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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000111_pilon:885863..893218- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040806 ID=XLOC_040806|Name=XLOC_040806|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7356bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:885863..893218- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGATGTGATGCGGTCATGGTCAAAGTTTCCCATATGAAAAATCCAACTGC
AACTAGAGAAATACAAATAATGGAAGAGGGATTTGACGGGCATTTTGTAA
GTAAATTACAGGCAGCTTTTTCTAATTCGAATTTTTATAATTAGAATATT
TTTGTATTTCGAACAACAATATTGGTCCTCTCAGCTGGAAATTAGTTTAA
AATGCTTTCTATGATTTGATCTTTCTCTAACTTGTGTCGAAGAAAGACTT
ATTTTCTTAACCCTATTAACCCCAAGCTTTTTTGACTTTTGTATCCCCAG
GGGGGGGGGGGTAGAATATACCACCCTCGATTATTTTTGATCTAGAAGAG
CTATGACCATGAAATTTGGTACAAATGTTCTCCATCCTAAAACAAATTTC
GAGAAAGAAAAAAAATTGATGACGTCATTCAAAAAGCGATGACGTCATCA
CAAAATTTCCACCTGTCGGAAAAAAGCCCAAAGAAATGGTTTACAAAAAT
GTCATCATTTTCAAAATAATATTTGTCAATACCTATCACGTGTCAAAATT
TCAAAATGATCGAATTAATAGTTCAGAAGTTATCAGCACCTTAAAGTTTT
GAGTTTTAAGCGATTTTAGCTGGGTTTTATGTAATGTTTCACAATAAAGT
CTGATCTGGAAGACCTTTGACCCTAAAATTTTACACAATTACTCTTAATA
AGATTTTCTTAAAAGTTTCAAGTCGTTTAAAAAAAATTTCTCCGAGATAT
ACACAAAAGAACCTGGAGAAAGAACCTTTCGTGGCAGATTCTACCCCCCC
CCTTGGGCTAATAAGGGTTAAAGATTAGATAGTTATAGCGAGGCCGCTGT
TCTTGTGGTTAAATGCCACCGGTCGGCTTTTCAGGGGCTGGTTATGAATT
TAAAAGGAAAATTTTTAAGCTGCCTCTAAAACAACTCGAGCAAATTCCTG
CCAAAAATCTATTCCACATGAGAAACATTTCCCTGAGTTTCTGCGTCCAA
ACTAATTTTAGTAATCAAATAGCTCAACGCTAGTTTAGACGGCCGACTTT
CTGCCCTACCTATTCTAATTATTAGAGTAGGCCAAAAGTGGACACACAGT
TGAAAATCAAAATCTTTGCTTGGAAAAGATTGAAAAAATTCATTGCATTG
ACGTTAAAAGAGGGCAATGCATTGCCTTTAGACAGCCAATTTTATGCCAA
CTTTAATTCGCAATTAAAATAGGCAGGGTGAAAATTCGGCCGTCTAAACT
ATAGCTCGGCTAAATTGATGTTATTGATGTTACTATAATCACTTCAATGC
AAGTGTGTCATTTTTAACAAGAGTGCCCCTACACCGGCTTACCTAACTCG
GACAGTTTTGTTTGGCTCCTTGAATGTAAAAATGGGCAAGTGAATGTTTT
GGGTGATTGTCTTTGTACTTTTTGTTAAAGCTTGGTCCAGTTATCTAACT
CAACGACCGTAATTTCAGTTTTTCAAAACTTTTTCCATATAAACCATGGC
CCCCGTCACCGGAAAGTATTTTTTTTTTACTTTGAAAAATCTTATATATA
CCGTTTAGAGGGGTGAAATAAGGGCAAAAAGTCGAAAATTTTCTTCGTCG
CCCAACCATGGTGGGCGACATATTTTTTTGGCCCCTCAATTCGATGCACA
CGCCAGGGGCCATGTAAACATAATCACTTTTTGTGCTCAAAGGAAGCTTA
TTCATCATGCAGTCATGAATCTGCCCTGGCAGATAGTACAAAATGTCTTT
TCGATGAAGGCAAAAGATCGACACACCATGTGTCTATCTCTTGATGATTG
ATTTTGTTTATATTTATTATAGATACAACCAGATCAAGAGTACACGTTTT
CTAAAGGTTTGCTTTCTTAAAAAGTTTTCTCATTTTACTCTTTAAAATAT
AGTTTCATTGATTTTCGCACCCCTTTTTCTTTTTTCCACTCGCTGTGCAA
AAATTAAATATTCAGCGCGCGTGAGAGAGAAAAGGAAAATAACCGACTAG
AAGCTTCTTCCAACGCCTTTTTTTCTTCACCTAAATACGTAAGGAGAGAC
ATACAGATTTCTGTATGTCTGACGCGTGCGGGATTGCATTTATTTTTCTT
TCTGTTTATTGTATTTTTGGAAATGCTCATTTATTTATATGTTCCCATGT
TTAATGTTACTATGAAATATCATTTAGTCAAAAAAGTTGGATGGATTCTT
AAAAACCTAAAAGAGGTTGTAAAATTAAAAAACGTTTTTTTAGGAAAGAA
GCTTCTAGTCGTTGAAATTCAGATAAGACACGCAACCTCACCTCTTCGAT
TCTTTTTATTTGGAGCTTGAATTTTTTGTATATGGGTTGTTTTGAACGAC
TAGTTTACTAGTCTAAGATATACCTAACTAAAGGTGAGCTTAAAATTTGC
GATTTTATGTCTTTATTTATATCTCATCAAATAGAGTAAAAAACCTCAGA
AATGACAGCTTTGCGAAAATTAAAAGATGTACAAACTCCCCTGTTTTACT
GGGTCCGCGAAAGTAAATGGTAATAAAGTCAAAGAAGATTTTGTTTTTGT
ACTGTCGTGTCGTGATCATATCAAATATCTCTGAAATCAGGGGGTCAGTA
CTAAAATCTCAGACAATTCTTTTAGTAAACTTTAAAATCCTTTTAAGTGG
GGTACTGAAATACCAAAAAGTTGATATCCAGAACTAAACTTTAAGAAATT
TTTTAGTATACTGTATTGGTATTAAGATTGGTGATTTTCATCATTTTTTC
GAATCTTCGGAATTTTTAGTCATTTTTTAAATAATAAAACTTGTATAAAA
TACCATTTATTTGAAATGTTATTTTTATTTCAAAGTTCTCGAAAACGCTA
GTATACATATATGATATATGTCTGAGATTTTAACACTTACCCCTGTTGAA
ATTGAATGAAAACATTGTATTATAGGAATGTTGTCTACATGTATTTCTAG
ATAAATTTATAAACTTTAAACCACCGGCTAGTGGCCCACAACTCACAATT
CTTCAGACTGATGAGGAAGCGATCAACAGATTGTTTGATAAACAAAAAGA
TGTTATTACTGGTACCGTGGGTCAGGCCATTGATATTCAGATAGAGATCT
TTGTTGGTGAGTATAATACAGTGTTTAAAGTTTCAGACTAAGATTCTTTT
GTCGGTTTTTGATGGAAAAAGGCCAGGATTTTAGGTAGTTGGAAAATAAG
CTTCGGAAAGTTAGCCATCTTTCTTCCTCAACCAGGGGGGTGGGGTGGTC
GGTACTAAAATTTCAGACATCATGACTTTTAGTGAAGTGATGGTATTACA
AAAAAGGCCTTAAAGCATTTTAGTACCATGTGTACTAAAATCCCAAATTA
GGTGGGGTCTTCAAGAAATTTTAGAAAAATTTTAGTGCATGAGTACTAAA
AATCACCAAATTTTAGGAAATTTAACTATTCACCAAGCATTTTAGGCAAA
ATCAAAAAAATCAAAACTTTCTATTTAAGATTTAAACACCCCTGTGTCAT
AAATTAAGTAAACATTTCGTCCCCTGTGGGAAAATACCCTTGAATTTCAG
TCCCACTGGAAAATTGACTTTGACTTCATCCCACTCAAAATTCCATTCTT
AAAAAAATTGCACTCCAAAACCACCCCTCACTTGGATTTTTAGCCTTGGA
ACAATAGAATTTCTATCCCATTAGCATTTCAATAGGAATTTTTATCCCCA
CTGAGGAAAAAGGTTCACCGGGGCTGTGAAACAGGGGTGTATTTAATGTT
CTGCTTTTATATAATATGGAATAAAAAAATGTTTTCGAAGTTGAATGCTT
TGTTTTTGTAAAGAACCATGGATAACTGGATAGAAAAGAAGTAGCAAGCT
GTAAATTAGAGGGGGAAAAATAACCAATCAATCTTTGCAATAACTAAAGT
AGAGCAGAGCAAAAATGTCTTGACTGTTTCTGAGTCTTTATTTAGAATAG
AGAGAGATAGATCAGGTTCATTGACAGCTTAAATAACCAGAGTTAGCATT
TTGTTGAAAGTCCAAAGACCGCCATTCTCTGAACCGAATTCCAAAATAAG
CCTAATTTAGGTGGTCACTATGCAAAAATGTCAAAAAAAATTTTAGTACA
TGTGTACTGAAATTCCTTTTTCAAAAATTAGGTGGGGATATGTCAAAAAT
TGTCAAAAAACCTTTTAGTACTCATAATATATGTCTTGGATTTTAGTACC
GACCCCCCCCTGCCTCAACTCATTTATGATTTTCTGTACCTCTATAAAAG
TATTTTACAATATTCAGCCCGCTATCCCGGATTACACAAAGGAATGTTAG
TCCGGGAGGGGTACCCTATCCAAAACAACGTTCGGTATATTAGCACAGTG
TTCAAAGTTCTTCCGTCCTACAGCATAACTCGAATAAGTTTTATAAGTCT
TGTAAACCTTACTCCATAACTCGAAATTTCCTTAACTCGAACAAATATTT
CTCCCCCGTGCGTGTTCGAGTTATGGAGACTACATTATATTTCCATTCTT
AAACCTTTTTGAATTTGCTTTTGAAATTTGAAAATATTTCGTAAATTAAG
AAACGAGGGTTTCAAATAGGAGGGTGTCAACAAACGGAGAGGGTGTTTGG
CGACTATCAAACACCTTTTTCTTTCGTCTTTTAAGGATATGATTGCGGTA
CATGGGATAACTCAACGGGAACAGAGTCACCAGTGTGCTACCCGGCAGGC
TTTGGACCTGGTCCGGGTGTGTTTCAATCAAACCGAAGTTGTATCGGAAA
GGTACAGGGATTTAATGATACGGACCAAACCAACACTGAAGAGTGCAATT
CAACTATTGGTCAGTATTTCTTACCTTAAGTGGATGAATTTTCGCCAGTA
GATGTTTTCTACCCGGTACCACCTAGGCTGCATGCATCCCCAAATTAGTT
TTGATATAGGGGATGCGAATCGGGCTCTGATATCGCTTCCGAGAAAATTA
CCGAATAGCTATGTATTTTTGAAAATAGCTTCTCTTCACTGCAGAGACAT
TCAGAGATTTTTTTTTTTGTTGTTCAAGCATTTTCTGAACGTAATATACT
AGAGAAATTAAATACTAGTTGGTATTGAAAAATATTAAATATACTACAGT
ATATACCGGAGCCTGTCCCGGCATGTATCTTTTAGATTTAAACAAAATTC
TACTAGAATTATGGATTATGTATAAGACTTTCAGATTATGTATAAGACAT
TCAGAGATTTTCGTAAAAATGTCTCAGACACAGAACGTTGCCGTAAGAAA
CCCGAACTTCGCGTTATCTTTTCAGACATCGAATAAGAGTTTGGTTCAGG
CTAATATTTTCGCGAGAGAAAAAAAATAATTTTCGTGGGATTTATTTTTG
CGAATCGTCCCTTTTAAAACGAATATCTTTCATTTTCCTAGAAGTTTCGG
TAGAAACCTAGGGTTGGTATTGGTATTGATATCGGAAAACAGCTCCAGAC
TTTTAGACCTTACTCTTGGTCTATAGGCACTGCTATAGGCTAGTGGCCGC
CACCGGGAATTGATTAATAATAGGTTTAAACATATTAGACAACTTTCACA
AAAGATGTTTATCAATAGAGATTTCAAATAAAAGAATGTTTAAAACACAG
CTGATTGGCTTAGGTTTCGAAACTCTCTATTGTTTCATTAAAACCTCAGT
TCACATGCGATTTATCTGGAGAATTTCAATATTCAAAACAAGAGCAGTGC
TCATATTCCAAAGAGTAGGAGTTCAACTCTCGAAACGAAGGAAGATACGA
CGTAGCCTACTATTAACTTCATTAAATAACGACATTGACTGAAATAGTTT
TGAAAGGCGTAGACTACGTATTTCCTCAAATAAGCGCCGAAAGGCTATCG
ATGAATTTTAAAAATCTTATGTGTGTTGGTCTTTAGAAGGGGAGAAAATT
ACCATTATGATCAGGGTCAGTTGAAAACGTTAGTTACCCAATTTGGCACC
CAAATTTGGTAACCTATTTGGGTACTGGAAAAATGGCGAATCAGCGCTGA
AAATATTGTAATTTTCACTTACAGGAAAATTTTAGATTCAGAAATCTAAA
AAATATCAATAGATATACTCTAGGCATCAAATTTGACTTGAAATAAAGGA
GCTCTCAAACTAAAATTTATGGGATTTCCCCTGTTCGCCCTGGGTTGACT
CGGATCTGATCTCTAACTGTGTAAAAATGAATATGATTTCGTGACCGGAA
TTAATAATTACAAACTTCAGCAAACTCAGGACTCAAAATTGTAAGACTTA
ATTCAAAGAATTTGGGTGAATTAGACTGAAAGTGTGTTTTTAAACTCACA
GTATTGAGTGTCAGGGCAAATAATTCCATTTAAGTTTCCAAATTGTTTAA
AAAGCTGTATAGAATGTAGTCTGTAAAAAAATTCGAAACAATCGAAACAA
TCTCTCTCGAAAAATTTCTATAATAGCTGTGACTAGAATTTGAAGTTCGG
GCGAGAATTGCTATTTTAGCACTTCCACTTTTTTACATTGAATATTTCGA
TTTCGAAGGGGGTTGGGTGGCTTCTAGGCTATATTGCAAGCCTTTATTGG
AGCAAATTTGAGCTTTTAACTCCTGAGGTTGTGAGTCTTAAAAGTCTCAT
AGTTAAAACTCTATTTCTCAACTGTAGTTTAACGCGCTTAAAAATCATTT
GTCGTGTTTATAATTTCACAGGGAAATCCCCTTTCCCCAAATATTTTTTC
ATGATTTTGTATATTTAAACGAAGAACACAAATTTTGATAGCATGAACCA
ATTTACAAGTTAGAAAAATGTTAATCGAAACGTAAAATTGTAGTCGATAA
GCCTATGCATCAATTCTAAAAAGCGCTTCATTTTAAAGGGCGGTGCTTTT
ATTAAAGGACTGGAAATGGTGTGCACCCCCTGTGAAGGAGGGGGGTTGAG
AAACTTTCAAATGAAAGGGGTAGCTTGGACAAAATGAGGTGAATTTGACT
GGGAGAGTGTAGAAGTTGGAATTAATAAGATAAAATAAATGAAGTGGTGC
TTTTATATTGTATTTTTAGCAGGGATTGAATTTGAAAAGTGATGGATTTT
CGATATTTGTTTGCAGGGATTCTATTTGTTAAAAATGATCCCCTTGAGAT
CACATTTCTCATTAAACATTACCGGTGATAATTGTCCCATTATTATTACA
CTTTAGATTGGGCTGATTGGGCACCATGGGGACCATGTGAAATGATTGAT
GACGATGAGATCTGTGGTATCAACGCTACTAAATACCGCAAAGCGACAAA
CTGCAAACAATCTGCATCAGGTGGCCTGGAAGAACAAGATGTTGATGCGT
ATTGGTGTGGTGAAGAAATCTACCATATACAGTCATGCGAAGTTTTTTGT
CCAGGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:885863..893218- >XLOC_040806 ID=XLOC_040806|Name=XLOC_040806|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1320bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:885863..893218- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGATGTGATGCGGTCATGGTCAAAGTTTCCCATATGAAAAATCCAACTGC
AACTAGAGAAATACAAATAATGGAAGAGGGATTTGACGGGCATTTTGGAT
GTGATGCGGTCATGGTCAAAGTTTCCCATATGAAAAATCCAACTGCAACT
AGAGAAATACAAATAATGGAAGAGGGATTTGACGGGCATTTTATACAACC
AGATCAAGAGTACACGTTTTCTAAAGATACAACCAGATCAAGAGTACACG
TTTTCTAAAGATAAATTTATAAACTTTAAACCACCGGCTAGTGGCCCACA
ACTCACAATTCTTCAGACTGATGAGGAAGCGATCAACAGATTGTTTGATA
AACAAAAAGATGTTATTACTGGTACCGTGGGTCAGGCCATTGATATTCAG
ATAGAGATCTTTGTTGATAAATTTATAAACTTTAAACCACCGGCTAGTGG
CCCACAACTCACAATTCTTCAGACTGATGAGGAAGCGATCAACAGATTGT
TTGATAAACAAAAAGATGTTATTACTGGTACCGTGGGTCAGGCCATTGAT
ATTCAGATAGAGATCTTTGTTGGATATGATTGCGGTACATGGGATAACTC
AACGGGAACAGAGTCACCAGTGTGCTACCCGGCAGGCTTTGGACCTGGTC
CGGGTGTGTTTCAATCAAACCGAAGTTGTATCGGAAAGGTACAGGGATTT
AATGATACGGACCAAACCAACACTGAAGAGTGCAATTCAACTATTGGATA
TGATTGCGGTACATGGGATAACTCAACGGGAACAGAGTCACCAGTGTGCT
ACCCGGCAGGCTTTGGACCTGGTCCGGGTGTGTTTCAATCAAACCGAAGT
TGTATCGGAAAGGTACAGGGATTTAATGATACGGACCAAACCAACACTGA
AGAGTGCAATTCAACTATTGATTGGGCTGATTGGGCACCATGGGGACCAT
GTGAAATGATTGATGACGATGAGATCTGTGGTATCAACGCTACTAAATAC
CGCAAAGCGACAAACTGCAAACAATCTGCATCAGGTGGCCTGGAAGAACA
AGATGTTGATGCGTATTGGTGTGGTGAAGAAATCTACCATATACAGTCAT
GCGAAGTTTTTTGTCCAGGTATTGGGCTGATTGGGCACCATGGGGACCAT
GTGAAATGATTGATGACGATGAGATCTGTGGTATCAACGCTACTAAATAC
CGCAAAGCGACAAACTGCAAACAATCTGCATCAGGTGGCCTGGAAGAACA
AGATGTTGATGCGTATTGGTGTGGTGAAGAAATCTACCATATACAGTCAT
GCGAAGTTTTTTGTCCAGGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:885863..893218 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 712-909:199 |
| Aaloc | 538-708:2720 |
| Aaloc | 382-534:4405 |
| Aaloc | 346-378:5535 |
| Aaloc | 250-345:7357 |
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