XLOC_041002 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041002
Unique NameXLOC_041002
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000016_pilon:2368821..2383823-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041002 ID=XLOC_041002|Name=XLOC_041002|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15003bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000016_pilon:2368821..2383823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTTTGACTCAAAAAATCTTAAAAATGGCAATAGACATGAAGCTAAAATC TTTTTGCAGTGATACTCTTTTGGAAATACTCCAGGGAAATCAAAATCGTT TGGGTTTAGGATTTGGGTATATCCACCATTATGGAATTGAAATCTGTGTT AAAACTGGCTAAAATACAACGTTTCAAGCAAAAACCCTGTTTTTGAATAA AAATTGCTCTAAAATGACAATAGACATGGACCCAAATTTTTTTGAAGTGA TAGTATTCTGTGAATAGTCTGAGATTTGTTTACATCCACCCTTATGGAAA TGAAATCTCTGTTAAAATGCTACATATTTCCATCCGATACATCATAATTG ACTAAATATTTTGTATATTATATTAAACAAAGAATGTGAATTTACAATCC TTTAATTTAAAAATACTAGTTGAAATAAATTATTAAAAAAATCCCATTTC ACTCAACAATTCTTTATAGCCCACTTACATTTCCATTTTCAAGACTTGTT CCGTCAAAAAAAGATTGAATTTTAGCTTGAAATATTATATACATTTTAAA ACTGGCTTCAGTTTAAAACTTGCGGTCCCAGAAGCATCTTATACCTGAAT AGTTTTTACCCCTAGAGTATTCACAGAACACTATCGATGCAAAAAGATTT TAGGTTCATGTCTATTGCCATATTAGAGCAGTCTTTAAGTCAATATGGGA TTTTTGCTTGAAATGTTGCAATTTAGCCAGTTTTAGCACAGATTTCAATT CCATAATGGTGGATATACCCAAATCCTAAACCCAAATGATTTTGATTTTC CTGGAGTACTTCCAGAAGAGTATCACTGCAAAAAGATTTTAGCTTCATGT CTATTGCCATTTTTAAGATTTTTCGAGTCAAAATTTGGATTTTTGATTGA AATATTGCGCTTTAGTAGGAATTTCAATTTCAAAATGGTGGATATACCCA AATCCCAAGCCCAGATGACTTTGATTTTCCTGCAGTATTTCCAGAATACT ATCACTGCAAGAAAATTTTAGACCCATGTCTATTGACATTTTGGAGATTT TTCAGTCCAAATTTGGGTTTTTGCCTGAAAAATGGCTCTTAGCAGGGATT TTATTTCCATAATGGCGGACATAGACGCATCCCAGACGCAAATGATTTTG ATTTCCCTGGAGTATCTTCAGTATACTATCACTGCAAAAAAAATTTCAGT CAGCATTTAAACTCAGTTTGTAGAAGCTTGCCTTAAAAAATGCCATTTTT TGAGAAATATGATTTTTTTTTGCTAAAAAGCGATTTTTGAAGACGCCATT ATGATTTTTTGAAAAAAGTGAAAAACTTGAAATTCATTTTGCTTAAAGAC TTTATTGAAGACTTCCATCTCTGAAAATTTTAGATATGTGAATCAATCTG TTTAAAATTTATGAGCTTGCAAAATTGGCCTTAAAAAGCATTTTGCTACC CAAAATTGGCTTAAAACGGCTCGTTTAGGGCTCCAATGGGCACAATTTTC AATCCAATATGATTATTTTGTTGTTTCTTCGTAAAATTTAGTACAGCAAG TGAAAAAAATAACTTTTGCAATAGATTTGACATATTTACAGGCCTGAAAA GGCCAGAAAATGCCATTTTTTCCAATTTTTGCCTGTAGTGCGAATCAGTA CCCCCAGGGGGGTTCGGCCAATTTTGAACTTCTGACCTTAAAAATTGCGC AGAATGCCTCACAATAGGTTAAATTTTCATAAAAAAACACTACATCTTGA ATTTTCTGACTTTGACATTTGACGCCCCACCCTACCGTCAGTTTTTCTTT GAAGCGTCCTCTTTTTTGATCCTTTTGATGAAGTTCTAAATTTTTATTGT CTGCACAGTGGACCGGGACTGTTTTATTTGGAACCGTAATGTCTGAACAT ATTCTTAGGCTCTGCACCTTATTTTTACTATAACTTTTTATCTGCTTAAA GCTCAGTAACCTAGGTTCAGCTTTGTTCTTAAGTTATTCTTTTAAAATTC TTCTAGTAAAATAGAAGTATTTTGGACTATTCAAGAAAAAGTCCTTCCCT ATTCTATGGTTTATATACTACGGTATCCAGGGAGAATCCACATTGTCAAA ACACAAGGAGGTTTATCAGATTTTAAGATTAAATATCCAGGGAGACTTTT GTCGAGAAAGAAATAAGGTCTTCTAGATTTTCATAAAAATGACCTCTAAC TAGTCATTTATCAAAATCTAAAAGAGCATACACGATGTTGCTACTCCTCT TCCATTCGGGTGTCACTGAGGATTTGAAAAGATGTTTGATACCGCATTGC TTGATGTTTGATGCTGAAGATTCAAATATGGCTGGAGAAATATAAGATAA GAAATGATAAACTGAGCAAATTTTTCCATTTCAGAACACGCTTGCAGAGA TGAGATTGCAGACTGCCATCTTGTTATCACAGTTGATAGATGAACAAGAG AAACGAGAACAAAGATTGAAATCCACTATCGTAAGTACAGTTAACATTCT CTAATTCGACGGGGAATCTTATTTGTTCGTATAACAAAAAGATTCGAATT ATTAGTAGAGGGAGGACCCGTGACCTATCTTTAATGCGACGCAGCCAAAC CTGCTCCGTTTCGACGAATGAAGTATTTAAAGAGTTTTTCGCAAGGGAGG TTTTTTGCTAAGGCCTATGAAAAATTTTTAGGACTCGAAAACTGATGTCA CAAGCAAAACCCCTTGACCCCTAAAATTTGACGAAATTTCAAAGTCAATA AAACCCGAAACCACTTATACCAAAGCTCAAATCATATAAAAAAAACTATA TAGAGGACTTTTAAGTGGATATTAACGAGAAAATTAACGTCAAAATTACG AAGAGTTGACTGTACAACCTATTGTTCTAATTTTCTCAACTTTGATTGGT CTATTTCAAAGATTATAGGCACAATACCCATGGTAGTGTTTTAAAAGCCA GTGATTTATGAGGCTATTTGCTCATGTTGCAAAACCAATGCAGAATATTT ATTTTCTCAATTCTTTTAATTCTTTCAAATCGCGTTAAAAGGTTTCAAAA TAATAATCTGCGCTTCATAAATGTAGAAAAGTTTTCTATCGTTAAAATGA AAAGTCAACTGACGAAACGCGCGCTGTTTTGTTCCAATGATTCACCTTTT CGACGTAGACTTCGCTAAATAGAGTCAATGTACCTTCAATCCTTTTTTAC GATTCTGATTGTCGTAAACCCAAGGTCAAAAAGTGATAAGCAAGTAAGTG TGTTACCGCAGTCAGAGGTGACCTGGAGGCTCCTCTTTCGATCGATAGCT ACCTGAAGGTAGAGGAGGGCGCCACTCTTTCTCCCTGGGTTGCCCCACTT ATCCTTGATCCTTCTCTTAATTGCTGAGAATCAAGCAGAGAGGCATCAAT TATCATTTTGTACTAAGTAAGAAGTTTTTGGTATGACCCGGCCGAAGGTT ACACCCACGACCTTGTGCATCGTAGCGGATGCTCTAGCATTGCATTACGG TCGCTTATTTATACTTAAGAGTGATCAATTCAGGTTCACTGCAAAAATCT CAATGTTTAACTTTTTCACATCTCAAATCTCCAATTTCTTCTTCATTGCC ATAGCACAAAATGGAAGAGGAGAGAGATGACCAAACTAAAGATTTCTGGT TGATTCAATTCCAACGTCTCGTGGATAACAAACCACAACTCTTGATCGAT GACGTAAGTATGACGTAATCTCGGATACAGCCGCCTATCCATTCGTGGTA TTCATTACGTAATGTTTTATACGGAAGCACCCGAAAAAGACCAGGTTTTT GACACTAATTTTGAACTGAAACAATAAAATTAGTGGTAAACAACCGGGCT ATTTTGGGTGCTTCCGTACATAACATTATACGTCATGAATATCATGAATA ACTCGAACCTTGTCTCTTCGTTTCCGACTCTGTATAATTCTAACATTCTA TGACTTGAACGAGTACTGATCTAAATTGCTGTTTGACCTATAGGGACACT CATTTAGTACCTTAGTACCAGAAGAAAACAACTATTTTGGAACATGATTG GGTCTAAAATTGGTAAAAAGGTACACAATAAGACATATTTCTGTGAACCC CTGGTAAAGTGTAAATGAAATTTATACTTTTCTATTTAGGAAAACAAACT GGATATGTATGTTGTGGAAATACTCTTACATGCCAGTGCACGTGAATATC TTCCACATTTTGCAAGACATCACGTGACTGAAATGGAAATGAACCAAATG ACACGTGACCGATTGAAAGAGGTTCCTTTTTTTGTTGTTCTCTGTATTAT TAGCTCTAAACTATCACACATTCCCACTGCTCGGCTTATTACTCTTTGAA ACCTCTTATCTCATGAATTTAAATTTGATTGACCTATTAATCCCAACGGG GTACGGGCTTATCGCCCGTAAACACACCGCCTTTATATTAGTAGGGGCTG AAGGTTGTAAAAGTTAAAAGAAACTAATTTCAGGCATAATGGCGTAAATT TTAATTCTGGTCCCTGAAAGGCTATATTCCTGAAGAATACTTCCAATGAG GGTCACAAAGTTCTTGAAATTTCTAGCTTCAATTTTAGCTTCTACTTCTT TCACTAAAGATTTTTGTGCCAAAATTTGGGGCGATATATACCGTCGGTTA CCCGACAAACTTAAAACACCGCCCTCCAGCAGACCTTTATTGCTTAATTT GATCATGAAATTACATTCGTACTATTAGCCTGTGCCACTTGTCATTTTTA TATTTTTGCGTTAAACTTTCGCACAGGCTAGTGTTTTTCAGCTTCGTAAA ATTTTGGATCTTGATCATTAATAATCCGTTTGACATGCCAATAACAAGTC CTATATAACACCCCTTTCTCACAGCCCCCGGGAAACTTTTTCCCACAGCG GAGATAAGATTTTCTATCGAAATCCCGATGGGAACAAAGATTCTATTGTT CTAAAGTCGCAGATTCAAGTGGGGATGGTTTTGGAGTGCAATTTTTTACA TCGAATTTTGAAGAGGGGGTGGTATCAAAGTCTATTTCCAAGTGGGGCTG AAATTGTAGGGTAATCTTCCCACCGGGGACAAAATTTTGGCCAAATTTCC CAGTGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTTTGTGACAGAGAGGTGTTTTATAAT AATCTCATGTCATCCCTTTGTTCTTATCTTTCTTAGATCGGTGTACATAA TGAAGAAATGATAAGCAACATTTTATCAAACATTGATTCCACAAAGAGCA TCAAAACGAAATTTGTCGAAAAAGAAACAGAAATATTTGTAAGTTTCATT TTCTCCGGGTGCTCTCTACAATGAAATTCAATAAGTTGATAGTTGTTGAA AGGATTTCTAAACCATTAAGTACCATTAACTACGCACTTACTTCTACATA ACTGAATCCTAACTTAAAACATATGCTACATTTGGACAGGGGTGTAGTTA AGAAAGTCATGTGAAAATGTTCCAGTCCGACTTTACCTTTAACCCCCCCC CTCCATTGAATTATTATAGTTCCCGATAATTTACAGAAAGGTTAGTGGTA AAGTGTGTAAAGTGTGAGAGTGGCCTCAATTATCACTATAAATCTTTCCT TGAGACCCGTGCACGTACACTTATCGATGTCCTTGGTCCCCTAGCCTTCT GCTCAGTAACTTGGTAACATTTCTTAGGCAAACATTCTTTCCACATTTGA AATCGAATGGGGAATCTTATTTGTTCGAGTTACAGAGAGATTCAAATTAT AGAAAGTATTTAAAAAGGTTTCTCCTTGACGGGGACTTTGAACAAGTTTT ATTTATAGAAAGATTGGAATAATAGAAGTTCGAATAAGCGAGAGTCTACT GTATATTAATCATATTGTTTATACTCCTTTATCAGTCACCACAGAAGGAG GTGGTAGAGGATCCATTAGCAAATGCAACTCCATCACACGTGCCAAAGAT GATTGCACCACCAGCTCTCGATGTGTGTTCAGAATCCGAATGTGTCATTT GTCTAGAAGAACAGGTAACTCATAATTTCACGACGAAAATATAAGTATTT TAAATAAAAAAATCTATTCGTTTGATACTTAAATATACAATTAATTTTAA ATTTTTTTCTAATCCCACGCCACGTTAATTCAGTTAGAATCTTCAATCTG TTTCGTTCGATTTTGGTCCTATTGAATTTGAAAGCTTTTAATTTATTCCC CAATAAGTCTTTAGGCCCAAAATTCGGTTTTGACTTATTAGGAAGGGTCG GCCATTATCAGACTCGGCGTACGAGGACCAGGTATTATTTATATATTTGT ATAATTTCTACATTTCTACCTTTTCAGCCATCAGTTGTATTTTTGACTTG TGGTCACGTGTGTTGTTGCGCAACATGTTGCCAACCATTGGATATATGTC CGTTATGCCGGCAGCCGATCACACAGAAATGTCGCTTGTACCGAAGTATG TAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000016_pilon:2368821..2383823-

>XLOC_041002 ID=XLOC_041002|Name=XLOC_041002|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3066bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000016_pilon:2368821..2383823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGATCCGTATGCACAACTCCTGATGATGATTTTGAAGAAAGTATCAAGAA
ACGGGAAGAACTGAAATTAAAAGAACAAGAAAAGCGCTTACAGATTGAGC
GTGAGATTTTGGAGGGTCAAGAAGATACAGCCAAACTGGTTGCTAATGCA
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GAAACGGGAAGAACTGAAATTAAAAGAACAAGAAAAGCGCTTACAGATTG
AGCGTGAGATTTTGGAGGGTCAAGAAGATACAGCCAAACTGGTTGCTAAT
GCAGAACAACAAAGACATAAATTCCATGTGGATCTAGAAAAGAGCAACCT
CCAAGCACAGACGGAGCTAGCTGAACAATTTAATCACGAAAACCAACAAC
GAAATAAACTCCTGGAGGAACTTTATTTAGGAGAGCAACCTCCAAGCACA
GACGGAGCTAGCTGAACAATTTAATCACGAAAACCAACAACGAAATAAAC
TCCTGGAGGAACTTTATTTAGGAGAGGAAAGTCATTTCAATGAAACTGTC
AACCTACTTGTTAGCATGGCCGAAAGAGGAAAGTCATTTCAATGAAACTG
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GCGAAGAAACAGAAAGATTACGTAAACAAGAAATGATCGAGAACGTATAG
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AGCGAAATGGGAAGAATATGAAAATCGAAAGAAAGAAACAATGGTCAAAT
CAATCTGCAGGGACGTTCAAGATCAAGAAGATCTTGAAAAAGTGTTGAAA
GAAAAAGATGAAGATCAATCACGTCTCCTGCAAACTGTCATTACGGAGGG
ACGTTCAAGATCAAGAAGATCTTGAAAAAGTGTTGAAAGAAAAAGATGAA
GATCAATCACGTCTCCTGCAAACTGTCATTACGGAGGAAGAGAAACAACG
TGCAGCCTTCGAGATGCTTCAATTTCAAAAGGATTCAAGGCTGAATCGAA
TCAAGAAAGAGGAAGAGAAACAACGTGCAGCCTTCGAGATGCTTCAATTT
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AACACGACGATGAAGTTGTGAAGATAATCGAGACAGAGTTAGCGAGATTA
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TGAACAAGAGAAACGAGAACAAAGATTGAAATCCACTATCCACAAAATGG
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CGTCTCGTGGATAACAAACCACAACTCTTGATCGATGACCACAAAATGGA
AGAGGAGAGAGATGACCAAACTAAAGATTTCTGGTTGATTCAATTCCAAC
GTCTCGTGGATAACAAACCACAACTCTTGATCGATGACGAAAACAAACTG
GATATGTATGTTGTGGAAATACTCTTACATGCCAGTGCACGTGAATATCT
TCCACATTTTGCAAGACATCACGTGACTGAAATGGAAATGAACCAAATGA
CACGTGACCGATTGAAAGAGGAAAACAAACTGGATATGTATGTTGTGGAA
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TCACGTGACTGAAATGGAAATGAACCAAATGACACGTGACCGATTGAAAG
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GATTCCACAAAGAGCATCAAAACGAAATTTGTCGAAAAAGAAACAGAAAT
ATTTATCGGTGTACATAATGAAGAAATGATAAGCAACATTTTATCAAACA
TTGATTCCACAAAGAGCATCAAAACGAAATTTGTCGAAAAAGAAACAGAA
ATATTTTCACCACAGAAGGAGGTGGTAGAGGATCCATTAGCAAATGCAAC
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GTGGTAGAGGATCCATTAGCAAATGCAACTCCATCACACGTGCCAAAGAT
GATTGCACCACCAGCTCTCGATGTGTGTTCAGAATCCGAATGTGTCATTT
GTCTAGAAGAACAGCCATCAGTTGTATTTTTGACTTGTGGTCACGTGTGT
TGTTGCGCAACATGTTGCCAACCATTGGATATATGTCCGTTATGCCGGCA
GCCGATCACACAGAAATGTCGCTTGTACCGAAGTATGTAACCATCAGTTG
TATTTTTGACTTGTGGTCACGTGTGTTGTTGCGCAACATGTTGCCAACCA
TTGGATATATGTCCGTTATGCCGGCAGCCGATCACACAGAAATGTCGCTT
GTACCGAAGTATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041002XLOC_041002-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000016_pilongenomesc0000016_pilon:2368821..2383823 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1408-1533:127
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