XLOC_040876 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040876
Unique NameXLOC_040876
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040876 ID=XLOC_040876|Name=XLOC_040876|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATATCAAAGAAGACCTAAAGCGTTCTTCATCCGAAGGAAGGCGTTC Caaaagaaaacggcatggcgcaaaagaaaagtttaaaaaacagaaaagtg TATTCCAGAAGTTATTGGAATCAGAACATCACATGGCAATGGTGTTTAGT TATTGTGGTGTTTTTCTGTTGTACGGTATGACGGATGAGCTCTTAGGTGA GAGTCAATAATATTTTATCAAACTtactgaattttgaaataaagacTGAA ATTGAGTACCGCCAATTACGCTCATGTTTATGAGAGCCAATAAGATTGAG ACTCAGATATATTTTTGGAAGATGAAGATCCCAGTTTTGACATCTTAGAC GGAGTACTTCCTGGGTAATACAGTACAGTACTCCCTCTTACTAACAAgtc tcgtttttttttcaaaaattctaatAAGTGTCGCATTTGAATGTGCCCGC GAAGGCAACTCTATTCATAGAAACAAAGGCGAAGGTAGTGGATGGAGCCA CTCTTTCTCCATGGATTGCTCTAGACCTTGatccttgatccgtctcttta ttTACTGAGCATCAATTACCAATTttgtctttggtatgacccggccgaGG ATTGAACCCAAGCCTTGCACACCTTTCGCAAAAGACCTACCTTTACTTCT TTAGGTCCAACACTGATTGAACTGAGTTGTCTTGcagccaaacctttaaa aacaaTGAGCTGGTTGTTCTTCTCACATGACATGGGTCTACTTTGCGGAA CGCTTTTCGGTGGATTGATTGTGTCTAGGTATGTGATTTGATTTTCATGT GTCGTTGAAAAATTCGTCGATAAAAACATTCGTCACTTGTCACTAACTTC ATTACCGACAAATAGTTTTTCTGACGAataattgccaccgcagggagcct aaaacaaccgaggatggcattcatagcttcacgcctAAGGATAGTTGGAC AAATAGCTCACAATTTTGCGCACTTGTTTGTCACTCTTCTTATACCGGTT AAATGGTAGCCCGGTAttaagtttgtctttttcttatccctagaGAATTA ATGAACCTaggaaattcactttttttgggaAGTTCCCTTTTTATatcaca agtagttattaagcgctccgCGTAGAACAAACGTGTGCACTAGTAAAATA ATATATGAGAGCAGTATCCTTACATACACGGTTATAAAAATACaatgctg aaatttggccaaaaattaagaacagtcttTACGGAGAAGTAcaaatttcc attttaattgATATGACAAGAACATTCAAGTCTGAAAGACTCATAAAATT cagagcagcccagccagagcCATCCAATAAGTTATGGTTATGGTAAATTG TTCTTATGTAAGGTAAGGCACATATGTCAGTCTAAGTAGACGCTAAAACA AAATGGGCTTTACTTTTGAAACTataactgtaaatcactcccttgacaca tttgatagcatttgaagactgaattttgtctcagatcagATGAGAAGtta aaaattactgtagggctaatacCTTTCCTTTTGAGAGCAAATTCAACTCA ACTCATTTGGAAAAAATAGTCGTCGAGTTCGTCGGTAAAAAATTCTTCAC CAAGtgatttttcgtcactttttgtcGACGAATTTCTTTTAGAGTATAAT AAAGGTATAATAAAGATTTATTAGTGTAACTGGTTAACGAGGTCcccgga ccttcaattcacgcaatttttgttcacgcaaagttTTCAGatttacgcat tcacgcaattttttcaacattttcacacattcacgcaactGAAAAAGTCC ATTCATGCATTAACGGAAACCGGTCGGGGTGGGGGCGTTTACTCCCTTGA TTTCCGTAAAGGAGGTAGGctcgattcccactcggtgctgtGATTGACTT GAAAAGTGAAATTGAGAACAGATTGTTTTCCACGgccagatcaaaatttt aatacaccttttcgaccgtagccgccaattgccgcgtgggcagtttttgt ccgttttaccaccctaaaaccgtcccagtctttttttcgcacttaaagaa aatataaaaaaagtgtgaaaaaaggattggatcgagtttagggtggtaaa ttaaataataaagtggcacgcgcctgaccgcgcgactacggtcgaaaagg tgtataattCCTTATCCTAGAAAGGGAAGATTTTTTGGGCAAGTGCCAAC ATCCAAtgcattttattttctttctacgCGACCTATTAATTCTttggaaa aatatcaagtaatgGCTAAAGACTTCAGAAGAATGACGTATAATCCGATC AGAAAGTTTGTTTACTTGAAATTATTTTCCGCGCAAAAAACCAACACGAA ACCAACAGTAAATTTAGTAATTCATtgcaaaatttgatattttacctTAT AAAAATGCCAGTAGAGTAAGTAGGTCAGAAAGCCTGTTTTTATGTTCGTA ACGAGCAAAGAATTAAAACTTGACGCAAGGGCCATCATATCATAATCCTT TTGGGTGATCTGCCCCAAACACTGCTACTGATCAAGTTATGATCGATTCA TTGGACAAGGCTTCTGttaagagccccccccccagcggatcTTCAAAtta cgcaatcacgcaatttttttttcgcaattcacgcaattttcgttcacgca aagctttccaattcacgcattcacgcaattttctttcacgcattcacgca agtgaaaaagcccattcacgcattcatgcaaacCGCTGAGGGGTTCCTGT TAAGTTCATGACAAAATTTTATGTTAATTTTATAAgtttatttattgaaa attgggCATAATAGTTTTGATTGATATACAATAAATTTATGATATACAAA TGCATGCTAagataaaattcttgaaaattatagatgttttattcaaataa aaatcaGCTAAATTCATATCAACTACAAAATTCTAGAGTAAGCTTTCTTT GACTCAGACAATTAAAAAGAACTTAGAATATCTTTCTAATAGTCTCCCTT TTATTTCCCCTGGTAAAAAGTATACTAGTTTCTGGAACGTGACttttaaa gaaagaagaaattcaCAGCAATAATTCCAGGTCTTACAGCaaacttaaaa attattaaaaataccaagaaaaaaaattaaattaagaaaattCTAGTGTT TCTCATACATTTGTATGTACACATCATTTCTTCTCTACATTTTGCTCGAC ATACATCTCTTTTCTGATTGGCTGAGACCAACGAACCTCGTTTCTGATTG GCCAATTCACTTACTCgcttctgattggttgatttgtATGATTCTGTATC CTTATTGGTTGTTTTAATTTCTCGTTTGTCGTTGTAAAGACTCGGGAAAT AGTCGGAAGATGGATGACTACGGAAACTGTCTCGGCACATCGAAGGGTAG AAATCACAGAGAGTTTTCTCTGATGATACTCTCTGCAAAAAATAAAGGTG GTGCACAATAAAGTGTCTTAGAATGTTAGAATGATTATTCCCCCctgttt gttaatttttcgattttttcccaACGGTTCTGACCTTATCCGGACCCCCT TCCTCGTTTATTGaacttggaaaaaatttcagctgTCAGAGtcctttatt ttgcttcaaatacCCTGGTTTTTGTCTATGATTAActcttttttttgggg ggggggggtaaaggTACAACTTCCAACTctccggcaattaggccccccgt CTACCCCTCTTCCCATTTATTAGACACCTGAGAATAATTGTTAGCGttct aatttaattttttattttgatgaaaattgaaattaagcTAATTAATACGG GCCTTTTGCTACAATCaaaaaaaGTTGGATTAAAATTTCTGTCAAACTAT ACTTTCATCTCTCTTGCAAATAgttttctttgatgaaatttattttgagt tTCGCTAGCTTACTGCAATTGCTTTGTCCATTAAGCCCCTTTGACACTTT GTTGTAATCGCTATCCTAAAGAGGCTAATTGTCCCAGGattattgattaa aaaattcgTTTACTTTAAAGGCGTTAGAAAAGGTGATAGACATATTCATT TCACAAATTCAAAAGAACTTAAAACCTTTTCTGAATACCATATTTTATTT ACGATGTTTGAATTACATCAATATatgttttaaaatcttaaatagcACAT GTCCTGTATAGGGGTCAAGGTTATTCTAAAAGCAGTATTAGGTTGTTTTT TCCCCTCATATTCCTAAGTTTCTTTGAGGACCtatgtcaaaattttctga aaaagagaagaaaaagccTATCTATCCTATCTAATATTGGTAGATTATTA GGCCCCTTATTACAATATATTAAAACCACATGCCCAAATTTTAATTTCCC CTATTAGTCATTATCAGTATGATTTCGAATGGGATAAAGCGAAAATGACC CGACTGAAAAATAATAGACAGCTCCAGAAAGACTTTATTTGAAATTCTCG AtcctcaaaatattttaccacaattttaagttttgattcTGATTTGCGAC AAGTGGAAATTATTCTTTGAGATGAATTTTTGGAGAAACGtgatatattt caaaataatacaTCGTTACTTTTTAGCTTTCTCAGgcgcctttttcaaat tttaacatGGACAATGTATAATCAATCGTTTATGAATGACACAGTTCACT CTCAATGACTTGAACACGCCTGGCGGACgagttatgaagtaaggtttata agacaaTGTTGGCTGAAACTGAAAAGACCAGCTagcttgttcgaattaag gaaacattcgagttatagagttttGAGAAATGGAGACTTAATTGTATATT AAGATAAACATCAAAGACCCAATGGGACCCTGGAAATGTCCTTTTGAAGT CCGTTATTGCTTTAGGTGCCACCATAGAGAAACCATATCACGAGTAATAA GAGTAATTCCCTTTGGAGCGTTTTCTATATGGTTGCaaaaaaaGTGCACA CTCGAAGCCAATGGACTTGGGATTGCCCCTACTGAAGAAATTACTCCATC GAAAGGCATAATCGTGaaaaaaaCAGAACTTTCTGATTCAAACTCTTCGT ACCTTTCTAGTTTCTCGTCCATAGTGTCCTCCTTCAGGGTTGTAAACATA CGGTGGATATTCTGCACACAAACTTGGATATAATGAACATGCGAACGATT TGTGTACTATTGCCTAGAAAGTAAAAGTAGTGAATATAATttagtaaaaa gaaaaaaaaaaagataatgtCTAACTGCCATTAAAACTTACAAAGGTTTC TATGTAAAATACTTTAAGGAAAAATAagagaataaaataaacaaagtttA TCAATAAACATGGACAAATTACATTCCCTCTTAATTGTTTACAAATGAAA ATCGTTTACATTCTTCAACAGATTCAGCCTTTAAACAATAACGATATTAT TTTGTTCTCAATTAAAAGAGCACGATGAATGTTAGTGCTGATGCCTTACC TTTTTGCTTTCTACTTTATCAATATTAGCTGCTGAAACAGTAGCCAGCCA AAATAACGTACATTCAAGGATgaaatataacatttttcttAGATTTGCTT TGTGTATATATGTATTCGTGTTGGTGTAAATTCTTCCAATATGTATATAT CTTGAATTCAGTAAAATATTTATCCAAATTAGTTCTTGCCAATATATCGA CCCTTTTGGTTAAGACGCAAATTCTTCAATGACTTATACACGTTTGAAAT CGAATATTTATAAACGTGAAATTATTAGTCTAAATTTAAGCTTTCATCAT CATTGTTTGAAAACTATCCATTAAAACAATAGACCTACTCACACTGTGGT TTACaataagtttctttttgttCTATTATGTTTTGTGTTATATTATTTTG TTCCATACTATCCGCATTATGTTTTATAGATATAGTATCGAATCGAAACA GGTGTCTATTGTGTATAATACCTCCTCTCACCTAATGTGTGGTTCCtttt tttgattgatggttggttttcattgatgcttaaggttcccttttcctttt tgttttgaagttgctttgaaagtcttaaaagtcttaaaatattcatcagt tttattttgttttccacATATTaagtgcacgtttttttatatataagaac gAACTATATAAATATaacaacataaggcttcgatagccaaaatatcaaga acaagttaagaacattttaaggctttgtggactctaaaacaccgaatttc ttaggaaaatggacaaaaatactctaaaagggtgaaaataagaacatgtt aagaacatttttgagctataaaatcgaaaagttaagaacgtcccaaggct tcaaaaatattgcatgttcttataaaaaacgtatattcTTGATTAGaacc ttttgttttctttttgaattttttgttataacGACCTCAAGGTGCCGGTT GGTAAtctaaaggaaaattttgaaaatagtgtttcattttttatgatctA CTAAACTCAATATACAAAAACGTTTTTCccttttcttgaattttgatAAC AAAACAATACGACTTTGATTGTagaaaatctcgaaaaaaaagatatatta aggcttaatattttacaaaattattattttgaagaataatgaaaaataat caaaattatgAGGTAATTTGAAATCAAAGCTCGTGGTTTGTTACAAAAAC CGAACTCTTCCTTTTAAGGCGTATCTTACTTTGATGTTTCCCTCTTGAAT ACACGTAAAGATAGATCgctttatttttagaaagaggATAAAAATCATTG CTAAATTTCATTAAGGCATTAAAAATTTATGCACAACCTGTTTCGTGTTT CGTACAAATTTTCGCTTTGAAGTACACGTGGGTTTTTATGGggtatttat atttttttgtttctcttGAAAATTAACACCCATGATGTCATAGGATCTAA ACCTAAGGGGAAGGTTCGAATTCGTTATTATCTTAGGGATTCGTACTAAA AGGCTGTTTTTGGGAAATTGATTTAAAGGAACATTTACTTTTTTCTGTCC GTGTATATGTACTGTATAATTTAATTTGAATGGTTCTAAGCAATTTTAAT TAAGTCTTCATTAATGACATCAATGATAATTAGGTGATAAACGTAGTTAA AAATATTGCctaaaatattcaaattcaaaatctttgaaatccaCTCCATT TTTATGGGCTTTAATTTACTCCTAGAATGTAATTTTGAGTGTTAACATGA AGCATGACACACTTAAAGCTTAGGATCTTAAGGATCTCAGGATCAAAAAG CtctaaattttagaaaattttgatttttgcgcCCCCTGTGAAAAGAAAAT ATCTGGAGGGCAtttttttAGGGTGGGGCTTGCATTTTGACAAGGACTGA ATGAATTCAGTATTGCAAAGAAAATGactattttctaaaaaaccatttat ttttgtttttggaaaaatagaccttttcataaatcacaTCAGatcacgag caacgcttacctcgtttaaaaaaatccttATGGCTATTGATTCCCAGAGG GGTTCATATGAAGTTCATTCTACTTAAAAAGTATGGGCGCGTTCAGacat gaaagtttaagtttaaggcttAAGTAGTACTAAGTTAATATGGGAATTAA GAAATGCAACGACTTAATTgctatttcatcttttagatagattacataag agaggaaaaaggaatccccttttgaaTGTTTGAGCGAGGCTTCGTTTTTG ATAGAGGTTcatcaaaaatggatttaacaAGTCGAtttttttGTTGCGGA GTATGGGAATCACCATACTTCGATCCATGATATTCTCACTAAAAGCccat aaaaccttttttttaaaccagagggtgattcctttttaaactttggttta acttatAAGGGTCGTGCagctaaatacaaaaggaatataaaagaaacatg cagacttaattactttaaaccttggtctgaacacgacctataACACTTGA AGTCTCGAGGAACATAATCaacttggtaatggtttcaaaacgaggcagtc atTGCACTcgaaataatttatgaaaatgcctAGATGTTAAACAAATACAA AGCATTTTAGAATTAATTTTgttcgaaaattaaaaattttcggtcgatga tattatttttatcctattttgctgtgtaaaattattgaaattatattgag caaaattattctaaaatattgacttttttcTTCCTAGAGtttttttGCGT ATTCCGTGACTaataagtaaaatatttttcaactcttgagctaaatatca aaattgataaatttttcatttttatttcaatttttcattttcttaatgac gtcatcactttaaGAAGAGGTGCTAAAATGGATATTATATCAGTTTCACC TCATATctataattttgataaaatgaaattAACCATATCCTTCCTATGTG ACAGGCATATTCTTAATATAGAAATTACCCGAAATATAACtcaatacttt aatgggataaattttcgcgagccGAAAAAATCGTGAATTATTTTACTTTC GCGAATAAATATTCTAAAAGATTTTGCGTTGGTTTAATTTTCCGAGTTAG CTAAAAAGCTAAAAAGTTGCCTTTTATAAACACCAAATATAGTCAAATCT TTTACTCTGtaaatctgatttttaaaatttttattcgtCTAATTATTTTC ACGAACCGCGAATTTCATTGTTGcgacaaaaatgacaaaaattttgcGAA AACTCAACATTAATTCTTGCGAAACAAGAAACAAGGGGacatgaatgttt ggtaaatttgggaccctttcagaacgaaaaatcgaaatattcccCCATTT taaccctgaaaagtggcaaaaacgATTTTAAGCagacgaaaaattcaaaa aaattctgatttcCGTCCTGAAAATTGtgcaaaatgaccaaaaaccgACC TGTCAGGtccacatcttgaaaattagtaagtTTAGGACCCTGTCAGACAT CTCTAGAgtctgaaaaagggaccctgatcagcggcacgtccccgtacctg aTTTTTTGCCTAAGTGCTcccccccccAGGAAAGCTCCCAATTTCCCCTT AGTTACTTAGTGAAAAATAAATACCCCAACTTTAAATGGATTCACCAAAA TCTTCTccttgccaaattttcaaaaataacaaacaGTCATGTCAAAGGGA AGTGAATTTAATTGGGCTTACTTATGTCGAAAATAATTTCGGAAAGTACA TATACTTGTCACAGCTCAGAGGTAAAATGATAGcaggggttttgctttgt tttcgGTAGGCTGGCGAATATGAGAAATTAACTCTAGATTCTAAGCCGGC GAATTCTTATCAAGGGCAGTGTATTGATTGGCGTCAATATGTTCTCGAGG CTGCGAACCGAACTTTTCGAATGgcgaattgtattttttttcgtgccttg gaccGGCGAAATTCGCCGTTGGCCgggcctaaataagacccctgGGTAAA GTGGTAAAATCAGCGGCTCTTTTTGCACAAAAGTTCATAGttgtaaaatt tcttttcctCGTTATTTTTTGTAGGGTTGATAAGAATTTGGCGATGACAA TTTGTTTGATATCAAACGCACTTAGTATCACTATATTACCCATTCTTCAC AAGTTTATGGGCATGGTGATTTTCGTCTTCTTGTATGGTTTCTTCCTCGG AACACCTGACACACTGGCTAATGTCATGCTCATCAAAGTCTTCGGAAAGG AGGTATTTCATTAAATGTTGAGTATTACTAAACAGTTCACCCGTGTGGAG CTCAGAATTAACTTAACTAAgtaaggctccagtacagcgTTATAAACTTA CATACAATGTAAGTCCAGGCGGCTCTGGCAAAACCACAGATCCCAGCCGG CTTTTACCCCTCTAAATTACTTCGGCACCGTGAAAATAAACTAATTAGGG TCTTGACTTGTAAAATACGAATAAATACAGTGTTCAAAATTCTTCCTTCT TACCGTAAGGTTGACTTTCCATAGTTTTAAAAGTGGAGGAGGggtctttt aaatttttcttgaataacCTTCAATACCGACagcaaaaattactaaaatc cTTATTCATGACAtttttttattcgttttttGTTCAAACATTGAAACACC GACAGATGAAAGGGCTAAAACCCTAACACCCGTAAATCCCCCTCTTTAGC AGCTCTTGAAAAAAGTGGCTGACAACAGTTAAAGTCAAACCTCATTATGT AAGCGCTGAGTTTCTTTCAGTTTTCTATACGTTTAAAAGACCTTAAAATA TACCTTTTCCTACAATGATGTTTCAGTTTTTTGGTCCATATCGATATTGT acacaaaactttttcaaacacaaTGTATCTTAACTTGATTTCGTATTCTT TTCAATATATCCATAGGTTGCACCGTACATTCAAGGAGTTCATTTCTTTT ACGGATTCGGTGCATTCTTGAGTCCATTGGTGGCCAGACCGTTTCTTCGG AAGAGCTGTACATACATGATCAACACAACGAAATATTATGATATACCTGA CCCAACGTAAGAAACTCAAAGCATCAATCTTTCTTCACGATGCttttttt CTTAAGGGCTTCATACACTACACAAAATATCGTCGAGCAATAAATTGCTg aatgccggcaatatattgaaaaggtcttcgcaatatattgtcagcttaaT TTCCAATATTTCAACAATGTAgggggggggattgtttacagaaaagaaat ccctttttataatagaggaCCTGTTGTTTActccgtacattacggtccaa aaactatattgtcgaatatggctcaccaatatattgtgtagtctaagtag ctcTTTAGATCTTTTTCATGTTACCATATTTCCCTCAAAACAAGCGCCAC TGCGCGACAGGTTTGAGGTGCAATGCGGGAGATTTCTTTATTTGATTTAA AGTTTGGTGCTCTGAGGGCAACGATTATCGGAGGGCTGGAAATATTGATA AAGCTCTTCtgtaattattttcagtttaccACACTGGTGACCAACTTAAC CAGTAATTATCTTTGTTGGTGATCTTTTccctagcacacaacgttgtttt aacgtttatctaacgttatatggacgttgtggacattagatgaacgttga aacaacattgtgtgctagctgggttGATTAGAGATAATTCAAAGTTGATT TTTACTGTTAAAGggtattttctattttctaattttctagaTTCAACTTA ACTTATGATAGTGGCACAGGTTTATGGGCCAAATCCAACACAGAATTCAA GCGAGATGAAGATAGCGATATAAGATACGCTTACTGGATGGCTGCGCTTT TCCACGTAAGAATTTTTGTGCATGCTTAGTTTTTCTGGGTACacctcttt tataagaacaaactatatgagaacataaggcttcgatgaccaaaaagtta agaacaagttaagaacattttaaggcttgaaacccaaaaagttaagaaca tcccaaggcttttgtggcaggggggccgggggggggcatggcccccccag cggagcttttttgaaggggcgccgaagagcaaggggcgccaaaagagatt ttcgaaacgccccaatcttaaaaatcatactttatgcgccttaaattgcg cccaggaccaattttactgagataattttaaaatacttgcattttttttc gctcgcttcgctcgcaataaagttaattggtaacttctttgcaatctagg tattttacaagttttttgtgtacaatatagcatcatcaaatgaaaatcta actgcgcccgaagactaatttgctgacaacaatattgaaatcataaacaA TCAGTTTttccgctcgcttcgctcgcattatacattgtttctttaagttt cttttcactctagcaagtgtcaaatttgtctatttttatatagtgattta gggtatcttggcagtcgatttttaaaatttttctagtcGGTCCCAAtcat ggtggggcctgttttttccattttccattcatcaaagatatatctactct tctccattaaatatttccttcctcattatgcctaggcaaatgaattagta aaagtttagaaaatggtGGGTGAGGGCACCActttcgaaaatttgggggg gggggcgccattttaaaaaaattaactttggcccctccagaaaaattttc ccacaacgccactgagaCACATAGTTTCTCTCGACCACACATTACAgatg acgctctctaattcgatttttaagttggtctttcatcgaataagagatCA TATCGAAAAGTAGAGAGTCGTTTAGGAGAGTTTCTTGtcgacggtgactt tcaatattatcatgaaggtaataaagatatagatggagagaaaacggtcg tgttcacactacataccttccttaataaaaatgtagttaggagaatcttt tgttgactacaatacagaacgtgcatttaacaaagagtcgaacgcgtagt attgtaatttttaatcgatcttccttaattaagagtcgtaagctttattg tcttaagggtagggtagaggcttcccttaaaacaaaagattttattaagg aagcataaacaaagaatgcgtgcagtgaacaaaaaagttttacgatttca aaaacgaatgaactgaggaaaaaaatagaaatagtgCAAACGATGTTGCt gatgtgtaagatgaatgcagttaatgagtaaaaccattagaacaaatatg tttgcggatttcaagtgatgtatggataccaatatcaaccaatcacaggt gaaatcgaaactctcaataaaaaattaaccaatgagaagccttaagcaaa atctattaccgtgttataatagatctcgtgaacccacaaagaactgtaat aaaccagtgtattcagccatctaaatctctttgtttaactttgatagatt taattaggtaaactttccagtgtgaacgcgcccaAAGTCTCGGTAATaat ctaaatggtcgttgaaatcttttataaatctattcaaagcggcttttctt tgatgtaccatcattggaagcaaaaaacatcaatttataactttataaga acagaaagagactgtttggttgattttgaaaaacttaattttgccggAAA TCCTTGTTAatttcgaaatagtttcaactgatgtaagactaaaagagtat attaatttcataaggacacatttttgggctggcattttgttaacatcgag agttgcatcacattatcattgaaagtttcttatcttaaaatcttcacgtc taagtgggtagcggttttcatactctgacaaaatgatcgatacaaggttc ctaatcgtaacacgtaattcttttttaaatctttcgatggctttatgggc agcttcccctaaaagtttggagtattgtgcttattatgtgaagttttttt caatttttcatgacaaggctattatatttcaatatacttgttaaaaatgt aatgtcttttcattcatcttaaatattcccaagagtatacccaaaattaa tcatcttattcccaaagcaaccaaacagctgtttgcttccgatgataaat cagaatagaacaaaaggcattgactctccacctatctttattacctccat gatattatcaaggaattattatagacactggaaaaataactgcctgattt ttgccaatttctcatgtacaagccttgtccgcagtaatgacattattgtt caccctccttccaccattaaattatttttcgtaGTATTTTTATTGCAGTA CCTCACCATGgagcacttatccaattccTAAAAGAGACTTTAAGCTCTCC TCTGAGATTCATCTAACTCATCTTTAACTCATCTAGTTAATTACTAACta tacgtcgttatgacgttttaaattgcgagaaagatgcaaaaacatgctat gtataagaaattgaatattgacaccagaaatttttaaacttcaaccgCAA AAAATTCACCGTGCCACCAAAAGGTTTTCATACTCACGTCTAATATATAT CTCAGCACTTCCAGgagaaatatttgaaagatattcccaattcaaaattt cgtgtcattataagcattttgtttgattttactcgtctgatgattttttt ttcgtttttctcacaccagatttcataaatgtattcgcttggtattctag catttattttcaaacttttggccagcaaaaatacgaatagaaaaagttaa agagctttttagaaataagagtattaatcatttttcaaaatcagagtcct tcgagccaccatgacagttgtcctttgcggacaaagcctgtacattgatt gttttctgaaacaatagaaagacaatgcttttctctccaccgtttcattc gatgtttatccagagtctctataatacaccttttcgaccgtagccagcaa ttgccgcgcgggcatttttttgtctgctttatcccactaaaaccgtccca gtccttttttcgcacatatcgacaatagaaaaatgcgtcaaaaaaggatt gggacggttttagtgggataaagcggacaaaaaaatgcccgcgcgactac ggtcgaaaaggtgtacaAATCCATgatattatcgaataagggagagtATC GAAGAGAAtgacgtcgaattagagagcgtcagctGTATCTCTTTGGTCTT TACCGAgttgtatcggaggatatcgagggcgacggtaagtgaagtcgaca taaaacaaagtcgatagttgatgtatgGCTCTATAACttctttgctcacc taaacagacgacggtattttggtgtttttaccgtcgtcaaGCAAAGTGGA CGACGATTTTGGTAGCATGTCAACtaccgtctccttcgatttatccCGAA TACATcgaataaattttattacatacAGGTACCAGTTATTTTCGGATTAT CGTGGATCTTCTTGAAACGACATTTGGACAGTCAAAAAGGAATATATCGT GGCTCATTTGTTTCGTTGCATAATGATGATGAATGTAAGattgaataata ttttttttctgacgAATCATATCACTTTACGATGAATTAATGAATggtga aaaatgaaatacaGTACCAAATCTttgatttctcatgtttttttacactt ttccgGAATTGACTTGAATTTAAATGTAAGGAGCTACGGGGCAAATTTAA AATAGTAATACCCTAGATATTGAGACTCGAAGCACTTCAGTACATTAGTT CAGCGTCAAGACATCGAAAACTATAAGAAGTTTTTCTTGGATCACCCGAG GTATATAAGCAAAACTCAATCAAAATCGTaacttttcctttctttttcag TACCAGTACAATCTTTAGATATGGTATCATTTAATCCCGAGGCTTCTTTC TGGGAAAGAGTACAGACCAACTCAAAACATCGGCTGTTAGCTGTTACCAT ACTATGTTCTGTAATCATGTATCTATATGAAGGGCTTATGGTAAGTCAAG CCATACTTTATACTGTATTTTAAGACCAAAAAGTGAGCTATTTGATTGAG TACACCAAAGGAAGCAATTTAACGGAGACTAGATTTTTGTAGTTTGAGCC CAAAAACGAGCGATTTGATGGGGCTTATTCTTGATAATAGTTAAATAATT TTCATAGTaccagaaataatttttatcggTTCCTGAAATAACGATggtca tatattttttttcctaAAACTTGCAAAATCATCTGTCACGAAAATCTCAA ATCGGAAAAACGCAAAAGTGTTTCTTGggcaacttttctattttttgctc aaaagttGTTCTTCGTGTAATGGGGCTTAACAAGGTGACTTTATGCTCAA ACCACTTAACGTTTATATATAACCTGATAGAGGTTACTGAATTCCAACCA AGTAAAATGTTTTATCAGATTTAGAATTATAATCCGAACCTTAAAGGTAC CAATACTCGAAATAGAGCAAACAATACCAATCAAGTAGTCGTGCCTTTTT TAAGTCTATTAACTTCGATCACGATGACGATTACAGCTTAGTTAGTCCAG TGTCTTAAATATAGGTCAATGCTTTGAACCAATAAATTGATGTACCTCTG GGgatatcacttagtgcctaGCAGGAGGAGGactattttttttgtcatta gtGTGTCTTAGAAACTTTGCAGACTTGTTCTCCAGTCGTTAGAGATTCGC CATGGTGAATTTGAGCGCCGGAGAACGCTCAAATATCCAGTAGTGTGTTG TCTTATTTGTTCGTTAGTGTACTGTGTAACctatattataaagaaaaaaa ttgattattttccaTAGGCGATGTTCGGAGGGTATATTTATTCATACGCA GTGAAAGGAACGGTCAGCATGACGTCAGATCAAGGTGCTTACCTGACTTC CATGTACTGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+

>XLOC_040876 ID=XLOC_040876|Name=XLOC_040876|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2184bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000163_pilon:338079..354438+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATATCAAAGAAGACCTAAAGCGTTCTTCATCCGAAGGAAGGCGTTC
Caaaagaaaacggcatggcgcaaaagaaaagtttaaaaaacagaaaagtg
TATTCCAGAAGTTATTGGAATCAGAACATCACATGGCAATGGTGTTTAGT
TATTGTGGTGTTTTTCTGTTGTACGGTATGACGGATGAGCTCTTAGATGG
ATATCAAAGAAGACCTAAAGCGTTCTTCATCCGAAGGAAGGCGTTCCaaa
agaaaacggcatggcgcaaaagaaaagtttaaaaaacagaaaagtgTATT
CCAGAAGTTATTGGAATCAGAACATCACATGGCAATGGTGTTTAGTTATT
GTGGTGTTTTTCTGTTGTACGGTATGACGGATGAGCTCTTAGGTCCAACA
CTGATTGAACTGAGTTGTCTTGcagccaaacctttaaaaacaaTGAGCTG
GTTGTTCTTCTCACATGACATGGGTCTACTTTGCGGAACGCTTTTCGGTG
GATTGATTGTGTCTAGGTCCAACACTGATTGAACTGAGTTGTCTTGcagc
caaacctttaaaaacaaTGAGCTGGTTGTTCTTCTCACATGACATGGGTC
TACTTTGCGGAACGCTTTTCGGTGGATTGATTGTGTCTAGGGTTGATAAG
AATTTGGCGATGACAATTTGTTTGATATCAAACGCACTTAGTATCACTAT
ATTACCCATTCTTCACAAGTTTATGGGCATGGTGATTTTCGTCTTCTTGT
ATGGTTTCTTCCTCGGAACACCTGACACACTGGCTAATGTCATGCTCATC
AAAGTCTTCGGAAAGGAGGGTTGATAAGAATTTGGCGATGACAATTTGTT
TGATATCAAACGCACTTAGTATCACTATATTACCCATTCTTCACAAGTTT
ATGGGCATGGTGATTTTCGTCTTCTTGTATGGTTTCTTCCTCGGAACACC
TGACACACTGGCTAATGTCATGCTCATCAAAGTCTTCGGAAAGGAGGTTG
CACCGTACATTCAAGGAGTTCATTTCTTTTACGGATTCGGTGCATTCTTG
AGTCCATTGGTGGCCAGACCGTTTCTTCGGAAGAGCTGTACATACATGAT
CAACACAACGAAATATTATGATATACCTGACCCAACGTTGCACCGTACAT
TCAAGGAGTTCATTTCTTTTACGGATTCGGTGCATTCTTGAGTCCATTGG
TGGCCAGACCGTTTCTTCGGAAGAGCTGTACATACATGATCAACACAACG
AAATATTATGATATACCTGACCCAACaTTCAACTTAACTTATGATAGTGG
CACAGGTTTATGGGCCAAATCCAACACAGAATTCAAGCGAGATGAAGATA
GCGATATAAGATACGCTTACTGGATGGCTGCGCTTTTCCACaTTCAACTT
AACTTATGATAGTGGCACAGGTTTATGGGCCAAATCCAACACAGAATTCA
AGCGAGATGAAGATAGCGATATAAGATACGCTTACTGGATGGCTGCGCTT
TTCCACGTACCAGTTATTTTCGGATTATCGTGGATCTTCTTGAAACGACA
TTTGGACAGTCAAAAAGGAATATATCGTGGCTCATTTGTTTCGTTGCATA
ATGATGATGAATGTACCAGTTATTTTCGGATTATCGTGGATCTTCTTGAA
ACGACATTTGGACAGTCAAAAAGGAATATATCGTGGCTCATTTGTTTCGT
TGCATAATGATGATGAATTACCAGTACAATCTTTAGATATGGTATCATTT
AATCCCGAGGCTTCTTTCTGGGAAAGAGTACAGACCAACTCAAAACATCG
GCTGTTAGCTGTTACCATACTATGTTCTGTAATCATGTATCTATATGAAG
GGCTTATGTACCAGTACAATCTTTAGATATGGTATCATTTAATCCCGAGG
CTTCTTTCTGGGAAAGAGTACAGACCAACTCAAAACATCGGCTGTTAGCT
GTTACCATACTATGTTCTGTAATCATGTATCTATATGAAGGGCTTATGGC
GATGTTCGGAGGGTATATTTATTCATACGCAGTGAAAGGAACGGTCAGCA
TGACGTCAGATCAAGGTGCTTACCTGACTTCCATGTACTGGGCGATGTTC
GGAGGGTATATTTATTCATACGCAGTGAAAGGAACGGTCAGCATGACGTC
AGATCAAGGTGCTTACCTGACTTCCATGTACTGG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040876XLOC_040876-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000163_pilongenomesc0000163_pilon:338079..354438 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1000-1092:16268
Aaloc862-999:15303
Aaloc754-858:14879
Aaloc640-753:11192
Aaloc499-636:10367
Aaloc322-498:9526
Aaloc199-318:657
Aaloc1-195:1