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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041446 ID=XLOC_041446|Name=XLOC_041446|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9825bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atGGCACCTATAGTTTTTGCGTATTGGAAAATTCGCGGGGttagtagttt
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ATTAGGTGGCATAAGTTCAGTGAGACCATGAGGGCCCAAGGGAGGAAATT
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TAAAAGAGTTATCGCGGGAGGGGGGACTAAACACcccctagccccccccc
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TAATGCGAAATAAATTGACTAAATCTTTTTTCCCACACTACAAGAATTCC
TTTTGTCTTTCATTTCTTCTTCGTCGTGGTCAAGAAGTTTATTGCAGACC
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AAATCTGTCactaattcaaaattttataactaTCTCTAATTCTTTTGTAT
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CGATCCTTTAAAAATAGAGATTGAGACCCACCAGGCTATGAAAGGGAACT
TCTAGATTTATAGATTCAAGCGTACTTTCATATTTTCGAGAACACACTAA
AACCTGCGAAAGAAATTGTCTATTTCGTTAGGCCAAGAAAGCTTCTCAGA
AGATCAAAGGTCAGCACATGATCTGTACTGAAAATCAATGACTTGAATAG
CCTAAAAATCTAAGCCAAATCGATTCAGTTATTTGGTAAAATCTGTTGGT
AAGTTGTAACTTTTTCAAGGCAAATTTAAAATTGCGTACATCATTAAAAT
CATTAAAGCGCCAAAAACACTATATTGCCGTTAGCTGTATCTtggccttg
taaaaactggcttggaTAACCGGGCTATGACTGGAATAGCTTGCCGGCAA
TTCAATCCCTGATTCCCATATGAGAATCATTTTCTTTCTAGAACATTCCT
GAAATCATGGAGTTTATGTCATCAGAGAAATTCTTCAAAGGACCAATCAA
TAACAAAGATGCTTTGTTTAAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+ >XLOC_041446 ID=XLOC_041446|Name=XLOC_041446|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1326bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:2164205..2174029+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atGGCACCTATAGTTTTTGCGTATTGGAAAATTCGCGGGatGGCACCTAT AGTTTTTGCGTATTGGAAAATTCGCGGGCTTGCTCAAAGCATCAGACTGT TGCTTGGTTACACGAAAACCGACTTTGAAGACAAACATTATGAATGTGGA GAGGCTCCAACGTTCGATCGTTCATGTTGGTATAATGTCAAAGAAACTTT AGGCTTCGATTTTCCAAATCTTGCTCAAAGCATCAGACTGTTGCTTGGTT ACACGAAAACCGACTTTGAAGACAAACATTATGAATGTGGAGAGGCTCCA ACGTTCGATCGTTCATGTTGGTATAATGTCAAAGAAACTTTAGGCTTCGA TTTTCCAAATCTTCCATATTTGATTGACGGTGATGTCAAAATAACACAAT CAAATGCTCTTCCATATTTGATTGACGGTGATGTCAAAATAACACAATCA AATGCTATTCATCGTTATATTGCAAGGAAAAATGGGATGGATTCATCGTT ATATTGCAAGGAAAAATGGGATGGTTGGCGAAACAGATGAAGAAAGATTA CAAATTGATATCTTAGAAAACCAGTTGGCGAAACAGATGAAGAAAGATTA CAAATTGATATCTTAGAAAACCAGCTGATGGATTTCAGAAACGATTTTGT GATGATGTTATATTTCACCCCACCTGACCTTTACGAGCTGATGGATTTCA GAAACGATTTTGTGATGATGTTATATTTCACCCCACCTGACCTTTACGAG AACAAACGACAAGAGTATATCAAacgaaacaaaatatttcttggaagaTT GAGCAAGTATCTTGGTGACAAAACATTCTTTGTTGGAAAGAAGAACAAAC GACAAGAGTATATCAAacgaaacaaaatatttcttggaagaTTGAGCAAG TATCTTGGTGACAAAACATTCTTTGTTGGAAAGAAGcTCACTTTTGTCGA CTTCATCATTTACGAGCTTTTGGATCAGCACAAATTATTCGAAATATCAA TGTTCGAAGATTGCCAAAATCTACTGcTCACTTTTGTCGACTTCATCATT TACGAGCTTTTGGATCAGCACAAATTATTCGAAATATCAATGTTCGAAGA TTGCCAAAATCTACTGGACTTTGTTTCAAGGTTCGAGGACTTTGTTTCAA GGTTCGAGAACATTCCTGAAATCATGGAGTTTATGTCATCAGAGAAATTC TTCAAAGGACCAATCAATAACAAAGATGCTTTGTTTAAATGAAACATTCC TGAAATCATGGAGTTTATGTCATCAGAGAAATTCTTCAAAGGACCAATCA ATAACAAAGATGCTTTGTTTAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000003_pilon | genome | sc0000003_pilon:2164205..2174029 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 580-663:9742 |
| Aaloc | 559-579:9160 |
| Aaloc | 469-558:8368 |
| Aaloc | 376-468:6410 |
| Aaloc | 313-375:4513 |
| Aaloc | 265-312:3464 |
| Aaloc | 229-261:3212 |
| Aaloc | 181-228:2262 |
| Aaloc | 40-180:799 |
| Aaloc | 1-39:1 |
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