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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040869 ID=XLOC_040869|Name=XLOC_040869|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7690bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTACTCCGTTCTTGTTTGGACATTAAAAGGTAATGAAGAGCTAAAGCC
TGCCTTGGTGGAGGTAATGAAGTCCAATGATATTGTATCCATCAACGGCA
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TGGACAGGGGCAATGAGCCATAATGAAAAACAggtgaaattttgttgttt
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TTCATCTCACAAGGGTTTATTTTAAAGCTGTGGTAATTCTTGTCTCATAA
AATGATGAATCCGTTCACTTtctaaaatgtatttttctgatAAGCTCGAT
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CTTTTTCTGCCTTATTTACAGAAGCGACACATTTTTCTCTGGAAGAAAAT
AGCGGAGTGACTTTAAAAAAGCAGTCATGTTTATTAAGTGGCgactattt
ttttttctgggGTGCGCAGTCTCAAACAAACTGTTCGTATTTTTTATTTC
AGCGAGCCATCAGCTTGATCCCGCTCGTTAAAGAGGAAACTTTGTTAGTG
CCAAAGCTGGAATTCTTCAACATGAAGAGTGATGCACTGACGAAGCATAA
TCCAGGCAAATACCTCCTGAATGAGTTGATCAAGCTTGTTTTTACGGTCG
ATGAACTAGCCAGCCACAAAGCTACTCACAGTCGCTCAGTAAAAAGCCAG
CGTCCTGGTTTAGATGAAACTAAATGCAATACTATACGAGGTTTGGAACG
TTTTGTATTCATTTTCTCTTTTCCTGAGATTAGAAAATCTGTatggggcc
gtccatatagtacgtacgcaaagattttccaaaaattggatacccctccc
ccccttgtacgcagagaacaatagagaggatgtcatttaaacaatagatg
tacgcttttgctaaccccccctctccccccttcactgcgtacgtactata
tggatggcccctatTCAACACTATATTATTAACAATGAAATAAAACAATA
TAATTATTTCAGGTACTCtttttttGTGGCCATGTTAAAAAGGAAACTTA
ATTTCACCCCCTACAATTATGCACACAAAAGTAGGAAATTTAAGCCGTTA
CAAAATACGGTTGACGTACGCAAGCTAGGAAGGAAAACATCAGGCGAATC
AAGCACGCTCCGCTATGATTTTTAGCCCGCGCGGGTGAATATATTTGTCC
GCCCGTAGACCTCATACGTCAAGTACAAGATCGCAGTGTAGCTCACACAA
CCCTTTCTCTACGTGTatatacttaattttttttatttctacagCCTTTA
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GAAATGAGAAAAGTTTTTGAGTCTCAAATCGGTGCGgcaaggaagaagaa
aaaaaattcgctTGTCCCATATGTTCCTAGTTCCgaataa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+ >XLOC_040869 ID=XLOC_040869|Name=XLOC_040869|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTACTCCGTTCTTGTTTGGACATTAAAAGGTAATGAAGAGCTAAAGCC TGCCTTGGTGGAGGTAATGAAGTCCAATGATATTGTATCCATCAACGGCA AAGTTTTTTACAAACATCAGGGGTGTCAGTATGAAGGAAGAGAAGAATCT TACTTTGATGTACTCCGTTCTTGTTTGGACATTAAAAGGTAATGAAGAGC TAAAGCCTGCCTTGGTGGAGGTAATGAAGTCCAATGATATTGTATCCATC AACGGCAAAGTTTTTTACAAACATCAGGGGTGTCAGTATGAAGGAAGAGA AGAATCTTACTTTGAAACTCGACAGCAAGCGTTAAAGCGAGCTGAAGTTG TTAAGGGTATTGAAAGCTTAAAATGTGATAGCCGGCCGAAACGTCGATTA ATACCAAAACGATTTctagaagaaggagaagaagaagaagcagaagaaca acaagaagaagaGCTGCAAAATGCTGTTGTTTTATGTGAAATTGATGTGA AACTCGACAGCAAGCGTTAAAGCGAGCTGAAGTTGTTAAGGGTATTGAAA GCTTAAAATGTGATAGCCGGCCGAAACGTCGATTAATACCAAAACGATTT ctagaagaaggagaagaagaagaagcagaagaacaacaagaagaagaGCT GCAAAATGCTGTTGTTTTATGTGAAATTGATGTGACCACccctcaaaaga aaaaaaagaaacgaattgcaaacactcagaaagctaaaaaacaaacacag aaaACCACccctcaaaagaaaaaaaagaaacgaattgcaaacactcagaa agctaaaaaacaaacacagaaaGCATCAAAACCCTCAAAGAAGGTTGATC AAAATCAGGATGGTTTGTCTCGTTTGGTTAAAACAATACATCCAGAAAAA GCATCAAAACCCTCAAAGAAGGTTGATCAAAATCAGGATGGTTTGTCTCG TTTGGTTAAAACAATACATCCAGAAAAAGTAGTAGAAGAATGTACATTCT CAGATATCCTGAAAACTATCAATCCAAGCATtGTAGTAGAAGAATGTACA TTCTCAGATATCCTGAAAACTATCAATCCAAGCATtaatgatTTGTCCAC TTCGACAGGGGTAACAAACCGTAATACATCCACTTTGACAGaatgatTTG TCCACTTCGACAGGGGTAACAAACCGTAATACATCCACTTTGACAGGGGC AACGAACCATGCTACATCCCCTTCGACAGGGGGAACGAACCATGCTACAT CCCCTTCGACAGGGGCAACGAACCGTGATACATCCACTCCGACAGGGGCA ATGAACCGTGATACATCCACTTCGACAGGGGCTATGAACTATAATACTTC CACTTTAACAGGGGCAATGAGTCGTAATGAAAAACATGGGCAACGAACCA TGCTACATCCCCTTCGACAGGGGGAACGAACCATGCTACATCCCCTTCGA CAGGGGCAACGAACCGTGATACATCCACTCCGACAGGGGCAATGAACCGT GATACATCCACTTCGACAGGGGCTATGAACTATAATACTTCCACTTTAAC AGGGGCAATGAGTCGTAATGAAAAACATaatgatTTGTCCACCTCGATAG GGGCAACGAACCGTGATTCATCCACTTCAACAGGGGCAACGAACCATGAT TCATCCACTTCGACAGGGGCAACGAACCATGATTCATCCACTTCGACAGG GGCGATGAACCGTGATACATCCACTTCGACAGGGGCAATGAACTATAATA CTTCCACTTTGACAGGGGCAATGCGTCGTAATGAAAAACAGaatgatTTG TCCACCTCGATAGGGGCAACGAACCGTGATTCATCCACTTCAACAGGGGC AACGAACCATGATTCATCCACTTCGACAGGGGCAACGAACCATGATTCAT CCACTTCGACAGGGGCGATGAACCGTGATACATCCACTTCGACAGGGGCA ATGAACTATAATACTTCCACTTTGACAGGGGCAATGCGTCGTAATGAAAA ACAGagagATACATCCACCTTGACAGGGGCAATGAGCCATGATACGTCCA CCTGGACAGGGGCAATGAGCCATAATGAAAAACAgagagATACATCCACC TTGACAGGGGCAATGAGCCATGATACGTCCACCTGGACAGGGGCAATGAG CCATAATGAAAAACAgGATACTAGCTTCACATTTTCAAGTGACGAAGACG AGAACGATGAAAATGTGCCGGATACTAGCTTCACATTTTCAAGTGACGAA GACGAGAACGATGAAAATGTGCCGGACGTTCAAAGAACACCACagGACGT TCAAAGAACACCACagGTTGCGTCAGCAGCTATGAACAAATTACCTGGTG GATCACCTGACATAATCAATAAATTCAAAAGCCGGCTTCAATCAAaggag ctatttcaaaagaagacGTCTGCTTCTTCGTGTGatgaatgtgaaaaaaa aacgcaagaaataaataaattgagaGGTTGCGTCAGCAGCTATGAACAAA TTACCTGGTGGATCACCTGACATAATCAATAAATTCAAAAGCCGGCTTCA ATCAAaggagctatttcaaaagaagacGTCTGCTTCTTCGTGTGatgaat gtgaaaaaaaaacgcaagaaataaataaattgagaGGCTTACTTGCTCAA ATCCATGGACTGGCTGGCAACCACGACAGACCATCCCAAAACAGCCCTAC AGCGAGCCCTATTCCATTTAATAATAGCTTGGTATCAACTTCAAATATTA CTCCACAGGCTTACTTGCTCAAATCCATGGACTGGCTGGCAACCACGACA GACCATCCCAAAACAGCCCTACAGCGAGCCCTATTCCATTTAATAATAGC TTGGTATCAACTTCAAATATTACTCCACAGCGAGCCATCAGCTTGATCCC GCTCGTTAAAGAGGAAACTTTGTTAGTGCCAAAGCTGGAATTCTTCAACA TGAAGAGTGATGCACTGACGAAGCATAATCCAGGCAAATACCTCCTGAAT GAGTTGATCAAGCTTGTTTTTACGGTCGATGAACTAGCCAGCCACAAAGC TACTCACAGTCGCTCAGTAAAAAGCCAGCGTCCTGGTTTAGATGAAACTA AATGCAATACTATACGAGCGAGCCATCAGCTTGATCCCGCTCGTTAAAGA GGAAACTTTGTTAGTGCCAAAGCTGGAATTCTTCAACATGAAGAGTGATG CACTGACGAAGCATAATCCAGGCAAATACCTCCTGAATGAGTTGATCAAG CTTGTTTTTACGGTCGATGAACTAGCCAGCCACAAAGCTACTCACAGTCG CTCAGTAAAAAGCCAGCGTCCTGGTTTAGATGAAACTAAATGCAATACTA TACGAGCCTTTATCAATAAGTTCACTGGAGAGAATTGTCCAACAAAGCCA CTGTCGTCGGAAGAAATGAGAAAAGTTTTTGAGTCTCAAATCGGTGCGgc aaggaagaagaaaaaaaattcgctTGTCCCATATGTTCCTAGTTCCgaat aaCCTTTATCAATAAGTTCACTGGAGAGAATTGTCCAACAAAGCCACTGT CGTCGGAAGAAATGAGAAAAGTTTTTGAGTCTCAAATCGGTGCGgcaagg aagaagaaaaaaaattcgctTGTCCCATATGTTCCTAGTTCCgaataa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:2626233..2633922 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1681-1824:7547 |
| Aaloc | 1441-1677:6753 |
| Aaloc | 1321-1440:6058 |
| Aaloc | 1159-1317:5741 |
| Aaloc | 1138-1158:5514 |
| Aaloc | 1084-1137:5138 |
| Aaloc | 1003-1083:4303 |
| Aaloc | 790-1002:3431 |
| Aaloc | 601-789:2649 |
| Aaloc | 544-597:2559 |
| Aaloc | 490-543:2076 |
| Aaloc | 412-489:1760 |
| Aaloc | 343-411:1391 |
| Aaloc | 160-342:422 |
| Aaloc | 1-156:1 |
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