XLOC_041232 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041232
Unique NameXLOC_041232
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041232 ID=XLOC_041232|Name=XLOC_041232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7883bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCAATATTAACAGGATATAAGAAAACCTTAAATACCACCAGCCTTAACAC TTTTCTATTTGGTTGGATTAAAAACATACTAAGGAGGACGAAAAGTGCAT CAATCCATACCAATATGTAAGTAAAGTTGACTCTCTCTAATTCGATCTTC AAGGAACCATTAAGAGCTCAGGCAAATTATGGCCTGTCCAGATTTTTCAA ATTTACGTTAATTTTTTATCACCGTTTCCACTTGTCATAGCATATCACTT CATACATCGAAAGAAGCGTATTGGAGTGTATGTAGATCACTGGAATTGCT GTGCCATAATTAATTTTTTAACCCGAAAAAAGATATAAAGCAAAAACCAA AAAATGCTGACGTCAGCAAAACTTGTATTTTGAATAACCCCAGTTTGGCT TATGGTAAAAACATGAAAAAAAACTTTTTTGAAATTTTGCTGACGTCAGC GCTTTATTGCAAACTTTCGTATTTTGCTGATTTCTGCTGACGTCAGCAAA ATTTGCAAAAAATAGATATGCAAAAATGTTCCTATTATTGATATGCAACT TTTGTCCAAATTTCATGTTTATACCATAAGCCAAACTGGAGTTATTCAAA AAACAAGTTTTGCTGACGTCAGCATTTTTTGGTTTTTGTCTAATATCTTT TTTTGGGTGAAAAAATTAATTATGGCACAGCTATTCCAGTGATCTACACT CCAATAGGCTTCTTTCGATGTATGAAGTGATATGCTATGACAAGTGGAAA CGGTGATAAAAAATTAAGATAAATTTGGACGTGCCTTAATTTGCCTGAGA GAAGATTCGAATTACAGAGAGTAATTAAAAGCACTTTACAGTTGAGGGGA GAATATTTCAGTTCGAATTACAGAAAGAACCGAATAATAGAGATGCGAAT TAGAGTGATAGTTGACTAAAATATGACTACATTATAATGGCTAATGCATA AGTCAAGATATCTGTCTCATTTTTCGCTCATTATTAGAAAATAAACCCTA GCATGGGCTCTTCCAGAAAAGTTTTGTACATGGAGGGGGGGGGTGGAGGA TATATTGGATATTTTATATATTTTGTACGGGGGTTAGTGAAAAACCTGCA AAATTTGCCTTGTTTTAGGGGAAAACTTTGCTCTGATTAGGGGTGATTTT GAATGTCCGGGTGTCAACTGATGCTTGTCCGGGGATGAGATTCGTTGTCC GGAGGGTAATTTTCCAAAAAAATGCTATATCCTCCAACCCCGACATTCAA TTTTTAAATTTCAAGAGTTAAATAGCACCTTCAGTCTCTCCAAAACTTTT CTCCTTGGATAAAAAGTGGGGGTTGAGCCCTGCGAGTTTAAAGCCCGAAG CGCAAAAGGCTAAAGAGGAATCTTCAACCTTTCTCAATTAAAAAGTTTTC AGAAATTTTGTTGCTTTTGGAATGACGTATTGAATGAAGCGTTTTTTTGC CATTTTCAGACTGTATTTGACAATATTTGAAATCTGAAGGTATTTGATGT CCATTAGGTATTGACGCTAGCTAGTAAAGTTCAGTGACATTGACTCTCTT ATATTTCAATCTAGCGTTTGCGTAAACACCACGCACTAGCGTTTCAAGTG GAAAATGATTGCCTTCATTTCCCATCCAAGAGTTTCAACTCTAGAAGCGT CGGAACTTCAAGCTCAAGGGGTTGACACCTCACACATTACTCTAAGCGGA GATACTCTAATTTTTAGTATATTTTAGGATGATGTTTAGAATGACCCTAA TGAAGGAAGGTTGCGAAACGTCCCTCTCGATGTAAAATTATCACTTTGTA TTAAGTCAGTCAGGAAAAAAAGACACTTTTCTTATTCTGCTACTGGCAGT TTCATACCACTTTGGTGACAATCTTCAAGCAATTAAAACTTTGTATTAAC AATTTTGCTTACTAGGTTTTCCCTAATCTTCTGCATGGCTGCTTTAGTAC ATTTGGGAACCCTGATTGATGCTATTGATACAAAAGTCAGCGGGTACAAG ATCCAAGAGTTAGGTAAGGTCTTTTGCTTAAATGATGAAAATTGAGCTGG CGTGAGATAGATGAACTTAATGTAGAAGCAAATGCTAATAGACTTTTTTT GGTAAAAGTTGTACGATATAAGAACTAGACTATGTTATAGTCTAAGACGA ATCACTATCTAAGAAAAAAGCCCAAAGCCGAAGAAAATTCGCAAACAGGT TTTTTTGCCGAAAAGAGTTAACAGTCGGTAGAGTTGCCAGTCTTTTGCCG TTTCTTCGAAACTCTCCCGCCGATTTTTTTTCCGTATACCGCCATAACGC CATACCGCCATTTTTTCCCGCCTCTACTATCACTGTTATCCAGGCAGTAT TATCTAACTTTTGTGTTCTTAGAAGCTTAGGTAACCATCATCCAAACTTG CCCAGCTAACCCTTCCCACAGAGATTGACTGAATTAACAGCTCACCACTA TGTCACATTTAGGCTTTACAATGAGCATAAAATTTAAACAAGATTCAACT GTTTCCTTTTAGTACAATGCCCTTTACAAGTTGAAGCACTTGGATGTTGG AAAGATGAACGAAAAAACAGAGCTTTTCCTGATCAGGTATGAACAAATTG AATTCTCCTTTATTCTTTTATATTCGCTATAAGCTTTGAACCCGGGGGAG GGTAATATGTTTACTAGGTAATGGATATGTCGGAGCCAAAAATCGAAAAT CGACCCTTAAAAAGAGAAAAATTGACGTTTTTGGGGCCCATTAGAGAGAC TATTTTCATTTTTTTGTCGATTTTCATTCGATTTTTGTCCAAATCTTTGA AAATCATGACCCTTTGAGAAAGGAAATTTCGATTATCGTGAATTTTGGAC CCTAACGGAGACTCTATTTGCTTTTTAATGGTTTTTGTACCGCCTTAAAT GACTTTCGAGGGCGGAAAAAGGAACCCTTATATGGCTTGCACATTCTCTG CAACCATTTTGTCTAAGTACCCCCCCCTGGGGGCTTTCGATAAACTTCGT CTTGATGCTCTTACTGATTAGAATCAGGGCCCACTCCATGAAATTGAAAA TGGGAGGGGGGGGGGTAATGAATAAAGAGTCTAAGGATGCGCAACCAAAA ATTTTTACCTTGCAAAAAAGTGGGGGGGGGGCGTGGGCCCTGCGAATTTC TATTACTCTATTATTCGAATCTTTCTATAAATTCGAACTAAGTACCAGTT CCCGTCAAGTGGAAACCCTCACAAAATACTTTCTATAATTCTATCTATAA TTCGAGTTCGAATTAGCGAGAGTTTACTGTACATGTGTCAAACATTTTCA TGCATTTTTTGATTACTCTCTGTGGTAAATCTTCAACACTAACTTCCCTA ATTCTCCGTAATAGAATCTTACCTTTAATGAAAAATAAACTCATTCTTTC ACAGATCATGAATAGCCGTGATCCGACATCCAATGCAGCTTTCAACCCAA TCATCAACTGGGGAAAATACAATGCTTTCTTATCCAACTTTATTTGCGAG TAAGTGAACATTTCGGGATTTCAGTACGCCCTTTCTTATCTTTGTAAAAA GCTTTCGGCTGAGTGGATCAAAATTCTGCCTTATCGAGGAAAAAAAGGTC GGGGGAAAGTGACGAAAATGCCTCTAGGTGACGAAATTTATCCCCGACGA AAAAAAAACCAGACTAAATAGAACTCCGACATTTTTATTAATTTAATTCA TATCCACTTTTACGACTTTTTGTACAATGCAAATTTACGTCGAGTTAAAA ATCTGTCTCACTAACGGAATTCACCAAAGTACCTTTTGATAAACAAGTTC TGAAAAGCCAAGGTGCTCCATACAGTGTTAGAATCCAGAAATCATTGGTC TATGATGAGTTCATCTATTTTTGACTTTTTCAGATGCGGGAAGAAAATCT TGAAAAAAAAGAACGCGAATTCAGCAGTCATCGGAATTCAATATTACGGT TAGTATTTCTTCGTATGTATGACCTGAAGGCTCCCTTTTTGTAAAGCTTC TACCTGAAGATAGGGGAAGGCGCCACCCCTTTTCCTTGGATTTTTCAATT TAACTTGTTCCTTCCCTTTCTTTGTTTAAGGGCTCTGACCATAGTGAATT TTTCATAATTGCCGTGTTTAAAATGTGTTTTCTGACTGATGTAACCAACA AAACTATGGCATGTTATACATTTTCTGTTAGACAAACTATTCCTGAATCA AAAATTGCATTGAAAAAATTTGATGAAGAAGAAAATGAAGACTTTTGCGA GGAAGAGTATTTCAACTTTAAAGAGCTTAGTTTCGGCGAAGAAAAAACAT TTTGAAAATTTTTTCGCAGTACATGGTGTATCTTTTACCGAAGAATAAAA ATTTTTGCGGAAAATTTTTGTAAATGCTTCTTTGTCTCGAAATCTTCAAA ATAGTGGTTTTTTATCAATTTTTCATCTGGATTTTGCTTTAAAAAACAGT CATAACTTTTGACACATCTTTTTAGAAAAATTTTCCGCAAAATTTAAAAT AGTTCAATTCTTTGCGGACAGTGTAAAGAAATTTTGAAACAAAAAAGTTA ATTACCCATTAAAACTAAGCACTTTTTGTAAAAGAGGGTGATGCAATATA TTATTAACATCTTTTTAAAGTTCATAACGTCATTTTTGCAATTAAATTCT TAATTACTCTTAAGGGATTCGATTAAAAAGCAATTTATAAAGGCAATTCT TTGTTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTTTTATGTTCAAATACC AAAATCAATTTTTGGACTATGGTCAGAGCCCTTAAAGGCATCGAGTATCA CTTTGTGAGTCTTTGGTATGACCCCGCTGTGGGTTGAGCCTAAAATCTTG CGAACCGTAGCCGAAAATCCCGGTTTTTAGTGAGGTGCTCGCTACCCTTT CTGCTGCGGTCACTGTAAGACTTAAAGTATCAATTTCAAATCTCTTAATA GCTGAATGCTGGGGTGATTACCTGAAAGAGAATCCTGACTTTAAAATGCA CGACGAAACGCAAAGTTGTGTATCTGGTAGCTACTCACCGTATCTGAAGA AACAAAATAACCAATGTCAAGTTCATACTGGTCAGAGTGGAACCATGTTT GTCTACAAAATACAAAAACATTACAGTGCGTATTTAAAAGTTTATACTAA ATTATGGGGATTTTTTCTTATTTTCTAAATCAATGCAGAATATCTACTTA TAGCATTTTTTATCCAACATTTTTTACGTCAAACCTTTCAAAATTAAGGG TCTGTACTAAAAGATTTTGGGATATTTTTCCACTTTATGGTTAAAAGGCT TCTAATCTTAAGTTGTAAAAAAACAAAAAACATAGATGAGCAAAAGTAGC AATCAAAGGTGCTTTTTATACCCTTTGTCTTCCGTCTTCTGGGGGACGGA TGTTAGAGTTGCTGTCACTAAGCTACTGCCTAACAAACTGATCATGACTT AGTAGAAGGCGAATCGTTTATTCTTTTACAAGAAAAATATTCCGACGAAA CAATCCCATTTTCACTTACCCACAGAAAAAAAACTTTAAGAGATAATTAT AATCATACTAACCATTGTATAAACCAGGAACATGTCCAGAGATGCAAGGA AAATATGACATTGGTGGTTCTGAAATGACCATAACAAACCAAGATGGTTT GACTTTCCAAGGACAAGCAGGAAAACAGATTATCATGGATGGTGAATTCT ACCGTGGATGTTCAGGATCTGTCAAATACAATGGACAATCAATGTCATTT CATTATGCACCAGAAACTTGTATTTTAACTTATGGTGGTAACAGTGCTAC AAAGAAAAATTGCGACAAATGTAAGTTAATTGTTTAATTCACGTGAACCT TTTTAGCCAATGAACAAACTTCATTTGGCTATTGACGAGTATTTTACCTA TGGCTTGTAGAATTTTGAAAGAAATTATGTCAGCAAAATTAAGTATTAAG CCAGGTTAGGATGCGCCCAGTTTGTCGGCCTTATAAATTACTCCAATGGA GTTTGTTTAACTCGAACCTTTTGACTCGAAAGTCTCCTCAACTCGAAAAA AAATTCATAGTCCCTTCATTTAATAATGCCTTATAAACCTTACTGAAAAA CTAAATTTTCTTAACTCGAACAAATCTGTGTTCCCTTTGCTTGTTCAAGT TAAGGAGAATCTACTGTCTCATACGAAAAACTTGAAGAATCTCTGAAACA GAACTTTGCTTCAATGGTCTGGGTGATATAAATACGCCGTGGAATCCAGG CTTAATTCTCAATCAAGAAAACGACTTTGTAATAATATGCAACATACTTT TCCTTCTTACCAGCAATGATGTGTCCATTCTACAAAAATCTTGGATGTTG GAATGATTTTGATTCAAGAAAGAATCCACGAATGACCAAATACATTTTCA ATGACCGCGATCGAACGGACATAGGATGGTCAGGTACTGAGATTAGCTGG GACAATTGGCAATATGGATATCTTCAAGAATTACTTTGCCGGTGTGCTAA AGCTGCAAAAGAAAACGGAATGAAATATTTCTCGATCCAATATTATGGTG AGTATATGATTTTTAAAACCAATAACTTAAAAAATTGGTGTGTAACTTGT GTCTACTGTCTATGATCTTCTTAACTCACGCTGCTACACTCTTTAGCACA CTAATTTGGAAACAGAGACAGAATTTAATTCTACATCCAAAAGTTGAATA TACATTATTACACGAATATTACTAGGCAAGTATTCAACGGCCTTGAAATT AACACGCAAAAAATTAACACGAATTTGATTTGATTTTTCAAGGACACCAC GGCTGGTTTTAATTAAAGGGGTTTTAATTAACACGTTATTTCTTAATTCG TGTTAATTACATGTCTACTTATTTTCGTGTAATAAGGTAGATTATTCTAG AAACAAAACATTGATAATTTTAAAGAATAGAATATATCTATCTTGCTTTC GTAAGGCTATATAGAAAAGTCCTTTCGATGTTTATGACTTACTGTTGTGA AATAAAAACATGAAGGGTGATAATAACAATCTTGTCCCCAGAACCACTTG CACCTGTTTTACAAACCTTTCGTTAGCGCTATCAGAATCATTAAAAAGTC AAGTAAGGGACTGAGTATCCTTGATCCTTCTCTTAATTGCTGAGCATCAA ACAGAGAGGCATCAATCACCATTTTTAGGGTTTTTATATTAAGTACAAAG TACGGGTAAGACGCGGTCGAGGGTTGAGCCCACGACCTTGCGCTCTACCA CTGTACTACGGTTGCGCAGACAATCATACTTACTGAGGCAGACACCGATT AATATTCTTCATTCCAGCTGAATGTTGGATCACCAACGACGAACCAAAAG CGAAAGCAGATGGGGAAGCACATACTTGCGTCAATGATGAATACAAATTC TGTAATTTGTCAAAGAGCTCTTGCAAAGCACAGATATGTGCAGGTGTTAA TCAGAGCAACCAATTGTATGAGATTAAACAAGGTAAGTGCTTAGATTGTT TAGTCAATGTTTCCATATTTTTTAAATGATCATTCTTTAGTTCTAAAGAA ATTCAGAGGGTGATTTTAGGAAACATCTAAAAAATATAACAAATACGTTT TTTATCGAAGTGAAATTCAAGAACCCTTAGGGGGATTGGAATTAGATTAT ATGATTTCTAAGATCTTAGTCATAATCATAGTGGGACTTTGAAGATCCAA AAAAGGGACCCTTCAGGGCGGCACATACCCGCAACCTCCTTTTGTCAAGG TACCATCCCCCGAACATTGTACACACATTAAGAAATCTTTTATTTCTCAG GTCCAATGATGTGCGATTCAAATCCGTGTCCGTCAGACAAACAATGTGTT ACCGATGGTCCGGACAAATATTACTGTCAATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200-

>XLOC_041232 ID=XLOC_041232|Name=XLOC_041232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2694bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:493318..501200- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCAATATTAACAGGATATAAGAAAACCTTAAATACCACCAGCCTTAACAC
TTTTCTATTTGGTTGGATTAAAAACATACTAAGGAGGACGAAAAGTGCAT
CAATCCATACCAATATCCAATATTAACAGGATATAAGAAAACCTTAAATA
CCACCAGCCTTAACACTTTTCTATTTGGTTGGATTAAAAACATACTAAGG
AGGACGAAAAGTGCATCAATCCATACCAATATGTTTTCCCTAATCTTCTG
CATGGCTGCTTTAGTACATTTGGGAACCCTGATTGATGCTATTGATACAA
AAGTCAGCGGGTACAAGATCCAAGAGTTAGGTTTTCCCTAATCTTCTGCA
TGGCTGCTTTAGTACATTTGGGAACCCTGATTGATGCTATTGATACAAAA
GTCAGCGGGTACAAGATCCAAGAGTTAGTACAATGCCCTTTACAAGTTGA
AGCACTTGGATGTTGGAAAGATGAACGAAAAAACAGAGCTTTTCCTGATC
AGTACAATGCCCTTTACAAGTTGAAGCACTTGGATGTTGGAAAGATGAAC
GAAAAAACAGAGCTTTTCCTGATCAGATCATGAATAGCCGTGATCCGACA
TCCAATGCAGCTTTCAACCCAATCATCAACTGGGGAAAATACAATGCTTT
CTTATCCAACTTTATTTGCGAATCATGAATAGCCGTGATCCGACATCCAA
TGCAGCTTTCAACCCAATCATCAACTGGGGAAAATACAATGCTTTCTTAT
CCAACTTTATTTGCGAATGCGGGAAGAAAATCTTGAAAAAAAAGAACGCG
AATTCAGCAGTCATCGGAATTCAATATTACGATGCGGGAAGAAAATCTTG
AAAAAAAAGAACGCGAATTCAGCAGTCATCGGAATTCAATATTACGCTGA
ATGCTGGGGTGATTACCTGAAAGAGAATCCTGACTTTAAAATGCACGACG
AAACGCAAAGTTGTGTATCTGGTAGCTACTCACCGTATCTGAAGAAACAA
AATAACCAATGTCAAGTTCATACTGGTCAGAGTGGAACCATGTTTGTCTA
CAAAATACAAAAACATTACACTGAATGCTGGGGTGATTACCTGAAAGAGA
ATCCTGACTTTAAAATGCACGACGAAACGCAAAGTTGTGTATCTGGTAGC
TACTCACCGTATCTGAAGAAACAAAATAACCAATGTCAAGTTCATACTGG
TCAGAGTGGAACCATGTTTGTCTACAAAATACAAAAACATTACAGAACAT
GTCCAGAGATGCAAGGAAAATATGACATTGGTGGTTCTGAAATGACCATA
ACAAACCAAGATGGTTTGACTTTCCAAGGACAAGCAGGAAAACAGATTAT
CATGGATGGTGAATTCTACCGTGGATGTTCAGGATCTGTCAAATACAATG
GACAATCAATGTCATTTCATTATGCACCAGAAACTTGTATTTTAACTTAT
GGTGGTAACAGTGCTACAAAGAAAAATTGCGACAAATGAACATGTCCAGA
GATGCAAGGAAAATATGACATTGGTGGTTCTGAAATGACCATAACAAACC
AAGATGGTTTGACTTTCCAAGGACAAGCAGGAAAACAGATTATCATGGAT
GGTGAATTCTACCGTGGATGTTCAGGATCTGTCAAATACAATGGACAATC
AATGTCATTTCATTATGCACCAGAAACTTGTATTTTAACTTATGGTGGTA
ACAGTGCTACAAAGAAAAATTGCGACAAATCAATGATGTGTCCATTCTAC
AAAAATCTTGGATGTTGGAATGATTTTGATTCAAGAAAGAATCCACGAAT
GACCAAATACATTTTCAATGACCGCGATCGAACGGACATAGGATGGTCAG
GTACTGAGATTAGCTGGGACAATTGGCAATATGGATATCTTCAAGAATTA
CTTTGCCGGTGTGCTAAAGCTGCAAAAGAAAACGGAATGAAATATTTCTC
GATCCAATATTATGCAATGATGTGTCCATTCTACAAAAATCTTGGATGTT
GGAATGATTTTGATTCAAGAAAGAATCCACGAATGACCAAATACATTTTC
AATGACCGCGATCGAACGGACATAGGATGGTCAGGTACTGAGATTAGCTG
GGACAATTGGCAATATGGATATCTTCAAGAATTACTTTGCCGGTGTGCTA
AAGCTGCAAAAGAAAACGGAATGAAATATTTCTCGATCCAATATTATGCT
GAATGTTGGATCACCAACGACGAACCAAAAGCGAAAGCAGATGGGGAAGC
ACATACTTGCGTCAATGATGAATACAAATTCTGTAATTTGTCAAAGAGCT
CTTGCAAAGCACAGATATGTGCAGGTGTTAATCAGAGCAACCAATTGTAT
GAGATTAAACAAGCTGAATGTTGGATCACCAACGACGAACCAAAAGCGAA
AGCAGATGGGGAAGCACATACTTGCGTCAATGATGAATACAAATTCTGTA
ATTTGTCAAAGAGCTCTTGCAAAGCACAGATATGTGCAGGTGTTAATCAG
AGCAACCAATTGTATGAGATTAAACAAGGTCCAATGATGTGCGATTCAAA
TCCGTGTCCGTCAGACAAACAATGTGTTACCGATGGTCCGGACAAATATT
ACTGTCAATAAGTCCAATGATGTGCGATTCAAATCCGTGTCCGTCAGACA
AACAATGTGTTACCGATGGTCCGGACAAATATTACTGTCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041232XLOC_041232-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000021_pilongenomesc0000021_pilon:493318..501200 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1267-1347:82
Aaloc1102-1263:565
Aaloc868-1098:1569
Aaloc625-864:2305
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Aaloc1-114:7884