XLOC_040869 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040869
Unique NameXLOC_040869
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040869 ID=XLOC_040869|Name=XLOC_040869|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7690bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTACTCCGTTCTTGTTTGGACATTAAAAGGTAATGAAGAGCTAAAGCC TGCCTTGGTGGAGGTAATGAAGTCCAATGATATTGTATCCATCAACGGCA AAGTTTTTTACAAACATCAGGGGTGTCAGTATGAAGGAAGAGAAGAATCT TACTTTGGTATGTAAATTTTGCACCTATCTGAGGTGTTCTAAGATAATAA CGGTTTCCAATTACCTGAAAAGAAATATTCCAGTTTTGAGAAAAGGAAGT TAAAGATGGAGGGAAAATTCcctgattttgaattttgagaaaTCAGATTG TCATAATAGTTAAGATTCAAAACTAGTGTACGATCAGGGGCTATTTCGTA ATGAAAACTACTCTTTATGTGCTTTAATTCACGTTTTTATATTATGTTTG TGTTTAAATTTGTTTTCAGAAACTCGACAGCAAGCGTTAAAGCGAGCTGA AGTTGTTAAGGGTATTGAAAGCTTAAAATGTGATAGCCGGCCGAAACGTC GATTAATACCAAAACGATTTctagaagaaggagaagaagaagaagcagaa gaacaacaagaagaagaGCTGCAAAATGCTGTTGTTTTATGTGAAATTGA TGTGGTAATTGttcagaaaatattttattacattAAAGCATGGTTTCCAC CAGTGCGATAAGGGATCTTAAATTggtgagaacttattttggccaaaata aaagaaattgccCATTCGACAAGATAAGTTTTAGGATTTTTGCTGCTCCC TAAAATTAGTTCTCTCCAAAATAAAACTCCCTTAAATGTAATTATTGATG GCGGTCATTTGTTTTTTGCAAACTTGAGTTAAAATGAAACATTCAACATG ATAAGCGTAATCTGAAAAGAATCCAAAATTTTGAGTGAAGACCGGCTGtg acatcaatttttgtaaTGGAATGTTTGTGTCaatcttttcaagtgaaaac 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+

>XLOC_040869 ID=XLOC_040869|Name=XLOC_040869|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:2626233..2633922+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTACTCCGTTCTTGTTTGGACATTAAAAGGTAATGAAGAGCTAAAGCC
TGCCTTGGTGGAGGTAATGAAGTCCAATGATATTGTATCCATCAACGGCA
AAGTTTTTTACAAACATCAGGGGTGTCAGTATGAAGGAAGAGAAGAATCT
TACTTTGATGTACTCCGTTCTTGTTTGGACATTAAAAGGTAATGAAGAGC
TAAAGCCTGCCTTGGTGGAGGTAATGAAGTCCAATGATATTGTATCCATC
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AGAACGATGAAAATGTGCCGGATACTAGCTTCACATTTTCAAGTGACGAA
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GATCACCTGACATAATCAATAAATTCAAAAGCCGGCTTCAATCAAaggag
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TTACCTGGTGGATCACCTGACATAATCAATAAATTCAAAAGCCGGCTTCA
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ATCCATGGACTGGCTGGCAACCACGACAGACCATCCCAAAACAGCCCTAC
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GAGTTGATCAAGCTTGTTTTTACGGTCGATGAACTAGCCAGCCACAAAGC
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aaCCTTTATCAATAAGTTCACTGGAGAGAATTGTCCAACAAAGCCACTGT
CGTCGGAAGAAATGAGAAAAGTTTTTGAGTCTCAAATCGGTGCGgcaagg
aagaagaaaaaaaattcgctTGTCCCATATGTTCCTAGTTCCgaataa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040869XLOC_040869-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000019_pilongenomesc0000019_pilon:2626233..2633922 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1681-1824:7547
Aaloc1441-1677:6753
Aaloc1321-1440:6058
Aaloc1159-1317:5741
Aaloc1138-1158:5514
Aaloc1084-1137:5138
Aaloc1003-1083:4303
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Aaloc343-411:1391
Aaloc160-342:422
Aaloc1-156:1