XLOC_040820 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040820
Unique NameXLOC_040820
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000071_pilon:491718..506065-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040820 ID=XLOC_040820|Name=XLOC_040820|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14348bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:491718..506065- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000071_pilon:491718..506065-

>XLOC_040820 ID=XLOC_040820|Name=XLOC_040820|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:491718..506065- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCATTTGCAAGACTAACCCTCAACGTCAATTGAGATGATCATTTGC
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TACACATAGCAACAACAAACGAAGAAATCGAAGAGCATTTTCTTTGGTAG
TTGAAACCCCTACAAACATCATCACACAAAGTTGTGACGTTCCAATCCAT
ATCACTAAACCACACTATGCACAGACTGACCATCCTCAAGGATTCTTGAG
TAGTCTCTTTCAAAGTCGCAGTAAGAACCAGGCGAATGGTTTTGTCAAGA
ATGAAGCATTAGTGTCGAAAATCAAACAAGCCTGTCGTGTCGGAAGACGT
GTTTTGAACCATGTTGGACAGGCTGTCAGGGTACTTATTGCAAGCGTTAC
CATGTACACATAGCAACAACAAACGAAGAAATCGAAGAGCATTTTCTTTG
GTAGTTGAAACCCCTACAAACATCATCACACAAAGTTGTGACGTTCCAAT
CCATATCACTAAACCACACTATGCACAGACTGACCATCCTCAAGGATTCT
TGAGTAGTCTCTTTCAAAGTCGCAGTAAGAACCAGGCGAATGGTTTTGTC
AAGAATGAAGCATTAGTGTCGAAAATCAAACAAGCCTGTCGTGTCGGAAG
ACGTGTTTTGAACCATGTTGGACAGGCTGTCAGGCCAGGAGTATCGACAG
ACGATTTAGACTTCGTTGCACATCACTTGATCTGTGAAGAAGATGCTTAC
CCTTCGCCCCTTCGTTATCAATTCTTTCCCAAGTCTATTTGCACGTCCGT
AAATAACGTCGTCGTTCACGGTATCCCGGACAGCCAGGAGTATCGACAGA
CGATTTAGACTTCGTTGCACATCACTTGATCTGTGAAGAAGATGCTTACC
CTTCGCCCCTTCGTTATCAATTCTTTCCCAAGTCTATTTGCACGTCCGTA
AATAACGTCGTCGTTCACGGTATCCCGGACAGCCGTAAACTTGAAGAGGG
AGATATTATCAACATTGATATCTCGCCGTAAACTTGAAGAGGGAGATATT
ATCAACATTGATATCTCGGTTTTCTTGGACGGTGTGCACGGGGACTTATC
CGAGACCTACTTGGTGGGAGACGTGGAAAAGAAAGGGAAGAAATTGGTTG
AAGTGACAAAGCAGTGTTTACACGAAGCAATTTCTATTTGCGGGCCTGGT
CAACACCTTCAAAAGATTGGACAGAGTATAAGGTTTTCTTGGACGGTGTG
CACGGGGACTTATCCGAGACCTACTTGGTGGGAGACGTGGAAAAGAAAGG
GAAGAAATTGGTTGAAGTGACAAAGCAGTGTTTACACGAAGCAATTTCTA
TTTGCGGGCCTGGTCAACACCTTCAAAAGATTGGACAGAGTATAAGTTCG
ATCGCGCATGCTCACGGGTACACAGTATGTCCACATTACGTCGGTCACGG
CATTGGAGAAGAGTTTCATGAGATGCCACAAATCCTGCACCATGACAACG
ATTACCCTGGAAACATGGTCCCAGGAATGGTGTTTACCATCGTTCGATCG
CGCATGCTCACGGGTACACAGTATGTCCACATTACGTCGGTCACGGCATT
GGAGAAGAGTTTCATGAGATGCCACAAATCCTGCACCATGACAACGATTA
CCCTGGAAACATGGTCCCAGGAATGGTGTTTACCATCGAACCAGTGTTAT
GTGAAGGTGGAACAGACGTACTCCATTGGAGAGATGGATGGACTGTCGTC
ACCAAGGACGGGAAAAGAACCAGTGTTATGTGAAGGTGGAACAGACGTAC
TCCATTGGAGAGATGGATGGACTGTCGTCACCAAGGACGGGAAAAGAGCC
GCTCAATTCGAACATACAATCCATATCACAGACAGTGGTTTTGAAGTATT
GACAAAAGATGATCTTTCTGACAGCCGCTCAATTCGAACATACAATCCAT
ATCACAGACAGTGGTTTTGAAGTATTGACAAAAGATGATCTTTCTGACGA
CTTCTTACAGCCCAATGAAGTAAGAATGAAGAAAGTTGAAAGTTTGTTAA
CGTCGAGAACTCAAGACAATCAAGACTTCTTACAGCCCAATGAAGTAAGA
ATGAAGAAAGTTGAAAGTTTGTTAACGTCGAGAACTCAAGACAATCAAAA
GAAAATATAGCTTTTCTCAAAGTTGACTCATTATTTTTTTCTGATTTTTT
GCACAATGATGCAAAATGGCAAGAAAATATAGCTTTTCTCAAAGTTGACT
CATTATTTTTTTCTGATTTTTTGCACAATGATGCAAAATGGC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040820XLOC_040820-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000071_pilongenomesc0000071_pilon:491718..506065 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1075-1146:73
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