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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000266_pilon:209870..216325+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041380 ID=XLOC_041380|Name=XLOC_041380|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6456bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000266_pilon:209870..216325+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAATACAAGAACAACGACATCCCGATCCTGCAATGCCGATATCCCa
acaattaaaatttgaatgtaATGGAAATTGCCACAGGTATTgtttaaatt
atattttgtaaagatttttttaaactcaaTTCCTTTACCACAAGCTGACT
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tcttaaaaaaacaacaacaaagaaatattgtttttggaccgacttcggcg
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gtctgttaccagcttttctcaagattggctcattagttttttcagatttt
ttgcagtccgattttcgagaaaaattattttccggtCGCAAATGCGGGAA
Atatgccgtttttgctgattttcactggactttttcctgatatttcattg
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TCGTTGAGATAAAGCTTTCCATGATTGGCTCTGTCCCATTTTTCTCTCTG
CCTTTTTACCCCCAGCAGATAATAATTAACATTTTTGGTTCAACTTCAAA
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TTAATATCTTAACTTGTCTTGACTGCGGAACCCGAATCTTTACGAGTTCC
CCGCAAAGTTGAGATTTTTGCTCAATGAATATTTTACAATAGAGTAATTA
CTAGGTCACTTATGATATTCTTATTTGAATTCCATGTTTGTGGGCACCTT
TTTCCACACCTCTCCCTTCCTGTTATTTTCATTTGGGACTCAATAACAAG
TTTATTCATACACTGGAGGGAAGACGAAGAATGTTTCAATTATTGATGGA
GGGTTCTACCTTCTATATATGGTCATTACAAGGAGGTGTTATAGCACTCC
TCTCTTGTGCTTAGGCTCTTGAAATATGTCTTTCATGTACGCGGTACACA
TATCTCTGTTGATGAGATCCGTATTTTCAAAGAGTGTTTCAGCGCGCGGT
GTTTGTTTAATCTCCTACTAAGAAAATAAACCAAATTTGTTTGTGAACAA
CAGTCGCTGTTTGGACTACCGTTGGTGACGAAAAATGGTCCTTACCAGAT
TTTACGCTTTACGATCAGGATCTTTTTACACGGTGGCCTCTTATTGGCCc
atcttaaaaaaatcttttccctCGTAATTTCTATTTCGTTCTTCCGAAAA
AAGCAATGCAATTATTGTAGCCAGGAAAAACTTCTCCGGAAGGTCATTGA
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TATTCCtatcttttcttttcattggCAGGTTTTCACATCACCATAAACAA
ATATTACCACAACAAAACTCACATTGTAACTGTCGCAACAAGAAAATTCA
ATCCTTGTCCAGGTCAACCAATCACCATCTCATACAAAACTCGAAGgtaa
tattcaaaaattttatttcataatgttactcttttttttaaagtatgtta
tgagaagaaattttggggGAAGAAATTTGGTGGGGTTTGttttggcgatt
taataaaatttctaaaattggcgagaattaattttggggaacgacccatt
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aattttggcgggaagaaattttgaggcaattcgccaaattggccgaaatt
tctttctgccaaaatttcttctcttaaggtactcTAAGTTGTTCTTATTA
GGCTTATTTTAGTCACTGATTGGAATGAAATGAGCTTAACACTAATTCTT
TAAATCAAACTATTTCTTATTTGTTCTTGGAATTTCGTCAactttcagcc
tcgtgttctcaTAAAATTGAGACTGATttaaatttctaattttataagca
catcatCTAAGGAAATAACTTTTCAGgctgattttcttgaaaaattatga
atagGTAAGGCTCAGGTAAAAAATTATCACTAATTCTACTTGACTATAAT
TGTTCGTTTTCTCCGGTATTTTAAAGCTTGATAGTTCTAATTGCAGAATA
GTTAATAAAGGATAACTGACAATCCCTAAGTAAGCTTTATTGGGAAACGA
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GGCGtttaaaaaatccttttttggcGCCCGTTGcttttcggcgccccttc
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TTTATTCTCAGTGGCAAGTATTTTTCTTGAGTGCTGTTTATTGAGTAGAA
TTGAATTGCAACAGACTATGCTTGATACGAAGTCCATATAATGTACATAC
AACATTCATATtacgttaggtgaacgttgtAACTACTTCTTTATTAACTG
AGAGCTCTCGCAATGTATTTTGAGCGATAGATCTGtgtacatttcaaatt
ttaaaccgCGACCTTTCAATAAAATGTCTTCTGTGATCAGCACACAGCAA
CTTTTAAGGTAGGCATCGTTTGCTTTTATAATTCTTGTGTATCCTTTATC
TTTccattttaaagcattttttattATACAAATTGAATTAGTCAGTTATA
TAATCAAAACgttatacatcgttggaaagatagtaTTGAGACTTTCTGAA
AGCAATAATACATTttgattcgaaaaaaaaacaaatcaaaaaagtaaCAC
CTCTTCTGGAAAGATATCTTTAAAAATGTGAAAGTACATATTGATGATAT
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ttttcaaaaattatgaatcCGCTTGGGCGCGACCTAATTAATTTCGATTg
tcttattattatttttttatctatagttacgtatatgtaatcacatgaca
cgagtgcaattcgaatataattgcacgagtgatttttttgttattaattt
tccgagtccgaaaggacgaggaaaattcaaaacaaaaaaatcacgagtgc
aattttcgaattgtacgagttattatgtgatcacgagctaatcgcacaat
ggctttcgctactttttcccagttaggaaaataaattacagaaattacac
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tggctcggcattggagagtgtgattaacgattaattgctctctttgaggg
cgtgccaaataagaaaaaataacccatcgtgcgattatatCTATAATGGA
TCATTATATCAAATAAACGAAAAAACCATGTTTACGTAAATCTAAAGGAA
AGACCAGCTTCATATTTATTTACAGCCAACCTCCTTCAGGGACGGACTTA
TTTACCATCGGGTTCCTTATAACTGTTTCCCCCGctaattgatttttcaa
aaattttccacccaggacaccCGTGGGGGCCTCTCCAATTTTTATGGTAT
AACAAAAATCGCGTGACTGCAAAAATTGAGCTAGGGCCATTATCTTAATC
TATTAATTGATAGATTAAGATAGGATAATAGCCCTAGCTCAATTTTTGCA
GTCACGCGATTTTTGTTATACCATACACAAAGCCTGCCCCTTCGCCTCCC
CCGTTTTAAGTTACACcatttttgtatttaaaaagCAACTACAATTTACT
AAATATGGCGCCTACTTATACTGTAACATTTCATCAAAGAGTGTCCAATT
TAagacaagaagccggagcggcgtgaaggtccagctgacgtggcaataac
cgaatgtcgttcgtaccgggcTCCTTAAATGACGCAGAAAgatttccttc
ccatcctccactcaattctttgacactttctttgtattgctaagttttga
aagtttttgatgcatatctcgaaatttcgaaacttttgcagCTGATGGGA
TTCaaacccactatatacaaagcacctatgattagaacgccagcgcctta
accactcgaccatcgagtcacaactgcattaaggagttcaaagttcctta
aacatggtatttactccaaactctacccgggggctaaaacccaTCCAGGG
GTTCACTCCCAaccccaaccctagccctaaccctacctgaccctacctga
aacaaccctttaatctaaccaggaaatttgactctactaccaattcaatc
caaaacataggtcaaacatcgcgtgggtaggcggggcaaaaattctagat
cggcggttggtttagcctggacttgttaatttattgcgcgcacaggcccc
gacaaagacaaaatcttttcgatcagttgctttttaaaggtccattctgc
tgcgcgctggaccaaaaaaaattattgaaaaatatccAGAAGCTATCTCA
TGTCAATTAAGGGATTTATGTTTCTCCGGATGCTCCATTATACAGATAAA
AAGAATGGTAAAAACATGTTTGGTATCAATTTATTGATGCTTGGAAGAAG
TAAGCTACTCATGTGCTTTTAGCATTATAGACTATATTTAGAGTAAGAAA
GTCAAGTGAAAATCTTATCATCTTTTTCAGGTATTTTTTCGAATTGACTA
TCCTTACGTAAAGTTATCGGAACCTCGTAAAATGTTTGTGCACTTGAAGT
CATTTAATGATCAATGTAatctttccctttttttccaGGAAGTCCCAGGG
GAAGAAAGCAACACCCTAAGAAATACCGATAAAGAAAAACCCTCAGATTC
ACTAACGACCATGCCAAGGACACCAGAAACAGCACCAAGTGACTCCAAAA
TGACTGTTCAACTAAGCCAACAGTTGGCCGTTGAGCGTAAACGTAACGAT
GAGCTCTGTCTCAGGATTGAACAGTTACAAATTACTTTAGAAAGTGCTGA
TATTAATTACGAGATACTCAAACAAAAATTCATGGAACAATTTCAAACAT
TCCAAGAcgaattgaatattttgaaacgcAACTATCATAAACATACTGAA
AGTGGACCCAACTCACCGTCCTTGGGTCGACGCCGCCGTGCCATAAACAC
GGTTTCGGAACaacaaaatgaattaaaaatacTGACCAATACAGTGGAAG
AAAATACCAGAAACATTGATGATATTGACTTACGATTACAGATACATGAA
AACACTAGATATAACGGTCGCATATTATGGAAGATTGACGACTTTCATTC
CAGAAGACAACAAGTCTTATCAGGTGAACTCCACGCTTTACATAGTGCGC
CTTGTTATTCAAGTGATTATGGATACAAATTTTGTTTACGTGCTTACCTC
AATGGCGATGGAGTTGGAGAAGGAACACACGTGTCCCTTTTCCTTGTCGT
CATGAAGTCCGACCATGATCGAGTCTTAGAATGGCCTTTCCAAAAGAAAG
TGAAGATGACACTAATCAATCAACAAAATCGGCGTCGTGATCATACAGAA
GTCATGACACCGAATAAAGACTCAGCTAGTTTTCAACGGCCAAAAAATGA
CACCAATGTTGCGTCTGGTTGTCCGCTTTTTATGGCGCTCGATCGCTTAG
ATGCAGAAGGGTTTGTCAAAGAAGATGTATTATTTTTTGATGTTACCGTT
GAGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000266_pilon:209870..216325+ >XLOC_041380 ID=XLOC_041380|Name=XLOC_041380|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2244bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000266_pilon:209870..216325+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAATACAAGAACAACGACATCCCGATCCTGCAATGCCGATATCCCa
acaattaaaatttgaatgtaATGGAAATTGCCACAGATGGAAATACAAGA
ACAACGACATCCCGATCCTGCAATGCCGATATCCCaacaattaaaatttg
aatgtaATGGAAATTGCCACAGGTTTTCACATCACCATAAACAAATATTA
CCACAACAAAACTCACATTGTAACTGTCGCAACAAGAAAATTCAATCCTT
GTCCAGGTCAACCAATCACCATCTCATACAAAACTCGAAGGTTTTCACAT
CACCATAAACAAATATTACCACAACAAAACTCACATTGTAACTGTCGCAA
CAAGAAAATTCAATCCTTGTCCAGGTCAACCAATCACCATCTCATACAAA
ACTCGAAGGAAGTCCCAGGGGAAGAAAGCAACACCCTAAGAAATACCGAT
AAAGAAAAACCCTCAGATTCACTAACGACCATGCCAAGGACACCAGAAAC
AGCACCAAGTGACTCCAAAATGACTGTTCAACTAAGCCAACAGTTGGCCG
TTGAGCGTAAACGTAACGATGAGCTCTGTCTCAGGATTGAACAGTTACAA
ATTACTTTAGAAAGTGCTGATATTAATTACGAGATACTCAAACAAAAATT
CATGGAACAATTTCAAACATTCCAAGAcgaattgaatattttgaaacgcA
ACTATCATAAACATACTGAAAGTGGACCCAACTCACCGTCCTTGGGTCGA
CGCCGCCGTGCCATAAACACGGTTTCGGAACaacaaaatgaattaaaaat
acTGACCAATACAGTGGAAGAAAATACCAGAAACATTGATGATATTGACT
TACGATTACAGATACATGAAAACACTAGATATAACGGTCGCATATTATGG
AAGATTGACGACTTTCATTCCAGAAGACAACAAGTCTTATCAGGTGAACT
CCACGCTTTACATAGTGCGCCTTGTTATTCAAGTGATTATGGATACAAAT
TTTGTTTACGTGCTTACCTCAATGGCGATGGAGTTGGAGAAGGAACACAC
GTGTCCCTTTTCCTTGTCGTCATGAAGTCCGACCATGATCGAGTCTTAGA
ATGGCCTTTCCAAAAGAAAGTGAAGATGACACTAATCAATCAACAAAATC
GGCGTCGTGATCATACAGAAGTCATGACACCGAATAAAGACTCAGCTAGT
TTTCAACGGCCAAAAAATGACACCAATGTTGCGTCTGGTTGTCCGCTTTT
TATGGCGCTCGATCGCTTAGATGCAGAAGGGTTTGTCAAAGAAGATGTAT
TATTTTTTGATGTTACCGTTGAGTGAGAAGTCCCAGGGGAAGAAAGCAAC
ACCCTAAGAAATACCGATAAAGAAAAACCCTCAGATTCACTAACGACCAT
GCCAAGGACACCAGAAACAGCACCAAGTGACTCCAAAATGACTGTTCAAC
TAAGCCAACAGTTGGCCGTTGAGCGTAAACGTAACGATGAGCTCTGTCTC
AGGATTGAACAGTTACAAATTACTTTAGAAAGTGCTGATATTAATTACGA
GATACTCAAACAAAAATTCATGGAACAATTTCAAACATTCCAAGAcgaat
tgaatattttgaaacgcAACTATCATAAACATACTGAAAGTGGACCCAAC
TCACCGTCCTTGGGTCGACGCCGCCGTGCCATAAACACGGTTTCGGAACa
acaaaatgaattaaaaatacTGACCAATACAGTGGAAGAAAATACCAGAA
ACATTGATGATATTGACTTACGATTACAGATACATGAAAACACTAGATAT
AACGGTCGCATATTATGGAAGATTGACGACTTTCATTCCAGAAGACAACA
AGTCTTATCAGGTGAACTCCACGCTTTACATAGTGCGCCTTGTTATTCAA
GTGATTATGGATACAAATTTTGTTTACGTGCTTACCTCAATGGCGATGGA
GTTGGAGAAGGAACACACGTGTCCCTTTTCCTTGTCGTCATGAAGTCCGA
CCATGATCGAGTCTTAGAATGGCCTTTCCAAAAGAAAGTGAAGATGACAC
TAATCAATCAACAAAATCGGCGTCGTGATCATACAGAAGTCATGACACCG
AATAAAGACTCAGCTAGTTTTCAACGGCCAAAAAATGACACCAATGTTGC
GTCTGGTTGTCCGCTTTTTATGGCGCTCGATCGCTTAGATGCAGAAGGGT
TTGTCAAAGAAGATGTATTATTTTTTGATGTTACCGTTGAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000266_pilon | genome | sc0000266_pilon:209870..216325 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 205-1122:5539 |
| Aaloc | 88-204:1730 |
| Aaloc | 1-84:1 |
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