XLOC_040734 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040734
Unique NameXLOC_040734
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000021_pilon:1157723..1171163+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040734 ID=XLOC_040734|Name=XLOC_040734|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13441bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:1157723..1171163+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGCAAATGTAGTGACGTCAGTTATGTAAAGAATCTACCGGTAACCGAACT CgttcaaaatgaagaaatggATCGATTGTTTGTGAACGAAAAAGAATCTT TGGAGAATAGCGGTGAATTTGTGTTGAAAGATGtcaaagta

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000021_pilon:1157723..1171163+

>XLOC_040734 ID=XLOC_040734|Name=XLOC_040734|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1902bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021_pilon:1157723..1171163+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GACTTTCAGACCGAATACAAGGCTTACAGAAACAGAAACAATGTCTCCAA
AACTTTCTCCACAAACCATGACTCATACTATTGTGAAAATTTTGCATTCT
CTTGCATTACGTTACTCCTTGAGAAAAGTCCGTCTACTTTGCATTCATAC
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ACAAGGACTTTCAGACCGAATACAAGGCTTACAGAAACAGAAACAATGTC
TCCAAAACTTTCTCCACAAACCATGACTCATACTATTGTGAAAATTTTGC
ATTCTCTTGCATTACGTTACTCCTTGAGAAAAGTCCGTCTACTTTGCATT
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AACGGCCGACATTTTGTACCCAACCGGTGTCCAGTTTTCCGTTCAACGGT
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GTAACCGAACTCgttcaaaatgaagaaatggATCGATTGTTTGTGAACGA
AAAAGAATCTTTGGAGAATAGCGGTGAATTTGTGTTGAAAGATGtcaaag
ta
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040734XLOC_040734-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000021_pilongenomesc0000021_pilon:1157723..1171163 +
Properties
Property NameValue
Aaloc736-954:13223
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Aaloc424-561:1730
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