGATTACAATATACAAGATC
AGGCTAAGCTACACGTAGCAGTCAAGAAAACACTGATCAGTTCATCTCTA
AAGGAAGAACAAGTCACTCCCACGAAACCAAAATACAAACCAGAAGAATT
GTGGTCTAAACTTTCAGAGGTTCTTGCAAAGAATTATGGTCCAGATGAAT
CAGCAGTCATTATGATGCAATTTCGAAAGCTGAGAAAAGACTTTCTGATT
ACAATATACAAGATCAGGCTAAGCTACACGTAGCAGTCAAGAAAACACTG
ATCAGTTCATCTCTAAAGGAAGAACAAGTCACTCCCACGAAACCAAAATA
CAAACCAGAAGAATTGTGGTCTAAACTTTCAGAGGTTCTTGCAAAGAATT
ATGGTCCAGATGAATCAGCAGTCATTATGATGCAATTTCGAAAGGATTAT
GAGTGTATGTTGAAAACATTGAGTCTGGATGATATTGAAAGGATAGCAGA
AAAGAATCTAACAACTTGAGATTATGAGTGTATGTTGAAAACATTGAGTC
TGGATGATATTGAAAGGATAGCAGAAAAGAATCTAACAACTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000076_pilon | genome | sc0000076_pilon:244327..251072 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 373-447:76 |
| Aaloc | 160-372:2653 |
| Aaloc | 49-156:3959 |
| Aaloc | 1-48:6747 |
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