XLOC_041446 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041446
Unique NameXLOC_041446
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041446 ID=XLOC_041446|Name=XLOC_041446|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9825bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+

>XLOC_041446 ID=XLOC_041446|Name=XLOC_041446|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1326bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGGCACCTATAGTTTTTGCGTATTGGAAAATTCGCGGGatGGCACCTAT
AGTTTTTGCGTATTGGAAAATTCGCGGGCTTGCTCAAAGCATCAGACTGT
TGCTTGGTTACACGAAAACCGACTTTGAAGACAAACATTATGAATGTGGA
GAGGCTCCAACGTTCGATCGTTCATGTTGGTATAATGTCAAAGAAACTTT
AGGCTTCGATTTTCCAAATCTTGCTCAAAGCATCAGACTGTTGCTTGGTT
ACACGAAAACCGACTTTGAAGACAAACATTATGAATGTGGAGAGGCTCCA
ACGTTCGATCGTTCATGTTGGTATAATGTCAAAGAAACTTTAGGCTTCGA
TTTTCCAAATCTTCCATATTTGATTGACGGTGATGTCAAAATAACACAAT
CAAATGCTCTTCCATATTTGATTGACGGTGATGTCAAAATAACACAATCA
AATGCTATTCATCGTTATATTGCAAGGAAAAATGGGATGGATTCATCGTT
ATATTGCAAGGAAAAATGGGATGGTTGGCGAAACAGATGAAGAAAGATTA
CAAATTGATATCTTAGAAAACCAGTTGGCGAAACAGATGAAGAAAGATTA
CAAATTGATATCTTAGAAAACCAGCTGATGGATTTCAGAAACGATTTTGT
GATGATGTTATATTTCACCCCACCTGACCTTTACGAGCTGATGGATTTCA
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GAGCAAGTATCTTGGTGACAAAACATTCTTTGTTGGAAAGAAGAACAAAC
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CTTCATCATTTACGAGCTTTTGGATCAGCACAAATTATTCGAAATATCAA
TGTTCGAAGATTGCCAAAATCTACTGcTCACTTTTGTCGACTTCATCATT
TACGAGCTTTTGGATCAGCACAAATTATTCGAAATATCAATGTTCGAAGA
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GGTTCGAGAACATTCCTGAAATCATGGAGTTTATGTCATCAGAGAAATTC
TTCAAAGGACCAATCAATAACAAAGATGCTTTGTTTAAATGAAACATTCC
TGAAATCATGGAGTTTATGTCATCAGAGAAATTCTTCAAAGGACCAATCA
ATAACAAAGATGCTTTGTTTAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041446XLOC_041446-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000003_pilongenomesc0000003_pilon:2164205..2174029 +
Properties
Property NameValue
Aaloc580-663:9742
Aaloc559-579:9160
Aaloc469-558:8368
Aaloc376-468:6410
Aaloc313-375:4513
Aaloc265-312:3464
Aaloc229-261:3212
Aaloc181-228:2262
Aaloc40-180:799
Aaloc1-39:1