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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000324_pilon:49805..54039- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041241 ID=XLOC_041241|Name=XLOC_041241|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4235bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000324_pilon:49805..54039- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCGAAGCTGCTTCACCAGTGCGTTCCAGTAACATTCCTGAATCCGT
TGCATTGATCAATCTCCCTAACAACCAGCCCCAGGAACCTGACGACAACG
ACAGTGGATTAGACACTGGGTACGATGAACGGATCACTCATCGAAGTATT
GGTGGCCCGAACCACTTAAATGTGGTTCATAGAACACCCGCCTTTGTTAA
AAACTGTTGCCCGCCCCGAGGGCGTTTTGGTGAATACGCCACACGAATAA
TTGCTTGTATTGTAATATGGGCGGCTCTTTATTGCGTTGTCGGAAGTTCA
GCTTGGGTTGGCGGAAACTTATTCTCGTTGTATTTGCTTTTAGTACTGGC
TTCTCTTGGTGGATTCTTGGTAGCTTGGAAGACACAATATTTTAATTTCC
CAGCATTGTTAGGGATGTTGATCGTTGGTTTTCTATTGAAAAACATTGAA
GCGATAAATATTGCAAAGAACATTGATTCTAACTGGTCCTCTTCATTACG
TCAAGTCGCACTAGCTGTCATTCTTTTGCGCTCGGGCCTTGGATTAGATA
TAGCGGCATTGAAAAGACTTCGTTTTACTGTTTTGAGATTGGCTTTTGGA
CCCTGCATCACTGAAGCTGTTACAGTAGCCGTTATGGCGCATTTCTTGCT
TGGCTTGCCGTGGTTATGGGCTTTTCAACTAGGGTAATATTTATTTTTCT
CATAGCAGCAATTATCCCGGCACTCTACGTCAGAGCAACGTACACGCAAC
GCCTACGGGCTCTTATAATGTTAGATGAATATTTTAAACAACGTCGTGTG
GCAGCTGGGTTGAATTAAATTCTTAGTTATAAGTGTTAAGTTTTAAATCA
AATTATTTTCTTTCAATGAATCCAATAAAGAGATGAAATCGTTGTAAAAT
GGGCTATTCTAGAAATAGTCTGTACCCCTTATGTTGAGGAGCTGTGACGT
CCAGGGTGGTTTGGAAAATAAAAAATCCAGTCTGGTTTTTTGAATGATAA
AATCCTGGGTGATCCAAAGAAATGAGAGAAAAAAATTTAAGGGGTCCTGA
AAAATCGGAAAAAATCCAAGGGGTCACCTTTTTAAAAAAAGATTTCTTCA
ATATAGGGGGTAAAAAATTTTTCTGGGATAGCCCAATGACTAATTGACTA
ATGACCACTCAAGCTGTAAGTAGACAAGGTCGGAGTTGAGAAATACTAGT
TGGTTTCTGATATAGATCTGTCGGTACAAATGATAGCGGAAATAATTGAC
CTACCCTATAAAAGTTACTGACCATTTGAATTGCCAACACGATCTTCTAG
GTTCATCATTGGTGCTGTTTCACCAGCAGTTGTGGTTCCATCCATGTTGA
CATTGCAATTAGATGGTTATGGTGTAGAAGAAGGCATTCCAACGCTGGTC
ATGGCAGCGTCTTCTTGCGATGATGTACTTGCTATTAGTTTGTTTGGTGT
CTTTCTTGGTGTTTCTTTCTCAGAGGGTAAGAGGTTTTTTATATCGTAAT
GTTTCCAGGAATATTAATAGAAGAAACCAGTGAAAGTTTTTTAGGTCTTG
ATATAAAATAATTGATCGCTACCTACGCAATTCTTTATACAGATGGTTCG
TTTTTTTACCTAAAGGCTATTCATATTTAGCTTTCATTTGAACACCTCTT
AGGAAGAAATTTCGGGTTGGTGATATCGAACTTTTTGTTCTGGGCTAAAA
GAATTTCATCTTCTTTTTTCTTCAGGAAATTTGTTATGGAATATATTTCG
TGGACCACTTGAAATAGCCATGGGTATCATCGGAGGTTTATTAATTGGCA
GTCTGTTGTGGTATTTCCCTTGGAAGAAAGCTGTTAGTATCATCATCATA
TTTTTCACATCGTATAATTTTCAGGGAACTAGAGGTTTCTTTTGAAAAAT
ACACCTTTTCACTTACGACGTCGGCTTGGTAATGAGTTTATATTTGCCTT
TTCACTAGACCATTCTGTGCTTGTGTTTATCGTCACCCAAACAAATTTCC
AATGTTAAGGCCGACCAAGCGGATAAAGGTTGACAGGTCTATACGTTGCT
TATTAATAACCTTTTTCATTGGCCCTTCGTCTTGGTTATAGCTCACATAA
AACGCCAGATATGAAATTTTTAACACATGTTTTTTACATTCTTATACTTC
ATTACTGGACTTTTTCATTCCAGGGAAATGCAACAGCCAACCGAAGTGTT
CTTCTGCTCGCATTTGCTTTCTTGTTTTTATTTGGTAGTAATCAAGTCAA
TTTCCCTGGAGCAGGGGCGTTGGGCGTTCTGTGTTTGGGCGCTACAACTG
CTTACGGTTGGGGTGAAAAAGAAAAGGTAACTATATGTATGATGTTTGAC
ATGAAAGACTTTTCAATCTTCCAAAAAACTTGATTAGGCTCTTTAAAGCC
GAAAAAAGATCCCATGAGCCAGTCTATTTAGCCAGATTATCTTCACTTCA
AAATGCTTTACAATTCTTTTCGGCTTCCTTACTTGATAAAAAAGAATATT
CAACTGATGAACTTTATTTGTCTCATCCCATATCGTCCCTCATCCAGGGA
TATAGTCAATTACTCATTAACCAAGTTGGGGATAATGATTTTGTTATCCT
TCTTGTAGAAAATTATGTATGTAATTTCTATCAAGGGTGATTACATACTT
GGTAATGAGTAATTAACTTAATGACCTTGAGTCTCTATGGGTGAGGGTCA
ATATAAATACAGATCAGACATTAATTATATCGGTAAAAGGTTCTCTTTCA
TCAAGTAAAAGACCTTAAATTAATTTAAAGGGAAGAGAATCGGACTGGTA
GCTGTGCGTTCTATCAAAAAGGATAAATAGTCTCCCCCAGCGGACCTTCA
GTTGACGCAATCACGTAAATGTTTTTCCGAAATTCACCCATTCACGCAAT
ATTTTTTCGCAATTCACGCAATTTTTTTTTCACGCAAAGCTTTCCAATTC
ACGCATTCATGCAACTTTTTTTTCATTTTCACGCATTCGCGCAAGTGAAA
AAGCCCCATAAAGTGCACGGTATTTTCTTAAATGCCACTAATGCTATTAC
AATCAAACTATTATTACAGGTTCCAATCGAGAGAGTGATGGGAATTTTAT
GGGACATCTTTCAACCTCTTTTGTTTGGTTTGATTGGTGCAGAAGTCTCC
ATCCAATACCTCAAACCTGATCTTGTCGGTAATCGCCATTATCCTTCTAA
CGAATATTCTGTTTCTTTTTAGTTTTAATTTGACGTAAATTGATTGACGA
TATGGTTTTTTATCTGCTGGTTTGATCGAGATTAAGTCAGTCCATTACGG
TGCAAGTTTGCGATTGAAAACTTTAGACTACAAATCAGTTTTACTGGTTT
TTATTCAGGAGGATCAATCAATTTAGTTTTGCCCTAATTATCATTTTAGG
GATGGGCTTGGCTGCACTTGGGATTGGTCTTGTTTTAAGAATTGGTGTAA
CTTATTTTGCTGTCTTGGGAAATAGTTTCTCAACCAAGGAGAAATTATTT
TGCACTATCGCATGGTTACCTAAAGCTACAGTTCAAGTAATGTTGTTTCC
GTTTACCAAACTTCATAAACTATTATATTCTCATTTCTTTTTTCGACACA
ATTTTTCTTCGATCTTCGAGGGATAGAGAGCTAGACTGTTTAAGGAAACT
AATTTGTGCAATAAATAATATTCGTGGAACAAATTGTTTCAGTTATGTGT
GTCCTCCTAAGTAAAATGAAATAATTTCAGCTAAAAGTGGCTGTTTACCG
CGAAAATTAGTTCCACGAAAACCACCAATTTCATACCCTCGCACCGCAAA
TTTTTGTCCCGAAAAAATTACTTCTCACGAAAGTTCCTTATGCATTACGT
ACTTTCACATATTCGCTACATATTATATTATCACTCTTTACTTAATTTTT
AACGCTACGAGAGAGACGAGTGAAGTTTAATCACCCTATCTTATCACGCC
ACAATTGTCTAATTCAATTAAAATTTTCATTGTAACTCATTTCAGGCGGC
AATTGGTTCCATCCCTCTAGATAAAGCTCGTCAAGTCGCTTCTAAAGATC
CGACGGATGCTAATAACCAGGCCGTTGAATATGGAATTCAAATCGTCACT
TTAGCTGTGTTGGCAATCTTGATCACAGCTCCTTTAGGTGCAATTGGTAT
TTCATTAACTGGACCAAGATTTCTTTCACAAAGAAAGAATGAAGAACTTG
GAGAACCAGAAGCAAATGACGAATCAGATGCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000324_pilon:49805..54039- >XLOC_041241 ID=XLOC_041241|Name=XLOC_041241|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3210bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000324_pilon:49805..54039- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCGAAGCTGCTTCACCAGTGCGTTCCAGTAACATTCCTGAATCCGT
TGCATTGATCAATCTCCCTAACAACCAGCCCCAGGAACCTGACGACAACG
ACAGTGGATTAGACACTGGGTACGATGAACGGATCACTCATCGAAGTATT
GGTGGCCCGAACCACTTAAATGTGGTTCATAGAACACCCGCCTTTGTTAA
AAACTGTTGCCCGCCCCGAGGGCGTTTTGGTGAATACGCCACACGAATAA
TTGCTTGTATTGTAATATGGGCGGCTCTTTATTGCGTTGTCGGAAGTTCA
GCTTGGGTTGGCGGAAACTTATTCTCGTTGTATTTGCTTTTAGTACTGGC
TTCTCTTGGTGGATTCTTGGTAGCTTGGAAGACACAATATTTTAATTTCC
CAGCATTGTTAGGGATGTTGATCGTTGGTTTTCTATTGAAAAACATTGAA
GCGATAAATATTGCAAAGAACATTGATTCTAACTGGTCCTCTTCATTACG
TCAAGTCGCACTAGCTGTCATTCTTTTGCGCTCGGGCCTTGGATTAGATA
TAGCGGCATTGAAAAGACTTCGTTTTACTGTTTTGAGATTGGCTTTTGGA
CCCTGCATCACTGAAGCTGTTACAGTAGCCGTTATGGCGCATTTCTTGCT
TGGCTTGCCGTGGTTATGGGCTTTTCAACTAGGATGTCCGAAGCTGCTTC
ACCAGTGCGTTCCAGTAACATTCCTGAATCCGTTGCATTGATCAATCTCC
CTAACAACCAGCCCCAGGAACCTGACGACAACGACAGTGGATTAGACACT
GGGTACGATGAACGGATCACTCATCGAAGTATTGGTGGCCCGAACCACTT
AAATGTGGTTCATAGAACACCCGCCTTTGTTAAAAACTGTTGCCCGCCCC
GAGGGCGTTTTGGTGAATACGCCACACGAATAATTGCTTGTATTGTAATA
TGGGCGGCTCTTTATTGCGTTGTCGGAAGTTCAGCTTGGGTTGGCGGAAA
CTTATTCTCGTTGTATTTGCTTTTAGTACTGGCTTCTCTTGGTGGATTCT
TGGTAGCTTGGAAGACACAATATTTTAATTTCCCAGCATTGTTAGGGATG
TTGATCGTTGGTTTTCTATTGAAAAACATTGAAGCGATAAATATTGCAAA
GAACATTGATTCTAACTGGTCCTCTTCATTACGTCAAGTCGCACTAGCTG
TCATTCTTTTGCGCTCGGGCCTTGGATTAGATATAGCGGCATTGAAAAGA
CTTCGTTTTACTGTTTTGAGATTGGCTTTTGGACCCTGCATCACTGAAGC
TGTTACAGTAGCCGTTATGGCGCATTTCTTGCTTGGCTTGCCGTGGTTAT
GGGCTTTTCAACTAGGGTTCATCATTGGTGCTGTTTCACCAGCAGTTGTG
GTTCCATCCATGTTGACATTGCAATTAGATGGTTATGGTGTAGAAGAAGG
CATTCCAACGCTGGTCATGGCAGCGTCTTCTTGCGATGATGTACTTGCTA
TTAGTTTGTTTGGTGTCTTTCTTGGTGTTTCTTTCTCAGAGGGTTCATCA
TTGGTGCTGTTTCACCAGCAGTTGTGGTTCCATCCATGTTGACATTGCAA
TTAGATGGTTATGGTGTAGAAGAAGGCATTCCAACGCTGGTCATGGCAGC
GTCTTCTTGCGATGATGTACTTGCTATTAGTTTGTTTGGTGTCTTTCTTG
GTGTTTCTTTCTCAGAGGGAAATTTGTTATGGAATATATTTCGTGGACCA
CTTGAAATAGCCATGGGTATCATCGGAGGTTTATTAATTGGCAGTCTGTT
GTGGTATTTCCCTTGGAAGAAAGCTGAAATTTGTTATGGAATATATTTCG
TGGACCACTTGAAATAGCCATGGGTATCATCGGAGGTTTATTAATTGGCA
GTCTGTTGTGGTATTTCCCTTGGAAGAAAGCTGGAAATGCAACAGCCAAC
CGAAGTGTTCTTCTGCTCGCATTTGCTTTCTTGTTTTTATTTGGTAGTAA
TCAAGTCAATTTCCCTGGAGCAGGGGCGTTGGGCGTTCTGTGTTTGGGCG
CTACAACTGCTTACGGTTGGGGTGAAAAAGAAAAGGGAAATGCAACAGCC
AACCGAAGTGTTCTTCTGCTCGCATTTGCTTTCTTGTTTTTATTTGGTAG
TAATCAAGTCAATTTCCCTGGAGCAGGGGCGTTGGGCGTTCTGTGTTTGG
GCGCTACAACTGCTTACGGTTGGGGTGAAAAAGAAAAGGTTCCAATCGAG
AGAGTGATGGGAATTTTATGGGACATCTTTCAACCTCTTTTGTTTGGTTT
GATTGGTGCAGAAGTCTCCATCCAATACCTCAAACCTGATCTTGTCGGTT
CCAATCGAGAGAGTGATGGGAATTTTATGGGACATCTTTCAACCTCTTTT
GTTTGGTTTGATTGGTGCAGAAGTCTCCATCCAATACCTCAAACCTGATC
TTGTCGGGATGGGCTTGGCTGCACTTGGGATTGGTCTTGTTTTAAGAATT
GGTGTAACTTATTTTGCTGTCTTGGGAAATAGTTTCTCAACCAAGGAGAA
ATTATTTTGCACTATCGCATGGTTACCTAAAGCTACAGTTCAAGGATGGG
CTTGGCTGCACTTGGGATTGGTCTTGTTTTAAGAATTGGTGTAACTTATT
TTGCTGTCTTGGGAAATAGTTTCTCAACCAAGGAGAAATTATTTTGCACT
ATCGCATGGTTACCTAAAGCTACAGTTCAAGCGGCAATTGGTTCCATCCC
TCTAGATAAAGCTCGTCAAGTCGCTTCTAAAGATCCGACGGATGCTAATA
ACCAGGCCGTTGAATATGGAATTCAAATCGTCACTTTAGCTGTGTTGGCA
ATCTTGATCACAGCTCCTTTAGGTGCAATTGGTATTTCATTAACTGGACC
AAGATTTCTTTCACAAAGAAAGAATGAAGAACTTGGAGAACCAGAAGCAA
ATGACGAATCAGATGCTTAAGCGGCAATTGGTTCCATCCCTCTAGATAAA
GCTCGTCAAGTCGCTTCTAAAGATCCGACGGATGCTAATAACCAGGCCGT
TGAATATGGAATTCAAATCGTCACTTTAGCTGTGTTGGCAATCTTGATCA
CAGCTCCTTTAGGTGCAATTGGTATTTCATTAACTGGACCAAGATTTCTT
TCACAAAGAAAGAATGAAGAACTTGGAGAACCAGAAGCAAATGACGAATC
AGATGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000324_pilon | genome | sc0000324_pilon:49805..54039 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1366-1605:241 |
| Aaloc | 1231-1365:835 |
| Aaloc | 1120-1227:1167 |
| Aaloc | 967-1119:2063 |
| Aaloc | 862-966:2509 |
| Aaloc | 685-858:2935 |
| Aaloc | 1-681:4236 |
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