XLOC_040890 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040890
Unique NameXLOC_040890
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000163_pilon:98091..115266+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040890 ID=XLOC_040890|Name=XLOC_040890|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17176bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000163_pilon:98091..115266+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000163_pilon:98091..115266+

>XLOC_040890 ID=XLOC_040890|Name=XLOC_040890|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000163_pilon:98091..115266+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTCACAGCTGGTAAAAGGGGACGAGTATGCTCAAGACTGCAAAAGAAT
TGCAAAGTTTCACAGCTGGTAAAAGGGGACGAGTATGCTCAAGACTGCAA
AAGAATTGCAAAATTCATGCAAGATTTGGCAGCACACCCGTCATTCCAAA
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TTTGGCAGCACACCCGTCATTCCAAAACGATGAAAATCTGAAGAATTTCT
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CCATATGGACAGTGACGAAGAATTTCAGGGCTGGCGAGACAACACGAATA
CACTATTAACTCATTTGAAGCAACTCCATATGatCAAAGAAAAGTTATTA
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AATGgTTTATTGGACAATTTGCTGATACTCTCGAAGATACAATGAAACAT
GGTCAATCATCGACATTCATATCCGAGGACACGTTAGGGACGGCCATTGA
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CATTCATATCCGAGGACACGTTAGGGACGGCCATTGAACTTTACACTCGA
TATATGCAGGCTTGTCAGACCATGTTATTCCGCAGAACAACGAAGATGGT
AGAACTAGACAATGCAAAGAAAGCTCTTGCAAAAGCTAAACCTAAGAACC
AGGAACAGACCATGTTATTCCGCAGAACAACGAAGATGGTAGAACTAGAC
AATGCAAAGAAAGCTCTTGCAAAAGCTAAACCTAAGAACCAGGAACAGCT
ACAACAAGCCAAAGATGATGCTGAAAAAGCGTTCGAAGAAATTACTGAAG
TCATGAGGAAAGAGCTACAACAAGCCAAAGATGATGCTGAAAAAGCGTTC
GAAGAAATTACTGAAGTCATGAGGAAAGAGTACGAAGACTTCAACACGAA
ACGTATACAATTCTTTCAACAATCGCTGGAAGCGTTGGCGGAGAGGAAAA
TTGAAGAACACAAGACTACATCAGATCTCTTGAGTAAAGTTATCGTGGAG
TTAAAAGCGGCCGTTTAATACGAAGACTTCAACACGAAACGTATACAATT
CTTTCAACAATCGCTGGAAGCGTTGGCGGAGAGGAAAATTGAAGAACACA
AGACTACATCAGATCTCTTGAGTAAAGTTATCGTGGAGTTAAAAGCGGCC
GTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040890XLOC_040890-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000163_pilongenomesc0000163_pilon:98091..115266 +
Properties
Property NameValue
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Aaloc316-390:712
Aaloc259-312:1