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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041232 ID=XLOC_041232|Name=XLOC_041232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7883bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CCAATATTAACAGGATATAAGAAAACCTTAAATACCACCAGCCTTAACAC
TTTTCTATTTGGTTGGATTAAAAACATACTAAGGAGGACGAAAAGTGCAT
CAATCCATACCAATATGTAAGTAAAGTTGACTCTCTCTAATTCGATCTTC
AAGGAACCATTAAGAGCTCAGGCAAATTATGGCCTGTCCAGATTTTTCAA
ATTTACGTTAATTTTTTATCACCGTTTCCACTTGTCATAGCATATCACTT
CATACATCGAAAGAAGCGTATTGGAGTGTATGTAGATCACTGGAATTGCT
GTGCCATAATTAATTTTTTAACCCGAAAAAAGATATAAAGCAAAAACCAA
AAAATGCTGACGTCAGCAAAACTTGTATTTTGAATAACCCCAGTTTGGCT
TATGGTAAAAACATGAAAAAAAACTTTTTTGAAATTTTGCTGACGTCAGC
GCTTTATTGCAAACTTTCGTATTTTGCTGATTTCTGCTGACGTCAGCAAA
ATTTGCAAAAAATAGATATGCAAAAATGTTCCTATTATTGATATGCAACT
TTTGTCCAAATTTCATGTTTATACCATAAGCCAAACTGGAGTTATTCAAA
AAACAAGTTTTGCTGACGTCAGCATTTTTTGGTTTTTGTCTAATATCTTT
TTTTGGGTGAAAAAATTAATTATGGCACAGCTATTCCAGTGATCTACACT
CCAATAGGCTTCTTTCGATGTATGAAGTGATATGCTATGACAAGTGGAAA
CGGTGATAAAAAATTAAGATAAATTTGGACGTGCCTTAATTTGCCTGAGA
GAAGATTCGAATTACAGAGAGTAATTAAAAGCACTTTACAGTTGAGGGGA
GAATATTTCAGTTCGAATTACAGAAAGAACCGAATAATAGAGATGCGAAT
TAGAGTGATAGTTGACTAAAATATGACTACATTATAATGGCTAATGCATA
AGTCAAGATATCTGTCTCATTTTTCGCTCATTATTAGAAAATAAACCCTA
GCATGGGCTCTTCCAGAAAAGTTTTGTACATGGAGGGGGGGGGTGGAGGA
TATATTGGATATTTTATATATTTTGTACGGGGGTTAGTGAAAAACCTGCA
AAATTTGCCTTGTTTTAGGGGAAAACTTTGCTCTGATTAGGGGTGATTTT
GAATGTCCGGGTGTCAACTGATGCTTGTCCGGGGATGAGATTCGTTGTCC
GGAGGGTAATTTTCCAAAAAAATGCTATATCCTCCAACCCCGACATTCAA
TTTTTAAATTTCAAGAGTTAAATAGCACCTTCAGTCTCTCCAAAACTTTT
CTCCTTGGATAAAAAGTGGGGGTTGAGCCCTGCGAGTTTAAAGCCCGAAG
CGCAAAAGGCTAAAGAGGAATCTTCAACCTTTCTCAATTAAAAAGTTTTC
AGAAATTTTGTTGCTTTTGGAATGACGTATTGAATGAAGCGTTTTTTTGC
CATTTTCAGACTGTATTTGACAATATTTGAAATCTGAAGGTATTTGATGT
CCATTAGGTATTGACGCTAGCTAGTAAAGTTCAGTGACATTGACTCTCTT
ATATTTCAATCTAGCGTTTGCGTAAACACCACGCACTAGCGTTTCAAGTG
GAAAATGATTGCCTTCATTTCCCATCCAAGAGTTTCAACTCTAGAAGCGT
CGGAACTTCAAGCTCAAGGGGTTGACACCTCACACATTACTCTAAGCGGA
GATACTCTAATTTTTAGTATATTTTAGGATGATGTTTAGAATGACCCTAA
TGAAGGAAGGTTGCGAAACGTCCCTCTCGATGTAAAATTATCACTTTGTA
TTAAGTCAGTCAGGAAAAAAAGACACTTTTCTTATTCTGCTACTGGCAGT
TTCATACCACTTTGGTGACAATCTTCAAGCAATTAAAACTTTGTATTAAC
AATTTTGCTTACTAGGTTTTCCCTAATCTTCTGCATGGCTGCTTTAGTAC
ATTTGGGAACCCTGATTGATGCTATTGATACAAAAGTCAGCGGGTACAAG
ATCCAAGAGTTAGGTAAGGTCTTTTGCTTAAATGATGAAAATTGAGCTGG
CGTGAGATAGATGAACTTAATGTAGAAGCAAATGCTAATAGACTTTTTTT
GGTAAAAGTTGTACGATATAAGAACTAGACTATGTTATAGTCTAAGACGA
ATCACTATCTAAGAAAAAAGCCCAAAGCCGAAGAAAATTCGCAAACAGGT
TTTTTTGCCGAAAAGAGTTAACAGTCGGTAGAGTTGCCAGTCTTTTGCCG
TTTCTTCGAAACTCTCCCGCCGATTTTTTTTCCGTATACCGCCATAACGC
CATACCGCCATTTTTTCCCGCCTCTACTATCACTGTTATCCAGGCAGTAT
TATCTAACTTTTGTGTTCTTAGAAGCTTAGGTAACCATCATCCAAACTTG
CCCAGCTAACCCTTCCCACAGAGATTGACTGAATTAACAGCTCACCACTA
TGTCACATTTAGGCTTTACAATGAGCATAAAATTTAAACAAGATTCAACT
GTTTCCTTTTAGTACAATGCCCTTTACAAGTTGAAGCACTTGGATGTTGG
AAAGATGAACGAAAAAACAGAGCTTTTCCTGATCAGGTATGAACAAATTG
AATTCTCCTTTATTCTTTTATATTCGCTATAAGCTTTGAACCCGGGGGAG
GGTAATATGTTTACTAGGTAATGGATATGTCGGAGCCAAAAATCGAAAAT
CGACCCTTAAAAAGAGAAAAATTGACGTTTTTGGGGCCCATTAGAGAGAC
TATTTTCATTTTTTTGTCGATTTTCATTCGATTTTTGTCCAAATCTTTGA
AAATCATGACCCTTTGAGAAAGGAAATTTCGATTATCGTGAATTTTGGAC
CCTAACGGAGACTCTATTTGCTTTTTAATGGTTTTTGTACCGCCTTAAAT
GACTTTCGAGGGCGGAAAAAGGAACCCTTATATGGCTTGCACATTCTCTG
CAACCATTTTGTCTAAGTACCCCCCCCTGGGGGCTTTCGATAAACTTCGT
CTTGATGCTCTTACTGATTAGAATCAGGGCCCACTCCATGAAATTGAAAA
TGGGAGGGGGGGGGGTAATGAATAAAGAGTCTAAGGATGCGCAACCAAAA
ATTTTTACCTTGCAAAAAAGTGGGGGGGGGGCGTGGGCCCTGCGAATTTC
TATTACTCTATTATTCGAATCTTTCTATAAATTCGAACTAAGTACCAGTT
CCCGTCAAGTGGAAACCCTCACAAAATACTTTCTATAATTCTATCTATAA
TTCGAGTTCGAATTAGCGAGAGTTTACTGTACATGTGTCAAACATTTTCA
TGCATTTTTTGATTACTCTCTGTGGTAAATCTTCAACACTAACTTCCCTA
ATTCTCCGTAATAGAATCTTACCTTTAATGAAAAATAAACTCATTCTTTC
ACAGATCATGAATAGCCGTGATCCGACATCCAATGCAGCTTTCAACCCAA
TCATCAACTGGGGAAAATACAATGCTTTCTTATCCAACTTTATTTGCGAG
TAAGTGAACATTTCGGGATTTCAGTACGCCCTTTCTTATCTTTGTAAAAA
GCTTTCGGCTGAGTGGATCAAAATTCTGCCTTATCGAGGAAAAAAAGGTC
GGGGGAAAGTGACGAAAATGCCTCTAGGTGACGAAATTTATCCCCGACGA
AAAAAAAACCAGACTAAATAGAACTCCGACATTTTTATTAATTTAATTCA
TATCCACTTTTACGACTTTTTGTACAATGCAAATTTACGTCGAGTTAAAA
ATCTGTCTCACTAACGGAATTCACCAAAGTACCTTTTGATAAACAAGTTC
TGAAAAGCCAAGGTGCTCCATACAGTGTTAGAATCCAGAAATCATTGGTC
TATGATGAGTTCATCTATTTTTGACTTTTTCAGATGCGGGAAGAAAATCT
TGAAAAAAAAGAACGCGAATTCAGCAGTCATCGGAATTCAATATTACGGT
TAGTATTTCTTCGTATGTATGACCTGAAGGCTCCCTTTTTGTAAAGCTTC
TACCTGAAGATAGGGGAAGGCGCCACCCCTTTTCCTTGGATTTTTCAATT
TAACTTGTTCCTTCCCTTTCTTTGTTTAAGGGCTCTGACCATAGTGAATT
TTTCATAATTGCCGTGTTTAAAATGTGTTTTCTGACTGATGTAACCAACA
AAACTATGGCATGTTATACATTTTCTGTTAGACAAACTATTCCTGAATCA
AAAATTGCATTGAAAAAATTTGATGAAGAAGAAAATGAAGACTTTTGCGA
GGAAGAGTATTTCAACTTTAAAGAGCTTAGTTTCGGCGAAGAAAAAACAT
TTTGAAAATTTTTTCGCAGTACATGGTGTATCTTTTACCGAAGAATAAAA
ATTTTTGCGGAAAATTTTTGTAAATGCTTCTTTGTCTCGAAATCTTCAAA
ATAGTGGTTTTTTATCAATTTTTCATCTGGATTTTGCTTTAAAAAACAGT
CATAACTTTTGACACATCTTTTTAGAAAAATTTTCCGCAAAATTTAAAAT
AGTTCAATTCTTTGCGGACAGTGTAAAGAAATTTTGAAACAAAAAAGTTA
ATTACCCATTAAAACTAAGCACTTTTTGTAAAAGAGGGTGATGCAATATA
TTATTAACATCTTTTTAAAGTTCATAACGTCATTTTTGCAATTAAATTCT
TAATTACTCTTAAGGGATTCGATTAAAAAGCAATTTATAAAGGCAATTCT
TTGTTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTTTTATGTTCAAATACC
AAAATCAATTTTTGGACTATGGTCAGAGCCCTTAAAGGCATCGAGTATCA
CTTTGTGAGTCTTTGGTATGACCCCGCTGTGGGTTGAGCCTAAAATCTTG
CGAACCGTAGCCGAAAATCCCGGTTTTTAGTGAGGTGCTCGCTACCCTTT
CTGCTGCGGTCACTGTAAGACTTAAAGTATCAATTTCAAATCTCTTAATA
GCTGAATGCTGGGGTGATTACCTGAAAGAGAATCCTGACTTTAAAATGCA
CGACGAAACGCAAAGTTGTGTATCTGGTAGCTACTCACCGTATCTGAAGA
AACAAAATAACCAATGTCAAGTTCATACTGGTCAGAGTGGAACCATGTTT
GTCTACAAAATACAAAAACATTACAGTGCGTATTTAAAAGTTTATACTAA
ATTATGGGGATTTTTTCTTATTTTCTAAATCAATGCAGAATATCTACTTA
TAGCATTTTTTATCCAACATTTTTTACGTCAAACCTTTCAAAATTAAGGG
TCTGTACTAAAAGATTTTGGGATATTTTTCCACTTTATGGTTAAAAGGCT
TCTAATCTTAAGTTGTAAAAAAACAAAAAACATAGATGAGCAAAAGTAGC
AATCAAAGGTGCTTTTTATACCCTTTGTCTTCCGTCTTCTGGGGGACGGA
TGTTAGAGTTGCTGTCACTAAGCTACTGCCTAACAAACTGATCATGACTT
AGTAGAAGGCGAATCGTTTATTCTTTTACAAGAAAAATATTCCGACGAAA
CAATCCCATTTTCACTTACCCACAGAAAAAAAACTTTAAGAGATAATTAT
AATCATACTAACCATTGTATAAACCAGGAACATGTCCAGAGATGCAAGGA
AAATATGACATTGGTGGTTCTGAAATGACCATAACAAACCAAGATGGTTT
GACTTTCCAAGGACAAGCAGGAAAACAGATTATCATGGATGGTGAATTCT
ACCGTGGATGTTCAGGATCTGTCAAATACAATGGACAATCAATGTCATTT
CATTATGCACCAGAAACTTGTATTTTAACTTATGGTGGTAACAGTGCTAC
AAAGAAAAATTGCGACAAATGTAAGTTAATTGTTTAATTCACGTGAACCT
TTTTAGCCAATGAACAAACTTCATTTGGCTATTGACGAGTATTTTACCTA
TGGCTTGTAGAATTTTGAAAGAAATTATGTCAGCAAAATTAAGTATTAAG
CCAGGTTAGGATGCGCCCAGTTTGTCGGCCTTATAAATTACTCCAATGGA
GTTTGTTTAACTCGAACCTTTTGACTCGAAAGTCTCCTCAACTCGAAAAA
AAATTCATAGTCCCTTCATTTAATAATGCCTTATAAACCTTACTGAAAAA
CTAAATTTTCTTAACTCGAACAAATCTGTGTTCCCTTTGCTTGTTCAAGT
TAAGGAGAATCTACTGTCTCATACGAAAAACTTGAAGAATCTCTGAAACA
GAACTTTGCTTCAATGGTCTGGGTGATATAAATACGCCGTGGAATCCAGG
CTTAATTCTCAATCAAGAAAACGACTTTGTAATAATATGCAACATACTTT
TCCTTCTTACCAGCAATGATGTGTCCATTCTACAAAAATCTTGGATGTTG
GAATGATTTTGATTCAAGAAAGAATCCACGAATGACCAAATACATTTTCA
ATGACCGCGATCGAACGGACATAGGATGGTCAGGTACTGAGATTAGCTGG
GACAATTGGCAATATGGATATCTTCAAGAATTACTTTGCCGGTGTGCTAA
AGCTGCAAAAGAAAACGGAATGAAATATTTCTCGATCCAATATTATGGTG
AGTATATGATTTTTAAAACCAATAACTTAAAAAATTGGTGTGTAACTTGT
GTCTACTGTCTATGATCTTCTTAACTCACGCTGCTACACTCTTTAGCACA
CTAATTTGGAAACAGAGACAGAATTTAATTCTACATCCAAAAGTTGAATA
TACATTATTACACGAATATTACTAGGCAAGTATTCAACGGCCTTGAAATT
AACACGCAAAAAATTAACACGAATTTGATTTGATTTTTCAAGGACACCAC
GGCTGGTTTTAATTAAAGGGGTTTTAATTAACACGTTATTTCTTAATTCG
TGTTAATTACATGTCTACTTATTTTCGTGTAATAAGGTAGATTATTCTAG
AAACAAAACATTGATAATTTTAAAGAATAGAATATATCTATCTTGCTTTC
GTAAGGCTATATAGAAAAGTCCTTTCGATGTTTATGACTTACTGTTGTGA
AATAAAAACATGAAGGGTGATAATAACAATCTTGTCCCCAGAACCACTTG
CACCTGTTTTACAAACCTTTCGTTAGCGCTATCAGAATCATTAAAAAGTC
AAGTAAGGGACTGAGTATCCTTGATCCTTCTCTTAATTGCTGAGCATCAA
ACAGAGAGGCATCAATCACCATTTTTAGGGTTTTTATATTAAGTACAAAG
TACGGGTAAGACGCGGTCGAGGGTTGAGCCCACGACCTTGCGCTCTACCA
CTGTACTACGGTTGCGCAGACAATCATACTTACTGAGGCAGACACCGATT
AATATTCTTCATTCCAGCTGAATGTTGGATCACCAACGACGAACCAAAAG
CGAAAGCAGATGGGGAAGCACATACTTGCGTCAATGATGAATACAAATTC
TGTAATTTGTCAAAGAGCTCTTGCAAAGCACAGATATGTGCAGGTGTTAA
TCAGAGCAACCAATTGTATGAGATTAAACAAGGTAAGTGCTTAGATTGTT
TAGTCAATGTTTCCATATTTTTTAAATGATCATTCTTTAGTTCTAAAGAA
ATTCAGAGGGTGATTTTAGGAAACATCTAAAAAATATAACAAATACGTTT
TTTATCGAAGTGAAATTCAAGAACCCTTAGGGGGATTGGAATTAGATTAT
ATGATTTCTAAGATCTTAGTCATAATCATAGTGGGACTTTGAAGATCCAA
AAAAGGGACCCTTCAGGGCGGCACATACCCGCAACCTCCTTTTGTCAAGG
TACCATCCCCCGAACATTGTACACACATTAAGAAATCTTTTATTTCTCAG
GTCCAATGATGTGCGATTCAAATCCGTGTCCGTCAGACAAACAATGTGTT
ACCGATGGTCCGGACAAATATTACTGTCAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200- >XLOC_041232 ID=XLOC_041232|Name=XLOC_041232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2694bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CCAATATTAACAGGATATAAGAAAACCTTAAATACCACCAGCCTTAACAC TTTTCTATTTGGTTGGATTAAAAACATACTAAGGAGGACGAAAAGTGCAT CAATCCATACCAATATCCAATATTAACAGGATATAAGAAAACCTTAAATA CCACCAGCCTTAACACTTTTCTATTTGGTTGGATTAAAAACATACTAAGG AGGACGAAAAGTGCATCAATCCATACCAATATGTTTTCCCTAATCTTCTG CATGGCTGCTTTAGTACATTTGGGAACCCTGATTGATGCTATTGATACAA AAGTCAGCGGGTACAAGATCCAAGAGTTAGGTTTTCCCTAATCTTCTGCA TGGCTGCTTTAGTACATTTGGGAACCCTGATTGATGCTATTGATACAAAA GTCAGCGGGTACAAGATCCAAGAGTTAGTACAATGCCCTTTACAAGTTGA AGCACTTGGATGTTGGAAAGATGAACGAAAAAACAGAGCTTTTCCTGATC AGTACAATGCCCTTTACAAGTTGAAGCACTTGGATGTTGGAAAGATGAAC GAAAAAACAGAGCTTTTCCTGATCAGATCATGAATAGCCGTGATCCGACA TCCAATGCAGCTTTCAACCCAATCATCAACTGGGGAAAATACAATGCTTT CTTATCCAACTTTATTTGCGAATCATGAATAGCCGTGATCCGACATCCAA TGCAGCTTTCAACCCAATCATCAACTGGGGAAAATACAATGCTTTCTTAT CCAACTTTATTTGCGAATGCGGGAAGAAAATCTTGAAAAAAAAGAACGCG AATTCAGCAGTCATCGGAATTCAATATTACGATGCGGGAAGAAAATCTTG AAAAAAAAGAACGCGAATTCAGCAGTCATCGGAATTCAATATTACGCTGA ATGCTGGGGTGATTACCTGAAAGAGAATCCTGACTTTAAAATGCACGACG AAACGCAAAGTTGTGTATCTGGTAGCTACTCACCGTATCTGAAGAAACAA AATAACCAATGTCAAGTTCATACTGGTCAGAGTGGAACCATGTTTGTCTA CAAAATACAAAAACATTACACTGAATGCTGGGGTGATTACCTGAAAGAGA ATCCTGACTTTAAAATGCACGACGAAACGCAAAGTTGTGTATCTGGTAGC TACTCACCGTATCTGAAGAAACAAAATAACCAATGTCAAGTTCATACTGG TCAGAGTGGAACCATGTTTGTCTACAAAATACAAAAACATTACAGAACAT GTCCAGAGATGCAAGGAAAATATGACATTGGTGGTTCTGAAATGACCATA ACAAACCAAGATGGTTTGACTTTCCAAGGACAAGCAGGAAAACAGATTAT CATGGATGGTGAATTCTACCGTGGATGTTCAGGATCTGTCAAATACAATG GACAATCAATGTCATTTCATTATGCACCAGAAACTTGTATTTTAACTTAT GGTGGTAACAGTGCTACAAAGAAAAATTGCGACAAATGAACATGTCCAGA GATGCAAGGAAAATATGACATTGGTGGTTCTGAAATGACCATAACAAACC AAGATGGTTTGACTTTCCAAGGACAAGCAGGAAAACAGATTATCATGGAT GGTGAATTCTACCGTGGATGTTCAGGATCTGTCAAATACAATGGACAATC AATGTCATTTCATTATGCACCAGAAACTTGTATTTTAACTTATGGTGGTA ACAGTGCTACAAAGAAAAATTGCGACAAATCAATGATGTGTCCATTCTAC AAAAATCTTGGATGTTGGAATGATTTTGATTCAAGAAAGAATCCACGAAT GACCAAATACATTTTCAATGACCGCGATCGAACGGACATAGGATGGTCAG GTACTGAGATTAGCTGGGACAATTGGCAATATGGATATCTTCAAGAATTA CTTTGCCGGTGTGCTAAAGCTGCAAAAGAAAACGGAATGAAATATTTCTC GATCCAATATTATGCAATGATGTGTCCATTCTACAAAAATCTTGGATGTT GGAATGATTTTGATTCAAGAAAGAATCCACGAATGACCAAATACATTTTC AATGACCGCGATCGAACGGACATAGGATGGTCAGGTACTGAGATTAGCTG GGACAATTGGCAATATGGATATCTTCAAGAATTACTTTGCCGGTGTGCTA AAGCTGCAAAAGAAAACGGAATGAAATATTTCTCGATCCAATATTATGCT GAATGTTGGATCACCAACGACGAACCAAAAGCGAAAGCAGATGGGGAAGC ACATACTTGCGTCAATGATGAATACAAATTCTGTAATTTGTCAAAGAGCT CTTGCAAAGCACAGATATGTGCAGGTGTTAATCAGAGCAACCAATTGTAT GAGATTAAACAAGCTGAATGTTGGATCACCAACGACGAACCAAAAGCGAA AGCAGATGGGGAAGCACATACTTGCGTCAATGATGAATACAAATTCTGTA ATTTGTCAAAGAGCTCTTGCAAAGCACAGATATGTGCAGGTGTTAATCAG AGCAACCAATTGTATGAGATTAAACAAGGTCCAATGATGTGCGATTCAAA TCCGTGTCCGTCAGACAAACAATGTGTTACCGATGGTCCGGACAAATATT ACTGTCAATAAGTCCAATGATGTGCGATTCAAATCCGTGTCCGTCAGACA AACAATGTGTTACCGATGGTCCGGACAAATATTACTGTCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000021_pilon | genome | sc0000021_pilon:493318..501200 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1267-1347:82 |
| Aaloc | 1102-1263:565 |
| Aaloc | 868-1098:1569 |
| Aaloc | 625-864:2305 |
| Aaloc | 451-621:2931 |
| Aaloc | 385-447:4000 |
| Aaloc | 289-381:4480 |
| Aaloc | 217-288:5370 |
| Aaloc | 118-213:5968 |
| Aaloc | 1-114:7884 |
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