|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000301_pilon:252413..253711+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040758 ID=XLOC_040758|Name=XLOC_040758|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1299bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000301_pilon:252413..253711+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGCAAAGTTCGATGCCTCCACCACGACCAAGTTCAATGCCACCACCACAA
AGCTCGATGCCACCACCACAGAGTTCGATGCCGCCACGACAAAGTTCAAT
GCCACCACCACCACAAAGTTCAATGCCACCACCACAAAGCTCAATGCCGC
CACGACCAAGTTCAATGCCACTACCACAAAGCTCAATGCAGccaccacaa
agttcaatgccaccaccaccaccaagttcaatgccaccaccacaaagctc
aatgccgccacgaccaaGTTCAATGCAACCACCACAAAGTTCAATGCAGC
CACCGCAAAGCTCAATGCCACCACGACCAAGCTCAATGCCACCACTACAA
AGCTCGATGACGCCACGACCAAGTTCAATGCCACCACTACAAAGCTCGAT
GCCGCCACCACAAAGCTCGATGCCACCACCACCAAGCTCAATGCCACCAC
TACAAAGCTCGATGCCGCCACGACCAAGTTCAATGCCACCTCCACAAAGC
TCGATGCCACCACCACCAAGCTCAATGCCACCACGACTAAGTTCAATGCA
ACCACCACAAAGCTCAATGCCACCACCACAAAGCTCGATGCCGCCTCCAC
AAAGCTCGATGCCACCACGACCAAGTTCAATGCCACCACCACAAAGTTCG
ATGCCACCACCACAAAGTTCGATGCCACCACGACCAAGTTCAATGCAACC
ACCACAAAGCTCAATGCAACCACCACAAAGTTCAATGCCACCACCACAAA
GCTCGATGCCACCACGACCAAGTTCAATACCACCACCACAAAGCTCGATG
CCACCACGACCAAGTTCAATGCCACCACCGCAAAGCTCGATGCCACCACA
ACCAAGCTCAATGCAACCACCACATAGTTCAATGCCACCACGACCAAGTT
CAATGCAACCACCACAAAGTTCAATGCCACCACGACCAAGCTCAATGCCG
CCACCACAAAGCTCAATGCCACCACCACAAAGTTCAATGCTATCACGACC
AAGCTCAATGCCACCACGACAAAGCTCAATGCCACCACCACAAAGCTCGA
TGCCACCACGACCAAGCTCAATGCCACCACTACAAAGCTCGATGCCGCCA
AGACCAAGCTCAATGCCACCACTACAAAGCTCGATGCCGCCACCGCAAAG
CTCGATGCCACCACAGCAAAGTTCAATCACACCCTCTCCCAGCGTCCCAA
CACCACCAGCCACGAGTGCTCCACCTCCAACTCCACCTCCAGTACCTGAA
ATTCCCAAAATTCGAAGATTGTCGCTTAGTGGTGAGAAGTGAACCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000301_pilon:252413..253711+ >XLOC_040758 ID=XLOC_040758|Name=XLOC_040758|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2016bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000301_pilon:252413..253711+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGCAAAGTTCGATGCCTCCACCACGACCAAGTTCAATGCCACCACCACAA
AGCTCGATGCCACCACCACAGAGTTCGATGCCGCCACGACAAAGTTCAAT
GCCACCACCACCACAAAGTTCAATGCCACCACCACAAAGCTCAATGCCGC
CACGACCAAGTTCAATGCCACTACCACAAAGCTCAATGCAGccaccacaa
agttcaatgccaccaccaccaccaagttcaatgccaccaccacCGCAAAG
TTCGATGCCTCCACCACGACCAAGTTCAATGCCACCACCACAAAGCTCGA
TGCCACCACCACAGAGTTCGATGCCGCCACGACAAAGTTCAATGCCACCA
CCACCACAAAGTTCAATGCCACCACCACAAAGCTCAATGCCGCCACGACC
AAGTTCAATGCCACTACCACAAAGCTCAATGCAGccaccacaaagttcaa
tgccaccaccaccaccaagttcaatgccaccaccacGACCAAGCTCAATG
CCACCACTACAAAGCTCGATGACGCCACGACCAAGTTCAATGCCACCACT
ACAAAGCTCGATGCCGCCACCACAAAGCTCGATGCCACCACCACCAAGCT
CAATGCCACCACTACAAAGCTCGATGCCGCCACGACCAAGTTCAATGCCA
CCTCCACAAAGCTCGATGCCACCACCACCAAGCTCAATGCCACCACGACT
AAGTTCAATGCAACCACCACAAAGCTCAATGCCACCACCACAAAGGACCA
AGCTCAATGCCACCACTACAAAGCTCGATGACGCCACGACCAAGTTCAAT
GCCACCACTACAAAGCTCGATGCCGCCACCACAAAGCTCGATGCCACCAC
CACCAAGCTCAATGCCACCACTACAAAGCTCGATGCCGCCACGACCAAGT
TCAATGCCACCTCCACAAAGCTCGATGCCACCACCACCAAGCTCAATGCC
ACCACGACTAAGTTCAATGCAACCACCACAAAGCTCAATGCCACCACCAC
AAAGCTCGATGCCACCACGACCAAGTTCAATGCCACCACCGCAAAGCTCG
ATGCCACCACAACCAAGCTCAATGCAACCACCACATAGTTCAATGCCACC
ACGACCAAGTTCAATGCAACCACCACAAAGTTCAATGCCACCACGACCAA
GCTCAATGCCGCCACCACAAAGCTCAATGCCACCACCACAAAGTTCAATG
CTATCACGACCAAGCTCAATGCCACCACGACAAAGCTCAATGCCACCACC
ACAAAGCTCGATGCCACCACGACCAAGCTCAATGCCACCACTACAAAGCT
CGATGCCGCCAAGACCAAGCTCAATGCCACCACTACAAAGCTCGATGCCG
CCACCGCAAAGCTCGATGCCACCACAGCAAAGTTCAATCACACCCTCTCC
CAGCGTCCCAACACCACCAGCCACGAGTGCTCCACCTCCAACTCCACCTC
CAGTACCTGAAATTCCCAAAATTCGAAGATTGTCGCTTAGTGGTGAGAAG
TGAACCTTGACTCGATGCCACCACGACCAAGTTCAATGCCACCACCGCAA
AGCTCGATGCCACCACAACCAAGCTCAATGCAACCACCACATAGTTCAAT
GCCACCACGACCAAGTTCAATGCAACCACCACAAAGTTCAATGCCACCAC
GACCAAGCTCAATGCCGCCACCACAAAGCTCAATGCCACCACCACAAAGT
TCAATGCTATCACGACCAAGCTCAATGCCACCACGACAAAGCTCAATGCC
ACCACCACAAAGCTCGATGCCACCACGACCAAGCTCAATGCCACCACTAC
AAAGCTCGATGCCGCCAAGACCAAGCTCAATGCCACCACTACAAAGCTCG
ATGCCGCCACCGCAAAGCTCGATGCCACCACAGCAAAGTTCAATCACACC
CTCTCCCAGCGTCCCAACACCACCAGCCACGAGTGCTCCACCTCCAACTC
CACCTCCAGTACCTGAAATTCCCAAAATTCGAAGATTGTCGCTTAGTGGT
GAGAAGTGAACCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000301_pilon | genome | sc0000301_pilon:252413..253711 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 505-1008:796 |
| Aaloc | 244-501:325 |
| Aaloc | 1-243:1 |
|
