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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000350_pilon:261191..271960- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040680 ID=XLOC_040680|Name=XLOC_040680|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10770bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000350_pilon:261191..271960- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGTTTAATGGGTGTTTTGTCCGAAAATGTGAACGTCATTATGTTGTC
GTCGAAAAAATCAGGTATGTCTTTATTTTTTCTAACGATTAACTACTATT
TGTGTGACAATAACCCTTTCTTTATCCGCCACTGGGTTTTTCAGAATTTA
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ACATAGCAGACCATGTAACACCAAAGACTTATAACCAAAACAAGACGTCT
AACCATTGTTTCACCTTAGTTAGATCTCATCAGATAGCGTGTTATTGTTC
TTCTAATACAATAAACTATATCTACAGGGTTTCCGCATAATTAGTGAACG
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TTCAAAATGGCTGAAGCAGAAAAACTTTGATTAGAAAATTAGAAACTCTG
ACTTCGTTCTAATCTAAATGAATGTGAAAATGTTTTACTGGCAATCAAAT
CATCTTCGTAACAGAAAGATACAAGTTGAAGTTTTATGATATGGGCTCCT
CTCCTCAAGTGCTAAAGGAAACCCGACAGCCTGATATATCAACATCAAAA
CTGCCTTCTACATTCATATCTAACAGTTGATCGTCAACAACTATTGGAAA
CCAGAAAGATGTACTCAAAGATGATCAAATGATGAGCTTCAAAGACTTTA
GGACACTTTTAAACTTTTGAGGACGACCTGGCCTACAGTACCAAAAGACA
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TTATTATGGCTGATCACTTTTCTACTTAACTTTGGTGTTTGCAAAACTTG
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AACCCAATCTTATTGAATTCATACTCTTGACATTCAATTAAATTGATTGG
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GAATGAAGAAATAATAATCATGGTAGTAGACACTCAACTAGAGGGAATCG
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TTTTACTAAAACTATATCTACGATATAAAACTGTACTTTTGGGTACCTAA
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CAAACCCCCATTTATTTAGGTACCCAAGAGTAGTTAGAGCCTTTTATGGA
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CAGTGTATAAGTTTTTTTTATTCTAAAAATTTTTGTTAATCATATTGTTT
TGAAAAGATAGAATCAATGTTTGGGTCAAAGACTGATAATTGAATTGAAA
AATTAAAGAATTTTTTTTCACTCAATTTTCAATATTTTGATCCAAACTTT
TGAGGAGATTCTGACATAAAATTTTAACAAGTCTCCTGTTATTTTTAATG
CCTGTTTGATCATTTCACTTTTTTATGACACCTTTTGATAAAAATTACAG
TACCATAAAAATGTGAAAAATTTAATGAAAAATGATGGGATTGTTTTGAC
TCATCACTTCCTATTTAGAAAATAAGTACCTTTAAGGGAACTAATTTTGG
GAATTTAGACGAAATTCGCCAAAGTTCGTTCCTGCCAAAATTAAATATTT
TGCTCACTCGCCAAAATAAGTTCCCGCCAAAATTAAATTTTTTGTTTCCC
TGCCTAAATAACCCTGAAATTCATCAAAATTGCTCAAAATAAGGCAAAAT
AGAAGAGATTTATGCTGTCATTTGCCAAAATTAAAAAAATTCACTATTCG
CCAAAATAAGTTCCGACCAAAATTTAAAAAATTTAGGATATTTGCTGCCT
GCCAAAATTAGCTCCCACCAGAAAAGGTTCCCTCAAGGTATTTGAAAATT
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TGTAATTTTTGTTACCAACTATCAGTCTCGAGATTTGTAAAAAAAATGTC
TGGACACAAATGAACAAAGTAAAGCTCATGCATGTAACATATCTTTAACC
AGGACCCTAGTTAACTGGCATAGCACAATCTAATCAAAAAATACAAAATC
ATTAATTTATTGTTTGTTAATACTGAGAAACAAACAAAAAACAATTTTCA
AATACACAATACAATAATAGACAAAAATAGGCAATTCTTTTGAAAATAGA
TGACCTGATTTAATTTTTTCTGAGGATTAATTGACGATTGAAAATGATAC
TTAGATGACAAAGTATAGACAATAAGTCCCTTACGCCTGCTTACGCTACA
TTAAAATAGTTACACAAACAAATAATTTTGGTATTAACAGTCAGAGCATT
TCACAATATTAAGAACTAGGTACCTCCAAAATTACCTCTCAAAATTAATT
TCATTATGATGACTGACTGATTAATTTATATAGTTTGCTTCTGTTTGCTT
TCTATAATTTGTTAAAATTACCTAGCTAAAGAATTCATCTATATAAATTT
GTTCAAGATTATCTACAAGCAATACTTTTTTCATTTGCCAGAAACCAGTC
TTGCCAAATTAAAAATCTGGCACACTGTTTTAAAAGTAATATCCAAGCTT
TCAATACTCTTTCCATTTTTAGCCAATTGAATGTACGTTATTTTTGTAAA
TCTCAGATTCTGTCCATGAGATGGCAGATGGCGCTTATTTAGTCAATGAC
CCAGGCATAATCAATTGTATATTTTAGTCCACTTTCTACAAATGACATAC
ATCACAATTTCACGGTTGGGGTACCAAATATTTTCATATATATACTGATG
CAATAACCCTCACAATTTCAGTTTGTAGCCTGCTGTGAGCTAGTCTCTAG
TGACAGTGTGAACAATACATTATCCAAATTTTAAGATATTCCAAATATTG
TTAGTGTTAGTAGCAATCTTTTCATCATCGCTGTTGATAATTCTAATCTA
CCAAGTCTACCAGCCAAGCCACATATATCAAGATATCCAAAGAATCCATC
CAGTGACAAATTGATTCGGTGTTATAATAAAATAGCCAGAAAATTAAAGT
TATGATTCAAAAACCATCATTGCGACAAAATATTTTTCAGCATTGGGTGT
TAGTTGTATATATTTCAATTCTAATCACAATACATCTTGTTTGTTGAAGA
TATCCTTGATTTGAAGTCGCCCATCTGTTTTTGAAATGCCTTTTCAAGGA
GCAGGATATATATACAGAATTTATGATTGATTAATTTTTGATGTTTTTTT
ATATTATATATATTTTACACCTAAATAAATTGAAAAAAGTTATATCGAAA
TCGAATGAGCGATATTAAACCGAATACTTTTCATGTGAACAAACATAAAG
CCAGGTAAACTAACTGAAAACCTAAATTTCCAACAAAACACAGTCTGACA
GTTCACAAAAAATAGCACAAAAACATTGAGCCAGGCCAGTCTGAAAAGAG
CCAGGCCACAAAAAAGAATGGTATGGACTTAAAGTTTGGTCATATTAAAA
TGCTAGAAAATTATTTTTAATCATCAAAAAATTCTCTAACATAGTATTTC
AAAGCCATTCTTTGGGTCATTATAGCAAATACACAGAAACCAGTCAGCCA
TTTTGTTTTTGCGAAATTCCTTCCTTCTGGCCAAAGTTCAAGGTTCAAAG
AGCAGAAATGCAAAGAATAATTATTCTAAAATCAAACCAATCCAATTTGT
TGACATATTTCATGATAATTAGACCATAATTAGCAAAATTACATGGACAA
GTAGTTCCAAATTTGGTGGCCTTCGAGTTTTGGCGGCCATTTTTTAAAAT
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AACAATGAGATAATTTTGCATAATTATGCGCTTAGACGTCTTGTTTTGGT
TATAAGTCTTTGGTAACACCCCTGTCTTACAGCCCCGGTGGAACTTTTTT
CCTCAGTGGGGATAAAAAGTCCTATTGAAATTCCAATTGGGATAAAAATT
CTATTGTTCTAAGGTTAAAAGATCCAGTGGGGATGAGTTAGGAGTGCAAT
TTTTAAACATTGAATTACGAATGGGATTGAAATCAAAGTCAATTTTCCTT
TGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTCTGTGACACAGGGGTGTCATGTAGCTAA
GCACTAAAAGTTATAAGCCCTCCATCGAGTGAGTACTAAAGCAAGACAGA
TTCTTAATTGCAATATTTGTTTGTTAGTGTGTTGAATGATCCTGGATGGA
TTTTCTGAAACCTTATTTAATGCCCCTGTGTCACATACCCGCTGGGACAA
ATTTTTGTCCCCGTTGGGAAAATACCTTAGAATTTCAGCCCCACTTGGAA
ATTAACTTTTATTTCATCCCCATTCGAAATTGAATGTTTGAAAATTGCAC
TTCGAAACCACTGCCACTGAATTTTTTAACCTTGGAACATAGCAATTTCT
ATCCCAATTGGGATTTCAATAGGAATTTTTATCGCCACTGAGAAAAAAAG
TTCCACCGGAGCTGTGAGACAGGGGTGTCATTTAGCTAGCAAGTTCTTGA
GTTGATCATCTGTAAGCGGGACTCTGAAGCAAAATTGAACTTCCTGGGTG
GGGGTAGGGGTACTCAAGGTAACCTACCGTAGGTGAGGCCCTGAAGTGTG
CGTTTTCAGCCTTCTCATAGGGCACTGCAGGGGTTGAAATGAGAGAAAGT
GCACTCGAAGGGTGTAAAAAGTGAGAAAAACGAAGTGATTTGCGTGCAAA
ATTTTGGGAAAATCTGACCAAATGCGCCGTGATGGGCCTTCTTTCATCAA
ATGTTTACTTACTTACTTACTTACTTAAATTTGGCTTAGTTTTTCTCTGC
AATGTAAATGTCCCACCTTAAAGGCCTAAGAACAATTTGAGGCTCAGCTC
TGGTGAATATTTAAGTATATATAAACAAACTAAATAAGGCCAAACGAGGC
AAGAATATAGAGAAGAAAAAATTAAGAACTGCTCAGCCTGAGCCAAAATT
TACTGGTACTAATAAAAAAAGTGTGTATATCATGCGTTAGAACACATCCT
TAAGTCGAAGTTCGATGCCTCTTTGGTTGCTTACGTTAGTGAATGGATTA
AACGAAATTGGTTTTAGTTACTCCAGTCGCATTCATTTTCTTGCAAGTGA
GCCCATGGGGGACTGAAATTCAAAATGTTTTAATATTTACAACGCTATAC
AGCGCGGGACATGATATTTTTATGTTTTTACAATCTTACCGAGGGATCGA
AAACGGTACCTTACAAAAAGACTAATTCTAATTCTTAATACTTATGACGT
AATCTTTTATACCGAAACACACGAAAAACACCGGGCGTTTGCGACTAGTT
TTGAATTTAAACAATAATAATAATAATAATAAAGCTTTACAGGTTTGCAG
GCCACCGTGAAGACACATGGGCCTCTATAAACCGCTCGTACCTTTTACAA
TGATCTTTTTGAAATAAAGCTGCTCCTCCTGCTTTTCTTTTCGAATCGCA
TCTCCAATGTTTTTCTCGATGTGTTTGGATGTGATTTTAGCGTAGCTCAT
TGGTGGTCTTTCCTCTTCTTTCTTTTCGATGATGCTTTCAATCTTCTTTT
CAAGCGTGGTTATTCTGGTATCGATAGTTTCTTTCATTCCGTTGACCATA
ACATTGACGTCTTGTGCTTTCAAATGGTTTATTTCTTCGTCCTGCCATTT
CATTATATTCTCACAGGCTTTGATTTCGTTTTTGAATCCTTCAATTCTTG
ATGTTTCATTTGAATTATACCTTTCCATTACCTGTGGTGCGATTTTGGTA
CAGTTTTGACACTGGAAACTTCTTGATTTGTATGACAAGCATATCTGGAT
CTGGTAAAGTGGCAGTTCTGTACAAAGATAATGGACTAAACGGTGGCACT
TCCTGCATTGTAGGGTATCTTTTAGTTCGTTTTCTTCATTTATGATGCAC
TTTGACGGGCTGCAAAAGTCGTTTATTGATGGTGATTTTTTATTATTTTC
TTGAATTTTTTCCGCCATCTTTGTGCATTTTTCAGACGACAACCGTTCAG
TTTTGTATTTGACGTCCCGTAACAATGAAAAGTAGTGGCAAACGCCCGGT
GTTTTTCGTGAGTTTCCGTACAAAAAATTACGTCATGAATATCTAGAATA
TCCCCAACGTTTTTCGGGAAAAAAATAGTGTGCTTGTTGTGGAGCGACAT
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AAATTTCTTAAGCCTTTCTTAAGCTTAAAAATGTTATTAACATGTTCTTA
CTTTTGTCATTTTGTGAGTATTTTTGTGCGTTTTTCTAAGAAATCGGTTG
CTTTAGAGTCTCCAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAAAATTT
TGGCCAATTTTGTTCTTGTAAAAAAACGTTTAAATGAAAACTAGTCGCAA
ACGCCCGGTTTTTTCGGTTTTTCGTGTGTTTCCGTATAAAACATTACGTC
ATGAATATCTAGAATATTCCCAACCTTTTTTGGAAAAAAATATTGTGCTT
GTTGTGGAGCAACATTTTAATTCATCTTACTATTTTTTTTAAGATCATCC
AAAACTTTTAAAGCCTTCGGATGTTCTTAAATTTTTGAGTTTTAAGCCTT
AAAATGTTCTCAACATGCCCTTACTTTCACTATTTTTCCATTTTCCCTAA
GAAATCGGTTGATTTTGAGTCTCAAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGT
TCTTATCATTTTGGCCGTCGAAGTCTTATTATGTTCTTATATAATCTGTT
CTTGTATTTAAAAAAACGTTTATTATCTAAAATTACACCAGTGCCAAACC
TATAATAAAACTCTTTGAAAAGGGAATACACAAGCACAACCTTTTTACAA
AAAGGTATTAATTAAAAGTGATTATAAGGGGTATGCATTTTGTTTTGAAT
TTTGAATTGTCTTTCTTCTATTAAACTTCATAAAGCAATATCCAATTATT
GATATCACTCATTGTAGATCTTTCTTATCGCTTACGCTAGCTCTCCCGTG
AGAAAATTATCGACTTTCAAAGCAATTTTCTAAATCTGACAGTACCATAA
ACGTGTAATAATAATAACAAGGTTTCAGTCAATTTGTTGTTTATATGATG
TTTCAGATTTCTTCTGAATAGAAAACACTAGTTGGATTACGTACTTACGC
GTACAAACTAAAATTTTTTGAATGTTAATGTCAACATGGCTTTTACATCT
TACTTTAACATGACACAATGTTTATAAATTTATAGAGCGTGTAAAAGTGA
AAGTTATTGATTAGTCGAAGTAATTTTTAAAGTTGGAACTTTCTTGCTGT
GATGACAAACTGAACAACCTTGCATGAAATAAATTATTATTAAAAGTTTT
TGCTTTTACTGTAACAGAGAATATAAAATAGAAATACAAAGCTTCGGTTG
ATTTTGATGGAAAAATGTTACGAAGGTTGAGAAGTTTTTCGACGCCATAT
TTTTCAGCCATCCCTGAAGATGAAATTATAGATGATGAAATTAATAACAA
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CTTGTAAGTCCTAAGTACCTCATATGTTCCTCATAAGGTAGTCAAATCTG
CCCACACTTAAGATATTTCATAAATACACCCCTTCTTACAGACCCGGTGG
GATTATATCAGTCAGTGGGGGTAAAAATCATTGACCAAAACTCGATGGGG
ATTGATAGTGTCCCATGCTTCTTATGGCTGGGGACTTGGCTTCGATTGTT
TTCTAGTCTGAAAATTCAGTGGGGATGGAAAAAATGGTAAAATATTTTGC
AGTGCGGATTTGCTTATCTGATCATTTTCAGCTGGGACAAAAATTAGAGT
AACATTTTGAAAGTGCTCTCATCATTTGAAAACCTTCAAAGTCTAGTCTA
TCATGCTAGATGACTAATTCAGACAATTCAGTAACTTAAATTAGTCTAAT
ATCGACATCCCTCGTGTAATTCCAACACCCTTCTTAGAGATTAAAAGGAA
GGTCGGAATCACTGTTAGAAAAAAAAATGTTTTCCTCTCTGACCGTTGAT
AAGTCGATCAGCGATTCCAACCTTTATTTTATTTTCAGGGTTAAAAAAGG
GTGTCGGAATTAGATGAGAGATGTCGACAAAAGACCAACTTAAGGTGTAG
AAAATAAGCCATAATTAATATTATTTACTATGGTAGTAGGGACAAATCAT
AGTTTATATAAACTAATATTATCGCGTAAAAATTATCATATTTTTAAATC
ACACCCATATTACTGTATTAGACGAATTATCAACGACTCCTTTCCTCCTT
CAGTCTCTCTCCAGTCTCCCTGTGGTCTCTCTCCAGTCCTCCTTCAGTCT
CTCTCCAGTCCTCCTTCAGTCTCTCTCCAGTCCTCCTTCAGTCTCTCTCC
AGTCCTCCTTTAGTCTCTCTCCGGTCCCCCTTCAGTCTCTCTCCAGCCTA
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TGACAGTAATCTGAGATTTATTGAAACTGTAGACAGTCTTAAAATTCCTT
TCGTTTATGTAATATGCATTATGGTAAAAGAAAACACTCAGGTCAAGAAG
GTTGAAAATAGTTTGATCTTATATATGCATGCATCAGTCAGAGAAAAACT
TTTGGTCGTATCATAAGGACGAGTAATTGATCTTTCTTAACCATTTTGGA
AAAACTATCCTCAAAGGCTTTTTTGAAATCTCTCTTTCCGAATTTGAAAG
AGACAAGATGCTTTCGAGCAAGTTTTATAAAAATATCATGGCTTCGATGT
CAATGCAAAGAAAATATCAGGTCATACTCGAGATAGGTAAGTATTGAATC
CAGCTTTATTCAACAATTTGGCTGTGTCATCAATTTTGCAATTTTGGAGG
AGGGTCAGACATCGTAATAATGGCGTAAAATGACCAGCTTAGTAGTTGAT
TTTTTGACTTAATTTGTGCAATTAGCGTTTTGATTACTCTTGATTGCCAT
AGTTAAATGGCAATGAAACATCCGTTTTCTTTGCGAGAACATCCGAAATT
TTAAAGCCTTTGGTTGCTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCTTAAAAATGT
TCTTAACATGTTCTTGTTTTCACCATTCTGTAAGTATTTGCCATTTTCCT
AAGAGATTGGGTGTTTTAGAGTCCACAGAGAAAGCTTATATTATATTCAT
GTGTAGTTTGTTCTTGTATATTACCATGGTTAAACGACGATAAAACATCC
GATAAGTTTTTACGTCACAAAGAATAAAAATCGTAGTTTGAATTTGTTAC
ATGGTTGGCAGGTGGTGAACTTCTGAGAGACATCGTTGATTCCTGCCTCT
ATAGTCTCTTTGAGATCCCTTATCATGTTGGCAAGGGCGACTATAGGAAT
GAATATAATATTCTTTATAAGAAGTCTGAGAAAAACTTGTTGGTTGCGTG
TTTAAAATGGTATACTTTCGAGCCAAATTCTAAAGTTTAATGGATTAAAA
AGAAAGGTTGGTGATTTCTTGCACTTTATATTTTGAAGATTTGTCTATTC
AAGAAACCCGTTGTGTTGTTTATAAGAATAGTTAGAAATATTGTAAACAA
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ATTATTCATTCAAATAGATTTTGTTGTATATTGGATACAGTAACCTTGGT
TTTCTCTCCATCGCAGTGTTCATTCTATTTAGTTTGCCCTGGAGAGCTTT
GTTGGAGAGATTACAGAAACTACGATGGAGCTATGTGGTATAATTAGGTT
ATAAGTTGCGAATTTTATTTACTTTTCCGTCATTTATCGTGTGATCAAAG
GCTTTAATTTGTTTTCTTAATCTGGGACTTTTTGACACAAGACCTTACTT
GCAGTACTAGAGTGGTATTGGTGCGTCTGATTAACTAAAGTCAGAAAAAG
TGATCCCAGCTAACTTCGAGAGCAGAAAATTTGTGAAGAAGGACTACATA
AATAAGAAGAAATGGGGAGAAGTTTACAACAACAGAAATTCAACCATTTC
GTTTCTCGTTTTCTTTCAGCATGCGAACCGAAGGACGCTTTATCGTGGAA
CGGGAAAACGAAAGACGGAACGCGAAATTTCTCGACGGATGACGGATACG
TTGACGTCGATATTCCGTCAGATGACGAATATGAGAGCGAAAATGAACTG
AATTTCTCGTTAATCGACCCGAATATATTACGAGCGAGAATTATTCGTCA
TTTACCGAGTGAAGTAACGACAAAGTACGGTTCACCGATCGTTTTAACTT
GTTTAACGACTGTTTTATTTCCCGTTGATATCGAATGGACTCTAAACGGG
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AGTGCAGAACAGGACTAGAGCGGTCACTGAACCTCTATTAAGCCTTCCGA
ACACTCTGGAACTGAGATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000350_pilon:261191..271960- >XLOC_040680 ID=XLOC_040680|Name=XLOC_040680|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1130bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000350_pilon:261191..271960- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGTTTAATGGGTGTTTTGTCCGAAAATGTGAACGTCATTATGTTGTC GTCGAAAAAATCAGATGGGTTTAATGGGTGTTTTGTCCGAAAATGTGAAC GTCATTATGTTGTCGTCGAAAAAATCAGCATGCGAACCGAAGGACGCTTT ATCGTGGAACGGGAAAACGAAAGACGGAACGCGAAATTTCTCGACGGATG ACGGATACGTTGACGTCGATATTCCGTCAGATGACGAATATGAGAGCGAA AATGAACTGAATTTCTCGTTAATCGACCCGAATATATTACGAGCGAGAAT TATTCGTCATTTACCGAGTGAAGTAACGACAAAGTACGGTTCACCGATCG TTTTAACTTGTTTAACGACTGTTTTATTTCCCGTTGATATCGAATGGACT CTAAACGGGACCATTATTGAACCGACGATCGATGGTCGGATATTTTTCCG ACGACCGACGACAATTATTCATTTTGTATTTAACGACTGATGAACAAGGA ACAATAGAAATGGTCGCTAGAAATCGTTTCGGAAGCGAGAAGTCAATTTG TCAATTGAAAGTGCAGAACAGGACTAGAGCGGTCACTGAACCTCTATTAA GCCTTCCGAACACTCTGGAACTGAGATGACATGCGAACCGAAGGACGCTT TATCGTGGAACGGGAAAACGAAAGACGGAACGCGAAATTTCTCGACGGAT GACGGATACGTTGACGTCGATATTCCGTCAGATGACGAATATGAGAGCGA AAATGAACTGAATTTCTCGTTAATCGACCCGAATATATTACGAGCGAGAA TTATTCGTCATTTACCGAGTGAAGTAACGACAAAGTACGGTTCACCGATC GTTTTAACTTGTTTAACGACTGTTTTATTTCCCGTTGATATCGAATGGAC TCTAAACGGGACCATTATTGAACCGACGATCGATGGTCGGATATTTTTCC GACGACCGACGACAATTATTCATTTTGTATTTAACGACTGATGAACAAGG AACAATAGAAATGGTCGCTAGAAATCGTTTCGGAAGCGAGAAGTCAATTT GTCAATTGAAAGTGCAGAACAGGACTAGAGCGGTCACTGAACCTCTATTA AGCCTTCCGAACACTCTGGAACTGAGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000350_pilon | genome | sc0000350_pilon:261191..271960 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 379-567:190 |
| Aaloc | 67-375:500 |
| Aaloc | 1-63:10771 |
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