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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000214_pilon:570150..577697+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041049 ID=XLOC_041049|Name=XLOC_041049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7548bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000214_pilon:570150..577697+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgggTGAACCAATAGAAAATGGACATGCTGAAATCTCAGATGAAGTCAA
AGAGAAAGCTGAATCAATTAAAAATGAAGcaaaccaatttttcaaaagta
agtaAATTCTTTCCTTTTCTGAGAAGATTTTGATGTTCAAAATTCctcat
tttaatcattttagttttttttttcttcaattgtccaattgttttcttga
ttcatttaaattttgatttttttagatgGTAAATTTGACAAAGCTTTGGC
ACTGTACTCTGAAGCAATTGATTTGAATCCAAATGTTGCAGCTTACTACG
GAAACCGTAGTTTTTGTAATATCAAAATGGAtttttttGGAGCTGCGTTG
GAAGATGCAAATAGTGCTATCaagattgacaaaaaatatatcaaggtttc
aactttttttcatacTCTACACAAGTTTCAagtatttttaaacaaacatA
ATTTTGCATTGATAGGTTTTCTGTGGACTAACTCTCAAGGAATAAATTGT
TATTTCAGATGTTACTTTAAAAATGCTATgttaataaaagtttttagtCA
CCATTGCCTATTGTAGGGGTATTACAGAAGAGCATCTGCAAATATGGCAC
TTGGAAAATTCAAATTAAGTTTACGAGATTATGAAGCAGTAAGTATCAGT
ACCTCTTTATTGAACAAAATCATTCTTACTCTTAGTCTCTGATCTAATCC
TTATATTCCTGATTTTCTACCCTGATTCAATATAAGTTTTGTCGAAGGGA
ACAACAAAACATGTGTACAAATCTTAAGTGTTCTGTGTATAcacataatt
tttctttcttgataattctttttaaattgtTCATATCCTTGTTTCAATTC
TCCCTTCTGAAAAGGTTGCAAAAGTTTGTCCGAAAGATAAAGATGCACAG
AAGAAATTCACTGAATGTAAAAAGTTGGTACATCAACAAGCTTTTGCTCA
AGCTATAGCTGTTGATGATAATAAAGTCTCCCTTGTTGAATCTTTGGATC
TAGAATCTATGAGTAAGTGGTTGTCTTCCTTTtgggccaaattgaaaagt
ttccgtttctgtcacggaaggaaatcagagtcttttttggtctatttttg
aaaaatggtaaaatgaataaaaatagtATTAGTCCTGAATTAAAGCCTTC
ATAGTACTACTACTtccaaagcaaaataaatttcataaaagtttttcctc
attgaataattgaactttgaaggttctgtcacggaaggaatgcagcaaag
acattgaaaaagacaaaagtatgctgattcagattcctgtgaatttaaag
agaattttaaaGCCAAAATACCACCATAAGAAACTTATGTCTATCTGCTT
GTCATTGAAAAAAGAACtgagtcaaaaaaattaatttcaatggcTACAGG
CCTTCGCAACTGAGAAAGGTcagtgtcacggaaggacactgtcacggaag
gaaaaaattcctacttttcaaaatcagcaataGCGTAAGAAATGTTGAAT
GAAACTAGTGGAGTGACACATCATATCATGAATCATAGCCATTTTTACTA
TTCAGTTCATTTCAAAACCTTGTaactgtatttttattgttcaacccaag
cgagtgagctacttccaaaggctctaattagcatatttccatggtgctga
agcgatttagagggtttagaaccagctgggaacagtagttttgccagaaa
accggtttttaggcctctagagccgcctgggcttacgctgtaagcttgca
gcgctgtactggagccttagttaagcttattctgagctccataccgGGCT
GAGCTgtttcccaatggtcctaaacctcgtagGACACTCTcctgcaatgg
attagacccattgaagtccagcaaAGGGGGCTTAACCAACAAATTTTCAC
TTAAATAgcttaaaaacgcttaaaaagctctattataagtgtttttaagg
ctttttaaagcaaaaaacgtaaaaacgcaaATTTgcaagcgagtgagcta
cttccaaaggctctaatcatgcagggctgagctggttccaaatagtccta
aacctcgtgggatACTCTcctgcaatggattagacccattgaagtccaag
atttctaaaaataacaagatatttttaatccgtcacggaaggacaaggtg
aaagtgtcacggaaggacaaggtgaaagtgtcacggaaggacaataaTTT
CAGACCTTGTAAGTGAATATGAAGGAGGTTGCTTTGGAatgtaatttaat
tttttgttagggGGTACCAATAGTTAGAACTTGCAATAATATCGAGAATA
GTGTATTTGTACAAAGctggtgaaaaaactttttgtcttgaaattgtCAT
GGAAGGAATTCGATATTTGataaaagtttctgcttgcagtACTTTTCTGT
TGTTCgacttatttcaaaatgaataaacctattaaactaactagggtatg
tacttgttttaaaacaacatttcatttttgattaatcattttatttttca
aaagaaggtccattatattttaacacttgtccttccgtgacaaaaCCGTT
AGTTGTGTTTCGATATAATCACCTGATTACAGAGTCTAAAAGTGCGACTC
GGttgatttaaaagttgaaattggaaaatttaagggttatttaaaaaaaa
atcacagttacttattttgtttgtaagatttttgattttgtgttttggtt
gaccacttttcaatttggcccttttttagtaattttgGTTATTCTCATAT
TTTTGTCTGCAATAAACTGATACTCTCACACAAAACTTTTGTTATATCTT
GGAGTGATTGACAGATTCAAATCATCTTAAATGAATAACTTGTCAATCAT
AACTCAATTTGTTCATATCCTGTCTTTATACTTCTATTTGTCCCCTTCAG
CTATTGAATCTACTTATGAAGGACCTTCCCTTGACGAAGATGGGAAAGTG
ACGAAAGAATTCATGGATAAATTACTACCATAtttgaagaatcaaaagaa
aattcacaaGAAATGTGCATATCAAGTATGCAGTTTATGATTATTTATGT
ACTTTTTCAGTAAACTTAGGGAAATAATTTGGTTGTAAACAATGGTAATA
GCAAAGCTGTGATTATGGTTTGGGGGAAGGCCTTGTTTGTAACGACCAAA
ACTATTGATAAATAAGAGGTAAGAAAACAAATGTTCAACAAGTGAGAAAA
CATAATGTAATCAGCGCTCCATATGGAGCActattaaaagttgaaaaatt
gaccaattgaaaGATCaaatatagaaaaggcgcaaaaaagagttgctgca
tgctaaaaaattgctagcgaaaaaaCTTtatgcgagaattggagagttca
gatttaagcgtattattaATTAAAGGtatgataaatattttatatTGAAT
TACTGTGTTTTTGTCTTCATAGATTTTAGTAAACATCAAAGAGTATTTCG
AGAAATGTGATTCGCTAATTGATGTCACAATACCCAAGgtattaaacctt
ttttctaATTAGTTCTTAATTcataatttattgttttttttcaatggtTT
ATTTATTGTTGATTGAATTGTCTTGAatccttattttcaatattttaatc
tTCAAAGGATAAGAAGTTAACAGTATGCGGAGACATCCATGGACAATTCT
ATGATctgctgaatatttttgaaatcaatggATTACCGTCAGAAGAAAAC
CCATATGTATCCTTCTCATATATTCCATTGTCTTTTGCACCTTTGGTAAT
TTTTGTAGGGAATCTTGTGGTGCAAGTAAAAGTTTGTTGGGTGGGGCTTC
CGAGGGTATATAATACCAGTGAAGTTTCCTTGAATAAAGTCATAAATACC
TccttttcattgattttttgaacaaatagTAAAGCCAGATTAACAATATT
TAAGAGGAGGTCGGAATCGCTTTGAAAAATACTGAGCTTGTTGCAGTTTT
TAAAActaatcatcaaaacaaaatgatgtGCGTAATGGCTTAATGGCTCA
AATAAAGGCAAAAAGTTTTTGCAAACAAGTTTATTCACTGGCGAGGATGA
AGCTATATGGTAAATAGTTCACCAATCAGTCGTATATCCCTTAACCCTTG
TACTGGTTAGCTATTCAATGGTGATTTTGTTGATCGTGGTTCATTTTCTG
TAGAAGTCATCCTCACTTTATTCGGATTCAAACTTCTCTATCCAAACCAT
TTCTTCATGTCAAGAGGTATAGATCTGATCAACTTTCTGATGATAATGTT
GctttttaaaagtttagtaGACGAGTAAAAGACGACAATACGGAGAATTT
TTGACGTCAGAATGAAATATCTTTGTTCACTTGTAAAAACAGTACTTTTC
CTTCAAAACTTCAATACCTAAGGAAATACTTGAGGTATAACGTTATAAAT
AATAATGTTATAAACTTACAGCAAAGAAGCGCTGGAAATTTTGTACCTAT
ACAAAATAccaatataaaaaaagttacgtcaaaaagtttaggggtgcggt
ttttttttaatcaccctGTTTGTTACTTGAATATTAGTTCCAGTATTTTG
GGCTTTGTTCAGTTTACTGAGATCTATGGCTCACACAGTCTTTAAAAGTT
ATAAAACTTATTTGCCAAATCATTGAAATCACTATAAGCTTGTTATTAGT
CAGCACATTGACTTTTGAGGCATTCACGAAAAAATGTgttgttgaattta
tttttcaattcattttagGGAATCACGAAAGTGCTACGATGAACAAAATG
TATGGTTTTGAAGGAGAAGTAGTGTCAAAGTAAGTTTCATCTGTCCCTAA
GTCAAAGATTCGAATattaataaagatttttaaactgttgtttttatgtt
tttttacgATGTATTGACAATAGTTGTTTTAGTCtactattatttttttt
tatttctttagtttttttatccactttttaGGTACACTTCCAAAATGGCA
GATTTATTTACAGAAGTTTACAATTTGCTTCCTCTATGTCATTTGatcaa
caaaaaaattcttgtaaGATTTACAACAATTATCATGATTTCAATTATTG
ATTATAAACTAAAGAAATTCTTCTGTTAGGAAaagtaaaaactttaaaag
aatttctaatATGCATGAATAACAGGAAAGTTATGCACTTCttttttttC
CTATTCTGTTTATCCAAGTCTCGTAATAGAAAACAACTTTTTGCTGTTGT
AAGTTAGTTCTTCATTATTAGtcgacttattttgacaaaaccTTTTAATA
TTAACACTATTATTGCTGTTTGTATCTGGCAATGATGTCATGTTTTTAAG
TTTGAAAGAATATCTTCAGGATTAATATTCTTTATTCTTGATATATAttg
ttcttcttttcttttgaaaatgaaatggtgatattttttccttctatctt
tcacttcttctggttttttcatttcgtttcAGACAATGCATGGTGGTCTT
TTCAGTAAAGATGACGTCACTATAGAAGATATTCGCAAAGTTGACCGGAA
TAGACAACCCCCTGATTCAGGTATTTATTTTTAGctgttaaaatctttaa
aaatcaaaaaggtaTTTTAAGTTCTTTCAGTACTGAAGTTAAgctaaaaa
aattcatctatAAGCAATTCTTTGGCTGCCAGCAATTTTGATTGAGGACC
TAATTCAAAAAGTGGCACACCCACGATCCCAAACATGACCAATTTTCCTT
GAAGCCAAACCCGATAAAATTGCATTCAAAGTGGACATACAGCGGCTTTG
TAAAATTGCAAATCTTAATAATGTATTAAGTTCAGCAATTGCATGTTttt
gtagtttggctgaaaaattgaacaattgTAAAGGATGTTGGATTAAATGT
TTtcattcgatattttttttaaggaaTTATGTGTGAATTACTTTGGTCTG
ACCCTCAGCCTCAGGTAGGTGACTATTTAGATGAACCAATCAAGCCCTAA
GCAATGCATTAGTATTCAAACACATTGCAGAAAATGATATCAGTAGGTTT
AGATGCGACCTTCTTTTTCCTTTGCTGGGAAATTTTCTCTGAACAGACAA
TAATTCtccaaaaaatgcattttcatAATTGGCCTTCATGTTGTATTGTT
TCTTTTAGAATGGGAGAGCAGCAAGCAAACGAGGAACTGGAGTATCATTT
GGACCTGATATCACGCAAAACTTTCTAAATAGAAATAATCTTGGTTTGTC
tttttttGTTGACCATAAATTGTAATAATCTACTTTGAAACTTACTCAAC
TATCCCATCTAATTACTCTTgagaataaataaaagaaagccTTTATTAAA
TGCattattagcctatttcataggattcgtgcatctgttatgctatttta
taaatttaaagGGGAAAAATGCACTAATCTGTGCAGATTTTCCTTCGAGA
AAGACGttgaaaataattgattttctGTCATCATTCAATTTACGTGGTTT
CTTTTCcattcttttttgcttttgtaAAACTCATAATCTCAATTCGAAAA
AGAGTGATCAACCACaaaaaaaaTGATTACTGAAATGACgtagaaaaata
tcatgtactaaaaacacgaatcctatgaaataggatAATATGTAACTGTT
CTATTATCTATCGGTTTGCAGAATACATCATCCGAAGTCACGAAGTCAAA
GACGAGGGATATGAAGTAGCACATAATGGAAAGTGTATCACCGTTTTCTC
TGCACCCAATTACTGGTAATATAAAGATATAATATATGTATCAGCAATGC
ATACTTAACCCTGGCTAGACAGATCGAATTGCCCAGGGCAGCATCTCACA
CCATAAAACTAATTATAGCgccaaaagaaagaaaaagtgcaCATAAAGGA
GATTCCCTGGGGAATTCTGTGAATGACTCCTTCGGATTTAAGCAATGAAG
AATATATGATGGCCCTGCAACGTTCACAATTATCTATATAGGGTGAAGGA
GCTAGTTTGTGACGTTGACGCCTTAGAACAATCAGTCACCACTCCTAAAC
CCTTTGGAGGTTTAATAGATTGACTAATTTCTAATGTTACAATTATTTTT
ACGAAAGTTGCGTAACAATTATATGTGAAATTACGTCAGATTTTctaatt
ctatcaaaatttattgaggGATACAGTGGCTCTGCTTTTGTTCCCATAAA
AAATACCCACTTCAAATAATCAGCGGAAATGAAAAAACTCTCTTCATTCC
GTTCCAGTGACCAGATGGGTAACAAAGGTGCATTCATCACACTATACGAA
GATCTCAAACCGAATTTCACATCTTTCTCTTCTGTGGTATGTTAACATTA
ATCATATTGTCAAAAGAAAGTCTTTTTCACTATCTCGCAATCGAGTTTAA
AAAAGTCTAGTTAGTtacttgaaaaataagaaactcTAAAATGTGTTATT
GTTCATAAAACTAATATGAACGAATATTTAATTTATCCATCCAATCCTCT
TTAATAATTATGTACCCTCTGTTACATTTTAGCCTCATCCTTCAGTACGT
CCAATGGCATATGCAAACTCTATGATGTCCATGTTTGGATTAGCGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000214_pilon:570150..577697+ >XLOC_041049 ID=XLOC_041049|Name=XLOC_041049|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2958bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000214_pilon:570150..577697+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgggTGAACCAATAGAAAATGGACATGCTGAAATCTCAGATGAAGTCAA
AGAGAAAGCTGAATCAATTAAAAATGAAGcaaaccaatttttcaaaaatg
ggTGAACCAATAGAAAATGGACATGCTGAAATCTCAGATGAAGTCAAAGA
GAAAGCTGAATCAATTAAAAATGAAGcaaaccaatttttcaaaaatgGTA
AATTTGACAAAGCTTTGGCACTGTACTCTGAAGCAATTGATTTGAATCCA
AATGTTGCAGCTTACTACGGAAACCGTAGTTTTTGTAATATCAAAATGGA
tttttttGGAGCTGCGTTGGAAGATGCAAATAGTGCTATCaagattgaca
aaaaatatatcaagatgGTAAATTTGACAAAGCTTTGGCACTGTACTCTG
AAGCAATTGATTTGAATCCAAATGTTGCAGCTTACTACGGAAACCGTAGT
TTTTGTAATATCAAAATGGAtttttttGGAGCTGCGTTGGAAGATGCAAA
TAGTGCTATCaagattgacaaaaaatatatcaagGGGTATTACAGAAGAG
CATCTGCAAATATGGCACTTGGAAAATTCAAATTAAGTTTACGAGATTAT
GAAGCAGGGTATTACAGAAGAGCATCTGCAAATATGGCACTTGGAAAATT
CAAATTAAGTTTACGAGATTATGAAGCAGTTGCAAAAGTTTGTCCGAAAG
ATAAAGATGCACAGAAGAAATTCACTGAATGTAAAAAGTTGGTACATCAA
CAAGCTTTTGCTCAAGCTATAGCTGTTGATGATAATAAAGTCTCCCTTGT
TGAATCTTTGGATCTAGAATCTATGAGTTGCAAAAGTTTGTCCGAAAGAT
AAAGATGCACAGAAGAAATTCACTGAATGTAAAAAGTTGGTACATCAACA
AGCTTTTGCTCAAGCTATAGCTGTTGATGATAATAAAGTCTCCCTTGTTG
AATCTTTGGATCTAGAATCTATGACTATTGAATCTACTTATGAAGGACCT
TCCCTTGACGAAGATGGGAAAGTGACGAAAGAATTCATGGATAAATTACT
ACCATAtttgaagaatcaaaagaaaattcacaaGAAATGTGCATATCAAC
TATTGAATCTACTTATGAAGGACCTTCCCTTGACGAAGATGGGAAAGTGA
CGAAAGAATTCATGGATAAATTACTACCATAtttgaagaatcaaaagaaa
attcacaaGAAATGTGCATATCAAATTTTAGTAAACATCAAAGAGTATTT
CGAGAAATGTGATTCGCTAATTGATGTCACAATACCCAAGATTTTAGTAA
ACATCAAAGAGTATTTCGAGAAATGTGATTCGCTAATTGATGTCACAATA
CCCAAGGATAAGAAGTTAACAGTATGCGGAGACATCCATGGACAATTCTA
TGATctgctgaatatttttgaaatcaatggATTACCGTCAGAAGAAAACC
CATATGATAAGAAGTTAACAGTATGCGGAGACATCCATGGACAATTCTAT
GATctgctgaatatttttgaaatcaatggATTACCGTCAGAAGAAAACCC
ATATCTATTCAATGGTGATTTTGTTGATCGTGGTTCATTTTCTGTAGAAG
TCATCCTCACTTTATTCGGATTCAAACTTCTCTATCCAAACCATTTCTTC
ATGTCAAGAGCTATTCAATGGTGATTTTGTTGATCGTGGTTCATTTTCTG
TAGAAGTCATCCTCACTTTATTCGGATTCAAACTTCTCTATCCAAACCAT
TTCTTCATGTCAAGAGGGAATCACGAAAGTGCTACGATGAACAAAATGTA
TGGTTTTGAAGGAGAAGTAGTGTCAAAGGAATCACGAAAGTGCTACGATG
AACAAAATGTATGGTTTTGAAGGAGAAGTAGTGTCAAAGTACACTTCCAA
AATGGCAGATTTATTTACAGAAGTTTACAATTTGCTTCCTCTATGTCATT
TGatcaacaaaaaaattcttGTACACTTCCAAAATGGCAGATTTATTTAC
AGAAGTTTACAATTTGCTTCCTCTATGTCATTTGatcaacaaaaaaattc
ttACAATGCATGGTGGTCTTTTCAGTAAAGATGACGTCACTATAGAAGAT
ATTCGCAAAGTTGACCGGAATAGACAACCCCCTGATTCAGACAATGCATG
GTGGTCTTTTCAGTAAAGATGACGTCACTATAGAAGATATTCGCAAAGTT
GACCGGAATAGACAACCCCCTGATTCAGgaaTTATGTGTGAATTACTTTG
GTCTGACCCTCAGCCTCAGgaaTTATGTGTGAATTACTTTGGTCTGACCC
TCAGCCTCAGAATGGGAGAGCAGCAAGCAAACGAGGAACTGGAGTATCAT
TTGGACCTGATATCACGCAAAACTTTCTAAATAGAAATAATCTTGAATGG
GAGAGCAGCAAGCAAACGAGGAACTGGAGTATCATTTGGACCTGATATCA
CGCAAAACTTTCTAAATAGAAATAATCTTGAATACATCATCCGAAGTCAC
GAAGTCAAAGACGAGGGATATGAAGTAGCACATAATGGAAAGTGTATCAC
CGTTTTCTCTGCACCCAATTACTGAATACATCATCCGAAGTCACGAAGTC
AAAGACGAGGGATATGAAGTAGCACATAATGGAAAGTGTATCACCGTTTT
CTCTGCACCCAATTACTGTGACCAGATGGGTAACAAAGGTGCATTCATCA
CACTATACGAAGATCTCAAACCGAATTTCACATCTTTCTCTTCTGTGTGA
CCAGATGGGTAACAAAGGTGCATTCATCACACTATACGAAGATCTCAAAC
CGAATTTCACATCTTTCTCTTCTGTGCCTCATCCTTCAGTACGTCCAATG
GCATATGCAAACTCTATGATGTCCATGTTTGGATTAGCGTAACCTCATCC
TTCAGTACGTCCAATGGCATATGCAAACTCTATGATGTCCATGTTTGGAT
TAGCGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000214_pilon | genome | sc0000214_pilon:570150..577697 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1414-1479:7483 |
| Aaloc | 1336-1413:7209 |
| Aaloc | 1243-1332:6624 |
| Aaloc | 1156-1239:6109 |
| Aaloc | 1117-1155:5876 |
| Aaloc | 1027-1113:5433 |
| Aaloc | 946-1026:4933 |
| Aaloc | 886-942:4721 |
| Aaloc | 778-882:4111 |
| Aaloc | 679-777:3608 |
| Aaloc | 613-678:3423 |
| Aaloc | 490-612:2903 |
| Aaloc | 340-486:865 |
| Aaloc | 268-339:567 |
| Aaloc | 100-267:228 |
| Aaloc | 1-96:1 |
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