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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040876 ID=XLOC_040876|Name=XLOC_040876|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGATATCAAAGAAGACCTAAAGCGTTCTTCATCCGAAGGAAGGCGTTC
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CGACGATTTTGGTAGCATGTCAACtaccgtctccttcgatttatccCGAA
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CGTGGATCTTCTTGAAACGACATTTGGACAGTCAAAAAGGAATATATCGT
GGCTCATTTGTTTCGTTGCATAATGATGATGAATGTAAGattgaataata
ttttttttctgacgAATCATATCACTTTACGATGAATTAATGAATggtga
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ttccgGAATTGACTTGAATTTAAATGTAAGGAGCTACGGGGCAAATTTAA
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CAGCGTCAAGACATCGAAAACTATAAGAAGTTTTTCTTGGATCACCCGAG
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TGGGAAAGAGTACAGACCAACTCAAAACATCGGCTGTTAGCTGTTACCAT
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TGTCTTAAATATAGGTCAATGCTTTGAACCAATAAATTGATGTACCTCTG
GGgatatcacttagtgcctaGCAGGAGGAGGactattttttttgtcatta
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ttgattattttccaTAGGCGATGTTCGGAGGGTATATTTATTCATACGCA
GTGAAAGGAACGGTCAGCATGACGTCAGATCAAGGTGCTTACCTGACTTC
CATGTACTGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+ >XLOC_040876 ID=XLOC_040876|Name=XLOC_040876|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2184bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGATATCAAAGAAGACCTAAAGCGTTCTTCATCCGAAGGAAGGCGTTC Caaaagaaaacggcatggcgcaaaagaaaagtttaaaaaacagaaaagtg TATTCCAGAAGTTATTGGAATCAGAACATCACATGGCAATGGTGTTTAGT TATTGTGGTGTTTTTCTGTTGTACGGTATGACGGATGAGCTCTTAGATGG ATATCAAAGAAGACCTAAAGCGTTCTTCATCCGAAGGAAGGCGTTCCaaa agaaaacggcatggcgcaaaagaaaagtttaaaaaacagaaaagtgTATT CCAGAAGTTATTGGAATCAGAACATCACATGGCAATGGTGTTTAGTTATT GTGGTGTTTTTCTGTTGTACGGTATGACGGATGAGCTCTTAGGTCCAACA CTGATTGAACTGAGTTGTCTTGcagccaaacctttaaaaacaaTGAGCTG GTTGTTCTTCTCACATGACATGGGTCTACTTTGCGGAACGCTTTTCGGTG GATTGATTGTGTCTAGGTCCAACACTGATTGAACTGAGTTGTCTTGcagc caaacctttaaaaacaaTGAGCTGGTTGTTCTTCTCACATGACATGGGTC TACTTTGCGGAACGCTTTTCGGTGGATTGATTGTGTCTAGGGTTGATAAG AATTTGGCGATGACAATTTGTTTGATATCAAACGCACTTAGTATCACTAT ATTACCCATTCTTCACAAGTTTATGGGCATGGTGATTTTCGTCTTCTTGT ATGGTTTCTTCCTCGGAACACCTGACACACTGGCTAATGTCATGCTCATC AAAGTCTTCGGAAAGGAGGGTTGATAAGAATTTGGCGATGACAATTTGTT TGATATCAAACGCACTTAGTATCACTATATTACCCATTCTTCACAAGTTT ATGGGCATGGTGATTTTCGTCTTCTTGTATGGTTTCTTCCTCGGAACACC TGACACACTGGCTAATGTCATGCTCATCAAAGTCTTCGGAAAGGAGGTTG CACCGTACATTCAAGGAGTTCATTTCTTTTACGGATTCGGTGCATTCTTG AGTCCATTGGTGGCCAGACCGTTTCTTCGGAAGAGCTGTACATACATGAT CAACACAACGAAATATTATGATATACCTGACCCAACGTTGCACCGTACAT TCAAGGAGTTCATTTCTTTTACGGATTCGGTGCATTCTTGAGTCCATTGG TGGCCAGACCGTTTCTTCGGAAGAGCTGTACATACATGATCAACACAACG AAATATTATGATATACCTGACCCAACaTTCAACTTAACTTATGATAGTGG CACAGGTTTATGGGCCAAATCCAACACAGAATTCAAGCGAGATGAAGATA GCGATATAAGATACGCTTACTGGATGGCTGCGCTTTTCCACaTTCAACTT AACTTATGATAGTGGCACAGGTTTATGGGCCAAATCCAACACAGAATTCA AGCGAGATGAAGATAGCGATATAAGATACGCTTACTGGATGGCTGCGCTT TTCCACGTACCAGTTATTTTCGGATTATCGTGGATCTTCTTGAAACGACA TTTGGACAGTCAAAAAGGAATATATCGTGGCTCATTTGTTTCGTTGCATA ATGATGATGAATGTACCAGTTATTTTCGGATTATCGTGGATCTTCTTGAA ACGACATTTGGACAGTCAAAAAGGAATATATCGTGGCTCATTTGTTTCGT TGCATAATGATGATGAATTACCAGTACAATCTTTAGATATGGTATCATTT AATCCCGAGGCTTCTTTCTGGGAAAGAGTACAGACCAACTCAAAACATCG GCTGTTAGCTGTTACCATACTATGTTCTGTAATCATGTATCTATATGAAG GGCTTATGTACCAGTACAATCTTTAGATATGGTATCATTTAATCCCGAGG CTTCTTTCTGGGAAAGAGTACAGACCAACTCAAAACATCGGCTGTTAGCT GTTACCATACTATGTTCTGTAATCATGTATCTATATGAAGGGCTTATGGC GATGTTCGGAGGGTATATTTATTCATACGCAGTGAAAGGAACGGTCAGCA TGACGTCAGATCAAGGTGCTTACCTGACTTCCATGTACTGGGCGATGTTC GGAGGGTATATTTATTCATACGCAGTGAAAGGAACGGTCAGCATGACGTC AGATCAAGGTGCTTACCTGACTTCCATGTACTGG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000163_pilon | genome | sc0000163_pilon:338079..354438 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1000-1092:16268 |
| Aaloc | 862-999:15303 |
| Aaloc | 754-858:14879 |
| Aaloc | 640-753:11192 |
| Aaloc | 499-636:10367 |
| Aaloc | 322-498:9526 |
| Aaloc | 199-318:657 |
| Aaloc | 1-195:1 |
|