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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000016_pilon:2419886..2426552- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041004 ID=XLOC_041004|Name=XLOC_041004|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6667bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000016_pilon:2419886..2426552- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTATACTTGATTGGATTGGGACTTGGTGATGCTAAAGATATTACTGT
GAAAGGATTGGAAGCTGTTAAAAAAGCAGATCAAGTCTTTTTGGAAGCTT
ACACATCAATTTTAACTGGAGGAAAAGAAGCTTTGGTATGATCTGTCTTT
TAAATGACACCCTCTTCTCACAGACCTGGTGGGATTTTTTCAGCCAGTGG
GGGTAGATATAACGGACCAGAACTCGATTGGGATTGATATTCCTATGTTT
TTTCATAGCTTGGGATTTGAATTCAATTGTTTTGGAGTGGGGATGAAAAA
AAATATCATACTATTTTGCAATGAGGAATTGCTTATTGGATTTTTTTCAT
TTGGGACAAAAATTAAAGTATAATTCTGCATAATGTTTTTGTATAATGTA
GGACTTTGTATAGTAGGAATTGTTATGATCTTTTTATTTGCAGGAACAAT
TTTATGGTCGTGAAGTAATCCTTGCAGATAGAACACTTGTTGAGCAAGAA
TCAGGTTTGGATGATTTCAAGTTTCTTTCCTAGAAAAACTTTGGCATAGT
ATCCGACTCCAGAAGTGATCAAATTCGGTTCATATGGGTTAGTTTATGGC
TCAAACCTGGTGGGGGAACTCAAAAGACTGTTAGATTTGACTAAGATTTG
TTATCCCTTTCTTTGGTTTAATACCTAATGACCGAGTTTCAAATCCACGC
TAGTTTTTTCCTAAATTCTAATGTATTTCATTTAGATACGATATTGGAAA
ATGCCAAGGAAAAAGATGTCGTGTTTCTAGTTGTTGGTGACCCACTTGGG
TACGTGAAATTTTCATTCTGCCATTTGCCATTTTCATTTGAAAATATGCA
GGAGATGCGGGATAAATTCAAATAGCCCTCTAGACAGGGGCCATCTGTCT
GTCTTTTGTCATTAGAGTTATAGTTGCCCCTTGCCCTGTACTCCTTTTAT
TCCTATCTCTCATTTTGATACTGATTAAGCTAAAACATGACAAAGTCATT
AATGATGTATACCCAAAAGGGAGTTTCGCTTTGTGTCAATTTTCTTTCTG
ATTCTACTGTTTCAACTCTTTCAACTGTTATAAATCTTAGAGCAACAACA
CATACAGATTTGGTTATCAGAGCTGTAGAGAAGAATATTAAGTATAAGAT
TATCCATAATGCTTCAATAATGAATGCTGCTGGATGTTGTGGTTTACAGG
TTAAGAAATTTTCAAATACATGTTGTTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGT
GGAGGTCCTATAAATTCACCTCTGTCCGTTCATCCGTCTGTCCGTTCGTT
ACCAGCTTTTCTCGAGATTGAATCATAGGAATCATTTGATTTTTGGTACA
AAGGTGCAAAACGGTGATGGCCAAAATGTGACGGAGTCCGATTTTCGAAA
AAAAAAAATTTTCGGCTAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGTTT
TTTTGGACTTTGTGAAAAATCGGAACATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCA
TGAAAGTAGGGTACCATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGC
AAAAAAATTTATTTGGCTTAAAAAACGCATGTTTATCTATAAGAACCACT
ATTAATAAGCATACATTAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTTCTTTAT
GAGATAGATGTTTTTTTTTGCTCACGAGGGCTTACTTTTGAAGCATATGT
GTGTTTAGACATGAAATTTTGGTTGCTTGGCGTGTTTTTATAGAAAAACT
GGCCAAAGTCGATATTTTTCTATCAGCACATTATCAATTACTTAGGTATT
AGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTTATGATTTTTGCACAAAGA
TGCGTAACTATAAACCCTCGAATGTGACTGAGCCCGATTTTCGAAAAAAA
ATGTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAAAGGGTTTTTT
GGACATTGTGAAATATTGGATCGTTGTTTTTTTTCTGATTTTTTTGCATG
AAAGTAGGTAAAAGATGGGTCAAGCAGATTTTTGTAAAAAACTTTTCAGC
TCAAAAAATGCATCTTTATCTATAAGAATCACTATTGATAAGCAAATTAC
TCAATTTTTTGATGAGATAGATGTCTTTTTATGCTCACGAAGTCTTGAAT
ATGAAAGAATATTTCAAGAGCATGGAATTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTT
TATAAGAAACAAACGACTAATTTTAATAAATCGTCACTATTTGTGTTCTG
AATGATTGTTTAACGTTCATGCTCACGTAGATATCAATTATATATGTGTT
AAATGCATAACCAGGTAGGTCGAAAAAGTATCACTTGTTTTATAAACAAG
TGTCTGCCCCTATACCAGGCTTGCATTATGCTTAGCATTCTATTGTTCTT
AAACGATAGAGCCATTGTTTAGGTATCAAAAACTGAGCCTACATATGCTC
ATAAATGTTATGCTTATAGAAAAAAAACATGTATTTTCTTTTCAGCCCTT
TTGGCTGATAATGCTGAAACTAAGTTTTGCTTTTAATATTTTAGTTTAAT
TCTAAACACAATAAACTGTTCCTGGACACTGTCACTAATGCTATCTTTTG
ATAGAAATAAAAAATGACCAAATAATTTGAAAATAAACGTTTCGATATCC
ATATCCATTTAAGAAACTGCCAATTATTTCTTGCACTTAAATTTAAAAGA
CATTATTTTCAGCTGTATAATTTTGGTGAAACAGTATCAATTGTCATGTG
GAATGAAAACTGGAAACCTAAAAGTTTCTTTGAAAAGATTGCTCAAAACA
AAAAGCGAGGACTACACACTCTTTGTCTCTTAGGTGAGTGCGCTTTCAAG
ATTTAGACCATGTTCAGACGTTACGGTTCCGTCCTGAAACGAAACGAAAC
GGTTCCGAAACAAGTGTGAACGTCAAAATTCAAAACTTCAGAAAAGAAGA
CGTTACAAAGCAAAACAGATCGAAACGGTTTCGCTCCACTTTTTTCATCG
GAACGGAACTGCTCCGTTTTCTTGCTCCGAAACGTTCTGAAACCAATATG
AACACACTCGATCAGTAACGAATATCATACCGGAGCGAAACGGGACAGTA
ACGTGTGAACATGATTTTAGCCAGTAACTTTGAAGGAAGCGTTTTAGTCT
AAAGCTAGGAGAATCTTCCAAAACACTCCATCTGCAATTTGCACAAGATA
ATCCTCGTATCATGGACATATTTATTATTGACTCGGATAGATTATAATAT
GAAATTTCAGGTTCTTAAAACTAAAATAGTTTTTGTCTGTTTTCTAGCTG
AAATCGTATTATGTTCTAGGCTGCGGCCTAATTTATGCTTCTGCATTTAG
TATAGCAGTTTCGAAGTGACATTTAATGTTACTCATATATTGATAATATA
AACTTTTCTGTGTTGCAGATATCAAAGTAAAAGAACAGAGTGTGGAAAAT
ATGATGAGGTATGATATTTCAAAACTTGGTTTTTAGACCGGAGGAGACTC
GGAGGTCCTGTAAATCGTCCGTTCGTCCGTTCATTTGTCCGCCCGTTCAT
CTGTTACCAGTTTTTCATTTTCTTACTATTGTTGCCAATTTTTCTATGTT
GCTATTACATTAGCTTTGTAAGTCTATTCAGCATGTAGCTTGTTAATCTA
TACAGTCTGTCATGGAGTATAATCTTGAGACTTTTGGAACATGCAAACTG
CCCAGTGAGAAACATTTCAAACATTGTTTTTTTATTTGTTCTCTCATTCC
ACAGGGGCCGTAAAATATATGAACCACCAAGGTACTTAACAGCTAATGAT
GCAATTCAACAAATATTGGAAATTGTTCAATCAGGGGATGAAGAAATAGA
AGGGAAAGATTGTAAGTATACTTTCTTTTCTAACATTTTGCTGTTAAGTA
TAATTTTACTGGCATTCACTTGGTCTGCAAGTTAAACTATTCCAGTAATA
AGATTTGATATGTATTTGTACAAGGAAAACAGCTCAATGATCACCAGTTT
TCATGTTTTATGTTACAATTATTTCCTGGTGCTAACTCTACTTTTTGGTT
TCCAAAATGATATCTTCATGGTCTTTTTCAGTGATCACGGAAGACAGTTT
TTGTGTTGCACTTGCTCGTATTGGTTGGGAAGATCAACAAATATTCAGTG
GTAAAATGTCTACAGTAAGAGATACAGATCTAGGACCACCTATACATTCT
TTGGTGATCCCAGGTGATATGCATTTCATTGAAACTGACATGTTAAAATT
ATTTGCAATACAACCAAGTGAATTTGCAGGACTTCCTTCTGCATAATTGT
TGTTGTTGATTCAATTGGCTGAGTACTTCGAACGAGTTGTTACTGTATTG
AGAATGAAGTAAATGCCCAAAAATGATGCCTTTGGGTGGCAAGGTGCTTA
GGTGCTTGCTACTGTGTTAGCAACCAAGATTAGTGTGGTGTATGGTTTAA
AATTTAAAAAAATGGTTATTATTATCCATAAGACATACATTCAAGACACA
TTATCATAGGGATGCGTTAAAGTGAATATTATCCACAACTGAAGGAGACA
ATTATTTTGTAGGTGGAGATTTAAATCAAATTATAAAATTATTTTACTTT
TTTACAAATTATCTCTTTTATAAATTGTTTTTGAGCCTATACTATGAGGT
AAGACTTTGAAACAACTCAGAAACAACTTGGCTCTTCACTGTTTCCGTAC
TTTGATAAATACAGCATAAACTGACACGTGCAAGAAATTTTTATTTGCTA
ACCTGAAGTTTTAAAGGTATCTTTTTACAAATTATTTAATTAACTGATTT
ATGTTAATTGGACGTAATCTCAAAATTGAAAGAAAATAAAATGTTTTTCT
TTTAACCTTAGATACCAGAATATTAGACGGTTGAACGTGTTCCCTGTTCT
AAACTTTTTAAAGAATTTTATCAATTAGCACCATTTAATCATATGTCACA
CTTGGCCACTTTCGATCGGTCTCTAACTTAAATACATACCATAAACGATG
TTGGTCAAACGATATTGATCAATCAATCAATTAATCAATCATAGTGAGGT
CAGGTAGCACATAAAAACGTAAGAATACTTCAGATGGTGATTAAAGCATG
AAATTTGGCACAGATGATCCTTAGAGGGTCTAAAACTTAATTTCAAACAG
TAACACCAAATTTTGCCACCTGGCCACCTGCCAGATGACGTCATCAGGTA
GCTTAGCAAAAATTTATTTTTTTGAAAATATTTAAAATCTGATGGTATCA
GCGGAAAGAGCATTAAATGCTGATGAAAATTGAGGTATAAAACATACCTT
CAAAATCTTCCTATCAAAAGTTATGAAGGTTGAAAGTTTTTTGATGACGT
CATCATTTAGTACAAATTGACCAAATTTCATGTTTTATACATGAATTCAT
ATCAAAATTCATTGCTTTTTCCGATTCCGATGTTCAAATTGAATTAAAAG
CTTTAAATCCTACAGAATACTAAAACTTAGATTTTGAGCTTCATAAGGCA
AATCAACGCAGCGTTCTCCCTTCAAGAACACAGTGTACAACCAACTAATT
TTTTTGGATGTTTTAAGCCTTCTTATGTTGTTTAGACTTAAGCATCAGAA
GGAACTTCGATTTTTGACATGGATTCATGTATAAAACACTAAATTTGGTC
AACTAGTTCCGTTATTACGGGATTTTAGGTTTTGCCTGGAAAGGCTTAAG
ATGACGTCATCACAAAACTTTAAACCTTCATAACTTTTGATAGGAAGATT
TTGAAGGCATGTTTTATACCTCAATTTTCATCAGCATTTCATGCTCTTTC
CACTGATACCATCAGATTTTAAATATTTTCAAAAAAATAAATTTTTGCTA
AGCTACCTGATGACGTCATCTGGCAGGTGGCCAGGTGGCAAAATTTGGTG
TTACTGTTTGAAATTAAGTTTTAGACCCTCTAAGAATCATCTGTGCCAAA
TTTCATGCTTTAATCACCATCTGAAGTATTTTTGTGCTAACAGACCTCAC
TAATCAATAGAAATGTGATTTTTCTTTAAAAACTAGTAATAATGTATCAA
AAAATTTTTGTAATACCTAAAAGAGAGGATATTACAAAAGATTCTGCTAA
ATCAATTTACGTAATTAAAATGTCAGATATATAATGATAAATTTTCTTTT
TTTCTTTTAGTTTCAGCTTAGGAAAAGAAATAGTTGATTGTCAAAAGCAA
AGAGTATTTAATTCCAGATCACTGAATGACGAAAAGAACAAAGAGGACAA
ATCTCACTTAAGAAGATCATTCTATCCTTTTTGATACAAAATCATTCGAT
TAATTTCGGCTTAGTTTTGAAATAGGAGCTGACAGTTTCCTGCAAACTGT
CAGATTTTGTTTCAATCTTGATCCAAACGGTTGTCAAACATAACTGTCAC
ATTGCCACTATTACTATTTTTTAATTACATATTTTATGAGTCTTTTATTT
AATTTTACGATGATCTGTTTTTTAAGACCAATCATCATTTTTGCTTGTGA
GATCCCCAATAGTGTCATGTATTGTTCTAATGGAAAAATAGGCTTGAGTT
GAGTTTTTCGATGGCAAAATGTCTCGATGCAGATCCTCAATTTGTTATCT
AAAAGATCTTACCCACAGTTCTTGTAACAAATTTACGTTTATTTCAGGCT
GGATCACAATGTATGGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000016_pilon:2419886..2426552- >XLOC_041004 ID=XLOC_041004|Name=XLOC_041004|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1452bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000016_pilon:2419886..2426552- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTATACTTGATTGGATTGGGACTTGGTGATGCTAAAGATATTACTGT
GAAAGGATTGGAAGCTGTTAAAAAAGCAGATCAAGTCTTTTTGGAAGCTT
ACACATCAATTTTAACTGGAGGAAAAGAAGCTTTGATGTTATACTTGATT
GGATTGGGACTTGGTGATGCTAAAGATATTACTGTGAAAGGATTGGAAGC
TGTTAAAAAAGCAGATCAAGTCTTTTTGGAAGCTTACACATCAATTTTAA
CTGGAGGAAAAGAAGCTTTGGAACAATTTTATGGTCGTGAAGTAATCCTT
GCAGATAGAACACTTGTTGAGCAAGAATCAGGAACAATTTTATGGTCGTG
AAGTAATCCTTGCAGATAGAACACTTGTTGAGCAAGAATCAGATACGATA
TTGGAAAATGCCAAGGAAAAAGATGTCGTGTTTCTAGTTGTTGGTGACCC
ACTTGGATACGATATTGGAAAATGCCAAGGAAAAAGATGTCGTGTTTCTA
GTTGTTGGTGACCCACTTGGAGCAACAACACATACAGATTTGGTTATCAG
AGCTGTAGAGAAGAATATTAAGTATAAGATTATCCATAATGCTTCAATAA
TGAATGCTGCTGGATGTTGTGGTTTACAGAGCAACAACACATACAGATTT
GGTTATCAGAGCTGTAGAGAAGAATATTAAGTATAAGATTATCCATAATG
CTTCAATAATGAATGCTGCTGGATGTTGTGGTTTACAGCTGTATAATTTT
GGTGAAACAGTATCAATTGTCATGTGGAATGAAAACTGGAAACCTAAAAG
TTTCTTTGAAAAGATTGCTCAAAACAAAAAGCGAGGACTACACACTCTTT
GTCTCTTAGCTGTATAATTTTGGTGAAACAGTATCAATTGTCATGTGGAA
TGAAAACTGGAAACCTAAAAGTTTCTTTGAAAAGATTGCTCAAAACAAAA
AGCGAGGACTACACACTCTTTGTCTCTTAGATATCAAAGTAAAAGAACAG
AGTGTGGAAAATATGATGAGATATCAAAGTAAAAGAACAGAGTGTGGAAA
ATATGATGAGGGGCCGTAAAATATATGAACCACCAAGGTACTTAACAGCT
AATGATGCAATTCAACAAATATTGGAAATTGTTCAATCAGGGGATGAAGA
AATAGAAGGGAAAGATTGGGCCGTAAAATATATGAACCACCAAGGTACTT
AACAGCTAATGATGCAATTCAACAAATATTGGAAATTGTTCAATCAGGGG
ATGAAGAAATAGAAGGGAAAGATTTGATCACGGAAGACAGTTTTTGTGTT
GCACTTGCTCGTATTGGTTGGGAAGATCAACAAATATTCAGTGTGATCAC
GGAAGACAGTTTTTGTGTTGCACTTGCTCGTATTGGTTGGGAAGATCAAC
AAATATTCAGTGGCTGGATCACAATGTATGGTGCTGGATCACAATGTATG
GT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000016_pilon | genome | sc0000016_pilon:2419886..2426552 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 709-726:19 |
| Aaloc | 640-705:2585 |
| Aaloc | 532-636:2913 |
| Aaloc | 493-528:3248 |
| Aaloc | 370-489:3956 |
| Aaloc | 262-369:5577 |
| Aaloc | 199-258:5931 |
| Aaloc | 136-195:6225 |
| Aaloc | 1-135:6668 |
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