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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000119_pilon:70980..75461- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041436 ID=XLOC_041436|Name=XLOC_041436|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4482bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:70980..75461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGGCCATTATGATTTCATACCAATGGGATAGCCAACCAGAAGCAAT
CCGAATCAAAGATGCTCTAGAAGCTGATGGATATGACGTTTGGATGGATT
TGGATGATATGAGGGGAAATATTTACCAAAAGATGGCTGAAGGTGATTAC
TAGATAGACGTTTTTTTATAAGAACAAACTACATAAGAACATAAGGCTTC
GATGGCCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGAGGA
CCCTAAAACACAAAATTTCTTAAGACAATAGACACGAATACCCTCAAAAT
GGTGAAAATAAGAACATTTTAAAAATACTTTTAGGCTAAAAACTCAAAAA
GTTAAGAACATCCAAAAAACTTTGCATGTTCTTATACAAGAAAAACGTGT
AGATGATTTGATCGAAAGTTCAGAATGAATTGGGAATGAAATTTTGGAGG
AGTTCATTGGTTTCTAGGCTATTTTCTTTGCTATATTTAAATATTTTTGG
ATTCTGAGATCCTCTCCTTGTCTCGTGCCAAAGCCTAAGATTAACTTTAC
ATTCCAGAAGTAAAATAGAGAAATTCAAAAATCATTTAGTAGTCCTTTTT
TATCGAATATTATCATTTTGAGAACATCCTTGAATGATGCGAATACAGGG
CTAGGTCGCGATATATGTGTGTCTGAAAATGTCGTTGCTTTTCACGTCTA
ATGGAATAAATTGACGTACGGCAAGTGAGAATTGTCATGTATGAAATCGG
CAATTTCTCTCTCAATACGAAAATTTCATACTATCATACTACAGTCAGTA
AAACATAACGGGATAATGCTCTTCCACATGCTATGATTGTGTTACGTTAT
TGTATAAAATCATTGATTGAACGTTAACATAAACTGTCTCTTCTATACTA
TACAGAAAATCAGCGATATCCCCGTGGCTGAATTTCTTGGGGCGAATGGG
GCAATGTGTGGCGAGTTGTGGCAATAATATCAGCCACGGGGATATCGCTG
ATTTTCTGTATAGTATAGAAGAGACAGTTTATGTTAACGTTCAATCAATG
ATTTTATACAATAACGTAACACAATCATAGCATGTGGAAGAGCATTATCC
CGTTATGTTTTACTGACTGTAGTATGATAGTATGAAATTTTCGTATTGAG
AGAGAAATTGCCGATTTCATACATGACAATTCTCACTTGCCGTACGTAAG
TTTATTCCATTAGACGTGAAAAGCAACGACATTTTCAGACACACATATAT
CGCGACCTAGCCGAATACAGGGTGTCCCTAATTAAAGTATCGAGTTTGAA
CATGCGATTGAGTAGAAAAGTTTGTGTGTGTTATCGCTAAAATATAAGAA
CGTTCTCCATCACACAGGCTTATTACAAAAGGTAGTTACAACGTATAAAT
TAATCGTAATGACAAAGAAAAAAGAGGGAGAGCTTAAAATACAATTTTGT
GAACACGCACATAAACTTTCTACTCATAGTTGTGTTTCGACTCGATACTT
TAATTAGGGACACCCTGTAGTATGTTAAAGATTCCAGAAAACACGCCCTA
GTATTGAGAATGCAGAATGTAAGGAATGACTGTTTATTTTTTTCAGAGTC
TATTAGTTGCCTATCAGCTGTGTTTTAAACATTCTTTTATTTGAATTCTC
TATTGATAAACATCTTTTGTTAAAGTTTCTATTATGTTTAAACCTATAAA
TAAGCAATTCCCGGTGGGGCTTCCTAGTGGCTGCCTATATCAGAGTCTAT
AGACCAAGAGTAAGGCCTAAGAGCCTTGAGCTGTCTATTGTGTAGACTAA
TTAGTTGACGGATATGCCTACGATTTTCCTATTTTTCCGACCCTTAGTAG
GACTGAAATTTGATTTTCTGATTTTTCCGACCCTTAGCAGGACTTTGGAA
GTATAAGGTACCCTTAAGGGTGGCACATACCATACCCTCCATTTGCCTAA
GTAACCCCCCCTGGGTCTCCTTGATTTGAAAAACTTACAAGATTCGTTAC
ATTTTCTTCACAGGTGTTGAGAATGCTGCTGTGATTCTAGTATGCATGTC
AACCAAATATGAAAATTCGGTCAATTGTAATCGAGAATTGCAATTTTCTC
AAGACAAACGAAAACAACTGATTCCCATCATGATCGAAGCTGGATACAGA
CCAGGTAAAGTTATATCATGGGCCTCGTCAACAGGAGGGGGTGGGGGCGT
GGGGCGTGCCCCTCCCCTTTTTTGCAGACCCTGCCATATATTTTTTTAAA
GTTACTATTTTAAGCTGGTTTGAGATTTATGTACATTAGAACAATAAAAC
TATTATTATCCCCAATTAGGTAACGTTTTAAGGTGTTTTGAGGGTGTAAA
AAGTGAAAAATTTTCTCTGTTGCCCACCAGGGTCGCGATATTTTTTCCCA
GAATATTGCCCCCCCCCCCTTCAACTCAAAATGGCTCGCCGGGGCCCATG
AATATCTTGATAAAACAACCCTGTATCATTGAGTGACCCAATAAGAGTTG
TTTGTCAAACTAATGATAAGATGAAGAGGTAAATGGAAAGGAGTTGTCTT
TAAAATGACTTGTCTTTATTAAGAGGCAATTTAAAAAAGCTATTCACTGG
GGCAACCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTAAA
TGGACGTTAGATAAACGTCGAAAAAACGTTGTGTGCCTGCTGGGAAGTCT
TTTACCGATTTTTCTCGTAAGTAGAGGGTCTCAAAAGACGTTTTAAATTC
CTGTAAACCCCTGGTACATAACTCTAACCTACTTAGGACCTTTGCAGATG
CGAAAGCTAGTATATGGAAATTTTCTTTGATACCTTTTCTCTAGCTGTCT
ACCCGAAGGTAGGGGAGGGCGCCACTACTTTCCCTGGATTCCTCCATTTA
CCCTTGATCCGTCTCTATAGTTGCTGAGCATCAAGCAGAGAGGCATCAAA
TACCATTATGGGAATCTTTGGTATGACCCGGCTGGGAATCGAACCCACAA
CTTTGGGCACCGTAGCTGGATGCTCTACCACTACACTACACGGTCGTTTA
ACATTGCACTATGGTCGATTTGCTATATGTGAAAGCTAGTACTCTGACTT
TCTTTGATACCAATTTTTGTCCTGGTTTCTCAAATACTTACAAGACTGAT
TTAAATTGTTATTTCAGGTGGTGCTCTTGGTTTGATCATTGCTGGTCTTA
AATATGTCGACTTCAGCAACCCTGGTGATTTTGACGATAAGATGGTGGAA
CTTAGAGATGAAATTACTCATTACTGCAAACCAACACTACAGCCAACGGA
ATCTGCTCCAAAAGCCGCTTCGGAAACAGCCACAACAGGTAAGGGGTATA
TTTAGCCTATACGTCCATTAGCCATGTATTATGCTTAGAACTTCGGTTCT
TTCAGCACTCTATAGACTCGGTTGAGGAGCAAGCTCTGCCTCTCCGTTCA
CCACAAGCGATTATGTGAAGCTCAACACTTAGTGTTTTGAGCACTCTGGT
GAGCAGTCTATGCTCGGTTTCTGAGCCGGCACTGGTGAGTTCTGGGAAAG
AAATGTTCTCACCAGGGGAGACTTTTTAACCGGTTATAGTGGAGTTTTTA
TAGTACAGCAGTCTTTTTAATTAATTCAAAACTTCGGTTTTCCTCTTTTC
AATCTTTGCCATTGTTTATTGGTTACCAGTCCTGCCTACTTCATTGATGA
AATATTTTAGATAAGGAACTGAAAGATTAATGATTCATTTTTAAGGTGAT
TATAACATGAAGCTTGGAGTTGTGGAAGCCAGAGCCGAGTCTTGGGATGG
TGCTGCGACTGCATTAGTGGATAAATTGAGGAGCCGTAAACTGAAACGCG
GTCAAGTAGTATCTGTCTCCGCTCACAATAATGGTAAAAACGAGAATGCC
ATTTTCTCAGCTTTCTATGATATTAATGCCCCTGGTCAAGGAGATTTGGA
GATTCATTTTGATTCACAGAACTCATCATCATCATGGTCAACTATTTACC
AGACAGCCTGTGAACAAGCTGCTACAGTTAAGTTGAATGATATTATTGGT
ATATCTGGCTCTTGCAATATGGATCGTGCTGTTTTTTATGTATTCTCACA
AGTTCCAAGTCCTGTATCCGATTCCGCTACAGTTGAATACGTTGAAAGCA
GAGCAGATACTTGGGAAGAAGCTGCAGATGGAATTATAGGCCAATTAGAA
GCAAACGGTGTCTCAAATGGTCAAGTCTTAAACATAGATGCTCACAACAA
CGGTGAAGGAGAAGCTGCCATCTTTAGTGCTCACTACAGCAAAGATCTTC
CTGGCAAAGGTCCATTGTCAATCTCATACAAGGCACATAATGGAAGCTCA
GCTTGGGCTACTTTTTATCAGAATTGCTGTAACCAAGCTTCCAAATTGAA
GCGAAATGTATTTATTTCTATTACAGCTTCCATTAATACACCTGAAACGA
GCGTCATGTATATGTTCTATTATGATAATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:70980..75461- >XLOC_041436 ID=XLOC_041436|Name=XLOC_041436|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2382bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:70980..75461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGGCCATTATGATTTCATACCAATGGGATAGCCAACCAGAAGCAAT
CCGAATCAAAGATGCTCTAGAAGCTGATGGATATGACGTTTGGATGGATT
TGGATGATATGAGGGGAAATATTTACCAAAAGATGGCTGAAGATGTCGGC
CATTATGATTTCATACCAATGGGATAGCCAACCAGAAGCAATCCGAATCA
AAGATGCTCTAGAAGCTGATGGATATGACGTTTGGATGGATTTGGATGAT
ATGAGGGGAAATATTTACCAAAAGATGGCTGAAGGTGTTGAGAATGCTGC
TGTGATTCTAGTATGCATGTCAACCAAATATGAAAATTCGGTCAATTGTA
ATCGAGAATTGCAATTTTCTCAAGACAAACGAAAACAACTGATTCCCATC
ATGATCGAAGCTGGATACAGACCAGGTGTTGAGAATGCTGCTGTGATTCT
AGTATGCATGTCAACCAAATATGAAAATTCGGTCAATTGTAATCGAGAAT
TGCAATTTTCTCAAGACAAACGAAAACAACTGATTCCCATCATGATCGAA
GCTGGATACAGACCAGGTGGTGCTCTTGGTTTGATCATTGCTGGTCTTAA
ATATGTCGACTTCAGCAACCCTGGTGATTTTGACGATAAGATGGTGGAAC
TTAGAGATGAAATTACTCATTACTGCAAACCAACACTACAGCCAACGGAA
TCTGCTCCAAAAGCCGCTTCGGAAACAGCCACAACAGGTGGTGCTCTTGG
TTTGATCATTGCTGGTCTTAAATATGTCGACTTCAGCAACCCTGGTGATT
TTGACGATAAGATGGTGGAACTTAGAGATGAAATTACTCATTACTGCAAA
CCAACACTACAGCCAACGGAATCTGCTCCAAAAGCCGCTTCGGAAACAGC
CACAACAGGTGATTATAACATGAAGCTTGGAGTTGTGGAAGCCAGAGCCG
AGTCTTGGGATGGTGCTGCGACTGCATTAGTGGATAAATTGAGGAGCCGT
AAACTGAAACGCGGTCAAGTAGTATCTGTCTCCGCTCACAATAATGGTAA
AAACGAGAATGCCATTTTCTCAGCTTTCTATGATATTAATGCCCCTGGTC
AAGGAGATTTGGAGATTCATTTTGATTCACAGAACTCATCATCATCATGG
TCAACTATTTACCAGACAGCCTGTGAACAAGCTGCTACAGTTAAGTTGAA
TGATATTATTGGTATATCTGGCTCTTGCAATATGGATCGTGCTGTTTTTT
ATGTATTCTCACAAGTTCCAAGTCCTGTATCCGATTCCGCTACAGTTGAA
TACGTTGAAAGCAGAGCAGATACTTGGGAAGAAGCTGCAGATGGAATTAT
AGGCCAATTAGAAGCAAACGGTGTCTCAAATGGTCAAGTCTTAAACATAG
ATGCTCACAACAACGGTGAAGGAGAAGCTGCCATCTTTAGTGCTCACTAC
AGCAAAGATCTTCCTGGCAAAGGTCCATTGTCAATCTCATACAAGGCACA
TAATGGAAGCTCAGCTTGGGCTACTTTTTATCAGAATTGCTGTAACCAAG
CTTCCAAATTGAAGCGAAATGTATTTATTTCTATTACAGCTTCCATTAAT
ACACCTGAAACGAGCGTCATGTATATGTTCTATTATGATAATTAAGTGAT
TATAACATGAAGCTTGGAGTTGTGGAAGCCAGAGCCGAGTCTTGGGATGG
TGCTGCGACTGCATTAGTGGATAAATTGAGGAGCCGTAAACTGAAACGCG
GTCAAGTAGTATCTGTCTCCGCTCACAATAATGGTAAAAACGAGAATGCC
ATTTTCTCAGCTTTCTATGATATTAATGCCCCTGGTCAAGGAGATTTGGA
GATTCATTTTGATTCACAGAACTCATCATCATCATGGTCAACTATTTACC
AGACAGCCTGTGAACAAGCTGCTACAGTTAAGTTGAATGATATTATTGGT
ATATCTGGCTCTTGCAATATGGATCGTGCTGTTTTTTATGTATTCTCACA
AGTTCCAAGTCCTGTATCCGATTCCGCTACAGTTGAATACGTTGAAAGCA
GAGCAGATACTTGGGAAGAAGCTGCAGATGGAATTATAGGCCAATTAGAA
GCAAACGGTGTCTCAAATGGTCAAGTCTTAAACATAGATGCTCACAACAA
CGGTGAAGGAGAAGCTGCCATCTTTAGTGCTCACTACAGCAAAGATCTTC
CTGGCAAAGGTCCATTGTCAATCTCATACAAGGCACATAATGGAAGCTCA
GCTTGGGCTACTTTTTATCAGAATTGCTGTAACCAAGCTTCCAAATTGAA
GCGAAATGTATTTATTTCTATTACAGCTTCCATTAATACACCTGAAACGA
GCGTCATGTATATGTTCTATTATGATAATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000119_pilon | genome | sc0000119_pilon:70980..75461 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 457-1191:736 |
| Aaloc | 286-453:1314 |
| Aaloc | 145-282:2468 |
| Aaloc | 1-141:4483 |
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