XLOC_040735 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040735
Unique NameXLOC_040735
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000055_pilon:1366635..1380986-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040735 ID=XLOC_040735|Name=XLOC_040735|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14352bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000055_pilon:1366635..1380986- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAAGTTTATATCTCAAATTTACTTGTTTTTTAATTATCTTTCGAATGAGC CCAAAATCGTTTAATTTCGAGCACTTTCGATTTAGGCTAAATTGTACTTT AGTCTGACGTCATCATTAAAACTCATCTGCAGCATGACTGGTACATTTTC AGACCCGAGTTTATATCTCAAATTTACTTGTTTTTCAATTATCTTTCGAA TAAGCCCAAGATCGTCGATTTTCGAGCACTTTCGTTTTAGGCTAAATTGT ACACTTTAGGACCAAAAAATAATGCCCAAAATGAGCAATTTGGGGTAAAA TTTTGAAAAATCGGTCGATGACTTGAGAATCTACTAGGGTTGAACTGTCG AAAACCGAAAAAAACAGAGGTTGGAGTGTTTTTCCGGGCGGAGCATGGCT ATGTGACTGACTATTTCCCATTAAGAAATCTCAATTTTAGAAGCTTTTAG AAGGTTAATTGGAGCTGTAAGATTTACTCACAAAAGGAAAAGCAAAGCGG AAACATTACGGACAATATTTCATAGATATTGGAAGTTATGGAAGAGTGTA TGTCAAACAACTCACTGAAAGAACATCTTCTGGCTATTGTCAAGAAATCT CGAGAAATTGCTGACGGCAAAACAGAAAAGAAAAGGAAAACTTCAAAAGT GAAGAAAGAAACGCAACAAAACCCTAATACCCTCGTTGAACAGAAATCGA AACACGTTAAGGTAAAAAAACTTATGCAGTGCTTTCACTACTACCTTTAC ATTTTTTTATAAATTTGGACTTTAATATACGTTAAATTGCTGAAAGTCTT GGGACAATAGAAAAATGTTTATGTTCGCCTTTCTCATTTTTTTGTGACGG GACCTACTGTAAGGCCGAAGAACTATTTTTGTGTCTGAATGTACGTCAAA AATAGCTGTAAGATGATTTACAGTCGATACTCTCTTATTCGGCGTTTTTC 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TTAGCTCCACGAAATAAGTTTGCGTTCAATATTGGCATCCATTAAATTTT GTTTTGAAAAGATATTTTCTCTAGCCAGAAAATAAAAAGTTCTTTATAAG CACACACAATTTCAGACCCAATTTGTAGACAAAAAGTCGCTGGAGAATTT TGGAGGAAAGTATTAAGCAATAGGGTTCACCTTGAAGAAAATGTTGATCG AAAAATCTTGTCATTTGATGAAGGATTGCAAAGTTTACAGGCCCTTTTTT AGTCCAAATATTTTCTTACACCAATGTCAGAAACAATAAATCTCGTCTCA TCTTATTTCCAACACTTAAGTTAGCCAATAAGATTTCACCTATCAACAAA AGAGCTCATTAAAAATGCACGATATATGAGATTATGAGCATGCCTACCTC GTAATTTTTTTAATCGTAGGGCGAGCATGGTTACAATAGCATACTTCTCC TGTTTCTTTATACCTCCATGGTTATACAAATATTGAAATAGCTAATGTAA AGAATGCTATTGTTCAAAATTAGTATTGTTTTAATTAGTGAGAAGGATAG TTCGTCTTTGATATCTCAAGTTAGAACGAGGTATATGTTTGTCATTGCCT TCTGATGAAAAAGAATTACAAGCTGTTGCATCCAAAGTGATACAATCTGT CTTTTAAACAATAAAATTCTTATCCAAACTGATGATTCCTACAGCCTGGT TTTTGTTAGAGGGGTTAGTTTATTTTAGTTTATTGCAGTTTATTTATACC CTATAATTTATTTCTGTTTATATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG TCTGTTTATGACAATTAAGACGGAGGCAGGTCAACTAAGCAAAGCCAACC AGAGCCAGGTCAACTAAGCAAAGCCAACCAGAGCCAACAATGCAACTTTT TTCTATTTCAACTTCTTTCATAAAAGATTGACACAGTTTTGAATAATTTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000055_pilon:1366635..1380986-

>XLOC_040735 ID=XLOC_040735|Name=XLOC_040735|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000055_pilon:1366635..1380986- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGATACATCCTGAAAATACAAATGATAGTCCATTCGCTATCGAGAAGAC
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AGGTTGTTACAGGACAATACTCAACTGGAAATTCGTCATTGGTTTGGTTG
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AGCGTTACGCTGTGGACGTCAAGCTGTCCTATGATTATTATTTGCAGCAA
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CTCTCGGAGCGTTACGCTGTGGACGTCAAGCTGTCCTATGATTATTATTT
GCAGCAAGCAAGACCAATGCATGCTTTCCTTGTTTACATGAAAAATCGCA
CGCATACAAGCGAGAGCATCGACGCCGTCACATCATCAGTATGCAGGCTA
GCCATCGAAAATTACGATTCAGCCATCATCTCAACGTCCTGTATTCTTTT
CATGGAGTTGATAGAAGGCCCGTATCAATTATTGAAGGTGGACGTCAAAG
CTGCTGTTCTCATCTCAAAGTATTGGAACAAAAGAGTTTCTTTCGAGAAG
AAAACAAACGCACAAGACGTTAAGACGTTGCTAACATCGACGCCGTCACA
TCATCAGTATGCAGGCTAGCCATCGAAAATTACGATTCAGCCATCATCTC
AACGTCCTGTATTCTTTTCATGGAGTTGATAGAAGGCCCGTATCAATTAT
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AGAGTTTCTTTCGAGAAGAAAACAAACGCACAAGACGTTAAGACGTTGCT
AATTGATTTATTATTGGCAAAGAAATCAAGAGAGAACCTCATTACCCTTG
TCAGCCATTTGGAAGACTGCATCGAAGTTGCTATTCACGAAAATAAGGAA
ATTGACAGTTGATTTATTATTGGCAAAGAAATCAAGAGAGAACCTCATTA
CCCTTGTCAGCCATTTGGAAGACTGCATCGAAGTTGCTATTCACGAAAAT
AAGGAAATTGACAGGTTTTCGTTCGAAGCTATATGTCATTGGAAGATAGC
CATTCAATTTTGTCGTCTTCATCAGCTGCCCTTGACCACGTGTTTCGTCA
AATCGTGTTGTCAAACGGATAATTGGCTTCCTTTATTCTTGTTCATTCAA
CTGTATCAAATACCACCAACACAGGTTTTCGTTCGAAGCTATATGTCATT
GGAAGATAGCCATTCAATTTTGTCGTCTTCATCAGCTGCCCTTGACCACG
TGTTTCGTCAAATCGTGTTGTCAAACGGATAATTGGCTTCCTTTATTCTT
GTTCATTCAACTGTATCAAATACCACCAACACAGATATTGGAAGTTATGG
AAGAGTGTATGTCAAACAACTCACTGAAAGAACATCTTCTGGCTATTGTC
AAGAAATCTCGAGAAATTGCTGACGGCAAAACAGAAAAGAAAAGGAAAAC
TTCAAAAGTGAAGAAAGAAACGCAACAAAACCCTAATACCCTCGTTGAAC
AGAAATCGAAACACGTTAAGATATTGGAAGTTATGGAAGAGTGTATGTCA
AACAACTCACTGAAAGAACATCTTCTGGCTATTGTCAAGAAATCTCGAGA
AATTGCTGACGGCAAAACAGAAAAGAAAAGGAAAACTTCAAAAGTGAAGA
AAGAAACGCAACAAAACCCTAATACCCTCGTTGAACAGAAATCGAAACAC
GTTAAGAAGAACTATCGTGCTCAATTTTACTCGAAACTTGGTACCACTGG
TTTACCCTCCTCCAGAGGGAGTGTCAGTGAAAATCCTCGTGAGTTGGCTA
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ACATCGACGCCGAAGAAAGATCAAGTAGATGGCAATAACCAGGGACATGG
TCAAAAGCTGCAGCATGGTGACGATTTACAACTTTTAGATGAAGAACTAT
CGTGCTCAATTTTACTCGAAACTTGGTACCACTGGTTTACCCTCCTCCAG
AGGGAGTGTCAGTGAAAATCCTCGTGAGTTGGCTACCTCGCCATCAGATG
AAAACATGACGAGAATAACCAATCAGCTCCCCATGACATCGACGCCGAAG
AAAGATCAAGTAGATGGCAATAACCAGGGACATGGTCAAAAGCTGCAGCA
TGGTGACGATTTACAACTTTTAGATGATACACATTTCCAAGAGATGTCGG
AAATTCCTAATAGTAACAATTTGGTCGATTTGCTCCTACAATGTGATGAC
AACAATACACCATGGAGAAAATTACTGGCTTATTCGCTGGCTGTTTTTAA
TCCACTCTTAACTGTATTGGCCGCTTGTTATGAGATACACATTTCCAAGA
GATGTCGGAAATTCCTAATAGTAACAATTTGGTCGATTTGCTCCTACAAT
GTGATGACAACAATACACCATGGAGAAAATTACTGGCTTATTCGCTGGCT
GTTTTTAATCCACTCTTAACTGTATTGGCCGCTTGTTATGAGGAAGCTGA
TTGTTGGGAGTGTCTTTGCGTTTGGTATGTGTGTAGTGTGAATGAAGAAA
TGAGATTCAAGATATGCAGCAGTATACTTGGAAGCTGATTGTTGGGAGTG
TCTTTGCGTTTGGTATGTGTGTAGTGTGAATGAAGAAATGAGATTCAAGA
TATGCAGCAGTATACTTGATATCAAAGATGAAGACGCAATTTTGAATATC
AAAGATGAAGACGCAATTTTGATGCTTCGGAATCATCGCTGGTCAAATGA
AGATCTTTTGACAATTGTGAAATGTTTGTTGACTGAAGGTGTCAAATACG
CAAAGCTCATTTGTCATGGTTTTATCATTTTCAGAAAGGTATGCTTCGGA
ATCATCGCTGGTCAAATGAAGATCTTTTGACAATTGTGAAATGTTTGTTG
ACTGAAGGTGTCAAATACGCAAAGCTCATTTGTCATGGTTTTATCATTTT
CAGAAAGGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040735XLOC_040735-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000055_pilongenomesc0000055_pilon:1366635..1380986 -
Properties
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