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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000041_pilon:854781..857009+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040604 ID=XLOC_040604|Name=XLOC_040604|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2229bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:854781..857009+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCATTACAAATTATAATTCCTTGTTTCAGATTGGCATTGAAGGATTATT
CACCGATTTTCAACTCGAAAATTCACTCGAAGGACCTGAAGTCACCGATT
GTGTTCTGTCTTTCTGGAGTTCCTCAGAAAACAATCTTCTGACAGCATCG
ACCGACTTTGAAGTGAAATATACTTTAACGTACGAGCCCCAACAAAGACC
TTTCCCACAGGTCACTTTTGTGCAATTCCTTTACGCTCAAACAAACCAAC
GTTGTGGAACAGAACCCGAATGTCCTGAACAACCTCGCACCACCATAGAG
CCTCTACTACCAGGAGAACTTACCACACCAGCTCCTGGTCCTCAATGCGG
TCCCCTTCTCTCCAATTTGAATCGAACATCCACAGGATTGACAGGAACTG
TCACCTTCCCTATCTCTTCGAATGCTTCAACTTGGTATTTGAAGgtatat
tttaaaaacttttttgaaatggtcGAACCTGTAAAACCTTTTGGTTTCAG
TTGAAATTTCTCCTgtaataaaaatcattttttgttcaGCAAAGGATCAT
CATATTCATTGATAGGTTTTATTATATCCTGTCATCTAataaattgattt
gaagtttcatCTCTGACAGTCTTTTCATAATGGAGCTTAACGTATTGAGT
TTCAGACCGAAAAATGGAggcgaatcttcaacctttcatAGGCAAGAAAA
AGTATTTTGGAAAGCAGATTAAACTTTCTTGTCGTATAAAGATGTTTCTG
GCTCCGGCGTTAAATGCTACTTTCAATCTATCCTTTGTATGTGGGAAATA
AGGATTCTATCTTTCGGCTATCTAATCGACTTAAAGGTCCTACTATTTAA
ACAGGGTTAAAAAAGACTCCTTATTCGTTTACTTATCCGTTAATATATCC
GTTAATATCAACATCGACGAAATCCAATTTTGTTCTTTCTATCGTCTTCA
TAGGTTGGCATCGATGGTGCATTTAAGAGTTTGACGATAGAAGGTACAAC
TGAAGGACCAGATTTCAATGAATGTCTGCTCTCCTTTTGGAGTGGAGATG
ATAACAGTGTTCTAGTAACAGGAAAGGATTTGGTcttgaattttcaattg
atGACGAATGAAGGTGCATCTATCACCCATTTCACTCTTTACTATGCACA
AACAATGCAGAATTGTGGAACCGAGCCTACTTGTGGGTTCGAAACAACCG
CATCTCCTCAAATAACAACTGAAGCTCCAGAACAAACGACTCAAGCTCCA
GAaCAaacGactcaagctccAgaacAaacaactcaagctccagaacaaac
aactcaagctccagaacaaacaacccaagctccagaacaaacCACTCAAG
CTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAA
CAAACCACTCAAATTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCAC
TCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTC
CAGAACAAACCACTCAAGCTCCGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAA
CAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAA
GCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCGGA
ACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCA
CTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAGCTC
CAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAA
ACCACTCAAGCTCCAGAGCAaacaactcaggctccagaacaaacaactca
agctccagaacaaacaactcaagctccagaacaaACCACTCAAGCTCCAG
AACAAACAACTCAGGCTCCAGAACAAACAACTCAGGCTCCGGaacaaaca
acccaagctccagaacaaaccactcaagctccagaacaaacaactcaagc
tccagaacaaacaactcaagctccagaacaaacaactcaggctccagaac
aaACGACTCAGGctccagaacaaacaactcaggctccagaacaaacaact
caagctccagaacaaacaactcaagctccagaacaaACCACTCAAGCTCC
GGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCCAGAGCAAA
CAACGGAATCAGGCGGCGAATCGACCGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000041_pilon:854781..857009+ >XLOC_040604 ID=XLOC_040604|Name=XLOC_040604|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3440bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:854781..857009+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCATTACAAATTATAATTCCTTGTTTCAGATTGGCATTGAAGGATTATT
CACCGATTTTCAACTCGAAAATTCACTCGAAGGACCTGAAGTCACCGATT
GTGTTCTGTCTTTCTGGAGTTCCTCAGAAAACAATCTTCTGACAGCATCG
ACCGACTTTGAAGTGAAATATACTTTAACGTACGAGCCCCAACAAAGACC
TTTCCCACAGGTCACTTTTGTGCAATTCCTTTACGCTCAAACAAACCAAC
GTTGTGGAACAGAACCCGAATGTCCTGAACAACCTCGCACCACCATAGAG
CCTCTACTACCAGGAGAACTTACCACACCAGCTCCTGGTCCTCAATGCGG
TCCCCTTCTCTCCAATTTGAATCGAACATCCACAGGATTGACAGGAACTG
TCACCTTCCCTATCTCTTCGAATGCTTCAACTTGGTATTTGAAGTTCATT
ACAAATTATAATTCCTTGTTTCAGATTGGCATTGAAGGATTATTCACCGA
TTTTCAACTCGAAAATTCACTCGAAGGACCTGAAGTCACCGATTGTGTTC
TGTCTTTCTGGAGTTCCTCAGAAAACAATCTTCTGACAGCATCGACCGAC
TTTGAAGTGAAATATACTTTAACGTACGAGCCCCAACAAAGACCTTTCCC
ACAGGTCACTTTTGTGCAATTCCTTTACGCTCAAACAAACCAACGTTGTG
GAACAGAACCCGAATGTCCTGAACAACCTCGCACCACCATAGAGCCTCTA
CTACCAGGAGAACTTACCACACCAGCTCCTGGTCCTCAATGCGGTCCCCT
TCTCTCCAATTTGAATCGAACATCCACAGGATTGACAGGAACTGTCACCT
TCCCTATCTCTTCGAATGCTTCAACTTGGTATTTGAAGGTTGGCATCGAT
GGTGCATTTAAGAGTTTGACGATAGAAGGTACAACTGAAGGACCAGATTT
CAATGAATGTCTGCTCTCCTTTTGGAGTGGAGATGATAACAGTGTTCTAG
TAACAGGAAAGGATTTGGTcttgaattttcaattgatGACGAATGAAGGT
GCATCTATCACCCATTTCACTCTTTACTATGCACAAACAATGCAGAATTG
TGGAACCGAGCCTACTTGTGGGTTCGAAACAACCGCATCTCCTCAAATAA
CAACTGAAGCTCCAGAACAAACGACTCAAGCTCCAGAaCAaacGactcaa
gctccAgaacAaacaactcaagctccagaacaaacaactcaagctccaga
acaaacaacccaagctccagaacaaacCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAA
CACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAATT
CCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCGGAACA
AACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTC
AAGCTCCGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAG
AACAAACCACTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACA
ACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGC
TCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCGGAAC
AAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAGCTCCAGAACAAACAACTC
AAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCA
GAGCAaacaactcaggctccagaacaaacaactcaagctccagaacaaac
aactcaagctccagaacaaACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAGG
CTCCAGAACAAACAACTCAGGCTCCGGaacaaacaacccaagctccagaa
caaaccactcaagctccagaacaaacaactcaagctccagaacaaacaac
tcaagctccagaacaaacaactcaggctccagaacaaACGACTCAGGctc
cagaacaaacaactcaggctccagaacaaacaactcaagctccagaacaa
acaactcaagctccagaacaaACCACTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCA
AGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACGGAATCAGGCG
GCGAATCGACCGAAGTTGGCATCGATGGTGCATTTAAGAGTTTGACGATA
GAAGGTACAACTGAAGGACCAGATTTCAATGAATGTCTGCTCTCCTTTTG
GAGTGGAGATGATAACAGTGTTCTAGTAACAGGAAAGGATTTGGTcttga
attttcaattgatGACGAATGAAGGTGCATCTATCACCCATTTCACTCTT
TACTATGCACAAACAATGCAGAATTGTGGAACCGAGCCTACTTGTGGGTT
CGAAACAACCGCATCTCCTCAAATAACAACTGAAGCTCCAGAACAAACGA
CTCAAGCTCCAGAaCAaacGactcaagctccAgaacAaacaactcaagct
ccagaacaaacaactcaagctccagaacaaacaacccaagctccagaaca
aacCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTC
AAGCTCCAGAACAAACCACTCAAATTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCA
GAACAAACCACTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAAC
AACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCGAACAAACCACTCAAGC
TCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCGGAAC
AAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACT
CAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGCTCC
AGAACAAACCACTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAA
CAACTCAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAG
CTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAaacaactcaggctccagaa
caaacaactcaagctccagaacaaacaactcaagctccagaacaaACCAC
TCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAGGCTCCAGAACAAACAACTCAGGCTC
CGGaacaaacaacccaagctccagaacaaaccactcaagctccagaacaa
acaactcaagctccagaacaaacaactcaagctccagaacaaacaactca
ggctccagaacaaACGACTCAGGctccagaacaaacaactcaggctccag
aacaaacaactcaagctccagaacaaacaactcaagctccagaacaaACC
ACTCAAGCTCCGGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACTCAAGC
TCCAGAGCAAACAACGGAATCAGGCGGCGAATCGACCGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000041_pilon | genome | sc0000041_pilon:854781..857009 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1243-1722:1750 |
| Aaloc | 1018-1239:1526 |
| Aaloc | 445-1014:954 |
| Aaloc | 1-444:1 |
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