XLOC_041151 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041151
Unique NameXLOC_041151
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000279_pilon:136019..150015-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041151 ID=XLOC_041151|Name=XLOC_041151|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13997bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000279_pilon:136019..150015- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTCACTACTAACCAAAAGAATGGCTTCATTTCGTTTCGGAGCGAAACGGG ACCGCCACGTACGAACATGGTCTTAGGGATCCTTTTCTCAGAACTTCATC TCGGTATAAATATTTTGTGGTGTCTACACTCTAATGCATTATATCCAAAT GTTTCCTGAAAATTTTGTGGATAACTATTTACGTTAAGAAGAATTTACAG AAGTTTTTTTCTGATTTTGTTTACATATATGTAAAGTATTCCAAATACAT TCTCTTGAACCATTGGTTTACACGTTTCCAAAAAACTTTCAGAAAAATCA TAGTCATTCTAATCAACCGAACTTGCATTTTCTCTAGTCGATGGTAAATG GACAGAGTACAGTGAGTTCGGTGAATGTTCAGCCTCGTGTGGAGGTGGAT CACAAAAAAGAACTCGATCTTGCACAAACCCTGCACCAGCACATGGTGGA AAAGAATGCGAAGGATCTGATGAAGATGAACAAGAATGTGGAACTGATCC TTGCCCAGGTGCGTCTAGTCTACCTTCCATGTCAAGTTTTAGTTGGCTTT TCTTTAGCACTGAAGTAGTTTGTAGTTCCTTAAAATCTGGTGTTTGAAGG GTTATTCTACATAAGTGTTCCCGTTTTATATCAGGCACATGTTTTATATT AGGACATTGTCTGCCTATTATTATATTGTGCTGATATAAGCAAAATATGT TTTTTAAGCAAATGATATCACTCTTATTTAAAACAAACCCTTTAACCCAT TCCAGAAGAGATGGCTCGATAGGGCCAAGCTACAAATAATATGTCACTAA CATATACAAAAAAAAGATATTTGTGGACAATGAGGTCTTTCAGAAAAGAT TTGCTGCAGATTGTGAAAGAACAAGGGAAGAATGGGAATTTTTAAGTATT TTAATGTTTAACTTTCCAATCTCGTAGTCGATGGTAAATGGGGAGCTTAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000279_pilon:136019..150015-

>XLOC_041151 ID=XLOC_041151|Name=XLOC_041151|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3942bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000279_pilon:136019..150015- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTGTTTTTCATCAACAAGTCGCCAACAATCGTGATGCTAGCAGCAATGTT
TACACCGGCAAAGTTTTAGACTGGGTCAACTATAAACAATCTCTTGAAGA
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GTTCAGCCAGCTGTGGCGATTCTTTCCAAGAACGTGAACGAAGTTGTAAC
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AATGCGAAGGATCTGATGAAGATGAACAAGAATGTGGAACTGATCCTTGT
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ATGGACAGAGTACAGTGAGTTCGGTGAATGTTCAGCCTCGTGTGGAGGTG
GATCACAAAAAAGAACTCGATCTTGCATGGTAAATGGACAGAGTACAGTG
AGTTCGGTGAATGTTCAGCCTCGTGTGGAGGTGGATCACAAAAAAGAACT
CGATCTTGCACAAACCCTGCACCAGCACATGGTGGAAAAGAATGCGAAGG
ATCTGATGAAGATGAACAAGAATGTGGAACTGATCCTTGCCCAGATGGTA
AATGGACAGAGTACAGTGAGTTCGGTGAATGTTCAGCCTCGTGTGGAGGT
GGATCACAAAAAAGAACTCGATCTTGCACAAACCCTGCACCAGCACATGG
TGGAAAAGAATGCGAAGGATCTGATGAAGATGAACAAGAATGTGGAACTG
ATCCTTGCCCAGTCGATGGTAAATGGGGAGCTTACGGAGCTTTCAGCCAA
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GCTTACGGAGCTTTCAGCCAATGTAACAAGCCTTGTGGAGGTGGAAGCCA
ATCACGATCGAGATCTTGCAACAACCCTGCACCAAAATATGGAGGAAAAG
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CCAGTCGATGGTAAATGGGGAGCTTATGGAGCTTTCAGCCAATGTAACAA
GCCTTGTGGAGGTGGAAGCCAATCACGATCGAGATCTTGCAACAACCCTG
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GCTTGTAACACACAAAACTGTCCAGTCGATGGTAAATGGGGAGCTTATGG
AGCTTTCAGCCAATGTAACAAGCCTTGTGGAGGTGGAAGCCAATCACGAT
CGAGATCTTGCAACAACCCTGCACCAAAATATGGAGGAAAAGCTTGTGTT
GGATCAGCCACTGACAGCCGAGCTTGTAACACACAAAACTGTCCAGTCGA
TGGTAAATGGGGAGCTTATGGCGCTTTCAGCCAATGTAACAAGCCTTGTG
GAGGTGGAAGCCAATCACGATCGAGATCTTGCAACAACCCTGCACCAAAA
TACGGAGGAAAAGCTTGTGTTGGATCAGCCACTGACAGCCGAGCTTGTAA
CACACAAAACTGTCCAATCGATGGTAAATGGGGAGCTTATGGCGCTTTCA
GCCAATGTAACAAGCCTTGTGGAGGTGGAAGCCAATCACGATCGAGATCT
TGCAACAACCCTGCACCAAAATACGGAGGAAAAGCTTGTGTTGGATCAGC
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GGGGATCATGGAGCGGATATGGATCTTGTAACAAAAAATGTGGAACAGGA
AGTCAGACACGAACCAGATCTTGTAATAATCCTTCACCAAAATACAATGG
TGCTTCATGTTCAGGTTCATCTCAACAAAGCAGAAACTGCAACACTCACT
CTTTCAACGGAAAATGGGGATCATGGAGCGGATATGGATCTTGTAACAAA
AAATGTGGAACAGGAAGTCAGACACGAACCAGATCTTGTAATAATCCTTC
ACCAAAATACAATGGTGCTTCATGTTCAGGTTCATCTCAACAAAGCAGAA
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GCAGGACTACTTCTGGGGACGAACTTCCAAGTCATACTGCCGAAGCGGTG
TTGATTGGTTCTGGAGCACAAGCTGCCGAGGTGGTCATGGACGTATTGCC
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GATGAGTTATTCTGGATATATGGAATTCAAAACATGCGAAGGATCGTCAC
GTAATGTCGATTGTGGATCTGGAAAAGTCATCAAATTGCAGGACTACTTC
TGGGGACGAACTTCCAAGTCATACTGCCGAAGCGGTGTTGATTGGTTCTG
GAGCACAAGCTGCCGAGGTGGTCATGGACGTATTGCCAACAGATGTCACA
ACAGACAATCATGCAAATTGGAAGCTAACAATAGCTGGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041151XLOC_041151-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000279_pilongenomesc0000279_pilon:136019..150015 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1783-2019:238
Aaloc1618-1782:1123
Aaloc1447-1617:1655
Aaloc1276-1446:2137
Aaloc1105-1275:2621
Aaloc937-1104:3208
Aaloc853-936:3869
Aaloc682-849:12520
Aaloc505-678:12943
Aaloc250-501:13413
Aaloc106-246:13765
Aaloc49-102:13998